核小体の機能とウイルスの相互作用に関する新しい発見
研究によって、核小体がウイルスのタンパク質の振る舞いや細胞プロセスにおいて果たす役割が明らかになった。
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目次
核小体は細胞の中の小さな部分で、いろんな大事な役割を持ってるんだ。リボソームを作るのにも関わっていて、リボソームはタンパク質を作る機械だよ。核小体は細胞周期の制御やDNA損傷への応答、細胞のストレス処理、信号を認識する粒子の組み立ても手伝ってる。
最近、科学者たちは核小体には、細胞の他の部分からそれを隔てる膜がないことを発見したんだ。むしろ、液体の雫みたいに集まる3つの異なる部分でできてるんだ。それらはフィブリラ中心(FC)、濃密フィブリラ成分(DFC)、顆粒成分(GC)と呼ばれてる。FCは真ん中にあって、DFCに囲まれ、その両方がGCの中に含まれているんだ。これらの部分は、それぞれリボソームの構築に特化した役割を持ってるよ。
ユビキチン化とその影響
ユビキチン化は、ユビキチンという小さなタンパク質が他のタンパク質に付いて、その挙動に影響を与えるプロセスなんだ。この付着は、タンパク質がどう分類されるかや、細胞内でどう動くかを変えることができる。核小体に関連して、ユビキチン化はウイルスタンパク質HeV MがFCとDFCとどう関わるかに重要な役割を果たしているよ。ユビキチンの有無は、どれだけウイルスが作られるかを決めるのに役立つんだ。
これを調べるために、科学者たちは特別な細胞を使って、HeV Mタンパク質の振る舞いを見ようといろんな物質で処理したんだ。すると、HeV Mタンパク質は早い段階でFCとDFCの部分に見られることがわかったんだけど、特定の処理をした後、その量が変わって、ユビキチン化がタンパク質の分配に影響を与えていることを示してた。
ウイルス攻撃を受ける核小体
核小体はさまざまなウイルスの一般的な標的なんだ。この標的化はウイルスが細胞の機能をコントロールするのを助けて、複製を助けるんだ。多くのウイルスが核小体に影響を与えるけど、彼らのタンパク質の正確な影響はまだ完全には理解されていないんだ。特にRNAウイルスは、あまり遺伝子材料を持っていないのに、核小体をターゲットにするんだよ。
HeV Mタンパク質は、感染中に核小体に到達するウイルスのタンパク質の一つなんだ。このタンパク質は自分自身と安定したペアを作ることができて、ウイルスが細胞を組み立てて脱出するために重要なんだ。興味深いことに、HeV Mタンパク質は、ウイルスが脱出するのを助けるために、細胞の外膜に移動する前に核小体に行くんだよ。
遺伝子研究を通じて、研究者たちは核小体のタンパク質が感染に重要で、HeV Mタンパク質がそれらの多くと相互作用することを学んだんだ。新たに特定されたHeV Mタンパク質の役割は、リボソームRNA(rRNA)を作るのに役立つ核小体のタンパク質Treacleとの相互作用だよ。もしHeV Mタンパク質がTreacleに結合すると、通常のrRNAの生成を妨げて、細胞の機能を乱すことができるんだ。
HeV Mタンパク質の変異
研究者たちは、HeV Mタンパク質の特定の部分を変えることで(ある部分を別のもので入れ替えることで)、FCとDFCでの働きに影響を与えることができることを発見したんだ。この特定の変更はHeV Mタンパク質が自分自身とペアを作るのを止めさせて、ウイルスが核小体から脱出する能力も減少させるんだ。これが、こうした変異がタンパク質の動きや細胞内の他の構成要素との相互作用にどう影響するかを調査するきっかけとなった。
特定の変化、すなわちアミノ酸が1つ変わることによって、HeV Mタンパク質が異なる挙動をすることがわかった。この変異はFC-DFC部分に入るのを妨げるけど、GCに到達するのは止めないんだ。これを標準的なバージョンと比較することで、研究者たちはタンパク質の異なる部分が核小体での挙動にどう影響するかを理解しているよ。
核小体内のタンパク質の動き
研究によると、HeV Mタンパク質は核小体の中で動いたり位置を変えたりできるんだ。ウイルスが細胞に入った初期には、HeV Mタンパク質がFC-DFCに集まるんだけど、時間が経つにつれてそのエリアでの濃度が低くなって広がっていくんだ。この動きは、ウイルスタンパク質が特定の区画に入るところから始まり、そこを出て行くプロセスを示しているよ。
HeV Mタンパク質が核小体でどう動くかを理解するのは重要だよ。タンパク質の動きを追うことで、研究者たちはその行動のタイミングや、Treacleを含む他の構成要素との相互作用を学ぶことができるんだ。
ユビキチン化の重要性
ユビキチン化はHeV Mタンパク質が核小体でどこに行くかを調整するのを手伝っているんだ。研究者たちは、ユビキチン化のプロセスが妨げられると、HeV Mタンパク質がFC-DFC部分にうまくとどまれなくなることを発見したんだ。これは、ユビキチン化がタンパク質の局在にとって必要不可欠だということを示しているよ。
科学者たちが細胞をユビキチン化のプロセスをブロックする物質で処理したとき、HeV Mタンパク質がFC-DFCの代わりにGCに蓄積し始めたんだ。これは、ユビキチンを追加できなくなることでタンパク質の分類や位置が変わることを示しているんだ。
オリゴマー化とその役割
オリゴマー化は、タンパク質が一緒にくっついて大きな構造を形成するプロセスを指すんだ。HeV Mタンパク質がオリゴマーを形成する能力は、核小体内での局在に影響を与えているよ。研究者たちは、特定の変異を持つHeV Mタンパク質がFC-DFCにより多く蓄積されることを発見したんだ。これはオリゴマー化がそのタンパク質が部分とどう相互作用するかに役割を果たしていることを示しているんだ。
いろんなHeV Mタンパク質のバリアントの挙動を観察する中で、いくつかがFC-DFCに長く留まったり、Treacleとより良く関わることができることがわかったんだ。これはウイルスの影響を受ける中で、タンパク質がどう動き、どう相互作用するかの複雑さを浮き彫りにしているよ。
将来の研究への示唆
HeV Mタンパク質が核小体とどう相互作用するか、またその動きのメカニズムを理解することは、より広い関連性を持つ可能性があるんだ。この発見は、特に難治なヘニパウイルスによるウイルス感染対策の新たな戦略を見つける手助けになるかもしれない。
