イネにおけるSiRプロモーターの役割を解明する
研究が、SiRプロモーターを通じてコメの収量を向上させる可能性を明らかにした。
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多細胞性は生命の進化において重要なステップだよ。これによって、特定の機能を果たす異なる種類の細胞が発展できるんだ。この専門性は特に植物で見られるし、特に水から陸に移動してから顕著だね。時間が経つにつれて、植物が光合成に使う構造がより複雑になってきた。例えば、マーチャンティア・ポリモルファみたいなウィキウィキゴケには、いくつかの異なる細胞タイプで構成された「フタルス」って構造があるんだ。その中のいくつかの細胞、特に特定の構造の基部にあるものは、光合成に必要なクロロプラストをたくさん含んでいるよ。
同じように、アブラナ科のアラビドプシス・タリアナの葉には少なくとも9種類の異なる細胞があるんだ。最近の技術で、個々の細胞を調べるとさらに多くの細胞のタイプが見つかったんだ。米も、葉の中に複雑な細胞の配列があって、細胞の研究に基づいてさらに多くの種類が予測されているよ。米では、葉のすべての主要な細胞タイプで光によって光合成が始まる。最も光合成を行う細胞は「スポンジ状メソフィル細胞」と「パリセードメソフィル細胞」として知られているけど、他のタイプも貢献しているんだ。
植物の葉の中で重要な細胞タイプのひとつが「束鞘」。これは水や栄養素を運ぶ維管束を取り囲む光合成細胞のリングなんだ。これらの細胞の遺伝子機能はあんまりわかっていないよ。いくつかの遺伝子が束鞘に積極的に関与していることは知られているけど、これら特定の細胞で遺伝子の活動をうまく推進するプロモーターはあまり特定されていないんだ。
束鞘の機能
束鞘は植物機能において複数の役割を果たしているんだ。葉脈から光合成メソフィルへの水の輸送を手助けしたり、植物の中の硫黄や窒素などの元素を管理するのにも関わっているよ。いくつかの植物は、これらの細胞を使って害虫から自分たちを守る化学物質を貯蔵することもあるんだ。面白いことに、さまざまな植物種では、束鞘がC4と呼ばれる特定の形式の光合成を可能にする役割を進化させてきたよ。
すべての被子植物において束鞘細胞が共通して存在しているにもかかわらず、これらの細胞内での遺伝子発現を制御する詳細なプロセスはあんまりわかっていない。遺伝子発現に関係する転写因子の数は少なくて、まだ多くが未解明なんだ。
米に関する研究
米は重要な作物で、世界の食料供給の大部分を占めているんだ。C4光合成を米に組み込む可能性は、すっごく興味深い研究分野だよ。C4光合成は、もっと一般的なC3光合成に比べて光、水、窒素を効率よく使うことで知られているんだ。C4の特徴を米に導入できれば、収量を大幅に増やせるかもしれないね。
C4光合成を機能させるには、束鞘細胞内で特定の遺伝子が発現する必要があるんだ。これらの遺伝子には、C4酸を分解したり、有機酸を輸送したり、カルビン回路を促進したりするものが含まれているよ。ただし、遺伝子発現を促進する技術はあっても、米の束鞘でこのプロセスをうまく推進するための適切なプロモーターはまだ見つかっていないんだ。
新しいプロモーターの発見
米の束鞘により強力で効果的なプロモーターを見つけるために、研究者たちはこれらの細胞での遺伝子発現パターンを観察することに焦点を当てたんだ。広範なテストの結果、束鞘内で高い発現レベルの遺伝子に関連するいくつかの有望なプロモーターが特定されたよ。一つの特定のプロモーターは、SULFITE REDUCTASE(SiR)として知られる遺伝子から来たもので、束鞘内で特に強い活性を示したんだ。
このSiRプロモーターは、その活性をよりよく理解するためにさらに研究されたよ。詳細な調査で、このプロモーター内の特定のセグメントが、束鞘に特化した遺伝子発現を導くために重要であることが明らかになったんだ。
エンハンサーの役割
エンハンサーは、遺伝子発現を調整するのに役立つDNAの配列なんだ。これらは遠くからも機能して、遺伝子がオンまたはオフになるタイミングや方法に影響を与えることができるよ。SiRプロモーターには、束鞘内での活性に必要な遠位エンハンサー領域が含まれていて、いくつかの重要な要素から成り立っているんだ。
研究者たちがSiRプロモーターを分析したとき、特定のセグメントを削除すると束鞘での発現を促進する能力に影響を与えることに気付いたんだ。約980から394のヌクレオチドの領域がこの機能にとって必要であることがわかったんだ。このセグメントを削除すると、束鞘での発現が消えることがわかったよ。
さらに、この分析でプロモーター内の他のセグメントも遺伝子発現を微調整する役割を果たしていることが明らかになった。この要素の複雑な配置により、SiRプロモーターはさまざまな要因に応じて効果的に発現を調整できるんだ。
転写因子の重要性
転写因子は特定のDNA配列に結合して、遺伝情報の流れを制御するのを手助けするタンパク質なんだ。SiRプロモーターの場合、いくつかの転写因子がプロモーターの異なる領域と相互作用することがわかったよ。
さまざまな実験を通じて、特定の転写因子がSiRプロモーターの活性に必要であることが示されたんだ。その中には、いくつかの要素が協力して遺伝子発現を活性化するものもあったよ。
発現の向上
実用的な応用に関して、研究はSiRプロモーターの発現を強化することで、米の改良に向けた進展をもたらす可能性があることを示しているんだ。SiRプロモーターの活性を増幅する戦略を使うことで、研究者は米の束鞘内でより強力な遺伝子発現を引き出せるかもしれないね。これにより、新しい特性を取り入れたり、収量を改善することが可能になるかもしれないよ。
