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# 生物学# 進化生物学

砂漠のカメの分化に関する遺伝的洞察

研究が明らかにしたのは、異なる砂漠気候におけるウミガメの種を形成する遺伝的な違いってこと。

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砂漠におけるカメの進化砂漠におけるカメの進化的変化が進んでるんだって。研究によると、異なる気候でウミガメの遺伝
目次

環境の違いが時間をかけて新しい種を作ることがあるんだ。例えば、降雨量の変化や特定の地域に生える植物の種類によって、動物が周りに適応していくことがある。これらの適応は、交配の障壁を作って種を分けるのに役立っていて、これを生殖隔離って言うんだ。この隔離は、細胞分裂の問題とか、卵と精子の受精に関する遺伝的要因によって引き起こされることもあるよ。

砂漠のカメの研究

砂漠のカメ、いわゆるゴフォラス・モラフカイとG. アガシジーは、約400万から500万年前に異なる種に分かれたんだ。この2つの種は、異なる降雨パターンを持つ別々の砂漠に住んでいる。G. モラフカイが住んでいるモハーヴェ砂漠は主に冬に降雨が少ないけど、G. アガシジーが住むソノラン砂漠は夏に多く降るし、冬にも少し降るんだ。さらに、コロラド川が障壁になっていて、ある程度の混ざり合いはあるけど、完全に交配することはできないんだ。それぞれの住環境の違いは、食べ物を探す方法や活動時間にも影響を与えているんだ。

降雨パターンの違いに加えて、これらのカメは体の形や繁殖の頻度、寒い季節の冬眠の仕方にも違いがあるんだ。でも、特定の場所で交雑ができるってことは、まだ完全には分かれていないってことも示していて、研究者にとっては彼らの遺伝的違いを調べる貴重なチャンスになるんだ。

ゲノム分析

研究者たちは、G. モラフカイの詳細なリファレンスゲノムを作成し、G. アガシジーのゲノムと比較したんだ。これは遺伝子の順番を見ることで、科学者がゲノムがどのように進化してきたかを理解する手助けになるんだ。

G. モラフカイのゲノムは、先進的なDNAシーケンシング法を使って組み立てられ、多くの重要な情報を含む大量のデータが得られたんだ。この組成は高い完全性を達成していて、このカメの遺伝的構成を効果的に表しているんだ。

遺伝子の順序の変化

科学者たちは、ゴフォラスと他のカメの種類との間で遺伝子の順序がどのように変化したのか知りたかったんだ。彼らは、G.モラフカイとその親戚の間で遺伝子の順序はほとんど保存されているけど、一部の場所で再配置が起こっていることを発見したんだ。これはゴフォラス系統の進化の道筋を示唆するかもしれない。

G. モラフカイとG. アガシジーの比較では、多くの遺伝子の順序が保存されていることがわかった。でも、少数の違いはG. アガシジーのゲノムの組み立て中のエラーが原因かもしれない。

生息地と気候の分析

これらのカメが住む異なる環境をよく理解するために、研究者たちはさまざまな気候データを使って主成分分析を行ったんだ。彼らは、両種に影響を与える独自の気候条件を見つけ出し、異なる生態的ニッチを占めていることを示したんだ。G. アガシジーは、温度変化が大きい乾燥した地域でうまく生きているけど、G. モラフカイは、温度変化が少ない湿った生息地にいるんだ。

生物学的違いと遺伝子の相互作用

ポジティブセレクションを受けている遺伝子を調べることで、研究者たちは2つのカメ種でどの遺伝子がどのように異なって適応したのかを見ることができたんだ。細胞分裂や繁殖など、種の生存にとって重要な生物学的プロセスに関与するいくつかの遺伝子を特定したんだ。

例えば、細胞分裂を管理する遺伝子がポジティブセレクションを受けていることがわかったんだ。これは、正常な細胞分裂が成功した繁殖や全体的な健康に必要だから重要なんだ。さらに、カメの視力の発達に関連する遺伝子も注目されていて、これはそれぞれの生息地での異なる生活環境や光の露出に関連している可能性があるんだ。

視力と光の適応

特に、この研究は視力に関連する遺伝子とカメがどのように環境に適応しているかを強調してるんだ。モハーヴェ砂漠とソノラン砂漠ではUV光のレベルに違いがあるんだ。この露出が、明るい日光の中でどのように目が発達したかに影響を与えるかもしれない。2つのカメ種は、それぞれの環境に合わせて視力を適応させて、独自の環境で生き残る手助けをしているんだ。

強化と種分化の証拠

研究結果は、G. モラフカイとG. アガシジーが直面する異なる環境的圧力に対応して、さまざまな遺伝子がポジティブセレクションを受けていることを示唆しているんだ。これには繁殖に関与する遺伝子が含まれていて、これがこれらの種の進化的分離を強化するかもしれない。繁殖に不可欠な精子と卵の形成も、両種間のハイブリダイゼーションを防ぐ変化を示しているんだ。

研究はまた、両カメが自分たちの環境をどのように認識するかに影響を与える遺伝子の変化にも言及しているんだ。特に光のレベルや視力に関して、こうした適応は環境要因が2つの種の違いを引き起こす重要な要素であることを示しているんだ。

結論

G. モラフカイの染色体レベルのゲノム作成は、カメの種分化プロセスを探求するための新しいツールを提供するんだ。この研究は、ゴフォラス・モラフカイとG. アガシジーの間の遺伝的違いがかなり大きいことを示していて、彼らのユニークな環境によって駆動されているんだ。気候、水分、日光の変化が、これら2つの種が別々に繁栄するための適応を形作る上で重要な要素のようだね。

研究者たちはこれらのカメを引き続き研究することで、環境要因が種の進化に与える影響についての洞察を得ることができるんだ。これらのメカニズムを理解することは、G. モラフカイとG. アガシジーの保存にとって重要で、彼らのユニークな適応と生息している生態系を未来の世代のために守ることを保証するんだ。

オリジナルソース

タイトル: Strong signatures of selection on genes underlying core reinforcement mechanisms in speciating desert tortoises

概要: Genomic reinforcement and differential ecological adaptation are thought to be fundamental mechanisms of speciation. In this study we investigate the genomic basis of adaptation and reinforcement between two desert tortoise species of North America that occupy desert habitats with differing seasonal rainfall patterns and have considerable behavioral and reproductive differences yet maintain a narrow hybrid zone. We generated a chromosome-scale reference genome for Gopherus morafkai and performed analysis of synteny, genes under positive selection, and environmental niche modeling. Results show extensive positive selection (422 genes) including related to eye development and function that may relate to environmental differences, as well as prezygotic isolation mechanisms such as sperm-egg recognition, and postzygotic reinforcement mechanisms such as the spindle assembly checkpoint, and sister chromatid pairing. Together, results offer strong genetic support for the role of these classic processes in shaping reproductive isolation and lineage divergence of speciating tortoises.

著者: Greer Dolby, S. M. Baty, R. Araya-Donoso, A. Paulsen, A. Williams, D. F. DeNardo, K. Kusumi

最終更新: 2024-06-09 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597788

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.06.597788.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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