種とバイオームの関係を理解する
種が生態系とどうつながって、時間の経過とともに変化に適応するかを調べる。
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バイオームは、特定の気候、植物、生物種によって特徴づけられる広い地域のこと。各バイオームは、似たような生態的ニーズを持つ様々な種をサポートして、一緒に生活してる。種は、基本的に自分の生存に適した条件を提供する特定のバイオームでしか繁栄できないんだ。
種とバイオーム
各種には、住める範囲がある。この範囲は、その地域にあるバイオームの中でもほんの数個に限られることが多い。特定のバイオームで生き残るためには、他の種と効率的に競争する必要があって、その地域の環境条件に耐える必要がある。もしある種が長い間そのバイオームに存在し続けると、生物学者たちはその種がそのバイオームとの特別なつながりを持っていると認識するんだよね。
種の親和性の歴史的変化
時間が経つにつれて、種は関連するバイオームを変えることがある。歴史的な記録によれば、多くの種がバイオーム間で親和性を変えてきたことが示されていて、これは現在の生物多様性の分布を理解する上で重要なんだ。こうした変化は、環境の変化、長距離の移動、気候の変化など、様々な理由で起こることがある。
ある種のグループは、特定のバイオームにしか生息しない可能性が高く、変化は滅多に起こらない。一方で、他のグループは頻繁に異なるバイオームの間を移動したり、新しい条件に適応したりすることがある。この特化や一般化の背後にある要因を知ることは、科学者たちがどうやってコミュニティが形成され、時間をかけて適応していくのか、また種がどのように絶滅するのかを学ぶ手助けになるんだ。
系統発生モデル
これらの関係をさらに研究するために、科学者たちは系統発生モデルを使う。このモデルは、種が時間とともに異なるバイオームとのつながりをどのように得たり失ったりするかを理解するのに役立つんだ。通常、種はそこで生きているのが観察される場合にのみ、バイオームに関連付けられると仮定されている。でも、侵入種のように、歴史的に存在しなかったバイオームで繁栄する種もいる。
生態学者は、種の生息地との関係を説明するために、基礎的ニッチと実現されたニッチという2つの重要な概念を使う。基礎的ニッチは、競争や障壁なしに種が成長できる全ての環境条件を指し、実現されたニッチは、現在その種が見つかる特定の条件で、競争や他の要因によって絞り込まれることが多い。
バイオームの親和性の確立
確立されたバイオームの親和性、つまり種が現在見つかる生息地と、潜在的に適した生息地に住む可能性のある有効な親和性を区別することが大事だ。この違いは、種が環境にどう適応するか、または将来の変化にどう反応するかを知る手掛かりを提供することがある。
特定のモデルの目的は、種がこれらの異なる親和性を得たり失ったりした時期を推定すること。これに新しい方法、RFBSがあって、親和性のタイプを区別して、種、バイオーム、そしてそれらが進化する様子をよりよく表現できる。
RFBSモデル
RFBSは、種が進化する過程でバイオームとの関係をどう変化させるかをモデル化する方法。モデルは、3つのバイオーム関係のカテゴリーで動く:親和性なし、有効な親和性、確立された親和性。
- 親和性なし (0): 種はバイオームに何のつながりもない。
- 有効な親和性 (1): 種は機会があればバイオームで生き残れる。
- 確立された親和性 (2): 種は現在そのバイオームで生きてて繁栄している。
モデルは、確立された親和性が有効な親和性の一部であると仮定している。つまり、もし種がバイオームに確立されているなら、そこを耐えられるとも言える。でも、種が有効な関係なしにバイオームに確立されることはできない、そこでは生き残れないから。
親和性の変化
モデルは、時間とともに種がこれらの異なる状態の間をどう移動するかを追跡する。主要なプロセスは、アナジェネシス(種内の時間の経過)とクラドジェネシス(種が2つの新しい種に分かれる時)だ。
アナジェネシスの間に、種は確立されたり有効な親和性を得たり失ったりできる。例えば、新しいバイオームに対する関係を得ることは段階的に起こることがある。まず、その種は新しいバイオームに対して耐性を持つようになり(有効)、その後、そのバイオームに確立される。
クラドゲネティックイベントは、種が2つの新しい種に進化する時に関係がどう引き継がれるかを示す。さまざまな継承シナリオによって、新しい種は先祖の種からバイオームの親和性を得たり、失ったり、保持したりする可能性がある。
RFBSの実用的な応用
RFBSは、種の適応や生態的関係を調査するために様々な研究に応用できる。この方法を使って、都市環境が特定の種にどんな影響を与えるか、食事が獲物との相互作用にどう影響するか、病原菌が種間でどう広がるかを研究することができる。
これらの関係を適切にモデル化するために、研究者は観察データ、実験結果、種の自然史からの発見を使うことができる。
RFBSのテスト
研究者は、さまざまな進化シナリオを反映させたシミュレーションを使ってRFBSをテストした。彼らは、樹木のサイズや以前の分布など、異なる条件下でどのようなパターンが浮かび上がるかを探った。これにより、モデルがどれだけパラメータや先祖の状態を推定できるかを判断できる。
これらのシミュレーションからの結果は、RFBSがうまく機能し、データが限られているときでも正確な親和性や先祖の状態を検出できることを示した。
ビバルナムのケーススタディ
