脳内の機能的なコネクティビティの理解
脳の領域がどうつながってコミュニケーションするかの研究。
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脳はつながった多くの部分でできていて、これらの部分は一緒に働くんだ。これらの部分は信号を通じてコミュニケーションをとる。脳の異なる領域が互いに信号を送り合う方法は、私たちが物事を認識し、考え、行動する上で重要なんだ。この20年で、科学者たちはこれらの領域がどのように接続し、コミュニケーションをとっているのかを理解しようと集中してきた。彼らは「機能的接続性(FC)」というものを研究することでそれを行っている。
機能的接続性は、時間にわたる脳の活動パターンを見ている。科学者たちはこの活動をモニターして、異なる領域がどのように結びついているのかを見ている。FCを研究する最も一般的な方法は、安静時fMRIを使うことだ。この技術は、誰かがアクティブにタスクを行っていないときの脳を観察し、「内因的」機能的接続性を捉え、これは脳の自然な活動を反映していると考えられている。これらのパターンは整理されていて、個人ごとに一貫しており、脳の物理構造と関連付けられることができる。さらに、タスク中の人々の行動や思考にも関係している。
構造的接続性とは違って、-これは脳内の物理的接続を示すもの-機能的接続性は脳の領域が統計的にどのように相互作用するかにもっと焦点を当てている。FCを測定する方法に明確な「真実」がないため、研究者がどのようにそれを研究するかに依存することが多い。FCを測定する最もシンプルな方法はピアソンの相関法と呼ばれるものであるが、異なる相互作用を明らかにする可能性のある他の方法もたくさんある。
ペアワイズ統計の分析
私たちの研究では、さまざまな統計を使って安静時FCの特徴を見た。FCを研究するための方法の類似点と相違点を分析した。キーとなる脳の領域や、互いの距離、他の脳の領域との構造的なリンクのようなよく知られた特徴が、使われる方法によってどのように変化するかも調べた。
私たちは若い成人の大規模なサンプルを使って研究を行った。脳の活動を測定し、脳の領域がどのように相互作用するかを見るために239の異なるペアワイズ統計を計算した。FCを測定する異なる方法が異なるネットワークを生み出すことがわかり、私たちが見るものは使う方法によって大きく変わる可能性があることを示唆していた。
異なる方法の比較
異なる方法の統計的類似点を見たとき、重要な傾向が見えてきた。いくつかの統計は強い関係を示したが、他のものはそうではなかった。例えば、一般的に使われるピアソン相関法は、より複雑な方法と比較して明確な結果を出した。これは、異なるアプローチが脳の接続性の異なる側面を強調するかもしれないことを示している。
私たちはまた、FCマトリックスのトポロジー構造を調査した。一部の方法では、ハブと呼ばれる集中した領域が多くの接続が集まることが明らかになった。これらのハブの分布は使用する方法によって異なり、接続性を分析する方法が脳の構造と機能についての理解に影響を与えることを示している。
距離と接続性の関係
私たちが調査したもう一つの側面は、脳の領域間の関係が物理的な距離によってどのように変わるかだった。一般的に、近くにある領域は強い接続を持つ傾向があると理解されている。私たちの発見は、ほとんどの方法がこの考え方に合致している一方で、この関係の強さは大きく変わることを示した。いくつかの方法は弱い接続しか示さなかったので、脳の相互作用を測定し解釈する方法が私たちの結論に大きく影響を与える可能性があることを示唆している。
私たちはまた、構造的接続性が機能的接続性とどのように関連しているかを調べた。簡単に言うと、もし二つの領域が物理的に接続されている(回路内のワイヤーのように)、私たちはそれらがうまくコミュニケーションをとると期待する。しかし、ほとんどの方法がこの考え方を確認したものの、一致の度合いは異なった。いくつかの測定は、構造的および機能的な側面の間のより明確な接続を提供し、その効果を示している。
生物学的類似性と脳ネットワーク
私たちの研究では、異なる形式のFCが脳の領域間の実際の生物学的類似性とどのように関連しているかを調べるために調査を拡大した。遺伝子発現の類似性や神経伝達物質受容体の類似性など、さまざまな形式の領域間関係を調査した。この研究の部分は、FCの測定が生物学的特徴とどのように対応するかを理解し、結果をより意味のあるものにすることを目的としている。
いくつかのFC測定方法は、似た化学プロファイルを持つ領域との強い関係を示しており、これらの領域が互いの活動に影響を与える可能性があることを示唆していた。この関係は特に神経伝達物質受容体や電気活動パターンで顕著だった。しかし、いくつかの機能的活動と代謝接続性の間に強い接続が見つからなかったのは驚きだった。なぜなら、これらのプロセスは関係があるはずだからだ。
個人差と脳の行動
安静時FCを研究する一つの実用的な応用は、行動や認知における個人差を理解することだ。異なる統計的方法が脳の活動パターンに基づいて個人を特定し、認知行動を予測するのにどう役立つかを探った。私たちの発見は、ある方法は他の方法に比べて個人を特定するのに優れていることを示していて、これはメンタルヘルスを理解し、治療を個別化する上で重要な意味を持つかもしれない。
私たちの分析では、精度ベースの統計が個人を特定する上でしばしば他の方法を上回ることがわかった。これは、FCの計算方法によって、個人の脳がどのように構成され、機能しているかについてより信頼できる情報を提供できることを意味する。
また、どれだけこれらの方法が行動、認知パフォーマンスや物質使用を予測できるかを調査した。個人を指紋識別するのに最も効果的な方法は、行動を予測するのにも優れていることが多かった。これは、脳接続性を正確に測定することが、個人がどのように考え、行動するかを理解し、予測する助けになる可能性があることを示唆している。
情報フローパターン
私たちはまた、異なる統計が脳内の情報フローのパターンをどのように捉えているかを深く探った。相互作用を「シナジー的」と「冗長的」の2種類に分類した。シナジー的は結合された情報が新しい洞察を提供する場合、冗長的は情報が共有されるが新しい価値を追加しない場合だ。情報ダイナミクスを分解することで、さまざまな方法が脳内のこの複雑なコミュニケーションプロセスをどのように反映しているかが見えてきた。
私たちの分析は、多くの統計が冗長な情報を捉えている一方で-両方の領域が同じ情報を共有する場合-、一部の方法は一つの脳領域から他の脳領域へのユニークな情報のパターンを発見するのが得意であることを明らかにした。これらのさまざまなパターンを認識することで、脳が情報を処理し共有する方法をより深く理解できるようになる。
方法選択への感度
最後に、私たちは感度分析を行って、安静時fMRIデータの処理や分析における異なる選択に対して結果がどれほど堅牢であるかを確認した。データ処理の方法を変えたときに、私たちの結果が安定しているかを確認した。分析で使用する脳の地図の選択を含め、私たちの中心的な結論は異なる方法にわたって安定していることがわかった。これは、私たちのアプローチが脳の相互作用を研究する信頼できる方法を提供することを示唆している。
結論
安静時FCの研究は神経科学でますます人気が高まっている。しかし、私たちがFCを定義し測定する方法はかなり恣意的で、しばしばゼロラグ線形相関のようなシンプルな方法に依存している。さまざまな方法の包括的なベンチマークを通じて、個々の脳の組織に敏感な相互作用の複雑な景観が明らかになった。