研究者たちは、この知識がより良い抗ウイルスアプローチにつながり、細胞プロセスをどう操作できるかの洞察を提供することを望んでいるんだ。核小体内でのタンパク質の動きや相互作用の調整は、ウイルス研究だけでなく、特にRNA生成や細胞のストレス応答に関連する正常な細胞機能を理解する上でも重要だよ。
結論
核小体は細胞機能において重要な役割を果たしていて、ウイルスとの相互作用はこれらの病原体が宿主細胞にどのように影響を与えるかを明らかにできるんだ。HeV Mタンパク質はこのプロセスで重要な役割を果たしていて、タンパク質の動きや修飾、相互作用の入り組んだ踊りを示しているよ。これらのダイナミクスを研究することで、研究者たちはウイルス感染や細胞メカニズムの複雑さを解明できるかもしれなくて、新しい治療戦略につながることが期待されるんだ。核小体やその成分の調整に関する研究は、ウイルス病をより良く対処する方法を見つけるための有望な道だよ。
材料と方法
細胞培養、トランスフェクション、処理
HEK-293TとHeLaという細胞を特別な栄養溶液(DMEM)で育てて、細胞の健康を促進するためにタンパク質や抗生物質を含んでいたよ。細胞がほぼ満杯になるまで育てた後、新しいDNAを導入したんだ。この導入はトランスフェクションという方法で行われて、細胞が新しい遺伝子材料を取り込むのを助けるんだ。
タンパク質がどう振る舞うかを研究するために、研究者たちはいくつかの細胞をMG132という化学物質で処理したんだ。これはタンパク質の修飾に影響を与えるんだ。この処理はDNAを導入した後、細胞を観察する前に行われたよ。これらの処理の効果は顕微鏡で観察された。
ウイルス感染
ウイルスの研究では、特定のウイルス(HeV)を専門のラボ(BSL-4)で扱って、安全を確保したんだ。ガラスに育てた細胞はウイルスに感染させたり、させなかったりして、さまざまな時間にチェックしてウイルスがどう影響を与えるかを見たよ。
共焦点レーザー走査顕微鏡(CLSM)と画像分析
細胞を可視化するために、研究者たちは生きた細胞のイメージング用に設計された高出力の顕微鏡を使ったんだ。タンパク質に蛍光タグを付けることで、細胞内の異なるタンパク質の位置を見えるようにしていたよ。
定量分析は、細胞の異なる部分からの蛍光の強度を測定することで行われ、タンパク質が核小体でどのように分配されているかを理解するのに役立ったんだ。
免疫蛍光
研究者たちは抗体を使って固定した細胞の特定のタンパク質にラベルを付け、蛍光染料を使用して顕微鏡で興味のあるタンパク質を可視化できるようにしたんだ。
RNA合成アッセイ
細胞が新しいrRNAをどれだけ生産しているかを調べるために、研究者たちは生きた細胞のRNAにラベルを付ける特別なキットを使ったんだ。これにより顕微鏡で可視化できるようになるんだ。定量分析では、HeV Mタンパク質を表現している細胞と、そうでないコントロール細胞の間でrRNAの生成レベルを比較したよ。
免疫沈降とウェスタンブロッティング
この方法は、細胞抽出物から特定のタンパク質を引き出して相互作用を分析することを含むんだ。タンパク質を抽出した後、それらを分離し、膜に移し、特定の抗体でプローブして、興味のあるタンパク質を可視化するんだ。
超解像イメージング
研究者たちは細胞内の特定の構造をより詳しく見るために先進的なイメージング技術を利用したんだ。この方法は、従来の顕微鏡技術よりもはるかに良い解像度を提供して、細胞内小区画の理解を深めるのに役立つんだ。
補足情報
このセクションには、実験の結果をサポートする追加の図やデータが含まれていて、実施した実験に関連する詳細な分析や結果を示しているよ。実験的方法は主本文と一貫していて、研究から得られた結論を強化しているんだ。
タイトル: Sub-nucleolar trafficking of Hendra virus matrix protein is regulated by ubiquitination and oligomerisation
概要: Hendra virus (HeV) is a highly pathogenic member of the Henipavirus genus (order Mononegavirales), the replication cycle of which occurs primarily in the cytoplasm. The HeV matrix protein (HeV M) plays critical roles in viral assembly and budding at the plasma membrane, but also undergoes nuclear/nucleolar trafficking, to accumulate in nucleoli early in infection and, later, localise predominantly at the plasma membrane. Previously we found that HeV M protein targets specific sub-nucleolar compartments (corresponding to the FC-DFC (fibrillar centre (FC)/dense fibrillar component (DFC)) where it interacts with the nucleolar protein Treacle and modulates rRNA biogenesis by subverting the host nucleolar DNA damage response, indicating the importance of specific sub-nucleolar trafficking to infection. However, the mechanisms underlying targeting and movement between sub-nucleolar compartments by viral or cellular proteins remain