新しいイメージング技術がD. radioduransの秘密を明らかにしたよ
研究者たちは、液体相電子顕微鏡を使って強靭なバイ菌を調べてる。
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目次
液相電子顕微鏡(LP-EM)は、液体環境の中で細胞の内部の小さな構造を研究するための最近の貴重な方法だよ。この方法のおかげで、科学者たちはナノメートルレベルのものを見ることができて、これは生物材料が自然な状態でどう機能するかを理解するのにめっちゃ重要。LP-EMはバッテリーや金属の研究にも特に役立ってるけど、生物学の分野にも広がってきていて、研究者たちはタンパク質や細菌、高等生物の細胞まで調べられるようになったんだ。
イメージング技術の重要性
生物サンプルを見るための従来の方法は、サンプルがすごく薄くないといけなくて、これが細胞を傷つけたり構造を変えたりすることがあるんだ。多くの細胞はこれらの方法で扱える以上に厚いから、これは結構な課題。よく使われるイメージング技術には明視野透過電子顕微鏡(BF-TEM)と環状暗視野スキャン透過電子顕微鏡(ADF-STEM)がある。BF-TEMは薄いサンプルにはいいけど、ほとんどの細菌や人間の細胞のような厚いものには苦戦する。ADF-STEMは厚いサンプルのクリアな画像が得られるけど、最高の結果を得るためにはイメージング条件のバランスが大事なんだ。
イメージングにおける材料の役割
LP-EMではしばしば特別なホルダーを使ってサンプルを固定するんだけど、これが時には追加の厚みを生んで、細胞の内部を見るのが難しくなることがあるんだ。グラフェン液体セルはこれらの問題を軽減する新しいタイプのホルダーで、サンプルを包み込む非常に薄いグラフェンの層からできてる。このセットアップは、イメージングに使う電子ビームとの干渉を減らすから、より良い画像を得られるんだ。
生物モデルの選択
生物サンプルを研究するとき、どの生物を選ぶかってめっちゃ重要。面白い生物の一つはデイノコッカス・ラジオデュランスで、放射線や他の環境ストレスに対する抵抗力で知られてる細菌なんだ。この細菌は、大抵の他の生物が死んじゃうような極限状態でも生き残れるんだ。D.ラジオデュランスがどうやってそういう条件で生き残るのかを理解することで、科学者たちはその細胞構造や機能について洞察を得られるんだ。
サンプル準備の方法
D.ラジオデュランスを研究するために、研究者たちは細菌をグラフェンの層で包み込むんだ。この技術でサンプルは水分を保ちながら高解像度のイメージングができるようになる。封入後、科学者たちは顕微鏡で細菌を観察して、成長や構造を確認できる。成長段階によって、どうやって群れを作るかを見ることができるんだ。
細菌の成長を観察
D.ラジオデュランスが良い環境にいると、成長して分裂し、四つのクラスターであるテトラッドを形成するんだ。このクラスターは条件によって形が変わることもあるよ。食べ物が不足すると、細菌は異なる形になることがある。封入って研究者がこれらの変化をはっきり見るのを助けるんだ。
D.ラジオデュランスの構造的特徴
先進的なイメージング技術を使って、研究者たちはD.ラジオデュランス内部のさまざまな特徴を見えるようにしている。例えば、細菌の膜の間のスペースを測定できるんだ。細胞の各層には特定の厚さがあって、これらの寸法を理解することが細菌がどうやって構造を維持しているかを学ぶのに役立つ。また、栄養を保存するための貯蔵顆粒も見えるんだ。
細菌に適用されるイメージング技術
これらの細菌をイメージングする過程で、科学者たちは細胞分裂のさまざまな段階や細胞同士のコミュニケーションを観察できる。例えば、研究者たちは細胞がどう分裂し、近くの細胞とどうつながるかを見ることができるんだ。この情報は、細菌の集団がどう機能し、相互作用するかを理解するのにめっちゃ重要。
細胞内の元素分布
LP-EM技術を使えば、科学者たちは細胞の元素構成を調べることもできる。エネルギー分散型X線分光法(EDX)を使って、特定の元素、例えば硫黄やマンガンが細菌内のどこにあるかをマッピングできるんだ。この分析によると、D.ラジオデュランスは生存や放射線からのダメージからの保護に関わるかなりの量の硫黄を持っていることがわかってるんだ。
ストレスが細菌に与える影響
D.ラジオデュランスがストレスにどう反応するかを理解するのは重要。例えば、これらの細菌が真空条件にさらされると、膜が分離して亀裂ができることがある。これらの亀裂を使って、研究者たちはサンプルがどう封入されているかを評価し、厳しい条件下での構造維持を調べることができるんだ。
栄養制限と細胞の形
食べ物が限られると、D.ラジオデュランスは形が変わって、テトラッドの代わりにモナドやダイアドのような異なる形になるんだ。この変化は、細菌が環境に適応できることを示唆していて、細胞間のコミュニケーションも示唆してる。こうした変化を観察することで、研究者たちは細菌が周囲にどう反応するかを理解できるんだ。
LP-EM技術を使うメリット
LP-EM技術の使用にはいくつかの利点があるんだ。細胞を自然な状態で撮影できるから、構造を変えちゃうような有害な化学物質が必要ないんだ。グラフェン液体セルはサンプルを収める実用的な方法を提供し、画像のクリアさも向上させる。この新しいイメージングの方法で、科学者たちは細胞の動態や行動に関する重要な質問に答えることができるんだ。
研究の今後の方向性
LP-EMの研究から得られた結果は、生物学の根本的な質問を探る新しい機会を開くよ。細胞が異なるストレスの下でどう振る舞うか、栄養をどう保存するか、構造をどう保つかを理解することは、科学にとって大きな意味を持つかもしれない。また、タンパク質や他の細胞成分をリアルタイムで視覚化できる能力は、細胞生物学の新しい発見につながるエキサイティングな進展なんだ。
要するに、LP-EM技術は科学者たちが細胞レベルでの生命の複雑な詳細を観察するための新しいレンズを提供するんだ。D.ラジオデュランスのような生物を研究することで、研究者たちは生存メカニズムや細胞間の相互作用について洞察を得られて、微生物学や医学、材料科学などのさまざまな分野での進展への道を切り開いてる。イメージング技術やサンプル準備の進展が続けば、天然条件での生物プロセスの理解がさらに深まっていくよ。
タイトル: Liquid phase electron microscopy of bacterial ultrastructure
概要: Recent advances in liquid phase scanning transmission electron microscopy (LP-STEM) have enabled the study of dynamic biological processes at nanometre resolutions, paving the way for live-cell imaging using electron microscopy. However, this technique is often hampered by the inherent thickness of whole cell samples and damage from electron beam irradiation. These restrictions degrade image quality and resolution, impeding biological interpretation. Here we detail the use of graphene encapsulation, STEM, and energy-dispersive X-ray (EDX) spectroscopy methods to mitigate these issues, providing unprecedented levels of intracellular detail in aqueous specimens. This work demonstrates the potential of LP-STEM to examine and identify internal cellular structures in thick biological samples, in a radiation resistant, gram-positive bacterium, Deinococcus radiodurans using a variety of imaging techniques.
著者: Brian J Caffrey, A. Pedrazo-Tardajos, E. Liberti, B. Gaunt, J. S. Kim, A. I. Kirkland
最終更新: 2024-03-27 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.27.580996
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.27.580996.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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