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癌における突然変異:課題と革新

がん細胞の遺伝子の変化が治療の効果にどう影響するかを探る。

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目次

私たちの体の細胞は、遺伝的な変化を受け継ぐこともあれば、獲得することもあるんだ。がん細胞の場合、これらの変化がもっと頻繁に起こるんだよ。がん細胞には、健康な細胞には存在しない多くの変異が見られることが多いんだ。こうした変異は、がん細胞を治療に対して抵抗力を持たせることがあって、薬の効果に影響を与える。

がんにおける変異の役割

COSMICという大きなデータベースが、がんに特有のこれらの変異を追跡しているんだ。そこには、たくさんのがんサンプルから記録された何百万もの変異が含まれている。平均して、各サンプルには約15種類の異なる変異があるんだ。これらの変異は、薬がターゲットと結びつくのを妨げて、治療が失敗することにつながることがある。例えば、EGFRっていう遺伝子の特定の変異は、セツキシマブやゲフィチニブといった特定のがん薬に対する抵抗と関連しているんだ。同様に、他の変異もトラスツズマブのような薬に対してがん細胞を抵抗させることがある。

研究によると、がん患者のほぼ半分は、治療を始める前から抵抗があるかもしれないって言われている。この抵抗は、しばしば新しい薬が開発されるときに見落とされる遺伝的変異に関連しているんだ。だから、多くの薬は、これらの変異のせいで効果が大幅に減少してしまうんだ。

変異が薬の結合に与える影響

変異は、薬がターゲットとするべきタンパク質の形や構成を変えることがあるんだ。これにより、主に3つの問題が起こる:

  1. 立体障害:タンパク質の形が変わって、薬が結びつくのを物理的に妨げる。
  2. 立体構造の変化:タンパク質の形の変化が、薬の結合に影響を及ぼすことがある。
  3. 結合親和性の低下:変異が、薬とそのターゲットとの結びつきを弱めて、薬の効果を下げることがある。

解決策として、研究者たちは、複数のバリエーションに結びつくことができる薬をデザインすることを提案しているんだ。このアプローチにより、異なる変異にわたって効果的な治療が可能になるんだ。

マルチ特異性抗体の可能性

抗体は、私たちの体が感染症と戦うためにproducedするタンパク質なんだ。今では、がん治療として機能するように設計されているんだよ。これらのタンパク質は、ターゲットにしっかりと結びつく能力や、体内での長寿命が知られていて、がんに対しての効果を高めるために徐々に改良されているんだ。

新しいアイデアとして、「二重特異性」抗体を作成して、1つの抗体で複数の種類のがんタンパク質をターゲットにすることが考えられているんだ。これには、正常ながんタンパク質と変異したバージョンの両方をターゲットにすることが含まれるんだ。こうしたアプローチは、抗体がウイルスの複数の株に結びつく治療などで期待が持たれている。

でも、がんの場合、異なる変異がタンパク質の重要な部分を変えることがあるから、ユニバーサル抗体を作るには、これらの変化にも関わらず、効果的に結びつけることを確保するために慎重な設計が必要なんだ。

HER2とがんの役割

HER2は、変異すると攻撃的ながんのタイプにつながる遺伝子なんだ。特に乳がんや胃がんで重要なんだけど、乳がんの約15〜30%のケースでHER2の過剰発現が見られて、約4%の患者が治療を難しくするこの遺伝子の変異を持っているんだ。これらの変異は、治療の前または治療中に現れることがあって、患者のケアをさらに複雑にするんだ。

現在、HER2をターゲットにしたいくつかの承認された抗体があるけど、変異を持つ一部の患者はこれらの治療に対して抵抗を示しているんだ。研究者たちは、これらの変異、特にS310FやS310Yを解析していて、これが著名なHER2ターゲティング薬であるペルツズマブに対する抵抗を提供しているようなんだ。

より良い抗体の設計

最近の研究では、変異に対して効果的な抗体を修正することに焦点が当てられているんだ。コンピュータ技術を用いて、科学者たちは標準的なHER2と結びつく能力を保ちながら、変異型にも結びつく抗体をデザインしているんだ。