RFBSの効果を示すために、科学者たちはビバルナムという花の植物群にモデルを適用した。このグループは、多くの種が様々な森林バイオームで育つ。以前の研究では、ビバルナムの先祖が温かい地域に住んでいたという一方で、他の研究では寒冷な環境が示されていた。
RFBSを使った研究では、ビバルナム種の温暖な温帯起源に強い支持が得られた。温暖な温帯や寒冷な温帯地域に対する有効な親和性の一貫したパターンが特定され、熱帯環境にも一部の支持があった。
ビバルナムの歴史についての新しい理解は、これらの種が変化する気候や環境にどう適応してきたかを明確にするのに役立つ。
RFBSの未来
RFBSを使うことで、研究者たちは種が時間とともに環境とどのように相互作用するかをよりよく理解するための新しいツールを手に入れた。この方法は、親和性がどう変化するか、それがどう受け継がれるか、絶滅率がバイオームの関係にどう影響されるかを詳細に探ることを可能にする。
まだ探るべき疑問がたくさんあって、バイオーム間の変化が絶滅リスクにどう影響するかや、適応力が新しい生息地の探求にどう寄与するかなどがある。さらなるデータが得られれば、RFBSは種とその環境との複雑な相互作用を明らかにするために多様な生態学的知識を取り入れた新たな研究を支援できる。
結論
バイオームは、種が住む生態的な景観を形作る上で重要な役割を果たしている。種とバイオームの関係を理解することは、生物多様性の研究や環境変化の潜在的な影響を探る上で欠かせない。RFBSのようなモデルを使うことで、研究者たちは種の動的な歴史と、未来の環境にどう適応したり変わったりするかをより深く洞察できるんだ。
タイトル: A Phylogenetic Model of Established and Enabled Biome Shifts
概要: Where each species actually lives is distinct from where it could potentially survive and persist. This suggests that it may be important to distinguish established from enabled biome affinities when considering how ancestral species moved and evolved among major habitat types. We introduce a new phylogenetic method, called RFBS, to model how anagenetic and cladogenetic events cause established and enabled biome affinities (or, more generally, other discrete realized versus fundamental niche states) to shift over evolutionary timescale. We provide practical guidelines for how to assign established and enabled biome affinity states to extant taxa, using the flowering plant clade Viburnum as a case study. Through a battery of simulation experiments, we show that RFBS performs well, even when we have realistically imperfect knowledge of enabled biome affinities for most analyzed species. We also show that RFBS reliably discerns established from enabled affinities, with similar accuracy to standard competing models that ignore the existence of enabled biome affinities. Lastly, we apply RFBS to Viburnum to infer ancestral biomes throughout the tree and to highlight instances where repeated shifts between established affinities for warm and cold temperate forest biomes were enabled by a stable and slowly-evolving enabled affinity for both temperate biomes.
著者: Sean W McHugh, M. Donoghue, M. J. Landis
最終更新: 2024-09-02 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.30.610561
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.30.610561.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。