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# 生物学# 神経科学

老化する脳のマッピング: 新しい洞察

研究者たちは、細胞の変化を理解するために老化した脳の詳細な地図を作成した。

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老化した脳の地図老化した脳の地図を明らかにしたよ。新しい発見が、老化した脳の重要な細胞変化
目次

年を取るにつれて、脳は様々な変化を遂げて、アルツハイマーや他のタイプの認知症のリスクが高まるんだ。これらの変化は細胞レベルで起こるから、異なる細胞タイプの相互作用にも影響が出る。しかし、現在の研究の多くはこれらの細胞が脳のどこにあるか、その位置が相互作用にどう影響するかを考慮していないんだ。

空間的理解の必要性

単一細胞技術を使った研究は、脳の細胞が年を取るにつれてどう変わるかについてたくさんの情報を提供している。でも、これらの研究はよく重要な要素を見落としてる。それは空間的文脈。これらの変化が脳のどこで起こるかを理解することで、相互作用が老化や病気にどう影響するかをより明確に把握できる。この知識は、異なる細胞タイプがどう協力し合っているかや、特定の希少な細胞が隣接する細胞にどう影響するかを研究するのに役立つんだ。

技術の進歩

最近の空間技術の改善により、細胞を物理的な文脈で見るのが簡単になった。最近の研究では、加齢による脳の空間的変化を調べ始めているけど、大体は空間的または時間的変化のどちらかに焦点を当てていて、両方を同時に見てない。高解像度の空間的および時間的データが不足しているから、特定の細胞タイプが年齢とともにどう変化・相互作用するかを理解するのが難しい。

老化したマウス脳の新しい地図を作成

この研究では、研究者たちが老化したマウス脳の初の広範な地図を作成したんだ。若いマウスから老齢のマウスまで、さまざまな年齢の脳サンプルを集めて、MERFISHという先進技術を使って個々の細胞の遺伝子活動に関する詳細な情報を集めた。

研究者たちは皮質や線条体、海馬などの脳の領域に焦点を当てた。複数の年齢グループから多くの細胞データを集めることで、脳の老化が細胞の振る舞いにどう影響するか、そして異なる治療がどのように役立つかをよりよく理解することを目指した。

地図からの洞察

異なる年齢の細胞を分析することで、研究者たちはマウスが年を取るにつれて細胞タイプに劇的な変化があることを発見した。例えば、免疫細胞や特定の支持細胞の割合が増えた一方で、神経幹細胞や神経前駆細胞の数は年齢とともに減少していた。これらの変化はさまざまな脳の領域で観察され、老化が脳の細胞の風景に影響を与えることを示している。

研究者たちはまた、年齢とともに発現が変わる特定の遺伝子を特定した。これらの遺伝子の多くは免疫応答や代謝、脳が正常に機能するために重要なプロセスに関連している。この結果は、老化が脳の遺伝子発現や細胞構成をどのように変えるかを強調している。

若返りの影響

研究では、運動や部分的な再プログラミングのような特定の介入が老化した脳にどう影響するかを調査した。運動したり特別な遺伝子治療を受けたマウスと、そうでないマウスを比較した結果、いくつかの細胞タイプが介入の結果として若返りの兆候を示した。

例えば、運動は脳の血管細胞の一部をより若々しい状態に戻しているように見えた。同様に、部分的再プログラミングに関する治療もいくつかの細胞タイプに良い影響を与えた。ただし、すべての変化が良いわけではなく、一部の細胞タイプは早熟の兆候を示していて、介入に対する反応が複雑であることを示している。

老化時計:新しいツール

生物学的老化をよりよく理解するために、研究者たちは「空間的老化時計」という新しい機械学習モデルを開発した。この時計は収集した遺伝子発現データを使って、個々の細胞の生物学的な年齢を予測する。これにより、どの細胞が期待以上に老化しているかを特定する手助けになる。

全体的に、これらの老化時計は多様で、さまざまなデータセットに適用して、異なる条件における老化の影響を追跡できる。様々な介入が老化プロセスに与える影響を定量化する方法を提供して、研究者たちが効果的な治療法を特定するのを助けるんだ。

隣接効果の調査

この研究で重要な問いは、ある細胞が隣接する細胞の老化に影響を与えるかどうかということだ。研究者たちは、ある細胞タイプの近接が別の近くの細胞の老化にどう影響するかを調べた。異なる細胞タイプ間に重要な関係があることがわかり、ある細胞が周囲の老化に著しい影響を持つことが示唆された。

