タンガニーカ湖のシクリッドの活動パターン
研究によると、タンガニーカ湖のシクリッドには多様な活動行動があるんだって。
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適応放散は、関連のある種のグループが環境の中で別々の役割や"ニッチ"を占めるために素早く進化するプロセスだよ。これは、他の種が使っていない食料や避難所を見つけるために種が適応するときに起こることがある。ダーウィンのフィンチがいい例で、彼らのくちばしは異なる食事に合わせて進化したんだ。同様に、タンガニーカ湖のシクリッド魚は、さまざまな形とサイズを示し、さまざまな食事のニーズに適応しているよ。
異なる種がアクティブな時間帯に適応できることは知られているけど、密接に関連した種が生態系の中でどのように役割を進化させるかについてはあまり理解されていないんだ。注目されているのは、これらの活動パターンが時間とともにどのように変わるかで、これは生存にとって重要である可能性があるよ。
タンガニーカ湖は、多くのシクリッド魚が生息している場所なので、これらのパターンを研究するには特に興味深い。約900万〜1200万年の歴史を持ち、最も多様なシクリッドのグループがいて、体の形、行動、生態的役割の広い範囲を示しているんだ。観察によると、これらの魚は主に昼間に活動的だと言われてきたけど、夜や夕方、明け方に活発な種もあるみたい。これが、似たような種が競争を避けて資源を効率的に使うのに役立っているのかもしれない。
シクリッドの活動パターンを観察する
タンガニーカ湖のシクリッドの活動パターンを理解するために、研究者たちは複数の種を一定の期間観察できる制御された環境を設定したんだ。彼らは60種を監視して、さまざまな体のサイズや行動を含めるようにしたよ。
魚は透明な水槽に入れられ、メッシュのバリアで分けられて、物理的な接触なしにお互いを見ることや匂いを嗅ぐことができたんだ。数日間、昼も夜も個々の魚の動きを追跡することで、これらの魚がどのくらいの速さでいつ活動しているかに関する詳細なデータを収集できたんだ。
活動パターンの多様性
この研究では、シクリッド魚の間に驚くべき活動パターンの多様性が明らかになった。一部の種は主に昼間に活動的だったけど、他の種は夜や明け方、夕方にもっと活動的だった。また、昼も夜も特に強い好みがない種もあって、1日の中で活動が混在していたよ。
たとえば、夜に昆虫を食べることで知られている一種は、低光条件に適した大きな目を持っていて、昼間活動する対応する種は色鮮やかで攻撃的だった。この発見は、野生での自然な行動に関する以前の考えとよく合っていたんだ。
この活動行動を科学的に分析するために、研究者たちは主成分分析(PCA)という方法を使った。この方法はデータのパターンを明らかにするのに役立ったんだ。この方法で、活動の好みの違いは大きく3つのグループに分類できることがわかった:日中活動的(昼間)、夜間活動的(夜)、薄明かり活動的(明け方と夕方)。
いくつかの種は活動パターンに高い変動性があって、すべての魚がこれらのカテゴリーにぴったり当てはまるわけではないことを示しているよ。そのため、明確な日中または夜間の好みを示さない魚のために、「猫気分」という別のカテゴリーが導入されたんだ。
休息パターンの違い
魚がどれだけ活動的であるかを観察するだけでなく、研究者たちは魚がどれだけの時間を休んでいるのかも調べたんだ。この不活発さは、魚の睡眠の兆候かもしれないね。魚の動きを追跡することで、研究者たちは各種が昼間にどれだけの時間を休んでいたかを測定できたんだ。
ある種はほぼ18時間を休む一方で、他の種は約3時間だけ休憩を取っていたよ。この休息パターンの変動は、他の動物種に見られるものと似ていて、シクリッドグループの中でも大きな行動の幅があることを示しているんだ。
環境と行動の関連性
次に研究者たちが取り組んだ質問は、異なる活動パターンや休息時間が魚の食事や形状に関連しているかどうかだった。彼らはデータを魚の体の特徴や食事のニーズに関する既存の知識と比較することで、関連する種が必ずしも同じ活動パターンを共有していないことを知ったんだ。
たとえば、似たような生息地で同じタイプの食べ物を食べるシクリッドは、しばしば異なる活動時間を持っていた。密接に関連した種が同じ行動や休息時間を持つという明確なパターンはなかったんだ。これは、時間的ニッチの分割の考えを支持しているよ。
多くの種が同じ生態的スペースを占めながらも、異なる時間に活動することで適応しているんだ。これにより、複数の種が同じ資源をあまり競争せずに共存できるんだ。
活動パターンの背後にある遺伝的基盤
シクリッドがなぜそんなに多様な活動と休息の行動を示すのかをさらに理解するために、研究者たちは遺伝的研究を行った。彼らは魚のゲノムを調べ、活動パターンや全体の休息量に関連する変異を特定したんだ。
大量の遺伝子配列を分析することで、昼夜の活動に関連するいくつもの特定の遺伝的マーカーを特定したよ。しかし、サーカディアンリズムに関連する遺伝子との関連は見つからなかったので、活動パターンの変化は多くの生物の日常的リズムを調節する内部の生物時計とは独立に進化するかもしれないことを示唆しているんだ。
この複雑さは、これらの特徴の遺伝的基盤がサーカディアンリズムによって制御される単純なスイッチというよりも、個々の種の特性にもっと関連していることを示唆している。結果は、遺伝子、行動、進化の間にもっと複雑な関係があることをほのめかしていたんだ。
結論
タンガニーカ湖のシクリッドの研究は、種が活動パターンをどのように適応させて1日の異なる時間を利用するかについて重要な洞察を提供するよ。行動の傾向を長期間測定することで、研究者たちは種の多様化のメカニズムとして時間的ニッチの分割の重要性を強調したんだ。
この広範な研究は、自然の生態系における生物多様性に寄与する進化のプロセスに対する理解を深めている。異なる種が同じ環境で共存し、利用可能な資源をユニークな方法で活用することによって繁栄できることを示しているんだ。
