脳機能における環状RNAの役割
circRNAは、遺伝子の調節や脳のシナプス発達に重要だよ。
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目次
ノンコーディングRNA(ncRNA)は、脳内の遺伝子調節において重要な役割を果たしてる。プロテインは生成しないけど、遺伝子の調節には大事な機能があるんだ。その中でも、最近注目されてるのが円環RNA(circRNA)で、ユニークな構造があるのが特徴。通常のRNAとは違って、両端が開いてるんじゃなくて、円環を形成してて、これが安定性を持たせ、分解に強い。安定性は、前駆体mRNAの一部が円環状につながる「バックスプライシング」というプロセスから来てる。
循環RNAと脳
circRNAは脳内のいろんな形で見つかってて、特にニューロンに豊富に存在すると思われてる。脳の発達中に多く見られるし、神経接続やシナプスを担うエリアにクラスターすることが多い。一部のcircRNAは、シナプス機能に関与する遺伝子から派生してるから、ニューロン間の接続を作り強化するのに関わってる可能性がある。
研究では、circRNAのレベルがニューロンの活動に基づいて変化することが示されてて、ニューロンがどう適応し、新たな接続を形成するのかに関与してることを示唆してる。しかし、哺乳類のニューロンに見つかった何百ものcircRNAのほとんどは、まだ詳しく調査されてないんだ。
循環RNAとその機能
最も研究されてるcircRNAの一つはCdr1-asって呼ばれてる。これはmiR-7というマイクロRNAと結合することで知られてる。Cdr1-asがmiR-7の活性を調節できることで、シナプス伝達や統合失調症のような障害に関連する行動に関与してるんだ。Cdr1-asの喪失はmiR-7を不安定にし、ニューロン間のコミュニケーションに変化をもたらすことが示されてる。さらに、Cdr1-asの局所的な活動は、恐怖メモリーの消去のようなプロセスに必要なんだ。
他にもいくつかのcircRNAがシナプスや認知機能の調節に関与してることが示されてる。これらの発見は、circRNAがニューロンが接続を作り強化する上で重要な役割を果たす可能性を示唆してる。
病気におけるcircRNAの役割
最近の研究では、さまざまな神経疾患や精神的障害とcircRNAが関連付けられてる。例えば、特定のcircRNAであるcircIgfbp2は、外傷性脳損傷後に活性化される。このcircRNAは、脳に関連する多くの問題にリンクしてるミトコンドリアの機能不全と戦うのを助けるみたい。もう一つのcircRNAであるcircHomer1は、双極性障害や統合失調症の人々の脳で減少してることがわかってる。circHomer1の減少は、認知的柔軟性の問題と相関してる。
circRNAはアルツハイマー病やハンチントン病のような状態でも異なるレベルで見られる。これはcircRNAがこれらの病気のプロセスに関与してる可能性を示唆してる。
circRNAの風景を特定する
circRNAをさらに研究するために、研究者たちはラットの海馬ニューロンを使って、ニューロンの本体を軸索と樹状突起から分離できるようにした。この分離によって、ニューロンの異なる部分にどのcircRNAが存在するのかがよりよく理解できた。
過去の実験のデータを分析した結果、1000以上のユニークなcircRNAが特定された。その中の多くは、ニューロンの本体よりもその伸びた部分に多く存在してた。これはcircRNAがシナプス形成の際に局所的な遺伝子発現を調節する特化した役割を持っている可能性を示唆してる。
circRNAの機能を調査する
研究者たちは、シナプス発達に重要なcircRNAを特定することに焦点を当てた。彼らは、神経の伸びた部分で高く発現していて、他の種でも重要な存在感があるcircRNAを調べた。リストを絞った後、いくつかの候補を選んでさらにテストすることにした。
RNA干渉(RNAi)と呼ばれる技術を使って、特定のcircRNAをノックダウンしてシナプス形成と機能にどんな影響があるかを見てみた。結果は、いくつかのcircRNAがシナプスや樹状突起スパインの形成を抑制していることを示した。
特定のcircRNAがシナプスに与える影響
研究されたcircRNAの中で、circPhf21aとcircREREが特に目立った。これらをノックダウンすると、シナプス密度が増えたことから、これらが通常シナプス形成のブレーキとして働いていることが示唆される。これはシナプスの形成やタイミングを調節するcircRNAの複雑な役割を明らかにするものだ。
circREREをノックダウンすると、形成されたシナプスの数が増えたばかりか、その機能にも影響が出た。ミニチュア興奮性シナプス後電流の頻度の低下が見られ、より多くのシナプスが形成されたけど、多くは積極的にコミュニケーションを取っていないことを示してる。これはcircREREが新しいシナプスの創出を抑制しつつ、既存のものが適切に成熟することを確保している可能性を示唆してる。
circREREの作用機序
circREREがシナプス形成に与える影響を解明するために、研究者たちは既知のシナプス調整者であるmiR-128-3pとの関係を調べた。どうやらcircREREはmiR-128-3pの安定性を助けていて、分解を防いでいるみたい。circREREがノックダウンされると、miR-128-3pのレベルが低下し、シナプス形成を促進する遺伝子の発現が増える。
さらに分析すると、miR-128-3pはシナプス機能に関連する多くの遺伝子を標的にしていることがわかった。circREREの喪失はこれらの遺伝子の抑制を減少させ、それが新しいが機能しないシナプスの形成に寄与する可能性がある。
circREREと神経生理学
circREREの存在は、ニューロン全体の健康や機能にも影響を与えているみたい。例えば、circREREがノックダウンされたとき、多くのシナプスに関連する遺伝子がオンになって、circREREがシナプスのバランスを維持する明確な経路が示された。
研究者たちは、circREREとその役割が脳において種を超えて共通のパターンがあることも見つけた。ラットとヒトの神経系の間でcircREREとmiR-128-3pの間に類似の相互作用が認められた。
神経発達障害への関連
