ラジオミクスと肺癌:新しい道
肺がんにおける免疫反応の評価におけるCT画像診断の役割を探る。
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肺がんは、世界中でがん関連の死因として最も多いんだ。非小細胞肺がん(NSCLC)の治療法は改善されてきたけど、手術が多くの患者にとって主要な選択肢になってる。でも、手術を受けられない人もいて、特にがんが肺を越えて広がっている場合はそうなんだ。病気の後半ステージの患者は、治療の選択肢がいろいろあって、抵抗や再発といった問題に直面することが多い。これが、肺がんの診断や予後を助けるための新しい効果的な方法が必要だってことを示してるんだ。
免疫系の役割
肺がんの発生には、腫瘍自体と周囲の生物環境の両方が関与してる。この環境は、遺伝的要因のミックスとがん細胞が免疫細胞や他の細胞とどうやって相互作用するかによって形作られる。肺がんの重要な側面の一つは免疫回避で、がん細胞が免疫反応を隠したり抑えたりすることなんだ。
免疫系が腫瘍にどのように反応しているかを測る一つの方法が、腫瘍浸潤リンパ球(TILs)を使うこと。これらは腫瘍エリアに移動した免疫細胞で、がんに対する免疫系の反応を示すことができる。TILsは、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、さまざまなタイプのT細胞など、異なる種類の免疫細胞で構成されている。特定の治療法、免疫療法は、NSCLC患者の生存率を改善することが示されている。免疫細胞が腫瘍内にどう広がっているかによって、研究者は腫瘍を「免疫炎症型」、「免疫砂漠型」、「免疫排除型」の3つに分類する。免疫炎症型の腫瘍は特定の免疫細胞が多く、免疫療法に対してよく反応することが多い。
今のところ、TILを測るのには通常、手術や生検を通して腫瘍からサンプルを採取する方法が使われてる。この方法には限界があって、侵襲的だし、腫瘍全体やその環境を正確に反映しないことがあるんだ。また、多くの患者は免疫療法に関連する副作用に悩まされていて、これが生活の質や医療費に影響を及ぼすこともある。だから、リスクを最小限に抑えながら、免疫療法の恩恵を受けられそうな患者を特定する非侵襲的な方法が必要なんだ。
画像技術の可能性
定量的画像は、医療画像から詳細な特徴を抽出することに焦点を当てた分野で、一般にラジオミクスと呼ばれている。コンピュータ断層撮影(CT)画像を使って、ラジオミクスは侵襲的手法を使用せずに腫瘍全体とその周囲を分析できる。この技術は腫瘍の空間的特徴を詳細に特徴づけることができ、がんが時間とともにどのように変化し、治療にどのように反応するかを追跡するのにも使える。
私たちの研究は、CT画像からのラジオミクス特徴が、がんと闘う重要な免疫細胞の一つであるCD8+リンパ球浸潤のレベルに基づいて患者を区別するのに役立つかどうかを調べたんだ。
材料と方法
私たちの研究を行うために、NSCLC患者のCT画像と遺伝子発現データを含む3つの公開データセットを使用した。CT画像と特定の遺伝子データの両方を持つ患者だけが対象だった。
一つのデータセットを使ってモデルを訓練し、他の2つをテストセットとして使用した。テストセットには、特に扁平上皮癌と腺癌の異なるタイプの肺がんを持つ患者が含まれていた。
評価した患者の中には、複数の腫瘍を持つ人もいた。私たちの分析では、生検の記述に合った腫瘍に焦点を当てたんだ。
私たちは、データセットの一つの患者に対してTILsのデータを収集するための専用プラットフォームを使用した。他のデータセットについては、利用可能なRNAシーケンシングデータを使って免疫プロファイルを推定した。
患者を高CD8+と低CD8+のグループに分類するために、各データセットでCD8+の平均レベルを計算し、各グループに特有のカットオフ値を設定した。
ラジオミクス特徴の抽出
ラジオミクスは、医療画像からの大量の定量的特徴を収集することを含む。これらの特徴は、腫瘍の特性に関する重要な洞察を提供できる。
これらの特徴を抽出するために、まず画像内の興味のある領域、特に病変を定義した。経験豊富な放射線科医が必要に応じてセグメンテーションを確認し調整した。研究に参加する患者にはサイズ制限を設けなかった。
専門のソフトウェアを使って、CT画像を分析に適した形式に変換し、各病変から1246のラジオミクス特徴を抽出した。これらの特徴には、腫瘍の形状や質感に関するさまざまな統計が含まれていた。
統計分析
私たちは特徴を取得した後、いくつかの分析を行った。最初に、あまり変動のない冗長な特徴を取り除いた。それから、CD8+レベルに基づいて患者を2つのグループに分類した。
2つのグループを区別できるかどうかを確認するために、さまざまな統計テストを適用した。p値が0.05未満を有意と見なした。
その後、選ばれた特徴がCD8+レベルを予測する能力を評価するためにロジスティック回帰モデルを使用した。このモデルを2つの独立したテストセットで検証し、高レベルと低レベルのCD8+浸潤レベルを区別する性能を測定した。
結果
私たちの分析を通じて、高CD8+レベルと低CD8+レベルを大きく区別できる3つの特定のラジオミクス特徴を特定することに成功した。これらの特徴は、訓練セットと独立したセットの両方でテストした際に有望な結果を得た。
さらに分析したところ、画像パターンが患者が免疫療法にうまく反応するかどうかを示す効果的な指標になり得ることがわかった。
結論
がん治療はますます免疫療法に向かっており、特に肺がんの文脈で顕著なんだ。腫瘍の免疫環境、特にTILを含む腫瘍は、治療反応や患者の生存率に関連していることが示されている。