poorly defined. Here, we assessed the molecular regulation of HeV M protein nucleolar/sub-nucleolar trafficking, finding that in infected cells and in cells expressing HeV M protein alone, M protein localizes into Treacle-enriched FC-DFC at early time points, and that FC-DFC localization is subsequently lost due to relocalization into the surrounding granular component (GC) of the nucleolus. Analysis using mutated M proteins and pharmacological modulation of ubiquitination indicate that this dynamic localization is regulated by ubiquitination and oligomerisation, with ubiquitination required for retention of HeV M in Treacle-enriched sub-nucleolar compartments, and oligomerisation required for egress. To our knowledge, this study provides the first direct insights into the dynamics and mechanisms of viral protein trafficking between sub-nucleolar compartments, important to the interplay between HeV M protein and host cell factors during infection. AUTHOR SUMMARYHenipaviruses, including Hendra (HeV) and Nipah viruses, cause deadly diseases in humans and livestock and are considered priority diseases by the World Health Organization due to their epidemic potential and lack of effective treatments. Understanding how these viruses interact with host cells is essential for developing new therapeutics. Our study examines the matrix (M) protein of henipaviruses and its interaction with the nucleolus, a cell structure that mediates ribosome production, and is a common target for various viruses, although their functions are largely unresolved. Previously, we showed that the HeV M protein targets a sub-nucleolar structure, called the FC-DFC, to modulate ribosome biogenesis. Here, we report that the M proteins movement between sub-nucleolar compartments is controlled by two processes: ubiquitination, which causes accumulation of the protein in the FC-DFC, and oligomerization, which is associated with exit. Similar mechanisms are also observed in other henipaviruses. Our findings reveal mechanisms regulating the hijacking of host cell functions by henipaviruses and suggest new potential targets for antiviral therapies. This study is the first to investigate how viral proteins move within the nucleolus, offering new insights into interactions that may be significant to multiple viruses.
著者: Stephen M Rawlinson, T. Zhao, F. A. Gomez, C. T. David, C. L. Rootes, P. F. Veuglers, A. M. Rozario, C. R. Stewart, T. D. M. Bell, G. W. Moseley
最終更新: 2024-07-17 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.10.552741
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.10.552741.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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