Simple Science

最先端の科学をわかりやすく解説

# 生物学# 微生物学

イブプロフェン分解の環境影響

研究によると、バイ菌がイブプロフェンをどう変えるかと、それが生態系に与える影響がわかったんだ。

― 1 分で読む


イブプロフェン汚染を撃退すイブプロフェン汚染を撃退するバイ菌期待できそうだね。バイ菌がイブプロフェン汚染を分解するのに
目次

薬は病気を治すために作られてるけど、副作用もあるんだよね。これらの薬は人間に悪影響を与えるだけじゃなく、環境にも害を及ぼすんだ。よく使われる鎮痛剤の一つがイププロフェンで、ドイツや世界中で人気なんだ。 wastewater treatment plants(下水処理場)がイププロフェンの多くを取り除いてくれるけど、それでも川や湖に少し残ってて、南極みたいな極端な場所でも見つかってるんだ。

イププロフェンと環境

イププロフェンは痛みを和らげたり炎症を抑えたりするために広く使われてるけど、水系に出てくるのは心配だよね。下水処理場は約90%のイププロフェンを取り除けるけど、それでも川や湖に残っちゃう。これが野生生物や生態系にどんな影響を与えるのか疑問が残るよ。イププロフェンが自然の中でどう分解されるかを理解することは、人間や環境への影響を考える上で重要なんだ。

イププロフェンの微生物分解

研究者たちは、特定の微生物がイププロフェンを分解できることにすごく興味を持ってるけど、その具体的な方法はまだ完全にはわかってないんだ。いくつかの研究では、様々なバクテリアがイププロフェンを制御された環境で分解できることが調べられてきたよ。

イププロフェンを分解できるいくつかのバクテリアの種類が見つかったんだ。これには、薬を変える能力を示す様々なバイ菌株が含まれるよ。中には効果的にイププロフェンを分解するバクテリアもいるけど、イププロフェンがそのバクテリアに与える影響はまだ不明なんだ。

研究方法

バクテリアがイププロフェンをどう分解するかを学ぶために、研究者たちはいくつかのバクテリア株を使って実験を行ったよ。汚染物質を分解する能力が知られている7つの株が選ばれたんだ。研究者たちは、Priestia megateriumという1つの株が特にイププロフェンを変えるのに効果的だと発見した。それがきっかけで、この株に焦点を当てた詳細な研究が進んだんだ。

研究者たちは、P. megateriumがイププロフェンをどう変えたのか、そしてそのタンパク質が薬の存在にどう反応したのかを分析したよ。

変換の主要な発見

研究の結果、P. megateriumはイププロフェンを特定の方法で変換することがわかった。一つの主要なプロセスは、イププロフェン分子にヒドロキシル基を追加することなんだ。これはバクテリアが薬や他の化学物質を修飾する一般的な方法だよ。バクテリアはイププロフェンやその変換生成物に糖分子を結合させることもしてるんだ。

面白いことに、糖の結合は可逆的で、つまりバクテリアは後でそれを取り除ける可能性があるんだ。これが、治療プロセスの後でもイププロフェンが環境に残ってる理由かもしれないね。

バクテリアの生理的影響

この研究は、P. megateriumがイププロフェンにさらされた時にタンパク質がどう変わったかも明らかにしたんだ。特に、シトクロムP450酵素というタンパク質群が、イププロフェンの存在下でバクテリア内でより豊富になったみたい。これらの酵素は、イププロフェンを修飾するプロセスで重要な役割を果たすと思われるよ。

さらに、イププロフェンの存在はP. megateriumの成長やストレスへの対処にも影響を与えたみたい。たとえば、生存や成長に関連するいくつかのタンパク質が、イププロフェンにさらされた時に少なくなったことから、薬がバクテリアの正常な成長プロセスを妨げるかもしれないことが示唆されるよ。

実験方法の概要

実験では、科学者たちはバクテリアを育てるために特定の培養条件を使ったよ。バクテリアの株がイププロフェンをどう扱うかを見るために、一連の変換を行ったんだ。これはバクテリアを制御された環境で育てた後、イププロフェンを追加して、時間とともにバクテリアがどう反応するかを観察することが含まれてた。

異なる間隔でのサンプリングにより、研究者たちはイププロフェンのレベルの変化と変換生成物の形成を追跡することができたんだ。高度な技術、例えば高速液体クロマトグラフィーを使って、サンプルを分析して新しい化合物を特定したよ。

主要な変換生成物

実験中に、いくつかのイププロフェンの変換生成物が特定されたんだ。主要な生成物の一つは、ヒドロキシル化されたイププロフェンだったよ。もう一つの生成物は、イププロフェンに結合した糖分子を含んでいたんだ。成長媒体にグルコースがあると、バクテリアがこれらの糖結合生成物を形成する能力が高まったみたい。

変換速度は、バクテリアが静止期か対数増殖期かによって異なったんだ。静止期の細胞は、活発に分裂していないにも関わらず、対数増殖期の細胞よりも高い速度でイププロフェンを変換したよ。

グルコースの変換への影響

グルコースの存在は、P. megateriumがイププロフェンをどう変換するかに大きな影響を与えたんだ。グルコースが追加されると、バクテリアは糖結合体を含むもっと多くの変換生成物を生成した。これは、グルコースがエネルギーを提供するだけでなく、イププロフェンの変換プロセスを助けていることを示唆してるよ。

グルコースなしの実験でもバクテリアはイププロフェンを変換したけど、全体として生成物は少なかったんだ。これは、グルコースがバクテリアの中でイププロフェンの変換効率を最大化する上で重要な役割を果たしていることを示してるね。

