α-シヌクレイノパチーの新しい洞察:遺伝子活性の変化
研究によると、α-シヌクレインに関連する脳の病気で遺伝子発現の違いが見つかったんだ。
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αシヌクレイノパチーは、脳の障害のグループで、時間が経つにつれて悪化し、重大な障害を引き起こし、現在は治療法がないんだ。これらの障害の中で最もよく知られているのは、パーキンソン病、レビー小体型認知症、そして多系統萎縮症。これらの障害の重要な特徴の一つは、脳細胞内に異常なαシヌクレインというタンパク質の塊が存在することだ。この塊は、これらの病気で発生する脳の損傷に関与していると考えられている。
パーキンソン病やレビー小体型認知症では、これらの塊は主に神経細胞に見られる。レビー小体とレビー神経突起という構造を形成してる。一方で、多系統萎縮症では、これらの塊は主にオリゴデンドロサイトという脳の別の細胞タイプに影響を与える。αシヌクレインは、パーキンソン病や関連障害のほとんどの患者に一貫して見られるけど、LRRK2遺伝子の変異によって引き起こされるような他の遺伝的なパーキンソン病の形では常に存在するわけじゃない。
現在、これらの障害の進行を遅らせる効果的な治療法はなく、研究試験はしばしば期待外れの結果を出すことが多い。この成功の欠如は、これらの状態での神経細胞の損傷と死に至るメカニズムについての知識が不足していることに起因している。
トランスクリプトミクス研究の役割
最近のαシヌクレイノパチーを持つ人々の脳組織の研究の進展は、病気に関連して遺伝子の活動がどのように変化するかに新しい洞察を提供できるかもしれない。ただ、以前の研究では遺伝子レベルでの不一致が示され、生物学的経路のレベルでの一致は部分的だった。この不一致は、細胞の喪失やグリア細胞の増殖によって変化するサンプル内の脳細胞の種類の違いに起因していることが多いんだ。
シングルヌクレオプルRNAシーケンシングは、これらの制限を解決できる有益な技術として浮上してきた。この方法では、異なる脳細胞タイプ特有の遺伝子活動の変化を研究者が見ることができる。パーキンソン病の脳サンプルを用いた初期の研究は、個々の細胞の遺伝子活動に関する貴重な情報を得た。
病気の影響が少ない特定の脳領域を研究することで、早期の細胞機能障害に至るプロセスについての明確な洞察が得られるかもしれない。研究によれば、極端な変性が見られない前頭前皮質が、研究する際に有益なエリアになるかもしれない。
研究の概要とデザイン
この研究では、研究者たちはシングルヌクレオプルRNAシーケンシングを用いて、特発性パーキンソン病、LRRK2関連パーキンソン病、多系統萎縮症の患者の前頭前皮質を分析した。これらの結果を、年齢と性別が似た神経学的に健康な個体のサンプルと比較した。
299,000を超える高品質な核のデータを収集し、興奮性神経細胞、抑制性神経細胞、オリゴデンドロサイト、星状膠細胞、内皮細胞、ミクログリアなどのさまざまな細胞タイプを含めた。彼らの分析は、異なる病気の患者と健康な対照者の間での細胞の違いを特定した。
細胞組成と遺伝子発現に関する主要な発見
研究者たちは、前頭前皮質の脳細胞の組成が、健康な対照と比較して3つの病気グループすべてで変化していることを発見した。特発性パーキンソン病と多系統萎縮症では、神経細胞の数が減少し、グリア細胞の個体数が増加するという一般的な傾向が見られたが、多系統萎縮症の特定のグリア細胞を除いて。
組織全体の分析で見られたこの違いにもかかわらず、シングルヌクレオプルシーケンシングでは、個々の細胞を詳しく見るとさまざまな細胞タイプの割合に重大な変化は見られなかった。興味深いことに、研究者たちは病気のサンプルで捕捉された神経細胞の数がわずかに増加しているのを見て、細胞の喪失の予想結果に矛盾する結果が得られた。
研究者たちが遺伝子発現を詳しく調べると、多くの神経細胞で特発性およびLRRK2関連パーキンソン病において発現している遺伝子の数が全体的に減少していることがわかった。一方、グリア細胞はほとんどが発現する遺伝子の数が増加しており、病気の背景でそれらの細胞の活動レベルが高いことを示している。
病気に関連する特定の遺伝子変化
研究チームは、各タイプの細胞クラスターで有意に発現した特定の遺伝子を特定し、パーキンソン病のさまざまな形や多系統萎縮症における遺伝子活動の違いを明らかにした。特発性パーキンソン病のために272のユニークな遺伝子が、LRRK2関連パーキンソン病には54、そして多系統萎縮症には125が特定された。
特に注目すべきは、特発性およびLRRK2関連パーキンソン病の神経細胞が遺伝子発現の一貫したダウンレギュレーションを示し、多系統萎縮症では神経細胞の外層に位置する細胞での遺伝子活動の増加という独特のパターンが見られた。この遺伝子発現の変動は、各病気が特定の脳領域や細胞タイプにどのように異なる影響を及ぼすかを浮き彫りにしている。
PDE10Aの重要性
分析の中で際立っていた遺伝子はPDE10Aで、特発性およびLRRK2関連パーキンソン病のさまざまな神経細胞タイプでダウンレギュレーションされていることが確認された。研究者たちはこの結果を免疫組織化学染色で確認し、健康な対照と比較して影響を受けた神経細胞のPDE10Aタンパク質の活動が減少していることを示した。
PDE10Aは細胞内のシグナル伝達プロセスを調整する重要な役割を果たしていて、運動制御とも関連がある。このダウンレギュレーションは、ドーパミン作動性シグナル伝達を超えた影響があるかもしれないことを示唆し、皮質機能や病気における広範な役割があることを示している。
グリア細胞の遺伝子発現変化
研究では、グリア細胞内の遺伝子発現の変化も見つかった。多系統萎縮症では、オリゴデンドロサイトに複数の遺伝子で発現の変化が見られたが、パーキンソン病ではこれらの細胞での変化は少数だった。星状膠細胞は多系統萎縮症で三つの特定の遺伝子に変化が見られ、これらの病気におけるグリア細胞の役割が独特に影響を受けている可能性がある。
遺伝子変化の経路解析
研究者たちは、観察された遺伝子発現の変化によって影響を受けた生物学的プロセスを明らかにするために経路分析を行った。特発性パーキンソン病では、特に神経細胞クラスターにおいて、タンパク質合成に関連する経路のアップレギュレーションが見られた。一方、多系統萎縮症では同様の経路のダウンレギュレーションが示されていて、これらのタンパク質関連プロセスのバランスが2つの病気で異なる可能性を示唆している。
αシヌクレイン病理に関連する変化
