環状RNA生成方法の進展
新しい方法が医学用のcircRNAの安定性と生産性を向上させる。
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目次
mRNA、つまりメッセンジャーRNAは、体がタンパク質を作るのにめっちゃ大事な役割を果たしてるんだ。DNAから遺伝的指示を運んで、いろんな機能に必要なタンパク質を作るのを助けるんだけど、その重要性にもかかわらず、mRNAはかなりデリケートで、体の中で簡単に壊れちゃうんだ。この分解は、主にRNAをターゲットにする特別な酵素によって起こるから、mRNAを治療に使うのは結構難しい。
mRNAの安定性の課題
医療でmRNAを使う上での大きな問題は、その安定性なんだ。科学者たちは、mRNAをしっかりと保つ方法を見つける必要がある。一つの方法として、mRNAの構造を環状の形、つまりcircRNAに変えることで保護することがある。この環状の構造は、通常の直線状のmRNAを壊す酵素から守ってくれるんだ。研究者たちは、circRNAが体の中で長持ちして、直線状のものよりも長い間タンパク質を作ることができるって発見した。
circRNAの作成方法
circRNAを作る方法はいくつかあるんだ。化学反応や酵素反応を使う方法もあれば、特定のRNA配列を使って自分でサークルを形成できるものもあるよ。従来の化学的方法は、通常小さなRNAパーツを使うから、短い長さのcircRNAしか作れないんだ。逆に、リガーゼと呼ばれる酵素を使ってRNAの端をつなげる方法もあるけど、RNAの長さや配列に依存するからちょっと難しいんだ。
一部の研究者は、自己切断・再結合できる特別なRNA配列を使って環状の形を作ってきたけど、そういう方法も問題にぶつかることが多いんだ、特にメチル化みたいな修飾が入ると。さらに、既存の環状RNAの方法は、mRNAが正しく機能するために必要な特定の修飾とあまり相性が良くないこともある。
circRNA製造の新しいアプローチ
今回の研究では、circRNAを作るための新しい化学的方法が開発されたんだ。この方法は、RNAを作って修飾するのに必要なステップを減らして、現在のmRNA生産技術に統合しやすくしてる。革新的なアプローチでは、特定の化学反応を使って効率的に環状化を実現してる。
プロセスは特定の方法で修飾された直線RNAを作ることから始まる。次に、そのRNAをシンプルな二段階の化学反応を使用して環状RNAに変換するんだ。この方法は手頃で、様々な長さや配列のRNAに適用できるんだ。
新しい方法の利点
この新しい方法では、従来の技術を使って作ったものよりもずっと長いcircRNAを生産できるんだ。得られたcircRNAには、翻訳を助ける特定のキャップみたいな、これまで作るのが難しかった修飾を含めることができる。研究によると、この新しい環状化方法は、生きている細胞の中でもちゃんと機能して、安定性と機能を保ってるんだ。
新しいcircRNAのテスト
研究者たちは、新しいcircRNAの安定性や細胞内でのタンパク質生成能力をテストしたんだ。いろんな細胞タイプを使って、これらの環状形が現実の設定でどう機能するかをチェックしたんだ。そして、新しいcircRNAを従来のものと比べて、タンパク質生成に関してどうだったかを見たんだ。
興味深いことに、この新しい化学的環状化方法で作られたcircRNAは、安定性や細胞内での活性の面で、従来の標準的な方法と同じくらい機能したんだ。この発見は、新しい方法がmRNA生産の既存のプロトコルに効率を失うことなく組み込めることを示唆していて、すごく重要なんだ。
修飾の役割
研究では、RNAへのさまざまな修飾がそのパフォーマンスにどう影響するかも調べてる。例えば、RNAの機能の重要な部分はキャップと呼ばれる構造で、翻訳プロセスを助けるんだ。研究者たちは、このキャップを環状RNAに追加することで、どれだけタンパク質を製造する能力に影響を与えるかを探ったんだ。
彼らは、特別なキャップ構造を環状RNAに組み込むことで、タンパク質生成能力が大幅に向上することを発見したんだ。これからも、従来の方法が環状化にだけ焦点を当てる一方で、思慮深い修飾を施すことでより良い結果が得られるってことを示してる。
長さと構造の影響
研究の一部は、RNAの長さと構造が環状化プロセスにどのように影響するかに焦点を当てているんだ。研究者たちは、短いRNA配列が長いものよりも環状化しやすいことを発見したんだ。また、ポリAテールのような特定の配列がRNAが円を形成するのを難しくすることも注目したんだ。
この課題を克服するために、RNAの端を近づけるために設計された短いDNA鎖、つまりスプリントを導入したんだ。これにより、特に長いRNA配列や複雑なRNA配列の環状化効率を向上させたんだ。
翻訳効率の探求
研究者たちはさらに、生成されたcircRNAがさまざまな細胞タイプでタンパク質にどれだけうまく翻訳されるかを分析したんだ。新しいcircRNAを線形RNAや従来の方法で作った環状RNAと比較したんだ。結果は、新しいcircRNAが効果的にタンパク質を生成する能力を保持していることを示していて、この化学的アプローチの利点を強調しているんだ。
結論と今後の方向性
この研究は、全長mRNAに適用できるcircRNAを作成するための新しい化学的方法を示してるんだ。得られたcircRNAは、治療ツールとして役立つかもしれない安定性と機能性を示しているんだ。重要なのは、この方法が科学者たちにcircRNAにさまざまな修飾を簡単に組み込むことを可能にして、治療におけるこのRNAの用途を大幅に広げることができるってこと。
研究者たちがRNA治療の分野でイノベーションを続ける中、この研究は、さまざまな病気の治療に役立つより効果的なRNAベースの医薬品を開発するための基盤を築いてるんだ。今後の研究は、この方法をさらに微調整して、RNAの構造や修飾を最適化することに焦点を当てるだろうし、最終的には治療応用におけるcircRNAの可能性を最大限に活かすことを目指すんだ。