成長段階の比較

研究では、異なる成長段階のバクテリアがイププロフェンをどう扱うかを比較したんだ。静止期の細胞は、対数増殖期の細胞よりも良い変換能力を示したよ。イププロフェンの初期の急速な変換は、成長段階に関係なく最初の4時間に主に起こったけど、その後は静止期の細胞が対数増殖期の細胞よりも優れた結果を出し続けたんだ。

この結果は、成長の時間とグルコースのようなエネルギー源の存在が、バクテリアがイププロフェンのような複雑な化学物質を分解する効果に大きな影響を与えることを示唆してるよ。

毒性とバクテリアの成長

研究のもう一つの重要な側面は、イププロフェンがP. megateriumの成長にどう影響するかを理解することだったんだ。高濃度のイププロフェンはバクテリアの成長を抑制することがわかったから、毒性の影響があるみたい。ただし、糖結合型のイププロフェンはかなり毒性が低く、バクテリアは最小限の遅れで成長し続けることができたんだ。

これは、バクテリアがイププロフェンを糖を加えることで修飾すると、毒性を解毒して成長に悪影響を与えないようにできることを示唆してるよ。

シトクロムP450と変換メカニズム

シトクロムP450酵素は、P. megateriumにおけるイププロフェンの変換で重要な役割を果たすことが強調されたんだ。これらの酵素は、薬を含む様々な物質にヒドロキシル基を追加することに関与してるよ。阻害実験では、これらの酵素をブロックすると特定の代謝物の形成が大幅に減少したことが確認されて、イププロフェンの変換における役割が確認されたんだ。

さらに、イププロフェンが存在する時に異なる種類のアルコール脱水素酵素がより多く見つかったので、これらもイププロフェンの修飾に寄与しているかもしれないね。

バクテリアの反応とプロテオミクスの変化

研究では、P. megateriumがイププロフェンに反応してそのタンパク質の発現がどう変化したかも調べたよ。薬にさらされた後、DNA修復やストレス応答に関与するいくつかのタンパク質がより豊富になったことから、イププロフェンがバクテリアのDNAにダメージを与える可能性があるんだ。

さらに、胞子形成に必要なタンパク質が少なくなったので、イププロフェンがバクテリアの繁殖や胞子形成能力を妨げる可能性があることが示唆されたよ。これは、特に食料源が限られる環境でバクテリアの長期的な生存に大きな影響を与えるかもしれないね。

結論

全体として、この研究はP. megateriumがイププロフェンを効果的に変換できることを示していて、環境におけるこの一般的な医薬品の解毒のための潜在的な道を提供してるんだ。この発見は、バクテリアが化学物質とどのように相互作用するのか、そして有害な物質をどう変えるのかについての洞察を提供するよ。

この研究は、廃棄物管理プロセスがイププロフェンのような薬の存在を考慮する必要があることを理解する上で意味があるし、これらの微生物を利用したバイオレメディエーションの取り組みについてさらに調査するための扉を開くものでもあるんだ。研究が続く中で、薬の生態学的影響や、その影響を軽減する方法についてもっとわかることが期待されてるよ。

オリジナルソース

タイトル: Transformation of the drug ibuprofen by Priestia megaterium: Reversible glycosylation and generation of hydroxylated metabolites

概要: As one of the most-consumed drugs worldwide, ibuprofen (IBU) reaches the environment in considerable amounts as environmental pollutant, necessitating studies of its further biotransformation as potential removal mechanism. Therefore, we screened bacteria with known capabilities to degrade aromatic environmental pollutants, belonging to the genera Bacillus, Priestia (formerly also Bacillus) Paenibacillus, Mycobacterium, and Cupriavidus, for their ability to transform ibuprofen. We identified five transformation products, namely 2-hydroxyibuprofen, carboxyibuprofen, ibuprofen pyranoside, 2-hydroxyibuprofen pyranoside, and 4-carboxy--methylbenzene-acetic acid. Based on our screening results, we focused on ibuprofen biotransformation by Priestia megaterium SBUG 518 with regard to structure of transformation products and bacterial physiology. Biotransformation reactions by P. megaterium involved (A) the hydroxylation of the isobutyl side chain at two positions, and (B) conjugate formation via esterification with a sugar molecule of the carboxylic group of ibuprofen and an ibuprofen hydroxylation product. Glycosylation seems to be a detoxification process, since the ibuprofen conjugate (ibuprofen pyranoside) was considerably less toxic than the parent compound to P. megaterium SBUG 518. Based on proteome profile changes and inhibition assays, cytochrome P450 systems are likely crucial for ibuprofen transformation in P. megaterium SBUG 518. The toxic effect of ibuprofen appears to be caused by interference of the drug with different physiological pathways, including especially sporulation, as well as amino acid and fatty acid metabolism. ImportanceIbuprofen is a highly consumed drug, and, as it reaches the environment in high quantities, also an environmental pollutant. It is therefore of great interest how microorganisms transform this drug and react to it. Here, we screened several bacteria for their ability to transform ibuprofen. Priestia megaterium SBUG 518 emerged as highly capable and was therefore studied in greater detail. We show that P. megaterium transforms ibuprofen via two main pathways, hydrolyzation and reversible conjugation. These pathways bear resemblance to those in humans. Ibuprofen likely impacts the physiology of P. megaterium on several levels, including spore formation. Taken together, P. megaterium SBUG 518 is well suited as a model organism to study bacterial ibuprofen metabolism.

著者: Tjorven Hinzke, R. Schlüter, A. Mikolasch, D. Zühlke, P. Müller, K. Riedel, M. Lalk, D. Becher, H. Sheikany, F. Schauer

最終更新: 2024-03-19 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585558

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585558.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

著者たちからもっと読む

類似の記事