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日本脳炎ウイルス:生存のメカニズム

JEVが宿主の防御をかわして生き延びる方法を見てみよう。

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JEVのサバイバルタクティJEVのサバイバルタクティクスが明らかにされた中。JEVの巧妙な防御回避と複製の手法を調査
目次

日本脳炎ウイルスJEV)は、フラビウイルス群に属するウイルスで、ジカウイルス、デングウイルス、ウェストナイルウイルスなど有名なウイルスも含まれてる。このウイルスたちは、動物と人間の両方に影響を与える病気を引き起こすことがある。JEVは特に深刻な脳感染を引き起こす可能性がある、特に子供にとって危険。

JEVの遺伝子は、ウイルスが増殖するために必要なタンパク質を作るのに欠かせない単一のセクションから構成されてる。この遺伝子の端には、ウイルスがタンパク質を作るのを調節する特別な領域がある。これらの領域は非翻訳領域(UTR)と呼ばれて、ウイルスが効率的にタンパク質を作る能力に重要な役割を果たしている。

ウイルスの構造とタンパク質の生産

JEVのゲノムは、長いタンパク質の鎖を作るのを助け、その後、小さな機能的なタンパク質に分解される。ウイルスは、自身のゲノムRNAを青写真として使って長いタンパク質鎖を生成し、それを加工してウイルスの一部であるエンベロープやカプシドタンパク質を作り出す。

遺伝子からタンパク質を生成する過程は翻訳と呼ばれ、いくつかのステップが含まれてる。これは、遺伝子が細胞の機械によって認識され、タンパク質を作るプロセスを開始するところから始まる。

翻訳開始の重要性

翻訳の始まりは、ウイルスがどれだけうまくタンパク質を作れるかにとって重要。多くのウイルスは、このプロセスを遺伝子の始まりにあるキャップ構造に依存してる。このキャップは、宿主の細胞機械がウイルスRNAを認識し、翻訳を開始するのを助ける。

しかし、JEVは宿主の通常のタンパク質生成が停止しても、タンパク質を作り続ける方法を発達させている。こういう状況は、ウイルス感染中に細胞がウイルスから防御しようとするときによく起こる。

JEVが宿主の防御機構をかわす方法

JEVに感染した細胞では、通常のタンパク質生成プロセスが抑制されることが多い。この防御メカニズムのため、宿主細胞はウイルスがその機械を使えないように自分のタンパク質を作る能力を低下させる。しかし、それでもJEVは自身のタンパク質を生産できる。この能力は、ウイルスが自己複製し、感染サイクルを続けるために重要。

JEVは、この宿主のシャットオフの影響を避けるために、タンパク質の翻訳を開始する別の方法を使う。これらの別の方法は、キャップ非依存翻訳と呼ばれる。

翻訳開始のメカニズム

JEVは主に二つの方法で翻訳を開始できる:

  1. キャップ依存翻訳:これは、ウイルスRNAの始まりにあるキャップ構造が翻訳機械が認識してプロセスを開始するのに必要な従来の方法。しかし、JEVは必要に応じてこのキャップへの依存を回避する方法を工夫できる。

  2. キャップ非依存翻訳:この方法では、ウイルスRNAはキャップ構造なしでも翻訳される。JEVは、RNAの端にある要素を利用して、通常の方法がブロックされても翻訳が行えるようにしていると考えられてる。

JEV翻訳におけるRNAの構造の役割

JEVのRNAが形成する特定の形や構造は、キャップなしで翻訳を開始する能力にとって重要。DB2とsHP-SLという二つの主要な構造が、JEVのRNAの3'領域に存在し、キャップ非依存翻訳において重要な役割を果たしている。

これらのRNA構造は、タンパク質を作るのに関与する必要な細胞因子をリクルートするのを助ける。ウイルスは、翻訳プロセスを効果的に行うために、DDX3やPABP1などの因子を必要としている。

細胞因子との相互作用

DDX3やPABP1は、通常宿主細胞が自身のタンパク質の翻訳を助けるために使用するタンパク質。しかし、JEVはこれらのタンパク質を使って、自身のタンパク質生産を助けるように適応している。