circREREの神経発達障害との関連は興味深い質問を投げかける。RERE遺伝子の変異は、発達の遅れや自閉症に関連づけられている。miR-128-3pのレベルを保持する上でのcircREREの役割は、特に発達の重要な時期において神経回路の健康に大きな要因になる可能性がある。
circRNAはニューロン機能の調節に特定の役割を持っていると思われ、その発現における混乱がさまざまな障害に寄与するかもしれない。circREREや同様のRNAタイプが脳でどのように機能するかを理解することで、神経発達条件の治療や予防に関する新たな洞察が得られるかもしれない。
circRNA研究の影響
circRNAとその脳内での機能に関する発見は、新たな探求の道を開いている。circREREのような循環RNAは、シナプス形成や機能の理解に大きな影響を与えるだろう。この知識が神経疾患や精神障害に対する治療法の新しい戦略につながる可能性がある。
circRNAの理解を深めることで、神経回路がどのように適応し、変化していくのかについての知識も高まるだろう。研究が進むにつれて、さらに多くのcircRNAが特定され、特定の神経プロセスにおける役割が明確になっていくはずだ。
結論
circRNA、特にcircREREは、脳内のシナプス形成や機能を調節する上で重要な役割を果たしている。miR-128-3pとの相互作用は、シナプスの発達と成熟をバランスさせる複雑なメカニズムを示唆してる。
この研究は、ニューロンの健康や病気におけるcircRNAの重要性を強調してる。科学者たちが脳の謎を解き明かし続ける中で、circRNAはきっと重要な焦点エリアになり、日常の認知プロセスや深刻な神経疾患に関する新たな洞察を提供するだろう。神経科学の未来は、これらの魅力的な分子の複雑さを解き明かすことにかかってるかもしれない。
タイトル: A functional screen uncovers circular RNAs regulating excitatory synaptogenesis in hippocampal neurons
概要: Circular RNAs (circRNAs) are an expanding class of largely unexplored RNAs which are prominently enriched in the mammalian brain. Here, we systematically interrogated their role in excitatory synaptogenesis of rat hippocampal neurons using RNA interference. Thereby, we identified seven circRNAs as negative regulators of excitatory synapse formation, many of which contain high-affinity microRNA binding sites. Knockdown of one of these candidates, circRERE, surprisingly promoted the formation of electrophysiologically silent synapses. Mechanistically, circRERE knockdown resulted in a preferential upregulation of synaptic mRNAs containing binding sites for miR-128-3p because of a reduced protective interaction between miR-128-3p and circRERE. Accordingly, overexpression of circRERE rescued exaggerated synapse formation upon circRERE knockdown in a miR-128-3p binding site-specific manner. Overall, our results uncover circRERE-mediated stabilization of miR-128-3p as a novel mechanism to restrict the formation of silent excitatory synaptic co-clusters and more generally implicate circRNA-dependent microRNA regulation in the control of synapse development and function.
著者: Gerhard Schratt, D. Kelly, S. Bicker, J. Winterer, P. Nanda, P.-L. Germain, C. Dieterich
最終更新: 2024-04-11 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.09.588686
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.09.588686.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。
参照リンク
- https://gene.sfari.org/
- https://github.com/dieterich-lab/DCC
- https://github.com/dieterich-lab/CircTest
- https://www.thermofisher.com/order/custom-genomic-products/tools/sirna/
- https://github.com/dcolam/Cluster-Analysis-Plugin
- https://imagej.net/software/fiji/downloads.Transfected
- https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/topGO.html
- https://ethz-ins.org/scanMiR/
- https://ethz-ins.org/enrichMiR/