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# 生物学# 生化学

マウスモデルを使ったアルツハイマー病の調査

アルツハイマー病とその治療法をよりよく理解するために、マウスモデルを使った研究をしてるよ。

Junmin Peng, J. M. Yarbro, X. Han, A. Dasgupta, K. Yang, D. Liu, H. Shrestha, M. Zaman, Z. Wang, K. Yu, D. G. Lee, D. Vanderwall, M. Niu, H. Sun, B. Xie, P.-C. Chen, Y. Jiao, X. Zhang, Z. Wu, Y. Fu, Y. Li, Z.-F. Yuan, X. Wang, S. Poudel, B. Vagnerova, Q. He, A. Tang, P. Ronaldson, R. Chang, G. YU, Y. Liu

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目次

アルツハイマー病(AD)は、記憶や思考能力をゆっくりと壊していく脳の障害だよ。普通は65歳以上の人に影響が出ることが多く、アメリカには何百万人もこの病気にかかっている。病気は脳に変化をもたらし、記憶、行動、日常のタスクに問題を引き起こすんだ。

脳で何が起こるの?

ADでは、脳に2つの主な問題が起こる。まず、ベータアミロイドというタンパク質が神経細胞の外に蓄積して、ベタベタしたプラークを形成するんだ。これが脳細胞間のコミュニケーションを妨げる。次に、タウという別のタンパク質が神経細胞の中でもつれを作り、これが細胞にダメージを与えて細胞死を引き起こす。こうした変化は、症状が現れるずっと前に始まるんだ。

他の関連タンパク質

ベータアミロイドやタウの他にも、アルツハイマーに関与するかもしれない他のタンパク質があるんだ。例えば、アルファシヌクレイン、TDP-43、U1 snRNPなどだ。科学者たちは、これらのタンパク質がどのように連携して病気を引き起こすのかを理解しようとしている。

遺伝的要因

研究者たちは、ADのリスクを高めるいくつかの遺伝子を発見した。特に、家族性ADを引き起こす3つの主要な遺伝子、APP、PSEN1、PSEN2が知られている。他にも、APOE4やTREM2のような遺伝子は、病気のリスクを高めることがわかっているけど、約100の他の遺伝子は少しだけ影響を与えているかもしれない。

アルツハイマーのマウスモデル

ADをよりよく理解するために、科学者たちはしばしばマウスモデルを使うんだ。これらのマウスは、アルツハイマー患者に見られる遺伝的変化を持つように設計されている。100以上のマウスモデルがこの障害を研究するために作られている。よく使われるモデルには、5xFAD、3xTG、NLFがあるよ。

現在のモデルの限界

これらのマウスモデルは貴重な洞察を提供するけど、人間のADの全ての側面を完全には再現できていないんだ。これらのマウスで見られる脳のダメージの程度は、人間の患者に比べてあまり深刻でないことが多い。研究者たちは、それぞれのモデルの強みと弱みを理解して、研究に適したモデルを選ばないといけない。

最近の技術の進歩

生物学における新しい技術、特に「オミクス」研究により、科学者たちは脳内の多くの分子を同時に調べることができる。これが、さまざまなマウスモデルが人間のADとどう比較されるかを評価するのに役立っている。

トランスクリプトームおよびプロテオームの変化

マウスモデルにおける遺伝子活性の研究では、免疫応答や脳信号に関与するタンパク質に変化が見られた。しかし、時にはRNAのレベル(遺伝子活性に関連する分子)が、そのRNAから作られたタンパク質のレベルと一致しないことがある。これは、RNAが作られた後に発生するいろんなプロセス、例えばタンパク質がどのように作られたり分解されたりするかによるものかもしれない。

アルツハイマーのモデルのプロテオーム解析

包括的な研究では、ADの異なるマウスモデルにおける何千ものタンパク質やホスホペプチド(リン酸化された特定のタイプのタンパク質)を調べた。この研究には、一般的に使われるモデルの5xFADやNLGFに加えて、3xTGやBiGも含まれていた。目的は、ADに関連するタンパク質の共通の変化を見つけることだった。

方法論

この研究では、これらのマウスの脳サンプルが分析され、年齢とともに変化するタンパク質が特定された。研究者たちは、これらの変化が人間のデータとどう比較されるかを見たんだ。アミロイドの蓄積が特定のタンパク質の分解に影響を与えることがわかり、アミロイドの蓄積が脳のタンパク質の変化に寄与していることを示唆している。

マウスモデルにおける共有プロテオームの変化

この研究では、3つのADマウスモデルの年齢ごとのタンパク質レベルを、年齢が合った対照マウスと比較した。これらのモデルのデータを調べた結果、病気に関連するタンパク質レベルの多くの共通の変化が見つかった。

主な発見

  • 5xFADとNLGFモデルで似たようなタンパク質の変化パターンが見られた。
  • NLFは変化が少なかったけど、他のモデルは年を取るにつれて著しい変化を示した。
  • アミロイドの蓄積レベルに応じて多くのタンパク質が変化し、アミロイドレベルと脳内のタンパク質変化の直接的な関連を示している。