  • DDX3:このタンパク質はJEVのRNAに結合し、翻訳プロセスを助ける。ウイルスRNAをタンパク質生産に必要な翻訳機械に接続する橋のような役割を果たす。

  • PABP1:同様に、PABP1はJEVのタンパク質だけでなく、宿主のタンパク質の翻訳にも重要な役割を果たす。JEVは、このタンパク質を利用して、宿主の翻訳が抑制されていても効果的に自身のタンパク質を生産できるようにしている。

DB2とsHP-SLの役割

DB2とsHP-SLは、JEVのRNAの3' UTRの重要な部分。これらはRNAを安定させ、必要な細胞タンパク質が効果的に結合できるようにする。

これらの構造が削除されたり変更されたりすると、ウイルスは効率的にタンパク質を生産できなくなる。実験では、これらの構造なしでは、JEVの宿主の防御を回避する能力が著しく低下することが示されている。

JEVの翻訳メカニズムに関する発見

最近のJEVに関する研究では、ウイルスが宿主の防御によって引き起こされる敵対的な環境でもタンパク質生産を維持できることが示されてる。これを達成するのは次の組み合わせによる:

  1. 3' UTR構造を利用して補助タンパク質をリクルート。
  2. DDX3とPABP1と複合体を形成し、ウイルスRNAに必要な翻訳機械を持ってくるのを助ける。
  3. 通常のキャップ依存的な方法が停止していても、ウイルスRNAが翻訳されるようにする。

結論

JEVがどのようにタンパク質を生産し、宿主細胞の防御を回避するのかを理解することは、潜在的な治療法やワクチンを開発するために重要。JEVが翻訳開始のために使う独自の方法に焦点を当てることで、研究者たちはウイルスの複製と拡散の能力を妨害するためのターゲットを見つけることができる。

今後の方向性

さらなる研究は、他のフラビウイルスにおける異なるRNA構造の役割に焦点を当て、さまざまなタイプのウイルス間で似たようなメカニズムが使われているかどうかを明らかにすることができるかもしれない。これらの相互作用をより詳細に理解することで、新しい抗ウイルス戦略につながる新たな洞察が得られるかもしれない。

オリジナルソース

タイトル: DDX3 regulates the cap-independent translation of the Japanese encephalitis virus via its interactions with PABP1 and the untranslated regions of the viral genome

概要: The translation of global cellular proteins is almost completely repressed in cells with flavivirus infection, while viral translation remains efficient. The mechanisms of flaviviruses evade host translational shutoff are largely unknown. Here, we identified viral elements and host factors associated with JEV evasion of host shutoff. JEV 5'UTR lacked IRES or IRES-like activity, while noncapped 5'UTR initiated translation in the presence of 3'UTR. Furthermore, the elements DB2 and sHP-SL within 3'UTR were involved in the regulation of cap-independent translation, which is conserved in the genus Orthoflavivirus. By RNA affinity purification and mass spectrometry analysis, cellular DDX3 and PABP1 were identified as key factors in regulating cap-independent translation of JEV via their interactions with DB2 and sHP-SL RNA structures. Mechanistically, we revealed that DDX3 could bind to both 5'UTR and 3'UTR of the JEV genome to establish a closed-loop architecture, recruit eIF4G/eIF4A to form the DDX3/PABP1/eIF4G/eIF4A tetrameric complex via its interaction with PABP1, thereby recruiting 43S PIC to the 5'-end of the JEV genome to start translation. Our findings demonstrated a noncanonical translation strategy employed by JEV and further revealed the regulatory roles of DDX3 and PABP1 in this mechanism. These results expand our knowledge of the translation initiation regulation in flaviviruses under the state of host translational shutoff, which provides a conserved antiviral target against orthoflavivirus.

著者: Yanhua Li, L. Zhang, C. Tang, X. Chen, J. Shi, X. Jiao, J. GUo, B. Wang, K. Bu, A. Wahaab, Y. Yuan, M.-a. Sun

最終更新: 2024-10-16 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.15.618401

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.15.618401.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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