研究は、SiRプロモーターをさまざまなコアプロモーターと組み合わせることで発現レベルを増加できることがわかったんだ。このプロモーター内の配列の長さやタイプがその効果に寄与していることが明らかになったよ。
植物育種への影響
SiRプロモーターとその機能に関する発見は、植物育種や遺伝子工学にとってワクワクする可能性を秘めているんだ。米の束鞘細胞での遺伝子発現を制御するメカニズムがよりよく理解できるようになったことで、これらの細胞をもっと効率的に操作できるようになるかもしれないよ。これが米の栄養価向上やストレス耐性の改善といった特性の強化につながるかもしれないんだ。
結論
SiRプロモーターの役割を探求することは、複雑な植物生物学を理解するための新しい道を開いたよ。特定の細胞での遺伝子発現メカニズムを解明することで、研究者は作物植物のターゲット改善のための戦略を開発できるんだ。この作業は、世界の食料需要が高まる中で重要で、より効率的な農業の実践を開発することに直接貢献しているよ。遺伝子調節ネットワークへのさらなる調査は、新しい植物科学や農業の革新につながるさらなる洞察をもたらすことを約束しているんだ。
タイトル: A transcription factor quintet orchestrating bundle sheath expression in rice
概要: C4 photosynthesis has evolved in over sixty plant lineages and improves photosynthetic efficiency by [~]50%. One unifying character of C4 plants is photosynthetic activation of a compartment such as the bundle sheath, but gene regulatory networks controlling this cell type are poorly understood. In Arabidopsis a bipartite MYC-MYB transcription factor module restricts gene expression to these cells but in grasses the regulatory logic allowing bundle sheath gene expression has not been defined. Using the global staple and C3 crop rice we identified the SULFITE REDUCTASE promoter as sufficient for strong bundle sheath expression. This promoter encodes an intricate cis-regulatory logic with multiple activators and repressors acting combinatorially. Within this landscape we identified a distal enhancer activated by a quintet of transcription factors from the WRKY, G2-like, MYB-related, IDD and bZIP families. This module is necessary and sufficient to pattern gene expression to the rice bundle sheath. Oligomerisation of the enhancer and fusion to core promoters containing Y-patches allowed activity to be increased 220-fold. This enhancer generates bundle sheath-specific expression in Arabidopsis indicating deep conservation in function between monocotyledons and dicotyledons. In summary, we identify an ancient, short, and tuneable enhancer patterning expression to the bundle sheath that we anticipate will be useful for engineering this cell type in various crop species.
著者: Julian M Hibberd, L. Hua, N. Wang, S. Stanley, R. Donald, S. Kumar Eeda, K. Billakurthi, A. R. Borba
最終更新: 2024-09-12 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.17.599020
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.17.599020.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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