PANX1のリン酸化と機能の再評価
新しい知見が、リン酸化によるPANX1活性化に関する既存の見解に挑戦している。
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目次
PANX1は細胞に見られる大きなチャネルの一種だよ。免疫反応、炎症、血管の狭まりなど、体のさまざまな機能に大事な役割を果たしてる。PANX1が活性化されると、ATPや他の物質が細胞の内側から外に放出されるんだ。これらの物質は周りの細胞に信号を送り、コミュニケーションを助けるんだよ。
PANX1の研究背景
PANX1に関する研究はほぼ20年続いてる。科学者たちはその構造や働き方を解明しようとしてるんだ。2020年には、クライオ電子顕微鏡という技術を使ってPANX1の構造を理解する手がかりを得たよ。これにより、チャネルの作り方やイオンの動き、ブロックされる仕組みがわかったんだ。ただ、PANX1がどうやって開いたり閉じたりするのか、いまだにたくさんのことがわかってないんだ。
どんな信号がPANX1を活性化させるのか、またその活性化をどうやって元に戻せるのかを理解することにも興味があるよ。この知識は、PANX1に関連する病気の治療薬の開発にも役立つかもしれない。
PANX1の調節
PANX1の機能は作られた後にさまざまな修飾によって影響を受けるんだ。これには、タンパク質の切断、糖分子の追加、リン酸基の追加、そして一酸化窒素基の付加が含まれるよ。一つ重要な例は、特定のプロテアーゼがPANX1を切断して、死にかけている細胞を体から取り除くのに重要な役割を果たすことだね。
研究では、リン酸基の付加(リン酸化と呼ばれるプロセス)がPANX1の活性を制御するのに役立つことが示されている。Srcキナーゼという一種のタンパク質がこのプロセスに重要な役割を果たしているようだよ。細胞表面の特定の受容体が活性化されると、Srcも活性化され、最終的にはPANX1が開くことになるかもしれない。
リン酸化とPANX1
いくつかの研究がリン酸化がPANX1の活性に与える影響を調べているよ。特に、科学者たちはリン酸化可能な特定の部位に注目している。例えば、実験では主に二つの重要な部位、Tyr198とTyr308が注目されている。Srcキナーゼはこれらの部位をリン酸化する役割があるようで、理論上はPANX1が開くことに影響を与えるはずなんだ。
でも、まだ多くの疑問が残ってる。PANX1がSrcによって直接リン酸化されるのか、他のタンパク質がこの信号伝達プロセスに関与しているのかは不明だし。最近の研究では、Tyr150という別の部位でも活動が検出されていて、他のキナーゼの影響も考えられるね。
研究の目的
最近の研究の目的は、リン酸化がPANX1のチャネル活性をどう変えるかを探ることだったよ。最初に、科学者たちは市販の抗体を使って特定の部位でPANX1がリン酸化されているかを確認しようとしたんだけど、実験ではリン酸化されたPANX1を認識できなかったんだ。
これは使われた抗体の信頼性や、PANX1のリン酸化に関する結論について問題を提起するもので、PANX1がリン酸化によって活性化されるという既存の見解を再考する必要があることを示唆しているよ。
リン酸化部位の調査
PANX1のリン酸化をよりよく理解するために、研究者たちはその構造を分析したんだ。特にチャネルの開口部の近くに位置する二つのチロシン残基(Tyr199とTyr309)に注目したよ。これらの場所は、PANX1の機能に影響を与えるかもしれないから重要なんだ。
研究者たちは異なる種のPANX1を見て、これらの残基がさまざまなタンパク質の形で保存されているかを確認した。これが、リン酸化を検出するのに効果的な抗体を明らかにする手助けになるかもしれないし、異なる動物モデルでも機能するかどうかを確認できるんだ。
抗体実験
研究者たちは、リン酸化されたPANX1に特異的に反応すると主張されている市販の抗体に目を向けた。人間またはマウスのPANX1を発現している細胞株でこれらの抗体をテストしたんだ。
PANX1単独で発現している細胞のサンプルを調べたとき、抗体は信号を示さなかったが、研究者たちはPANX1が存在することを確認した。これは抗体が非リン酸化タンパク質を認識しなかったことを示している。Srcキナーゼが存在するサンプルを見たときにも、抗体はリン酸化されたPANX1を検出できず、他のタンパク質と反応している可能性が高いことを示唆しているよ。
これによって、以前の研究で使われた抗体がリン酸化されたPANX1を特異的に検出しないかもしれないという疑念が生じて、以前の結果が疑問視されることになった。
さらなるin vitro分析
分析を強化するために、研究者たちは次に精製されたPANX1とSrcタンパク質を使ったin vitro実験を行ったんだ。また、より広範囲な抗リン酸化チロシン抗体を用いて、リン酸化を検出できるかを試みたけど、抗体はSrcだけを認識し、PANX1は認識しなかった。これは、少なくともSrcによる条件下ではPANX1がリン酸化されていないことを示唆しているよ。
これにより、PANX1が活性化されたSrcと共に発現していても、リン酸化の標的にならない可能性があることがわかった。以前の研究では特定のリン酸化部位が異なる細胞型で活性化されるとされていたが、彼らの実験セットアップではその活動は観察されなかったんだ。
異なる細胞型の探検
使った細胞型が結果に影響を与えているかを確認するために、研究者たちはNeuro2Aという別の細胞株でPANX1をテストした。ここでは、PANX1が糖分子によって大幅に修飾されていることが分かった。これらの細胞から糖基を取り除く処理をした後、SrcがPANX1の全体的なリン酸化状態に影響を与えないことを見つけたんだ。
HEK293TとNeuro2Aの両方の細胞で、データはPANX1がSrcによってリン酸化されないことを示唆している。細胞の種類がリン酸化活性に影響を与えないことを確認するのが重要だったんだ。
マウスPANX1のテスト
