ブラジルでのオロプーチェウウイルスの感染者急増
ブラジルでオロプーチェウウイルスの感染者が最近増えてきて、公共の健康に対する懸念が高まってる。
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オロプーチェウウイルス(OROV)は、特にアマゾン地域で特定の昆虫によって広がるウイルスだよ。これは、ペリバニウイルス科に属してる。OROVは主にナマケモノやげっ歯類、サル、鳥類などの野生動物に見られるんだ。これらの動物がウイルスを保有してて、刺す虫や蚊などのいろんな昆虫が人間に感染させる。
デングやジカなどの他のウイルスとは違って、人間が感染しなくてもウイルスは広がることができる。でも、OROVが動物から人間にジャンプすると、田舎や都市でのアウトブレイクを引き起こす可能性があるんだ。最近の研究では、西アマゾン地域のブラジルのいくつかの州で症例の急増が報告されてるよ。
1960年代から、アマゾンでは約30回のOROVのアウトブレイクがあったんだ。2014-2015年以前は、OROVはブラジルでデングに次いで2番目に多く報告されたアルボウイルスだった。最大の記録されたアウトブレイクは1970年代後半にパラー州で起こり、10万人以上のケースがあったと推定されてる。21世紀には、さまざまな場所で小規模なアウトブレイクが記録されてるけど、他のウイルス性疾患と重なる症状のため、本当の感染の広がりは過小評価されてる可能性がある。
最近の伝染病
2022年末から2024年初頭にかけて、ブラジルのアクレ、アマゾナス、ロンドニア、ロライマ州でOROVの症例が劇的に増加したよ。2024年3月31日までに、6,000件以上の症例が検査で確認された。アマゾナス州が最も多く、次いでロンドニア、アクレ、ロライマ州が続いた。この続いている疫病は、最近のOROV症例の最大の増加を示してるだけじゃなく、過去のアウトブレイクよりも広い範囲に影響を与えてて、140以上の自治体に及んでる。
アマゾン地域以外でも新しい症例が出てきたって報告もあるんだ。これは、これらの地域でのOROVの現在の伝播要因を理解する必要性を強調してるね。
疫学的パターン
最近のアウトブレイクには注目すべきいくつかの特徴があるよ。まず、確認された症例の地理的分布が州ごとに大きく異なることだね。各自治体ごとに人口10万人当たりの症例率が違った。年齢層分析では、あらゆる年齢層で感染が発生してるけど、少し高齢者に傾向があるみたい。男性と女性の感染率は概ね均等で、男性対女性の比率はほぼ1:1だった。
報告された最も一般的な症状には、熱、頭痛、筋肉痛が含まれてる。他の症状として、吐き気、眼窩後部痛、嘔吐も見られたよ。特に、いくつかの症状は女性患者に多く見られた。症例の頻度にもかかわらず、最新の報告ではOROVに関連する死亡者は確認されてないんだ。
環境的影響
OROVの症例の増加は、アマゾンの雨季(11月から4月)と一致しているようだ。雨が増えることで、昆虫ベクターの繁殖に理想的な条件が整い、彼らの個体数が急増するんだ。この季節的パターンは、以前のOROVのアウトブレイクと一致しているよ。
ウイルスの伝播は、森林伐採や土地利用の変化などの人間の活動にも影響を受けてる。違法な伐採や農業の拡大は、生息地の破壊を招いて、人間と感染した動物やベクターとの接触を増やす可能性があるんだ。
増加した降雨は、OROVの重要なベクターであるミジンコの個体数の増加に関連付けられてる。研究によると、降雨とミジンコの個体数の増加の間には約1〜2ヶ月の遅れがあることが分かってるよ。
遺伝子研究とウイルスの進化
OROVがどのように広がり進化しているかを理解するために、研究者はさまざまな自治体の患者からウイルスをシーケンスしたんだ。遺伝子解析では、ウイルスの異なる系統が明らかになり、OROVが時間とともに遺伝的変化を遂げていることが示されてる。
系統樹解析では、2015年から2024年に流通していたOROVは、以前の株から進化した独特の系統を表していることがわかったよ。これらの遺伝的変化を理解することで、ウイルスの広がりや新しい条件への適応能力を評価するのに役立つんだ。
系統地理学とOROVの広がり
地理データを使って、科学者たちはOROVがアマゾン地域でどのように広がったかの道筋を追跡したよ。症例を示す地図は、ウイルスが州や地域間でどのように移動したかを示してる。
OROVの系統は、2つの主要なルートを通じて広がった:一つはロライマに向かって北上するルート、もう一つはロンドニアに向かって南下するルートだ。観察されたパターンから、OROVは特定の地域で急速に動いて、雨季に複数のアウトブレイクを引き起こしたことがわかった。
短距離の移動が最も一般的で、これは感染した昆虫ベクターの移動によるものと思われる。でも、かなりの長距離のジャンプも見られ、これはしばしば人間の旅行や移動に関連している。
公衆衛生の懸念
現在進行中のOROVの疫病は、深刻な公衆衛生の問題を引き起こしている。ウイルスの広範な拡散能力と時間とともに適応する能力は、健康機関にとって重大な懸念なんだ。最近のアウトブレイクが示すように、OROVがアマゾン流域の外に定着する可能性は、さらなるリスクをもたらす。
OROVを制御するための現在の戦略は、多くの場合、昆虫の個体数の管理や人間の感染を防ぐことに重点を置いてる。監視と診断の強化は、OROVの拡散をよりよく理解し、対応するために不可欠なんだ。
人間、動物、環境の健康の相互関連性を考慮に入れた取り組みを統合することが、OROVや似た感染症に対処するためには重要なんだ。
将来の行動に対する提言
調査結果に基づいて、OROVの脅威に対処するためにいくつかのアクションが推奨されてるよ:
監視の強化:OROVの症例やベクターの個体数を追跡するためのしっかりしたモニタリングシステムを確立する。
公教育:OROVの伝播、予防戦略、自然生息地の保護の重要性についての意識を高める。
研究資金の支援:OROVの生態学的および遺伝的ダイナミクスに関する研究を支援して、公衆衛生戦略に役立てる。
環境保護:森林伐採や生息地破壊に対する規制を強化して、 zoonotic感染を引き起こす人間と動物の接触を最小限に抑える。
ベクター制御戦略:都市環境でミジンコと蚊の両方をターゲットにした統合的な害虫管理戦略を実施する。
診断テスト:迅速に症例を特定し、アウトブレイク時の対応時間を短縮するために、診断テストの広範な利用を確保する。
学際的な協力:健康専門家、エコロジスト、政策立案者との連携を促し、包括的な戦略を策定する。
結論
オロプーチェウウイルスは、特にアマゾン地域で重大な健康上の課題を引き起こしていて、その伝播のダイナミクスは環境条件や人間の活動に影響されてる。最近の症例の急増は、ウイルスが広がる可能性があることを思い出させて、協調的な対応が必要だということを示してる。OROVのアウトブレイクに寄与する要因を理解することが、今後の感染を制御し、公衆衛生の安全を確保するために重要になるだろう。
タイトル: Emergence of a novel reassortant Oropouche virus drives persistent human outbreaks in the Brazilian Amazon region from 2022 to 2024
