ティランジアにおけるCAMの進化を解明する
研究がティランシア植物のCAM適応における遺伝的複雑さを明らかにした。
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生物の複雑な特性がどのように進化するかの研究は、進化を研究する科学者たちにとって大きな課題だったんだ。単純な特性は遺伝子の一つの変化によって起こるから一般的だけど、複雑な特性が生まれる仕組みを理解するのは簡単じゃない。特定の植物や動物の種類に関わらず、同じ特性が何度も現れることがあるけど、それに至る遺伝子の経路は違うことがあるんだ。
この現象の一つの可能性は、似たような身体的特徴がさまざまな遺伝子の変化のセットを通じて現れること。これは、いくつかの特性が多くの異なる遺伝子によって影響を受けていて、その遺伝子が機能を重複して持つから起こるんだ。自然界には、特定の種類のマウスやさまざまな植物のように、同じ遺伝的背景を共有せずに似た特性が生まれた例がたくさんあるよ。
CAM)
クラッスラセア酸代謝(その複雑な特性のひとつがクラッスラセア酸代謝(CAM)と呼ばれている。これは、いくつかの植物が光合成を助けるために二酸化炭素(CO2)を捕まえる方法なんだ。科学者たちは、少なくとも38の植物科でCAMが独立して少なくとも66回発展してきたことを発見している。CAM植物は、夜にCO2を蓄えて昼間に使用する独特の方法があり、これは大部分の植物、つまりC3植物とは違うんだ。
CAMとC3植物の主な違いは、CO2の初期処理の仕方だ。CAM植物は酵素を使ってCO2をマレートという別の化学物質に変えて、それを一晩保存して昼間に再びCO2に戻して光合成に使用する。このプロセスにより、CAM植物は涼しい夜に気孔を開け、昼間は閉じて水を節約できる。これは特に暑い場所や乾燥した場所の植物にとって役立つんだ。
CAMは複雑な特性と見なされている。特定の遺伝子をオンにしたりオフにしたりするタイミングの変化だけでなく、その植物が効果的に機能するための特定の解剖学的特徴とも関連している。これらの特徴には、細胞内の大きな貯蔵域や、細胞の配置の仕方が含まれる。ただ、昔は植物はC3かCAMのどちらかに分類されると思われていたけど、新しい方法が多くの植物がこれらの特性をミックスして示すことを示しているんだ。
ティランジアの役割
ブロメリア科の一部であるサブジェヌスティランジアは、植物の異なる生態的特性がどのように進化してきたかを研究するのに興味深いグループなんだ。ティランジアには、700万年の間に発展してきた250を超える種が含まれている。これらの種の多くは、CAMの発展を含む独自の方法で環境に適応しているんだ。
この研究では、選択的(C3とCAMの間で切り替え可能なもの)および常在CAM植物(常にCAMを使用するもの)が遺伝的背景を共有しているのか、それとも異なる遺伝子の変化を通じてCAM特性を獲得しているのかを探ることを目指している。これを行うために、科学者たちは非常に異なる炭素同位体測定を示した2つのティランジア種、T. leiboldianaとT. vanhyningiiを調べたんだ。1つは強いCAM植物だと信じられていて、もう1つは主にC3植物として機能すると考えられている。
実験の設定
研究質問に答えるため、CAMと干ばつストレスに関連した生理学や遺伝子発現の変化を捉える実験が設計された。両方のティランジア種は、14日間の12時間の明暗サイクルを導入する前に、6週間の間、制御された条件下で栽培された。いくつかの植物は水を与えずに干ばつ条件に置かれ、他の植物は通常の水やり条件で保たれた。
14日後、葉のサンプルが日中と夜間の様々な時間に採取されて、損傷を避けた。分析は、各種が干ばつにどのように反応するか、特に葉の酸性レベルの変化を見て、CAMの活動とRNAシーケンシングを通じた遺伝子発現を調べた。
酸性の変化を測定する
葉のサンプルの酸性レベルを測定して、通常と干ばつ条件での変化を観察した。これらのレベルは、植物がCAMを実行する能力を反映していて、CAM植物は通常、夜により多くの酸を蓄えて昼間に使用するんだ。
結果は、T. vanhyningiiが強いCAMのようなパターンを示し、日中と夜間での酸性レベルの変化が顕著だったことを示した。一方、T. leiboldianaは、通常の条件下では酸性にほとんど変動がなく、典型的なC3植物として機能していることを示している。しかし、干ばつ条件下では、T. leiboldianaの酸性レベルが変化し始め、弱いCAMサイクルの可能性を示唆した。
遺伝子発現分析
RNAシーケンシングを使って、植物で観察された変化に責任がある遺伝子を理解しようとした。手順には、葉のサンプルからRNAを抽出してシーケンシングすることが含まれた。データは、2つの種の間で遺伝子発現の分布が異なることを示していて、特に異なる水やり条件下で顕著だった。
T. vanhyningiiのほとんどの遺伝子は一定に保たれている一方で、T. leiboldianaは干ばつストレスに対してより広範な反応を示した。これは、常在CAM植物であるT. vanhyningiiは干ばつ時でも代謝プロセスを維持し、T. leiboldianaは水の利用可能性の変化に対してより敏感であることを示唆している。
重複する反応
さらなる分析では、2つの種の間で遺伝子発現の反応に重要な重複があったことが示された。干ばつへの反応を観察していると、T. vanhyningiiまたはT. leiboldianaのいずれかでユニークに発現する多くの遺伝子があり、それぞれの種が環境ストレスに対処するための独自の遺伝的戦略を発展させていることを示唆している。
彼らの近い関係にもかかわらず、遺伝子発現の重要な違いは、それぞれの植物が環境に適応する方法において異なる進化の道を歩んでいることを示している。T. vanhyningiiはストレス下で安定した代謝を維持し、T. leiboldianaは干ばつ時にCAM特性の強い活性化の兆候を示すんだ。
干ばつへの反応の比較
比較した結果、T. leiboldianaの反応は、ストレス下でCAMに切り替える能力を持つ典型的なC3植物により一致しているように見えた。それに対して、T. vanhyningiiは干ばつストレス下でも大きな変化なくCAM機能を保持している。