今後の研究は、遺伝的マーカーと行動的特性の関連性に焦点を当てて、進化がシクリッド魚だけでなく、他の動物群にもどのように影響を与えるかを解明することに努めるかもしれない。こうした関係を続けて研究することで、種が競争の激しい環境でもどのように適応し繁栄するのかをもっと学べることを期待しているんだ。この研究はまた、こうした複雑な生態系を支える多様な生息地を保護するための保全努力に役立つかもしれないね。
タイトル: Widespread temporal niche partitioning in an adaptive radiation of cichlid fishes
概要: The partitioning of ecological niches is a fundamental component of species diversification in adaptive radiations. However, it is presently unknown if and how such bursts of organismal diversity are influenced by temporal niche partitioning, wherein species avoid competition by being active during different time windows. Here, we address this question through profiling temporal activity patterns in the exceptionally diverse fauna of cichlid fishes from African Lake Tanganyika. By integrating week-long longitudinal behavioural recordings of over 500 individuals from 60 species with eco-morphological and genomic information, we provide two lines of evidence that temporal niche partitioning facilitated this massive adaptive radiation. First, Tanganyikan cichlids exhibit all known circadian temporal activity patterns (diurnal, nocturnal, crepuscular, and cathemeral) and display substantial inter-specific variation in daily amounts of locomotion. Second, many species with similar habitat and diet niches occupy distinct temporal niches. Moreover, our results suggest that shifts between diurnal and nocturnal activity patterns are facilitated by a crepuscular intermediate state. In addition, genome-wide association studies indicate that the genetics underlying activity patterns is complex, with different clades associated with different combinations of variants. The identified variants were not associated with core circadian clock genes but with genes implicated in synapse function. These observations indicate that temporal niche partitioning contributed to adaptive radiation in cichlids and that many genes are associated with the diversity and evolution of temporal activity patterns.
著者: Maxwell Eric Robert Shafer, A. L. A. Nichols, A. Indermaur, A. Rüegg, R. Gonzalez-Dominguez, M. Malinsky, C. Sommer-Trembo, L. Fritschi, W. Salzburger, A. F. Schier
最終更新: 2024-06-02 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.29.596472
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.29.596472.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。
参照リンク
- https://lh3lh3.users.sourceforge.net/snpable.shtml
- https://github.com/stschiff/msmc-tools/tree/master
- https://github.com/millanek/evo
- https://github.com/ncbi/datasets
- https://github.com/annnic/cichlid-tracking
- https://github.com/annnic/cichlid-analysis
- https://github.com/maxshafer/cichlid_sleep_gwas
- https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.9w0vt4bbf