設計プロセスには、HER2タンパク質と相互作用する抗体の重要な部位を特定することが含まれている。その部位が特定されたら、研究者たちはその部分に具体的な変更を加えて抗体の結合能力を向上させるんだ。この設計アプローチは、さまざまな変異を持つ広範な患者に対して効果がある抗体を作成するのに役立つんだ。

マルチ特異性抗体の工学

効果的なマルチ特異性抗体を作成するプロセスには、いくつかのステップがあるんだ。最初に、研究者は抗体のバリエーションライブラリをデザインして、その結合能力をテストするんだ。このライブラリには、変異を持つがんタンパク質に対して特異性を高めた可能性がある数多くの改変された抗体が含まれているんだ。

この多様なライブラリを生成した後、変異したHER2と通常のバージョンの両方に結合する可能性がある抗体候補を選ぶんだ。いくつかの選択ラウンドを経て、最も良い候補を絞り込むんだ。この反復的な設計と選択のプロセスにより、複数のがん変異に効果的に対処できる抗体を特定できるんだ。

テストと結果

有望な候補が特定されたら、それぞれの抗体を厳密にテストして、ターゲットタンパク質にどれだけうまく結びつくかを確認するんだ。これらのテストでは、しばしば特定のアッセイを使って結合強度を測定するんだ。結果は、いくつかの修正された抗体が、以前に抵抗を引き起こした変異が存在しても結びつけることができることを示しているんだ。

さらに分析プロセスが、これらの修正された抗体が細胞環境でどのように機能するかを調べるんだ。研究者たちは、がん細胞の挙動、特にがんの成長を促進する重要なシグナル経路に関連する点で、こうした抗体がどのように影響を与えるかを観察できるんだ。

がん治療への影響

マルチ特異性抗体の開発は、がん治療に重大な意味を持っているんだ。これは、患者ごとに特注の治療が必要なく、さまざまな変異に対して効果的な単一の治療薬を使用する可能性を開くんだ。これにより、新しい薬の開発にかかる時間、コスト、努力を節約できるかもしれない。

さらに、患者集団における潜在的な変異を早期に考慮することが、薬の開発プロセスを効率化するのに役立つかもしれない。広範な患者集団向けに予防的に薬を設計することが、成功した結果と高い治療指数をもたらす可能性がある。つまり、薬は効果的でありつつ、副作用を最小限に抑えることができるんだ。

結論

がんにおける変異が薬の反応にどのように影響するかを理解することは、治療結果を改善するために重要なんだ。マルチ特異性抗体を設計するという革新的なアプローチは、がん治療において、有効に薬の抵抗の課題に取り組むことを目指す有望な発展を示しているんだ。このアプローチは、幅広い患者に利益をもたらす可能性のある標的治療の作成を導くために、既存の遺伝データを利用する重要性を強調しているんだ。

研究が進むにつれて、これらの戦略が洗練され、がんの管理が改善され、最終的にはこの難しい病気に直面する患者の生存率が向上することを期待しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: Computational Engineering of a Therapeutic Antibody to Inhibit Multiple Mutants of HER2 Without Compromising Inhibition of the Canonical HER2

概要: Genomic germline and somatic variations may impact drug binding and even lead to resistance. However, designing a different drug for each mutant may not be feasible. In this study, we identified the most common cancer somatic mutations from the Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC) that occur in structurally characterized binding sites of approved therapeutic antibodies. We found two HER2 mutations, S310Y and S310F, that substantially compromise binding of Pertuzumab, a widely used therapeutics, and lead to drug resistance. To address these mutations, we designed a multi-specific version of Pertuzumab, that retains original function while also bindings these HER2 variants. This new antibody is stable and inhibits HER3 phosphorylation in a cell-based assay for all three variants, suggesting it can inhibit HER2-HER3 dimerization in patients with any of the variants. This study demonstrates how a small number of carefully selected mutations can add new specificities to an existing antibody without compromising its original function, creating a single therapeutic antibody that targets multiple common variants, making a drug that is not personalized yet its activity may be.

著者: Sapir Peled, J. Guez-Haddad, N. Zur Biton, G. Nimrod, S. Fischman, Y. Fastman, Y. Ofran

最終更新: 2024-03-29 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.21.550003

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.21.550003.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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