最後に、研究者たちはマウスPANX1を調べて、人間のPANX1と異なる振る舞いを示すかどうかを確認した。以前と同じ実験条件を使って、マウスPANX1もSrcの存在下でリン酸化の証拠が見られなかったことを確認したんだ。
PANX1チャネル活性への影響
PANX1がSrcによってリン酸化されないかもしれないという知識を持って、研究者たちはこれがチャネル自体の機能にどう影響するかを見たかったんだ。活性化されたSrcがある細胞でPANX1の活性を測定する電気生理学的実験を行ったよ。
結果は、Srcが存在する場合でもPANX1チャネルを流れる電流に大きな違いがないことを示したんだ。これは、SrcがPANX1のチャネル活性に影響を与えないことを示唆していて、Src依存のリン酸化がPANX1の主要な調節メカニズムではないことをさらに支持するものだね。
結論
さまざまな技術と細胞型から得られた証拠は、研究者が調べたシナリオにおいてPANX1がSrcによって大きくリン酸化されないことを示唆しているよ。代わりに、PANX1の活性に影響を与える他の調節メカニズムが存在するようだ。
リン酸化部位を正確に特定し、それがタンパク質の機能にどう影響するかを理解することが重要なため、これらの発見はSrcとPANX1のリン酸化を結びつける以前の主張を慎重に再評価する必要があることを示しているんだ。
研究者たちは、PANX1に対する既存の見解を再考し、PANX1の機能に影響を与える可能性のある他の経路やタンパク質を探ることが求められているよ。研究コミュニティは、リン酸化イベントを調べるためにより敏感で特異的な方法を使用して、PANX1のようなタンパク質の調節におけるリン酸化の役割を誤解しないようにするべきだね。
この研究は、異なるコンテクストにおけるPANX1の振る舞いに関するさらなる調査の扉を開くもので、これに関連する病気の治療研究への新たな道を切り開くことができるかもしれないよ。
タイトル: Human Pannexin 1 Channel is NOT Phosphorylated by Src Tyrosine Kinase at Tyr199 and Tyr309
概要: Protein phosphorylation is one of the major molecular mechanisms regulating protein activity and function throughout the cell. Pannexin 1 (PANX1) is a large-pore channel permeable to ATP and other cellular metabolites. Its tyrosine phosphorylation and subsequent activation have been found to play critical roles in diverse cellular conditions, including neuronal cell death, acute inflammation, and smooth muscle contraction. Specifically, the non-receptor kinase Src has been reported to phosphorylate Tyr198 and Tyr308 of mouse PANX1 (equivalent to Tyr199 and Tyr309 of human PANX1), resulting in channel opening and ATP release. Although the Src-dependent PANX1 activation mechanism has been widely discussed in the literature, independent validation of the tyrosine phosphorylation of PANX1 has been lacking. Here, we show that commercially available antibodies against the two phosphorylation sites mentioned above--which were used to identify endogenous PANX1 phosphorylation at these two sites-- are nonspecific and should not be used to interpret results related to PANX1 phosphorylation. We further provide evidence that neither tyrosine residue is a major phosphorylation site for Src kinase in heterologous expression systems. We call on the field to re-examine the existing paradigm of tyrosine phosphorylation-dependent activation of the PANX1 channel.
著者: Wei Lu, Z. Ruan, J. Du, J. Lee, Y. Li
最終更新: 2024-03-18 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.10.557063
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.10.557063.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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