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生態系における遺伝的変化:アレルセイルアプローチ

遺伝的変化が保護活動や生態系の管理にどう役立つかを見てみよう。

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アレルセイル:新しい遺伝ツアレルセイル:新しい遺伝ツールる。エコシステムの問題に取り組む方法を革新す
目次

最近、病気を広げる昆虫や作物の喪失、有害な植物や動物、気候変動など、いろんな問題から生態系を改変する必要が高まってる。これらの問題に対処するための一つの方法は、全体の遺伝子構成を変えることだ。これには主に二つの方法があって、役立つ特性を導入する(個体群の改変)か、有害な種を取り除く(個体群の抑制)かだ。

例えば、絶滅危惧種に特性を追加して生存を助けたり、気候変動による将来の環境変化に備えさせるために変更を導入したりできる。研究によると、たった一つ、あるいは数個の遺伝子変化でも、いろんな種にとって大きな利益をもたらすことがある。一例として、熱に耐えるのを助ける遺伝子や、植物が真菌に抵抗するのを助ける遺伝子、さらにはミツバチが害虫と戦うのを助ける遺伝子などがある。遺伝子の改変は、昆虫が病気を広めにくくしたり、外来種をより害が少なくしたりするためにも使える。

遺伝子変化の仕組み

役立つ特性を個体群に広める一つの方法は、これらの特性を持つ個体を放つことだ。もし導入した遺伝子が自然選択によって好まれれば、世代を超えて広がることができるけど、この過程は利益の大きさや特性がどのように遺伝するかに応じて時間がかかることもある。何らかの理由で役立つ特性がすぐに広がらなかったり、有害な個体群を制御したい場合、大量に個体を導入する必要があるかもしれない。このアプローチは高くつくし、多くの種にとって実用的ではないことが多い。また、管理された繁殖や多くの個体を導入することは、他の有害な特性の存在を知らずに増やしてしまったり、対象種の遺伝的多様性を脅かす可能性もある。

この課題を解決するために、科学者たちは合成遺伝子ドライブを開発している。これらは個体群内で自らの広がりを速める特別な遺伝的要素だ。色々な遺伝子ドライブが作られているけど、その速さや持続性には規制や一般の受け入れに関する懸念がある。

遺伝子変化はより微妙なものでもあり、DNAの微細な編集が含まれることもある。一部の規制では、編集されたけど外来DNAを使っていないと考えられる遺伝子には厳しい監視がないこともある。これにより、規制の承認や公共の支持を得やすくなることがある。一つ提案されているシステムはアレルセイルと呼ばれ、遺伝子ドライブの複雑さなしに遺伝子編集を広めるのを助けることができる。

アレルセイルの理解

アレルセイルは、ゲノムエディターを使って遺伝物質に変化を作る。エディターは生殖細胞系で働くから、子孫に影響を与える。エディターによって行われた変化は、個体群を通じて急速に広がることができる。アレルセイルは単に既存の特性を複製するわけではなく、新しい変化を生み出す。

エディターは単純なメンデリ的な方式で遺伝するけど、彼が生み出した編集は個体群を通じて早く広がることができる。このアプローチは、既存の遺伝子の頻度を増やすだけの伝統的な方法とは異なる。

個体群の改変

アレルセイルシステムを使った個体群の改変を見ると、絶滅危惧種を安定化させたり、根本的に遺伝的多様性を変えることなく病気と戦ったりするのに非常に効果的だ。このシステムを使うことで、科学者たちはこれらの変化が時間とともに個体群にどのように影響するかを理解するのに役立つ。

これを研究するために、研究者たちはアレルセイルの挙動をシミュレーションするためにコンピューターモデルを使っている。これらのモデルは、遺伝子エディターを個体群に導入したときに何が起こるかを予測するのに役立つ。理想的な条件下では、編集が非常に効率的で個体群に利益をもたらすとき、アレルセイルは新しい特性が採用される速度を大いに高める。

シミュレーションは、エディターが効果的な場合、望ましい変化が急速に広がることを示している。しかし、これらの変化にコストが伴う場合、科学者たちはアレル頻度の潜在的な低下を考慮する必要がある。フィットネスの利益や喪失などが、世代を超えてこれらの変化にどのように影響するかを形作るからだ。

編集ダイナミクスに影響を与える要因

遺伝子変化を導入する際の重要な側面の一つは、編集の効率が特性の広がりにどのように影響するかを理解することだ。高い編集効率が理想だけど、成功する編集の割合が低いと、望ましい変化の広がりが遅くなることがある。

研究によると、たとえ低い編集効率でも、特性は従来の方法よりもかなり早く広がることができる。しかし、エディターが行った編集と密接に関連している場合、時には有益な特性の広がりに制限をかけることがある。

アレルセイルを使った個体群の抑制

アレルセイルを使うもう一つの重要な側面は、個体群の抑制だ。特定の遺伝子が性を決定する種をターゲットにする一例がある。特定の種では、この遺伝子を失うことでメスがオスに変わり、性比が劇的にシフトする。