例えば、免疫細胞の一種であるT細胞は隣接する細胞の老化を促進しているようで、神経幹細胞は近くの細胞を若返らせているように見えた。これらの発見は、老化した脳における細胞の相互作用が老化が細胞レベルでどう起こるかを理解する上で重要であることを示している。

T細胞と神経幹細胞の役割

T細胞は隣接する細胞に強い影響を与えて、しばしばその老化プロセスを加速させることが示された。これは驚くべきことで、T細胞は一般的に保護的だと思われていたから。この研究は、T細胞が周囲にネガティブに貢献する可能性があることを強調している、特に老齢のマウスにおいて。

逆に、神経幹細胞は近隣の細胞に若返り効果を示し、老化細胞に若々しい特徴を回復させる手助けをするかもしれない。これらの観察は、特定の免疫細胞が老化を加速させる一方で、幹細胞がその影響を逆転させることができる複雑な相互作用を示唆している。

細胞相互作用の背後にあるメカニズム

これらの影響がどのように起こるかを理解するために、研究者たちは追加の技術を使って遺伝子発現を分析し、老化プロセスに関与する経路を特定した。T細胞における近くの細胞の振る舞いに変化をもたらす可能性のあるシグナル伝達メカニズムを調べた。これには、インターフェロンシグナルが近くの細胞の老化を促進する方法を研究することが含まれた。

神経幹細胞に関しては、近隣の細胞を若返らせる可能性を示唆する脂質代謝や成長因子に関連する経路が特定された。

結論

この包括的な研究は、老化が脳に与える影響を細胞レベルで理解する上で貴重な洞察を提供する。新しい技術と分析ツールの組み合わせにより、老化プロセスの理解が深まり、老化関連の病気に対する治療ターゲットが見えてくる。

結果は、老化した脳における細胞変化の空間的および時間的側面の両方を考慮する重要性を強調している。異なる細胞タイプの複雑な相互作用を解明することで、研究者たちは老化を通じて脳の健康と抵抗力を促進するための戦略をよりよく特定できるようになる。

将来の方向性

今後の研究では、これらの発見を実践的な介入にどう翻訳できるかを探る必要がある。ライフスタイルの変更、遺伝子治療、薬物療法などが考えられる。健康的な脳の老化を支援し、神経変性疾患の影響を軽減するための戦略を開発する可能性が広がっている。

要するに、老化した脳に関する理解が深まることで、特に空間分析を通じて、認知の低下や神経変性の状態に対処する新しい道が開ける。これは未来の研究にとってワクワクする分野なんだ。

オリジナルソース

タイトル: Spatiotemporal transcriptomic profiling and modeling of mouse brain at single-cell resolution reveals cell proximity effects of aging and rejuvenation

概要: Old age is associated with a decline in cognitive function and an increase in neurodegenerative disease risk1. Brain aging is complex and accompanied by many cellular changes2-20. However, the influence that aged cells have on neighboring cells and how this contributes to tissue decline is unknown. More generally, the tools to systematically address this question in aging tissues have not yet been developed. Here, we generate spatiotemporal data at single-cell resolution for the mouse brain across lifespan, and we develop the first machine learning models based on spatial transcriptomics ( spatial aging clocks) to reveal cell proximity effects during brain aging and rejuvenation. We collect a single-cell spatial transcriptomics brain atlas of 4.2 million cells from 20 distinct ages and across two rejuvenating interventions--exercise and partial reprogramming. We identify spatial and cell type-specific transcriptomic fingerprints of aging, rejuvenation, and disease, including for rare cell types. Using spatial aging clocks and deep learning models, we find that T cells, which infiltrate the brain with age, have a striking pro-aging proximity effect on neighboring cells. Surprisingly, neural stem cells have a strong pro-rejuvenating effect on neighboring cells. By developing computational tools to identify mediators of these proximity effects, we find that pro-aging T cells trigger a local inflammatory response likely via interferon-{gamma} whereas pro-rejuvenating neural stem cells impact the metabolism of neighboring cells possibly via growth factors (e.g. vascular endothelial growth factor) and extracellular vesicles, and we experimentally validate some of these predictions. These results suggest that rare cells can have a drastic influence on their neighbors and could be targeted to counter tissue aging. We anticipate that these spatial aging clocks will not only allow scalable assessment of the efficacy of interventions for aging and disease but also represent a new tool for studying cell-cell interactions in many spatial contexts.

著者: Eric D Sun, O. Y. Zhou, M. Hauptschein, N. Rappoport, L. Xu, P. Navarro Negredo, L. Liu, T. A. Rando, J. Zou, A. Brunet

最終更新: 2024-07-19 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.16.603809

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.16.603809.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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