CRISPR-Cas12aを使った遺伝子編集の進展
CRISPR-Cas12aは、研究で効率的な遺伝子編集のための新しい方法を提供するよ。
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遺伝子編集は、生物学や医療研究で使われる強力なツールだよ。一番人気のある遺伝子編集の方法はCRISPR-Cas9って呼ばれてるんだけど、最近開発されたCRISPR-Cas12aっていう新しい方法があって、CRISPR-Cas9とはいくつか違った特徴があるんだ。この記事では、CRISPR-Cas12aが遺伝子編集にどう使えるか、特に研究用の動物モデルを作るためについて話すね。
CRISPR-Cas12aって何?
CRISPR-Cas12aは、特定の場所でDNAを切ることができるタンパク質なんだ。この方法を使うことで、科学者たちは生物の中で遺伝子を追加したり、削除したり、変更したりできるんだよ。CRISPR-Cas9と比べると、CRISPR-Cas12aは短いRNA配列を使って、特定の状況でより良く働くための独自の特性を持ってる。1つのRNAセット内で複数のRNAガイドを作れる能力があって、研究者は一度にいくつかの遺伝子をターゲットにできるから、プロセスが効率的になるんだ。
enAsCas12aマウスモデルの作成
CRISPR-Cas12aがどれくらい効果的かを見るために、科学者たちは特別なマウスモデル、enAsCas12aマウスを作ったんだ。このマウスは、性能向上のために設計されたCas12aタンパク質のバージョンを持ってる。研究者たちは、タンパク質が細胞内でうまく働くように追加の配列を加えた。強化されたバージョンを使って、マウスのDNAにCas12a遺伝子を挿入したから、体全体で常に発現してるんだ。
マウスができた後、科学者たちは新しい遺伝子がちゃんと働いてるか、健康に問題がないかをチェックしたんだよ。enAsCas12aマウスモデルは健康で、血液や免疫系に問題の兆候は見られなかったんだ。これでモデルがさらに研究に使えることが確認されたんだ。
細胞での遺伝子編集のテスト
enAsCas12aマウスの健康が確認できた後、研究者たちは新しく作ったモデルが遺伝子編集にどれだけ役立つかをテストする実験を行ったんだ。これらのマウスから細胞を取り出して、特定の遺伝子をターゲットにするRNAガイドを導入するためにレントウイルスベクターを使ったんだ。テストの結果、enAsCas12aシステムは遺伝子編集に関して非常に効率的で、ほぼ100%の成功率で特定の遺伝子をターゲットにできたんだ。
次に、科学者たちはシステムが複数の遺伝子を一度に変えられるかを試したんだ。4つの異なる遺伝子を一度にターゲットにするセットアップを設計したところ、結果は素晴らしく、全てのターゲット遺伝子がenAsCas12a細胞で効果的に編集され、enAsCas12aシステムがないコントロール細胞には変化が見られなかったんだ。
enAsCas12aシステムの生体内テスト
enAsCas12aシステムが細胞内でどう機能するかを確認した後、研究者たちは生きている生物の中でどれだけうまく機能するかを見たかったんだ。ヘマトポエティック再構成って呼ばれる手法を行い、enAsCas12aマウスから幹細胞を取り出して他のマウスに移植したんだ。これによって、編集された細胞が全体の生物の中でどんなふうに振る舞うかを研究したんだ。
結果は良好だったよ。編集された幹細胞を受け取ったマウスは、数週間以内にリンパ腫っていう癌の一種を発症したんだ。これでenAsCas12aシステムが生きているマウスの中でも遺伝子の変化を効率的に行えることが確認されたんだ。
遺伝子ノックアウトライブラリーの開発
enAsCas12aシステムが大規模な研究にどう使えるかを理解するために、研究者たちは2つの新しい遺伝子ライブラリーを作ったんだ。これらのライブラリーには、何千もの遺伝子をターゲットにできる多くのRNAガイドが含まれてるんだ。研究者たちは、これらのライブラリーをマウス細胞で使うように設計し、異なる病気や生物学的プロセスに関連する遺伝子をターゲットにすることにしたんだ。
研究者たちは、これらのライブラリーを使ってがんに関与する重要な遺伝子を特定できるかを実験したんだ。細胞にいろんな薬をかけて、どの遺伝子が影響を受けるかを観察したんだ。その結果、ライブラリーは非常にうまく機能し、がん細胞の耐性に関与することが知られている遺伝子を特定できたんだ。
異なる遺伝子編集技術の組み合わせ
研究のもう一つの面白い点は、enAsCas12aシステムとdCas9っていう別の遺伝子編集方法を組み合わせたことなんだ。この組み合わせで、研究者たちはいくつかの遺伝子を活性化しつつ、別の遺伝子を無効にすることができるんだ。科学者たちは、このアプローチを免疫システムの重要な成分であるT細胞で試したんだ。
実験では、Cd19っていう遺伝子をうまく活性化しながら、Trp53っていう遺伝子も編集できたことが分かったんだ。結果は良好で、ほとんどの編集された細胞が望ましい遺伝子活性化と遺伝子ノックアウトを示したんだ。
複数のRNAガイドによるマルチプレクシング
複数の遺伝子を同時に制御できる能力、つまりマルチプレクシングは、enAsCas12aシステムの大きな利点の一つなんだ。1つの分子から複数のRNAガイドを生成できるから、研究者たちは複雑な実験をより簡単に作れるんだ。この機能をいろんな細胞タイプで試してみたところ、システムは1つの実験で複数の遺伝子を効果的に修正できることがわかったんだ。