分析の中で、研究者たちはLRRK2関連パーキンソン病におけるαシヌクレイン病理に特有の変化を探った。彼らは脳内にαシヌクレインの塊がある人とない人を比較した。その結果、病理を持つ人々において特定の遺伝子セットが差異的に発現していることが示され、これらの異常なタンパク質集合体に関連する特定の転写署名が浮き彫りになった。
特に、αシヌクレインタンパク質自体をコードするSNCA遺伝子の発現が病理を持つ神経細胞でアップレギュレーションされていることが分かった。これは、αシヌクレインの集合体の存在が対応する遺伝子の活動の増加と関連していることを示していて、病理への細胞の反応を強調している。
研究結果の意義
この研究の結果は、各タイプのαシヌクレイノパチーが独特のトランスクリプトミクス署名を持っていることを示している。特発性およびLRRK2関連パーキンソン病の遺伝子発現プロファイルはかなり似ていたが、多系統萎縮症のものは特に影響を受けた細胞タイプで重要な違いが見られた。
さらに、この研究は細胞特異的分析の重要性を強調している。差異的に発現した遺伝子のほとんどは特定の脳細胞タイプに固有のものであり、組織全体の分析では見逃される可能性がある。これにより、今後の研究はこれらの病気のメカニズムをよりよく理解するために個々の細胞タイプに焦点を当て続けるべきだということが示唆される。
結論
この研究は、異なるαシヌクレイノパチーにおける遺伝子発現と細胞タイプの関与の複雑な相互作用を明らかにしている。証拠は、これらの病気が神経細胞とグリア細胞に与える影響における重要な変動を指し示していて、病気の進行に寄与する基礎的なプロセスのより明確なイメージを提供している。特にαシヌクレインの堆積に関連する特定の遺伝子署名の存在は、今後の研究や治療開発のガイドになる可能性がある。
PDE10Aのような特定の遺伝子の機能や、これらの病気の病因における役割に関するさらなる調査は、新しい介入の道を提供するかもしれない。病気の状態に応じて遺伝子発現がどのように変化するかを理解することが、αシヌクレイノパチーの進行を遅らせたり変えたりする効果的な治療法の開発には不可欠だ。
タイトル: Single-nucleus transcriptomics reveals disease- and pathology-specific signatures in α-synucleinopathies
概要: -synucleinopathies are severe neurodegenerative disorders characterized by intracellular aggregation of -synuclein, yet their molecular pathogenesis remains unknow. Here, we explore cell-specific changes in gene expression across different -synucleinopathies. We perform single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) on nearly 300,000 nuclei from the prefrontal cortex of individuals with idiopathic Parkinsons disease (iPD), Parkinsons disease caused by LRRK2 mutations (LRRK2-PD), multiple system atrophy (MSA) and healthy controls. iPD and LRRK2-PD exhibit a largely overlapping cell type-specific signature, which is distinct from that of MSA, and includes an overall decrease of the transcriptional output in neurons. Notably, most of the differential expression signal in iPD and LRRK2-PD is concentrated in a specific deep cortical neuronal subtype expressing adrenoceptor alpha 2A. While most differentially expressed genes are highly cell type- and disease-specific, PDE10A is found consistently downregulated in most cortical neurons, and across all three diseases. Finally, exploiting the variable presence and/or severity of -synuclein pathology in LRRK2-PD and iPD, we identify cell type-specific signatures associated with -synuclein pathology, including a neuronal upregulation of the SNCA gene itself, encoding -synuclein. Our findings provide novel insights into the cell-specific transcriptional landscape of the -synucleinopathy spectrum.
著者: Gonzalo S Nido, M. Castelli, S. Mostafavi, O. Shadad, G. Alves, O.-B. Tysnes, C. Dölle, C. Tzoulis
最終更新: 2023-10-10 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.10.23296642
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.10.23296642.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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