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齧歯類の動き分析のための運動偏差指数の紹介

研究での齧歯類の動きを評価する新しい測定方法。

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目次

げっ歯類は、人間の健康問題を研究するためによく使われるよ、特に神経系に関連する問題、たとえば脊髄損傷、脳卒中、多発性硬化症、パーキンソン病とかね。筋肉や骨に関する問題を調べるためにも使われるんだ。げっ歯類が前肢をどれだけうまく動かすかを評価する一般的な方法は、食べ物を取るために手を伸ばしたりつかんだりする特定の作業を行うことだよ。これによって、科学者はげっ歯類がどれだけ機能できるか、病気がどのように進行するか、治療がどれだけ効果的かを理解する手助けになるんだ。

でも、これらの運動タスクは結構時間がかかるから、研究者が集められる情報が限られることがあるんだ。これらのタスクの結果は、たいていは何回げっ歯類が食べ物のペレットに成功したか、何回トライしたか、決まった時間内に取れたかとか、シンプルな指標でまとめられるんだけど、これらのサマリーメジャーは計算が簡単で特別な機器も必要ないけど、主に成功率についてしか教えてくれなくて、作業中のげっ歯類の動きの詳細は示してくれないんだ。

これらのタスク中の異なる動きのパターンを理解することはめっちゃ重要。たとえ二つの異なる動きのシーケンスが同じ成功を収めても、メカニクスが違う場合があるからね。この研究では、結果がげっ歯類の元の動きの方法に戻っているのか、それとも怪我に対する補償的な新しい動きの方法を反映しているのかが重要な疑問になるんだ。一つのシンプルな評価方法は、げっ歯類がペレットを取るために通常使う動きを制限することだよ。たとえば、いくつかのげっ歯類はペレットをつかむためにすくい上げるテクニックを発展させるんだけど、この方法は設定を変更することで妨げられることもあるんだ。たとえば、げっ歯類がペレットを引きずらないようにギャップを作るとかね。

タスク中の動きに関する情報をもっと集める別の方法は、関与する動きのシーケンスを分析することだよ。典型的な動きは、爪を上げたり手を伸ばしたりする小さな定義されたアクションの一連に分けることができて、これを詳細に測定できるんだ。全体像を得るために、研究者は動きを追跡するためにビデオ技術を使うことがあるけど、これは特別な機器や複雑なデータ分析を必要とするから、すべての研究室ができるわけじゃないんだ。ありがたいことに、コンピュータ技術と機械学習の進歩により、物理的なマーカーなしで動きを追跡するのが簡単になったんだ。でも、これらのシステムは詳細なデータを大量に生成するから、分析して解釈するための専門知識が必要になるよ。

臨床現場では、動きの問題を評価するための標準的な方法があって、さまざまなスケールやテストを使うんだ。これらの方法は、特定の動きを実行できるか主観的に判断する訓練を受けた観察者に依存することが多いんだけど、観察者によって異なる結果が出ることもあって、一貫性が問題になることがあるんだ。提案された代替案は、全体の動きのパターンに基づいた定量的な測定を使用し、これを健康なグループと比較することだよ。たとえば、歩行の問題を異なる神経学的状態で測定する「歩行偏差指数」ってのがあるし、上肢の動きを健康のベンチマークに対して標準偏差を使って評価するアプローチもある。

人間において動きを評価するための測定が多く作られている一方で、それとは逆にクリニックでの評価を反映したげっ歯類用のメトリクスを作る方法はあまり多くないんだ。この論文では、げっ歯類のための新しい測定法、「運動偏差指数 (KDI)」の開発と検証に焦点を当てるよ。

研究デザイン

私たちの研究では、私たちの機関の動物ケア委員会に承認された進行中の実験のデータを使用したよ。一般的な実験用ストレインのC57BL/6Jマウスに注目したんだ。このマウスは制御された環境で飼われ、脊髄損傷の前には食べ物の報酬のためにタスクに参加する動機を確保するために制限された食事を与えられていたんだ。

マウスの脳の機能を操作して動きにどんな影響が出るかを観察するために手術を行ったんだ。手術後、マウスは食べ物のペレットを取るタスクのトレーニングを始める前に一週間の回復時間を与えられた。このトレーニングは、介入の影響をテストする前に基準となるパフォーマンスレベルを確立するのに役立ったよ。

シングルペレットリーチタスク

主要なタスクは、マウスが目の前に置かれた単一の食べ物ペレットを取ることだったんだ。このタスクは、マウスが簡単にはアクセスできない場所にあるペレットをつかむために手を伸ばすことができるように3つのスロットで設定されたよ。各セッションでは一連のトライアルが行われ、成功した試行の回数を記録してパフォーマンスを評価するんだ。

高速カメラがマウスがタスクを実行している様子を録画して、特殊なソフトウェアを使用して動きのパターンをコマごとに分析できるようにしたんだ。このソフトウェアのおかげで、マウスがペレットを取るためにどう手や体を動かしているかを追跡することができて、動きのメカニクスを理解するのに重要なんだ。

運動データの処理

収集した運動データを分析するために、マウスの重要なポイントをラベル付けして、指やペレットに焦点を当てたよ。このラベル付けデータから、見えないビデオでこれらのポイントを認識できるモデルをトレーニングして、トライアル中の各動きの座標を抽出できるようにしたんだ。

