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# 生物学# ゲノミクス

V. mimicusに関連したビブリオ症の増加病例

V. mimicus株が腸炎の増加を示していて、新しい毒性因子が浮き彫りになってるね。

Sergio Morgado, E. Fonseca, A. C. P. Vicente

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ビブリオ症とV.ミミカスのビブリオ症とV.ミミカスの脅威かったよ。mimicusが健康に関する懸念だってわ新しい調査で、V.
目次

報告によると、世界中でビブリオ症のケースが増えてるって、特にヨーロッパ、アジア、アメリカで。V. mimicusはその中の細菌の一つで、汚染された食べ物を食べたときに胃腸炎やコレラに似た下痢の症状を引き起こすんだって。科学者たちはV. mimicusがどうやって病気を引き起こすのかをまだ学んでるところで、一部の株はコレラを引き起こす細菌Vibrio choleraeに関連する通常のマーカーを持ってないんだ。最近、フロリダで起きた危険な胃腸炎のアウトブレイクは、これらの典型的なマーカーがないV. mimicus株に起因してることがわかって、他に何が病気を引き起こす要因なのか疑問が生まれてる。

V. mimicusのゲノム研究

研究者たちは、最近のフロリダのアウトブレイクを含む様々なV. mimicus株の遺伝的構成を調査したんだ。特定の遺伝子のセット、タイプIII分泌系(T3SS)と二つの毒素、tdhとtrhが少数のゲノムに見つかった。これらのT3SSと毒素は、病気を引き起こす能力に関連していると考えられるゲノムの領域に通常存在しているんだ。面白いことに、T3SSの遺伝子配列の多くは、関連する別の細菌V. parahaemolyticusのものに似てる。

研究で使われた方法

V. mimicusの遺伝情報を分析するために、研究者たちは公開データベースからデータを集めたんだ。病原性に関連する遺伝子を探して、遺伝子島や統合的接合要素を示す可能性のあるゲノムの領域を特定したよ。遺伝子予測用の特定のソフトを使って、正確性を確認するために手動チェックも行った。

T3SSと毒素についての発見

調べた44のV. mimicusゲノムの中で、5つがT3SSに関連する遺伝子を持ってた。そのうち4つのゲノムにはtdh遺伝子もあったし、1つのゲノムにはtrh遺伝子が見つかった。これらの毒素の存在は、特に通常のコレラ関連遺伝子を持たない株において、胃腸炎を引き起こす重要な役割を果たす可能性を示唆してる。

系統解析

研究者たちは、異なるV. mimicusゲノム間の関係を視覚化するために系統樹を作ったんだ。T3SSを持つゲノムは二つの主要なグループと一つの孤立した株に分かれた。この分析により、tdh遺伝子は二つのグループの両方のゲノムに見られ、trh遺伝子は独立したグループに存在していることがわかった。

T3SSのカテゴリー

T3SSにはT3SS1とT3SS2の2つのタイプがある。2番目のタイプは、tdhとtrh遺伝子と一緒に見つかることが多く、これは人間の体内で細胞膜を損傷することが知られている。これらの毒素は胃腸炎を引き起こすことで知られる別の細菌、V. parahaemolyticusでも一般的なんだ。研究者たちは、V. mimicusのT3SSには異なるサブグループがあり、細菌とそれらの持つ毒素との複雑な関係を示してることを発見した。

V. mimicus F9458の詳細なゲノム分析

V. mimicus F9458のゲノムを詳しく見たら、T3SSとtdh遺伝子が、統合的接合要素(ICE)のように機能する部分に位置してることがわかった。この発見は、V. mimicusでのそのような要素の初めての特定を示している。ICEVmF9458はゲノムのかなりの部分を覆い、遺伝子材料を転送できる可能性を示すパターンが見つかった。

最近のアウトブレイクとの関連

2019年のアメリカでのV. mimicusのアウトブレイクでは、特定の病原性因子が、報告された重度の下痢に寄与しているかもしれないと研究者は提案した。今回のアウトブレイクからのゲノムを調べた結果、T3SS2に関連するtdh毒素が特定された。以前のV. parahaemolyticusに関する研究では、T3SS2とtdh毒素が似たような下痢のアウトブレイクの主な要素であることが示唆されてた。

発見の重要性

これらの発見は、V. mimicus感染を調査する際にはコレラ毒素遺伝子の存在だけでなく、病気に寄与する可能性があるTDHやTRHのような他の毒素も調べる必要があることを強調してる。V. mimicusでの初めてのICEの特定は、これらの有害な特性が異なるビブリオ種の間で広がる可能性に懸念を抱かせる。

結論

要するに、ビブリオ症のケースの増加はV. mimicusの存在と関連してて、病気を引き起こすためにさまざまな毒素メカニズムを使ってるかもしれない。T3SSと毒素のtdh、trhはこれらの細菌の病原性に重要な役割を果たすみたい。病原性に関連する遺伝的要因は複雑で、これらの細菌がどのように機能し、公衆衛生にどう影響を与えるかを理解するためには、引き続き研究が必要だよ。これらの発見を考慮して、V. mimicusのケースで他のビブリオ種に関連する毒素も検査する範囲を広げることが重要だね。

オリジナルソース

タイトル: Vibrio mimicus carrying the Type III Secretion System 2 (T3SS2) and TDH toxin of Vibrio parahaemolyticus in an integrative conjugative element context

概要: ObjectivesIdentify possible virulence factors in the genomes of Vibrio mimicus that may be determinants of diarrheal cases/outbreaks. MethodsAll V. mimicus genomes from Genbank were retrieved and the virulome was searched with Abricate using the VFDB database. Genomic islands (GIs) and integrative conjugative elements (ICEs) were identified using IslandViewer and ICEberg, respectively. ResultsFive ctx-negative V. mimicus genomes carrying the Type III Secretion System 2 (T3SS2) and the TDH/TRH toxin from Vibrio parahaemolyticus were identified. The T3SS-positive genomes presented the phylotypes T3SS2 and T3SS2{beta} and formed two clusters and one singleton throughout the V. mimicus phylogeny. Genomes carrying T3SS2 and T3SS2{beta} were associated with the tdh and trh genes, respectively. Furthermore, genomic analyses characterized an integrative conjugative element (ICE) with a size of [~]150 kb carrying both V. parahaemolyticus virulence determinants. ConclusionsIn addition to looking for cholera toxin genes in V. mimicus cases/outbreaks, it is important to consider V. parahaemolyticus toxins such as TDH and TRH. Furthermore, an ICE was identified and characterized in V. mimicus, being associated with T3SS2 and the TDH toxin, which is worrying, as it can disseminate these virulence factors among Vibrio spp.

著者: Sergio Morgado, E. Fonseca, A. C. P. Vicente

最終更新: 2024-10-26 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619894

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619894.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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