西ガーツの小型哺乳類におけるアデノウイルス
研究によると、カルナータカ州の小型哺乳類でアデノウイルスの感染率が高いことがわかった。
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アデノウイルスは、人間を含む多くの動物に感染するウイルスの一種だよ。これらのウイルスはさまざまな形があって、いろんな病気を引き起こすことがあるんだ。軽い風邪みたいな症状が出る人もいれば、呼吸器の問題や脳の感染症みたいな重い健康問題に直面する人もいる。最悪の場合、死に至ることもあるんだ。これまでの研究は主に人間や農場の動物への影響を調べてきたけど、野生動物、特に小型哺乳類におけるウイルスの振る舞いについてはまだまだわからないことが多いんだ。
小型哺乳類の重要性
マウスやモグラみたいな小型哺乳類は、生態系において重要な役割を果たしているよ。新しいウイルスの潜在的な宿主として見られることが多いんだ。人間が土地を変えると、その地域に小型哺乳類が増えることがある。その増加は、新しい病気が出現するリスクを高めることがあるんだ。多くの種類の哺乳類が人間の活動と共存する地域では、ウイルスが動物から人に移る条件が整いやすくなる。だから、アデノウイルスみたいなウイルスが小型哺乳類のコミュニティでどう存在しているかを研究することが大事なんだ。
研究エリアとサンプル
私たちの研究は、インド南部のウエスタン・ガーツにあるカダマネの森林プランテーションモザイクで行われたよ。この地域は生物多様性が豊かで、近くには多くの人が住んでいるんだ。人間の活動によって自然生息地が急速に変化しているところなんだ。小型哺乳類は、森林の断片、草地、人が住む場所など、さまざまな土地から採集されたよ。合計で136匹の小型哺乳類が捕獲され、7つの異なる種を代表しているんだ。
アデノウイルススクリーニング
アデノウイルスの検査のために、動物の組織からのサンプルや口の中の液体、肛門からのスワブを取ったよ。特定の技術を使ってこれらのサンプルからDNAを抽出し、アデノウイルス遺伝子を検査したんだ。サンプルが純粋であることを確認してから、ウイルスの存在を特定するために配列を分析するプロセスを経たよ。この作業は、安全性と正確性を確保するために厳しいガイドラインに従って行われたんだ。
アデノウイルスの有病率の発見
検査したサンプルの中で、小型哺乳類の組織サンプルからアデノウイルスが見つかったけど、スワブサンプルにはウイルスの兆候は見られなかったよ。小型哺乳類全体でのアデノウイルスの存在率は約21%だったんだけど、特にウエスタン・ガーツに多く見られるRattus sataraeは、テストした動物の39%近くが陽性だったんだ。他の種、例えばMus cf. terricolorやMus cf. fernandoniは感染率が低かったけど、R. rattusやSuncus nigerは全く陽性が出なかったよ。
系統関係
小型哺乳類で見つかったアデノウイルスの株を詳しく調べて、既知のアデノウイルスと比較したんだ。分析の結果、これらのウイルスは複数の異なるグループに属していることがわかったよ。Rattus sataraeのサンプルでは、5つの異なる系統のアデノウイルスを特定できて、すべてが他の関連ウイルスとのつながりを示していることがわかったんだ。私たちの研究は、小型哺乳類で見つかったウイルスと他の場所で見つかったウイルスとの間に重要な遺伝的違いがあることを示していて、これらがユニークな株であることを示しているんだ。
発見の重要性
この研究の結果は、特にウエスタン・ガーツにおける小型哺乳類の中に見られる以前は見えていなかったアデノウイルスの多様性を強調しているよ。Rattus sataraeの高い感染率は、この種の個体数が増えるとウイルスが他の動物や人間に広がる可能性が高まることを示唆しているかもしれないね。これは、感染した小型哺乳類を食べるかもしれない小型肉食動物にとって特に懸念されることなんだ。
今後の研究への提言
この結果を受けて、Rattus sataraeやこの地域の他の小型哺乳類におけるアデノウイルスのさらなる調査が重要だね。人間と野生動物が混在する景観でウイルスがどのように変化し広がるかを理解することは、公衆衛生にとって重要な情報を提供するよ。新しいアデノウイルスの変異株がどのように出現するかを研究するためのモデルを作る手助けになるんだ。広範囲にわたる長期的な研究が、ウイルスの伝播のダイナミクスにおけるさまざまな種の役割をよりよく説明する助けになるだろう。
結論
私たちの研究は、ウエスタン・ガーツの野生動物の中でアデノウイルスの多様性を調べる初めての試みの一つなんだ。この結果は、人間の活動と共存する小型哺乳類におけるこれらのウイルスを監視する重要性を強調しているよ。自然生息地が変化し続ける中で、新しい健康リスクの可能性が現実のものとなっているから、これらのウイルスが野生動物の中でどのように機能し広がるかを引き続き研究する必要があるんだ。
タイトル: Identification of distinct rodent-associated adenovirus lineages from a mixed-use landscape in the Western Ghats biodiversity hotspot
概要: Shifts in land-use patterns and increased human-livestock-wildlife interactions have generated numerous possibilities for pathogen spillover. This demands increased efforts of pathogen surveillance in wildlife, especially in changing landscapes with high biodiversity. We investigated adenovirus diversity in small mammals, an understudied host taxon, from a forest-plantation mosaic in the Western Ghats biodiversity hotspot. Using PCR-based screening followed by Sanger sequencing and phylogenetic analyses, we attempted to detect and characterize adenovirus diversity in seven species of small mammals. We observed high prevalence (up to 38.8%) and identified five lineages of adenoviruses with unique mutations in the endemic and dominant small mammal species, Rattus satarae. These lineages significantly differed from other known Murine adenoviruses (p-distance > 25%), indicating the likelihood of novel adenovirus diversity in this endemic small mammal. Collectively, our results highlight the potential for unexplored diversity of DNA viruses like adenovirus in poorly explored host taxa inhabiting human-used landscapes and its zoonotic implications.
著者: Balaji Chattopadhyay, B. R. Ansil, A. Sanyal, D. Sreenivas, K. M. Garg, U. Ramakrishnan
最終更新: 2024-05-19 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.18.594665
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.18.594665.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。