これは、異なるCAM戦略が近縁種の中で共存できることを強調していて、複雑な遺伝的経路が異なる手段を通じて似た特性をもたらすことができることを示している。T. leiboldianaが真のC3植物ではなく、弱いCAM植物として機能する可能性があることを示すのは、これらの特性をさまざまな環境や発生の文脈で研究する重要性を示しているんだ。
議論
この研究は、CAMがさまざまな形で現れ、異なる植物種でさまざまな適応につながることを示している。環境の課題に対する植物の反応の複雑さと、そうした適応の遺伝的基盤を強調している。
さらに、CAMは単一の特性だけでなく、異なる植物が時間をかけて発展させた適応のスペクトルであることを示唆している。ティランジア群の研究を通じて、研究者たちはこれらの植物が多様でしばしば厳しい環境でどのように進化したのかに関する重要な洞察を得ることができるんだ。
結論
要約すると、2つのティランジア種に関する研究は、CAMに関連する進化の経路を明らかにするのに役立っている。結果は、表面上は似ていて同じグループに属する2つの種が、基盤となる遺伝的メカニズムが驚くほど異なることを示している。T. leiboldianaとT. vanhyningiiの干ばつストレスに対する異なる反応は、植物の適応の複雑な性質を強調している。これらの違いを理解することは、植物の特性の進化や遺伝学と環境圧力の間の複雑な関係を理解するために重要だ。
今後の研究は、より広範囲の種と環境条件を探求することで、CAMの複雑さや植物の進化における役割をさらに解き明かしていくことができるよ。
タイトル: Closely related facultative and constitutive CAM phenotypes show little transcriptomic overlap in the subgenus Tillandsia
概要: 1.O_LIThe evolutionary trajectory of Crassulacean acid metabolism (CAM) remains elusive, as it has evolved repeatedly, yet represents a complex trait requiring changes on several organismal levels. It is debated whether distinct forms of CAM embody a single quantitative trait, or entirely separate, categorical phenotypes. The subgenus Tillandsia provides an excellent opportunity to compare the genetic basis of different forms of CAM, as species are closely related, yet display a broad range of CAM phenotypes. C_LIO_LIBy combining physiological and transcriptomic analyses of well-watered and drought-stressed accessions of a Tillandsia species pair, we achieved a comprehensive characterization of their photosynthetic phenotypes and the transcriptomic underpinnings and overlap of distinct CAM phenotypes in Tillandsia. C_LIO_LIWe found that a species previously identified as C3 displays an active CAM cycle under drought stress, yet the effect of drought was markedly increased compared to the constitutive CAM species. The CAM-specific transcriptomic response to day-night changes and to drought showed little overlap between the two species, with most DE genes showing distinct regulation patterns or being unique to one species. C_LIO_LIOur study reveals that the two species do not exhibit a shared transcriptomic basis of CAM expressed at distinct levels, but that different transcriptomic routes can lead to similar phenotypes, supporting the view that CAM is a highly polygenic trait. C_LI
著者: Clara Groot Crego, S. Saadain, M. de La Harpe, J. Hess, M. H. J. Barfuss, W. Till, C. Lexer, O. Paun
最終更新: 2024-05-10 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.09.593278
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.09.593278.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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