この分野にはかなりの研究があるけど、腫瘍とそのマイクロ環境がどのように相互作用するかについてはまだ多くの疑問が残ってる。既存の研究はしばしば侵襲的方法に依存しており、腫瘍環境の複雑さを正確に表現できないことがある。
私たちの研究は、CT画像から得られた特徴が肺がんにおける免疫反応についての洞察を提供できることを示している。結果は、治療の意思決定を導くために、腫瘍の重要な特性をキャッチするためのラジオミクスを使う可能性を強調している。
進展はあるものの、ラジオミクスにおけるデータ収集と分析方法の標準化には課題が残っている。画像技術やデータ処理のばらつきが結果に影響を与える可能性があるんだ。これらの発見の信頼性を向上させるためには、より大きな一貫性とサンプルサイズが必要だ。
要するに、画像技術は腫瘍のCD8+レベルを決定するのに有望だけど、臨床環境で広く適用できる信頼性の高い方法を確立するためにはもっと努力が必要だ。このアプローチは、より個別化されたがん治療への道を提供して、成功する治療結果の可能性を高めることができるんだ。
タイトル: A CT-based radiomics approach for CD8+ lymphocytes infiltrationstratification in patients with non-small cell lung cancer
概要: BackgroundAccurate prediction of tumor microenvironment is crucial for optimizing decision making throughout cancer treatment process. Current biopsy or surgical-based approaches to assess tumor microenvironment are limited by their invasiveness and tumor heterogeneity. The present study aimed to investigate the association of computed tomography radiomics features and CD8+ lymphocyte infiltration levels for patients with non-small cell lung cancer. Materials and Methods283 patients with CT imaging and RNA-Seq data were collected from open-source data repositories. The study included three independent cohorts of non-small cell lung cancer patients, with one serving as the training set and the other two as external test sets. 1246 CT radiomics features were extracted. Three discriminative texture features were used to train the AI model. ResultsThe model, trained on discriminative features, achieved a mean area under the curve AUC-ROC of 0.71({+/-}0.17 std) on the training data. The AUC-ROC of the model on the two independent test sets is 0.67 (95% CI: 51%, 80%) on TCGA and 0.64 (95% CI: 51%, 74%) on LUNG3. ConclusionCT texture features can differentiate patients with high from low CD8+ lymphocyte infiltration levels. These features can non-invasively analyze the whole tumor and aid in the identification of patients that can respond to immunotherapy. Tweetable abstractTexture radiomics features on CT scans can aid in stratifying CD8+ lymphocyte infiltration levels for patients with NSCLC.
著者: Fadila Zerka, M. FELFLI, C. VOYTON, A. THINNES, S. JACQUES, Y. LIU, A. IANNESSI
最終更新: 2024-05-24 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.23.24307791
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.23.24307791.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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