私たちの発見は、異なる方法が脳の接続性の異なる側面を強調することができることを示している。この理解は、特定の研究の質問によって使うべきアプローチがどれかを示す上で重要だ。例えば、精度に焦点を当てた方法は、脳の相互作用のより詳細な見方を提供し、個人差の特定や行動に関連する予測の最適化に役立つかもしれない。
今後、研究者たちは答えたい質問に基づいて方法を選択することが重要だ。利用可能な方法の多様性は、すべての研究に一つの方法がフィットするわけではないことを意味する。代わりに、研究者たちは各方法のニュアンスを自分の研究の焦点に関連づけて考慮し、脳の機能的構造をより正確で意味のあるものとして探求する必要がある。
タイトル: Benchmarking methods for mapping functional connectivity in the brain
概要: The networked architecture of the brain promotes synchrony among neuronal populations and the emergence of coherent dynamics. These communication patterns can be comprehensively mapped using noninvasive functional imaging, resulting in functional connectivity (FC) networks. Despite its popularity, FC is a statistical construct and its operational definition is arbitrary. While most studies use zero-lag Pearsons correlations by default, there exist hundreds of pairwise interaction statistics in the broader scientific literature that can be used to estimate FC. How the organization of the FC matrix varies with the choice of pairwise statistic is a fundamental methodological question that affects all studies in this rapidly growing field. Here we comprehensively benchmark the topological and geometric organization, neurobiological associations, and cognitive-behavioral relevance of FC matrices computed using a large library of 239 pairwise interaction statistics. We comprehensively investigate how canonical features of FC networks vary with the choice of pairwise statistic, including (1) hub mapping, (2) weight-distance trade-offs, (3) structure-function coupling, (4) correspondence with other neurophysiological networks, (5) individual fingerprinting, and (6) brain-behavior prediction. We find substantial quantitative and qualitative variation across FC methods. Throughout, we observe that measures such as covariance (full correlation), precision (partial correlation) and distance display multiple desirable properties, including close correspondence with structural connectivity, the capacity to differentiate individuals and to predict individual differences in behavior. Using information flow decomposition, we find that differences among FC methods may arise from differential sensitivity to the underlying mechanisms of inter-regional communication, with some more sensitive to redundant and some to synergistic information flow. In summary, our report highlights the importance of tailoring a pairwise statistic to a specific neurophysiological mechanism and research question, providing a blueprint for future studies to optimize their choice of FC method.
著者: Bratislav Misic, Z.-Q. Liu, A. I. Luppi, J. Y. Hansen, Y. E. Tian, A. Zalesky, B. T. T. Yeo, B. D. Fulcher
最終更新: 2024-05-08 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.07.593018
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.07.593018.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。
参照リンク
- https://osf.io/75je2/
- https://sites.google.com/site/bctnet
- https://github.com/FIU-Neuro/brainconn
- https://github.com/netneurolab/netneurotools
- https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/
- https://github.com/netneurolab/neuromaps
- https://github.com/Imperial-MIND-lab/integrated-info-decomp
- https://github.com/dominance-analysis/dominance-analysis