概要: The Brazilian western Amazon region is currently experiencing its largest laboratory confirmed Oropouche virus (OROV) outbreak, with nearly 6,000 reported cases in the states of Amazonas (AM), Acre (AC), Rondonia (RO), and Roraima (RR), between August 2022 and March 2024. Here, we sequenced and analyzed 382 full-length OROV genomes from human samples collected between 2022 and 2024 from all four states, aiming to trace the origin and genetic evolution of OROV leading to the current outbreak. Genomic analyses revealed that the recent upsurge of OROV cases in the Brazilian Amazon region coincides with the emergence of a novel reassortant viral lineage containing the M segment of viruses detected in the eastern Amazon region from 2009 to 2018 and the L and S segments of viruses detected in Peru, Colombia, and Ecuador from 2008 to 2021. The novel reassortant OROV lineage likely emerged in the Central region of the AM state between 2010 and 2014 and displayed a long-range silent dispersion during the second half of the 2010s. The 2022-2024 OROV epidemic was spatially segregated into three major subpopulations located in RR, AMACRO (a bordering region between AC, RO, and AM-Southern region), and AM-Central (which includes the Amazonas capital, Manaus) regions. The peak of OROV transmissions in all regions occurred during the rainy season in the Amazon basin. Furthermore, our phylodynamics reconstructions showed that OROV spread was driven mainly by short-range (< 2 km) movements, with an average dispersal rate [≤] 1.2 km/day, consistent with the pattern of an active flight of infected vectors. Nevertheless, a substantial proportion (22%) of long-range (> 10 km) OROV migrations were also detected, consistent with viral dispersion via human activities. Our data provides an unprecedented view of the real-time spread and evolution of a neglected emergent human pathogen. Moreover, our results emphasize the need for widespread, long-term genomic surveillance to better understand the real burden of OROV within and beyond the Amazon region.
著者: Felipe G Naveca, T. A. P. Almeida, V. C. Souza, V. A. Nascimento, D. S. Silva, F. O. Nascimento, M. C. C. Mejia, Y. S. Oliveira, L. Rocha, N. Xavier, J. Lopes, R. Maito, C. Meneses, T. Amorim, L. Fe, F. S. Camelo, S. C. A. Silva, A. X. Melo, L. G. Fernandes, M. A. A. Oliveira, A. R. Arcanjo, G. Araujo, W. Andre Junior, R. L. C. Carvalho, R. S. S. Rodrigues, S. V. G. Albuquerque, C. Mattos, C. C. Silva, A. L. F. M. Mendonca, T. Rodrigues, F. Mariscal, M. A. Morais, M. M. Presibella, N. Q. Marques, A. Paiva, K. Ribeiro, D. Vieira, J. A. S. Queiroz, Passos-Silva
最終更新: 2024-07-24 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.23.24310415
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.23.24310415.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。
参照リンク
- https://viralzone.expasy.org/,44
- https://www.paho.org/en/documents/real-time-rt-pcr-protocol-mayaro-mayv-and-oropouche-virus-orov-duplex
- https://microreact.org/project/orov-north-2022-2024
- https://sidra.ibge.gov.br/pesquisa/censo-demografico/demografico-2022/universo-populacao-por-idade-e-sexo
- https://basespace.illumina.com
- https://ictv.global/report/chapter/peribunyaviridae/peribunyaviridae/orthobunyavirus
- https://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/