非標準アミノ酸研究の進展
科学者たちは特別なアミノ酸を使ってタンパク質の生成を改善している。
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アミノ酸はタンパク質の基本的な構成要素で、私たちの体が使う標準のものは20種類ある。ただ、科学者たちは非標準アミノ酸(NCAA)って呼ばれる特別なアミノ酸のセットに興味を持ってるんだ。このncAAを使うと、新しくてワクワクする機能を持つタンパク質を作れるんだよ。このncAAをタンパク質に組み込むことで、そのタンパク質の動きが変わるから、研究や医療の可能性が広がるんだ。
科学者たちがこのncAAをタンパク質に追加するためには、オーソゴナル翻訳システム(OTS)っていう特殊なシステムが必要なんだ。これらのシステムは、ncAAを標準のアミノ酸の代わりに認識して使えるように細胞のパーツを調整したもので構成されてる。今のところ、400種類以上のncAAが実験で使われていて、特定のタンパク質コーディングの指示の一部を置き換える方法で主に行われてるよ。
ncAAをタンパク質に組み込む方法
ncAAをタンパク質に入れる人気の方法の一つは、細胞を騙してncAAがただの標準アミノ酸だと思わせること。これは、遺伝子配列の特別なコードを使って、細胞に一時停止してncAAを挿入させることで実現することが多い。最も一般的な方法は、DNAの特定の信号を操作してタンパク質の合成を止める指示を解除し、その代わりにncAAを追加できるようにすること。
ただ、これらの方法でも、科学者たちはncAAの組み込みを本当に効率的にするのに苦労してるんだ。様々なトリックを使って、細胞内のOTSのコピー数を変えたり、タンパク質を作るのに役立つ細胞の部分を調整したりして、プロセスの改善を試みてる。でも、ncAAを使ったときのタンパク質の量が、自然に作られるものに比べて合わないことが多いみたい。
OTSをエンジニアリングする挑戦
このオーソゴナル翻訳システムを作るとき、科学者たちはしばしば、過酷な条件で繁殖する生物のタンパク質を使い始めるんだ。こういうタンパク質は通常とても安定していて、いろんな変化に耐えられる。でも、これは同時に、室温などの通常の条件ではあまりうまく機能しないことも意味するんだ。
例えば、ncAAを追加するのを助ける特定のタンパク質を使うとき、研究者たちは新しい種類のncAAを受け入れるためにそのタンパク質に多くの変更を加える必要があることに気がつくかもしれない。これは挑戦的で時間がかかるプロセスで、科学者たちは自分たちの望むようには効果的に機能しないシステムに悩まされることになる。
より良い選択肢を探る
寒さを好む生物のタンパク質の中には、異なるパターンを示すものがある。これらのタンパク質の構造は、あまり多くの変更を必要とせずに様々な基質と働くことができる。これは科学者たちにとって大きな変化になるかもしれない。熱に強いタンパク質に頼らなくてもよくなるかもしれないから。
寒冷適応型の生物メタンコッコイデス・バートニイから得たタンパク質に焦点を当てた研究者たちは、室温でもっと効果的に機能する特定のタンパク質のバリアントを見つけた。テストでは、この新しいタンパク質がただ効果的であるだけでなく、異なるタイプのncAAを認識するのも得意だって分かった。
新しいタンパク質の評価
この有望なタンパク質を特定した後、研究者たちは、他のタンパク質と比較してどれだけncAAをタンパク質に組み込むことができるかをテストした。さまざまな設計で、この新しいタンパク質が従来のものを一貫して上回ることが分かった。これは、科学者たちがncAAを含むタンパク質をもっと簡単かつ効率的に作れることを意味する。
特に注目すべきは、複数のncAAを一緒に使うテストでも、この新しいタンパク質が素晴らしい効率を示したこと。これは、科学者たちが同時に複数の機能を持つ複雑なタンパク質を作る機会を提供するから、興味深い。
研究への影響
この新しいタンパク質を使って得られた発見は、特にバイオエンジニアリングや合成生物学の分野で、科学者たちの仕事の進め方を変えるかもしれない。ncAAのより効率的な利用を可能にすることで、研究者たちはより広範な機能を持つタンパク質を作れるようになる。このことは、疾病の治療により効果的なカスタムタンパク質を作ることができる新薬開発の進展につながる可能性がある。
さらに、同じ結果を得るのに必要な資源が少なくて済むことで、研究のコストが下がるかもしれないし、もっと多くのプロジェクトが完了できるようになる。これによって、医療、農業、材料科学など、さまざまな分野での革新が促進されるかもしれない。
研究の次のステップ
寒冷適応型のタンパク質を使った新しい知見を得たことで、科学者たちはncAAを使えるシステムの改善を続ける方法を探っている。これは、より効率的なバリアントを見つけるために、他の寒さを好む生物からのタンパク質をテストすることを含んでいる。
研究者たちはまた、これらのタンパク質が他の細胞工具と組み合わせて、タンパク質工学の可能性を押し広げる方法を探っている。より多くの情報を集めて方法を洗練させる中で、役に立つ特性の幅をさらに広げたタンパク質を生産できるシステムの開発を目指しているんだ。
結論
非標準アミノ酸とそれを組み込むためのシステムの探求はエキサイティングな科学の分野だ。寒冷環境で繁殖する生物のタンパク質に焦点を移すことで、研究者たちは新しい機能を持つタンパク質をより効果的に生産する方法を見つけられた。科学的技術が進化すれば、研究や実用的な応用のための魅力的な道が開かれるだろう。この研究は、タンパク質の機能や進化についての理解を深めるだけでなく、研究や産業に実用的な利益をもたらし、新しい発見や革新につながるはずだ。
タイトル: "Cold" Orthogonal Translation by Psychrophilic Pyrrolysyl-tRNA Synthetase Boosts Genetic Code Expansion
概要: Using orthogonal translation systems (OTSs) is the most efficient way to produce unnatural proteins by incorporating non-canonical amino acids (ncAAs) into the genetic code. Traditionally, efforts to expand substrate specificity start with a (hyper-)stable enzyme capable of withstanding the structural changes resulting from necessary mutations. However, we adopt a radically different approach by starting with an enzyme that evolved to cope with instability, potentially offering resilience to mutations. By engineering a psychrophilic ("cold") OTS from Methanococcoides burtonii, we developed an alternative to the commonly used mesophilic and thermophilic systems. This OTS exhibited remarkable in vivo efficiency and promiscuity, even at very low ncAA concentrations. Given the broad range of applicable host organisms, we anticipate that Cold-OTS will significantly advance the transformation of the expanded genetic code from an academic discipline into a high-value chemistry-driven biotechnology.
著者: Nediljko Budisa, N. G. Koch, P. Goettig, J. Rappsilber
最終更新: 2024-06-02 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.23.541947
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.23.541947.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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