アレルセイルエディターを使って重要な遺伝子を取り除く際、研究者たちはこれが個体群を不均衡な性比に向かわせるのにどれほど効果的かをテストしている。初期の結果は、このエディターの控えめな導入が、特に特定の性決定システムを持つ種で時間とともに数を劇的に減少させる可能性があることを示している。

アレルセイルの抑制戦略を、メスの子孫に害を与えるオスを放つなどの他の方法と比較すると、エディターはより効果的であることが多い。しかし、導入した遺伝子が望ましくない変異を生成したり、頻繁すぎると効果を失うことがある。

アレルセイルの単回・複数回の放出

アレルセイルの単回と複数回の放出がどう影響するかが研究の焦点になっている。エディターを一度放出すると、時間が経つにつれて個体群のサイズが大幅に減少するが、繰り返し導入すると、より迅速な減少が見られる。減少の程度は、導入の頻度や種の特定の性決定メカニズムに依存することが多い。

シミュレーションを行った研究者たちは、一貫したエディターの放出が他の方法に比べて個体群の崩壊を早めることを見つけている。例えば、放出が定期的に行われれば、たとえ低い頻度であっても短期間でかなりの減少を引き起こすことがある。

また、アレルセイルを他の戦略、例えば性転換とともに不妊を誘導することと組み合わせると、さらに迅速な個体群の崩壊につながることがある。

編集における連鎖の役割

エディターと行われた編集との関係も重要な要素だ。エディターとターゲット編集が遺伝的に密接に関連している場合、それらの変化を効果的に広げる能力が制限されることがある。より緩やかに結びついている状況では、柔軟性が高まり、編集の広がりが良くなる傾向がある。

性決定の変化の例

アレルセイルを使った際の顕著な発見の一つは、性決定に対する潜在的な影響だ。雌の生存に重要な遺伝子に影響を与える遺伝子変化を導入することで、科学者たちは個体群の性決定システムを変える可能性がある。

ある研究では、特定の編集の導入が個体群の性決定機構に急速なシフトをもたらした。これらのシフトの結果を分析する際、研究者たちは性決定が導入した編集の状態に基づいて行われる可能性があることを見つけ、時間とともに全く異なる性システムで構成される個体群につながることがわかった。

アレルセイルの潜在的な応用

アレルセイルの多様性は、保全活動や外来種の管理にさまざまな応用を開く。

絶滅危惧種の保護

絶滅危惧種には、アレルセイルを使って遺伝的多様性を迅速に向上させることができる。他の個体群から有益な特性を導入することで、苦境にある種の生存を強化できるかもしれない。

将来の環境変化に備える

もう一つの重要な応用は、環境の変化が予測される場合にある。こうしたケースでは、科学者たちは将来の脅威を予測し、次の段階で有益な遺伝子を事前に導入できる。

外来種への対処

外来種に対して、アレルセイルはその有害な影響を軽減する手助けができる。外来種を遺伝子改変して毒素の生産を減らしたり、害を少なくすることで、地元の野生生物がよりよく生き残れるようにする。

結論

アレルセイルの使用は、保全や生態系の問題解決を目指した遺伝子工学のエキサイティングな進展を代表している。迅速かつ効果的な個体群の改変を可能にすることで、気候変動や外来種、絶滅危惧種から生じる課題に対処する新たな方法を提供している。これらのシステムがどのように機能し、その広範な影響を理解することは、私たちが変化する自然の複雑さを乗り越え続ける上で重要になってくる。

オリジナルソース

タイトル: Allele Sails: launching traits and fates into wild populations with DNA sequence modifiers

概要: Population-scale genome editing can be used to alter the composition or fate of wild populations. One approach to achieving these aims utilizes a synthetic gene drive element--a multi-gene cassette--to bring about an increase in the frequency of an existing allele. However, the use of gene drives is complicated by the multiple scientific, regulatory, and social issues associated with transgene persistence and gene flow. Alternatives in which transgenes are not driven could potentially avoid some of these issues. Here we propose an approach to population scale gene editing using a system we refer to as an Allele Sail. An Allele Sail consists of a genome editor (the Wind) that introduces DNA sequence edits (the Sail) at one or more sites, resulting in progeny that are viable and fertile. The editor, such as a sequence-specific nuclease, or a prime- or base-editor, is inherited in a Mendelian fashion. Meanwhile, the edits it creates experience an arithmetic, Super-Mendelian increase in frequency. We explore this system using agent-based modeling, and identify contexts in which a single, low frequency release of an editor brings edits to a very high frequency. We also identify conditions in which manipulation of sex determination can be used to bring about population suppression. Current regulatory frameworks often distinguish between transgenics as genetically modified organisms (GMOs), and their edited non-transgenic progeny as non-GMO. In this context an Allele Sail provides a path to alter traits and fates of wild populations in ways that may be considered more acceptable.

著者: Maciej Maselko, M. L. Johnson, B. Hay

最終更新: 2024-04-10 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585647

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585647.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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