生の動きのデータは、突然の変化やノイズによるエラーを取り除くためにクリーンアップされて、分析したものが正確で本物の動きを代表するようにしたよ。これは、空間的および時間的な調整を含んでいて、一貫性を修正する必要があったんだ。クリーンアップの後、各トライアルの長さを標準化して、異なるトライアル間の動きを比較しやすくしたんだ。

運動偏差指数 (KDI) の開発

KDIは、リーチタスク中のげっ歯類の全体的な動きのパフォーマンスをまとめるために開発されたよ。高度な統計分析や次元削減技術を使って、トライアルから得られた多次元データを単一のスコアにまとめて、マウスが基準パフォーマンスと比較してどれだけうまく動いたかを反映しているんだ。

KDIを計算するために、まずデータを整理して主成分分析(PCA)を行って、データの複雑さを減らしつつ重要な情報を保持したんだ。このPCAで健康な動きに基づく参照パフォーマンススコアが生成され、後の傷害後や介入後のパフォーマンスを比較できるようになったよ。

私たちが導き出したKDIの値は低いスコアで、期待されるパフォーマンスに近い動きを示していて、高いスコアは理想的な動きのパターンからの偏差を示し、パフォーマンスが良くないことを反映しているんだ。

KDIの検証

KDIが熟練した動きのパフォーマンスを効果的に測るか確認するために、リーチタスクからの他のパフォーマンス指標とKDIスコアを比較したんだ。成功した試行や失敗した試行のようなさまざまな結果を見て、KDIが他のパフォーマンス指標とどれだけ相関しているかを確認したんだ。

分析の中で、成功したトライアルは失敗したトライアルに比べて常に低いKDIスコアを示していて、KDIがリーチタスクにおける動きのパフォーマンスの有効で敏感な測定であることを示しているんだ。

KDIの感度

KDIがマウスの食べ物を取る能力に影響を与えると期待されるさまざまな介入にどれだけ反応するかをテストしたよ。一つのコホートのマウスでは、慢性的な脊髄損傷の影響を調べたんだ。このタイプの怪我は動きに大きく影響を及ぼすから、KDIの値は大きく上昇して、運動パフォーマンスの低下を示していたよ。

別のコホートでは、オプトジェネティクスを使って熟練した動きに重要な脳の領域間のコミュニケーションを一時的に中断させたんだけど、これもまたKDIの値が増加する結果になったんだ。これらの発見は、KDIが実験的介入による動きのパターンの変化を検出できることを示しているよ。

動きのパターンを理解する

各マウスの動きの軌跡を分析することで、彼らが期待されたパフォーマンスからどのように乖離したかを示すユニークなパスを生成したんだ。これらの個々の動きのパターンを比較することで、タスクの特定の側面がマウスにとってどれだけ難しかったか、そして彼らの戦略がどこで異なるかを特定することができたよ。

たとえば、成功したトライアルは滑らかで予測可能な動きを示す一方で、失敗したトライアルはより不規則な動きを示していたんだ。このように動きを理解することで、研究者は改善が必要なポイントや難しさがどこにあるかを特定できて、回復や補償戦略に関する洞察を得ることができるんだ。

結論

要するに、運動偏差指数 (KDI) は、げっ歯類モデルにおける動きのパフォーマンスを評価する新しい方法を提供するんだ。先進的なモーショントラッキングと堅牢な統計分析を統合することで、さまざまな条件や治療が運動機能にどのように影響を与えるかについて、より深い洞察が得られるんだ。

私たちの発見は、KDIが運動スキルの臨床的評価を反映した意味のある指標であることを裏付けていて、動物研究を人間への応用によりよく翻訳できるようにしているよ。この方法を継続的に洗練させることで、運動機能障害や回復についてのより正確で詳細な理解が得られ、神経学的状態に対する効果的な治療法の開発を助けていくんだ。

この研究を通じて、研究者がげっ歯類の動きを研究する方法を向上させ、動き、傷害、回復の複雑な関係についての明確な理解をもたらすことを願っているよ。KDIは、基礎科学研究と臨床的関連性を結びつける重要なステップであり、異なるコンテキストでの運動機能障害によりよく対処できるようにするための方法なんだ。

オリジナルソース

タイトル: A Kinematic Deviation Index (KDI) for Evaluation of Forelimb Function in Rodents

概要: Rodent models are widely used to study neurological conditions and assess forelimb movement to measure function performance, deficit, recovery and treatment effectiveness. Traditional assessment methods based on endpoints such as whether the task is accomplished, while easy to implement, provide limited information on movement patterns important to assess different functional strategies. On the other side, detailed kinematic analysis provides granular information on the movement patterns but is difficult to compare across laboratories, and may not translate to clinical metrics of upper limb function. To address these limitations, we developed and validated a kinematic deviation index (KDI) for rodents that mimics current trends in clinical research. The KDI is a unitless summary score that quantifies the difference between an animal movement during a task and its optimal performance derived from spatiotemporal marker sequences without pre-specifying movements. We demonstrate the utility of KDI in assessing reaching and grasping in mice and validate its discrimination between trial endpoints in healthy animals. Furthermore, we show KDI sensitivity to interventions, including acute and chronic spinal cord injury and optogenetic disruption of sensorimotor circuits. The KDI provides a comprehensive measure of motor function that bridges the gap between detailed kinematic analysis and simple success/failure metrics, offering a valuable tool for assessing recovery and compensation in rodent models of neurological disorders.

著者: Abel Torres-Espin, Amanda Bernstein, Marwa Soliman, Juan Sebastián Jara, Yunuen Moreno-López, Edmund Hollis

最終更新: 2024-09-29 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.26.615237

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.26.615237.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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