ホスホプロテオームの変化の理解

リン酸化はADにおいてもう一つの重要なプロセスなんだ。タンパク質にリン酸基が加わる変化は、その機能や安定性に影響を与える。この同じ研究では、さまざまなマウスモデルでのリン酸化レベルの違いを分析した。

一貫した変化の特定

研究者たちは、両方のマウスモデルで共通してリン酸化レベルが変化したいくつかのタンパク質を見つけた。これらの変化は、免疫応答や神経信号に関与する経路に関連していることがわかった。

人間のアルツハイマーのデータとの比較

マウスモデルが人間のADとどう関係しているかを理解するために、研究者たちはマウスのタンパク質変化を人間の研究で見られる既知の変化と比較した。共通で影響を受けたタンパク質のコアセットが特定され、マウスモデルが人間の病気を理解するのに役立つことを示している。

経路活動

共有されているタンパク質を調べると、いくつかの重要な生物学的経路が顕著に活性化されていることがわかった。これらの経路は免疫応答、タンパク質代謝、細胞コミュニケーションに関連している。

ADモデルにおける追加の病理

一般的なモデルは役立つけど、ADの全ての側面を捉えているわけではないんだ。新しいモデルの中には、3xTGやBiGのように、タウのもつれやRNAスプライシングの問題など、病気の追加の特徴を示すものもある。

独自のタンパク質変化

例えば、3xTGはタウ経路に関連するタンパク質を示し、BiGはRNAスプライシングやシナプス機能に関連する変化を示している。これらのモデルを比較することで、追加の病理が存在することで人間のADにより近づくことがわかる。

マルチオミクスの統合と洞察

異なる「オミクス」レイヤーからのデータを統合することで、ADで何が起こっているのかのより良い全体像を得ることができる。タンパク質、RNA、その他の分子的な活動に関するデータを統合することで、研究者は病気をよりよく理解できるんだ。

重要なタンパク質の特定

分析を通じて、研究者たちはまだあまり研究されていないが、ADで重要な役割を果たす可能性のあるいくつかのタンパク質を特定した。これには、シナプス機能や免疫応答に関連するタンパク質が含まれていて、ターゲットにした治療法の開発に役立つかもしれない。

タンパク質ターンオーバー率の変化

研究からの大きな発見の1つは、脳におけるタンパク質の分解速度が変わることだったんだ。ADでは、一部のタンパク質が早く分解されないために蓄積しちゃうんだ。

タンパク質の寿命を調べる

科学者たちは、特別な技術を使って脳内のタンパク質がどのくらい長持ちするかを追跡した。ADモデルでは、一部のタンパク質が非常に長い寿命を持っていて、それが蓄積につながることがわかった。このタンパク質の長期的な存在が、病気の進行や症状に寄与するかもしれない。

結論

この広範な研究は、アルツハイマー病を研究するために複数のモデルを使用する重要性を強調している。マウスモデルと人間のデータの違いや共通点を理解することで、科学者たちは潜在的な治療ターゲットをよりよく特定できるんだ。

今後の方向性

発見は、あまり研究されていないタンパク質やプロセスに焦点を当てることで、アルツハイマー病の理解と治療における突破口につながるかもしれない。この包括的なアプローチが、この病気の課題に取り組むためのより効果的な治療法を開発する道を開くかもしれない。

さまざまなモデルからの発見を分析・統合し続けることで、研究者たちはアルツハイマーに立ち向かう新しい戦略を見出すことを願っている。この分野での継続的な研究は、この悲惨な病気に影響を受けた人々の生活を改善するために重要なんだ。

オリジナルソース

タイトル: Human-mouse proteomics reveals the shared pathways in Alzheimer's disease and delayed protein turnover in the amyloidome

概要: Murine models of Alzheimers disease (AD) are crucial for elucidating disease mechanisms but have limitations in fully representing AD molecular complexities. We comprehensively profiled age-dependent brain proteome and phosphoproteome (n > 10,000 for both) across multiple mouse models of amyloidosis. We identified shared pathways by integrating with human metadata, and prioritized novel components by multi-omics analysis. Collectively, two commonly used models (5xFAD and APP-KI) replicate 30% of the human protein alterations; additional genetic incorporation of tau and splicing pathologies increases this similarity to 42%. We dissected the proteome-transcriptome inconsistency in AD and 5xFAD mouse brains, revealing that inconsistent proteins are enriched within amyloid plaque microenvironment (amyloidome). Determining the 5xFAD proteome turnover demonstrates that amyloid formation delays the degradation of amyloidome components, including A{beta}-binding proteins and autophagy/lysosomal proteins. Our proteomic strategy defines shared AD pathways, identify potential new targets, and underscores that protein turnover contributes to proteome-transcriptome discrepancies during AD progression.

著者: Junmin Peng, J. M. Yarbro, X. Han, A. Dasgupta, K. Yang, D. Liu, H. Shrestha, M. Zaman, Z. Wang, K. Yu, D. G. Lee, D. Vanderwall, M. Niu, H. Sun, B. Xie, P.-C. Chen, Y. Jiao, X. Zhang, Z. Wu, Y. Fu, Y. Li, Z.-F. Yuan, X. Wang, S. Poudel, B. Vagnerova, Q. He, A. Tang, P. Ronaldson, R. Chang, G. YU, Y. Liu

最終更新: 2024-10-25 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620263

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620263.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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