この多様性は、複雑な生物学的経路を研究している研究者たちに多くの可能性を提供するんだ。一度に多くの遺伝子をターゲットにできることで、科学者たちはこれらの遺伝子が互いにどう関わって健康や病気に寄与するかを調べられるんだ。
結論
enAsCas12aマウスモデルの開発は、遺伝子編集技術における大きな進歩を示してるよ。CRISPR-Cas12aが効果的にいろんな病気のマウスモデルを作って研究するために使えることを示してるんだ。複数の遺伝子を同時にターゲットにする能力は、研究のための強力な新しいツールを提供して、科学者たちが複雑な生物学システムをより深く探ることができるようにするんだ。
全体的に、enAsCas12aシステムは高効率な遺伝子編集をサポートするだけでなく、遺伝子の機能や相互作用を研究するための革新的なアプローチの可能性を提供してるんだ。この研究は、医療や生物学における将来の応用に道を開き、遺伝学や病気のメカニズムの理解を深めることに貢献するんだ。
タイトル: Advancing the genetic engineering toolbox by combining AsCas12a knock-in mice with ultra-compact screening
概要: Cas12a is a gene-editing tool that simplifies multiplexed gene targeting through its RNase activity, enabling maturation of individual crRNAs from a pre-crRNA-encoding RNA. Here, we present a mouse model that constitutively expresses enhanced Acidaminococcus sp. Cas12a (enAsCas12a) linked to an mCherry fluorescent reporter. We demonstrate efficient single and multiplexed gene-editing in cells from enAsCas12aKI mice. To test in vivo activity, we transduced haematopoietic stem cells from E-MycT/+;enAsCas12aKI/+animals with Trp53-targeting pre-crRNAs followed by transplantation into irradiated recipient animals. Tumour development was accelerated and TRP53 protein lost. We generated compact, genome-wide Cas12a knockout libraries targeting each gene with four guide RNAs encoded on two (Menuetto) or one (Scherzo) vector. Introducing these libraries into E-MycT/+;enAsCas12aKI/+lymphoma cells followed by treatment with an MCL-1 inhibitor (S63845) or TRP53-inducer (nutlin-3a) identified known and novel drug resistance genes. Finally, we demonstrate simultaneous gene knockouts (Trp53 or combined Bax/Bak) and activation (Cd19) in primary T cells and mouse dermal fibroblasts from crosses of our enAsCas12a and CRISPR activation models (dCas9a-SAM). Our enAsCas12a mouse model and accompanying libraries enhance genome engineering capabilities and complements current CRISPR technologies.
著者: Marco Herold, W. Jin, Y. Deng, J. E. La Marca, E. Lelliott, S. Diepstraten, V. Snetkova, K. Dorighi, L. Hoberecht, L. Whelan, Y. Liao, L. Tai, G. Healey, W. Shi, A. Kueh, B. Haley, J.-P. Fortin
最終更新: 2024-06-13 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596755
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596755.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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