タイトル: Chemical circularization of in vitro transcribed RNA opens new avenues for circular mRNA design
概要: Circularization is at the frontier of therapeutic messenger RNA (mRNA) enhancements. Currently available enzymatic and ribozymatic methods for generating circular RNAs (circRNAs) face several challenges related to sequence limitations, purification, and sub-optimal biological activity. The chemical circularization of synthetic RNA fragments potentially overcomes these limitations but is applicable only to extremely short sequences. Here, we report a novel approach for accessing circular RNAs based on the chemical circularization of in vitro transcribed RNA. We efficiently accessed chemically circularized RNAs (chem-circRNAs) by making in vitro transcribed precursor RNAs modified at the 5' end with an ethylenediamine moiety, which undergoes an intramolecular reaction with the periodate-oxidized RNA 3' end under reductive amination conditions. We demonstrate that this method is modification-compatible and applicable to various sequences. Additionally, we report methods for the effective separation of chem-circRNAs from their linear precursors. Using this approach, we prepared multiple chemically-obtained circular RNAs (chem-circRNAs; 35-1500 nt long) with circularization efficiencies reaching up to 60%. We show that protein-coding chem-circRNAs are translationally active in living cells and exhibit increased durability, similar to enzymatically circularized mRNAs. We also demonstrate that this approach enables unprecedented access to chemically modified circRNAs, such as circ-mRNAs incorporating a functional endocyclic N7-methylguanosine cap or modified with N1-methylpseudouridine within the RNA body. Notably, circRNAs containing an endocyclic cap structure engage in the most efficient, cap-dependent mechanism of translation. Our approach makes chemically-modified circularized full-length protein-coding RNAs easily accessible, thereby opening new avenues for the design, modification, and functionalization of circular mRNAs.
著者: Joanna Kowalska, A. Mamot, M. Wasinska-Kalwa, K. Czubak, K. Frankowska, T. Spiewla, M. Warminski, D. Nowis, J. Golab, J. Jemielity
最終更新: 2024-10-10 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.10.617555
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.10.617555.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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