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変わる腸内マイクロバイオーム:加齢に注目

研究で、新しいラットモデルにおける年齢と性が腸内細菌にどのように影響するかが明らかになった。

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老化による腸の変化老化による腸の変化きく影響するんだって。研究によると、老化は腸内細菌の多様性に大
目次

何年にもわたって、科学者たちは私たちの腸内に住む小さな生物、腸内マイクロバイオームを研究するために一生懸命働いてきたんだ。この生物たち、主にバクテリアは私たちの健康に大きな役割を果たしていて、食べ物の消化から免疫システムの働きまで、いろんなことに影響を与えるんだ。研究者たちは、腸内マイクロバイオームが年齢とともに変化することに気づいていて、これらの変化はさまざまな健康問題に関連付けられることがあるんだ。

年を取るにつれて、腸内のバクテリアの組み合わせが良くない方向に変わることがある。この変化はディスバイオシスって呼ばれているんだ。多くの科学者たちは、腸内のバクテリアのバランスが欠けていることが老化の重要な要因だと考えている。いくつかの研究者は年齢とマイクロバイオームがどう関わっているのかを理解しようとしているけど、食事やライフスタイルがバクテリアの種類に大きく影響するから、老化がマイクロバイオームに与える影響について明確な結論を出すのが難しいんだ。

より良い理解を得るために、研究者たちはマウスやラットなどの実験動物に目を向けることが多い。彼らは食事や生活条件を厳密にコントロールできるから、老化がマイクロバイオームにどう影響するかを正確に研究できるんだ。

ロデントにおける発見

ロデントを使った研究では、腸内マイクロバイームも年齢とともに変化することが示されている。特に、研究者たちは食事やいくつかの薬が腸内バクテリアにどう影響するかを調べてきた。これらの研究では、カロリー制限や特定の薬が動物の老化に伴って腸内マイクロバイームに影響を与えることが示されているんだ。

でも、老化に伴うマイクロバイームの変化については、特に性差に関する知識がまだ不足しているんだ。過去のロデントに関する研究は、通常はオスだけに焦点を当てていたから、両方の性を考慮しないことで、老化が腸内マイクロバイームにどう影響するかの理解が限られてしまっていたんだ。

性ホルモンもマイクロバイームに影響を与えることが知られている。これらのホルモンは年齢とともに減少し、オスとメスでその減少の仕方が異なるから、老化プロセスが生物学的性によってマイクロバイームにユニークな影響を与えるってことなんだ。

もう一つの懸念点は、ほとんどの過去の研究が近交系のロデント種を使っていて、遺伝的変異が最小限だったこと。動物の遺伝子は腸内マイクロバイームに影響を与えるから、近交系動物の結果は遺伝的に多様な人間の状況を正確に反映しないかもしれないんだ。

新しいラットモデルの研究

これらの課題に取り組むために、研究者たちはOKC-HETB/Wという新しいラットの品種を使った。この品種は4つの異なる系統のラットを混ぜて作られたものなんだ。この厳密な交配のおかげで、OKC-HETB/Wラットは遺伝的に多様で、より多様な集団、つまり人間に適用できる洞察を提供するかもしれない。

この研究では、研究者たちは年齢と性がこれらのラットの腸内マイクロバイームにどう影響するかを見たんだ。また、ミトコンドリアのハプロタイプの違いが腸内マイクロバイームに影響を与えるかどうかも調べた。ミトコンドリアのハプロタイプは有機体が食べ物をどのように代謝するかやストレスに対する反応に影響することがあるんだ。

研究者たちは、予想通り、ラットの腸内のバクテリアの組み合わせが年齢とともに大きく変化することを発見した。多くの変化はラットの性別やミトコンドリアのハプロタイプに依存していた。老化は腸内バクテリアの特定のシフトと関連していて、健康に影響を与える可能性があるんだ。

重要なことに、この研究は腸内バクテリアの変化が短鎖脂肪酸(SCFA)のレベルに関連していることも示した。これらのSCFAは腸内バクテリアが食物繊維を分解する際に生成されるもので、腸の健康を促進したり炎症を調整したりするなど、さまざまな健康上の利点があるんだ。

方法論

OKC-HETB/Wラットは制御された環境で育てられ、標準的な食事を与えられた。研究者たちは若いラット(9ヶ月)と年を取ったラット(26ヶ月)を観察し、それぞれのグループから血液と糞便を採取した。これらのサンプルを使って腸内バクテリアや腸内で生成される代謝物を分析したんだ。

バクテリアの構成を理解するために、チームは糞便サンプルからDNAを抽出して、異なる種類のバクテリアを特定するためのマーカーとして機能する特定の遺伝子をシーケンスした。この分析により、バクテリアの種類や量が年齢とともにどう変化したかがわかったんだ。

さらに、彼らは血漿代謝物も調べ、脂肪酸や食べ物から得られる他の化合物に焦点を当てて、腸内バクテリアが宿主の代謝とどのように相互作用するかを理解しようとしたんだ。

腸内マイクロバイームの構成の変化

研究者たちは、ラットが老化するにつれて腸内バクテリアの種類と量が大きく変化することを発見した。いくつかのバクテリアは数が減少し、他のバクテリアは増加した。例えば、R. callidusというバクテリアの一種は、オスとメスの両方のラットで年齢とともに減少することがわかった。一方で、L. reuteriのような他のバクテリアは特定のグループのラットで数が増加したんだ。

興味深いことに、多くの変化は性別とミトコンドリアのハプロタイプの両方に依存していた。つまり、老化が腸内マイクロバイームに与える影響の仕方は、性別やラットの特定の遺伝的背景によって異なるってことなんだ。

メスのラットでは、研究者たちはオスよりも腸内バクテリアの変化の幅が広いことを観察した。年齢とともに減少したいくつかのバクテリア種が記録されていて、老化が特定の有益なバクテリアに悪影響を及ぼす可能性を示しているんだ。

短鎖脂肪酸(SCFA)の重要性

SCFAは腸の健康を維持するために重要な役割を果たしている。腸内バクテリアによって生成されるこれらの化合物は、体内のさまざまなプロセスを調整するのに役立つ。研究者たちは、ラットの糞便中のいくつかのSCFAのレベルを測定して、年齢に関連する変化を調べた。彼らは、年を取ったメスのラットで特定のSCFAのレベルが増加することに気づいたんだ。

この研究は、SCFAの生成が腸内に存在するバクテリアの種類にしばしば関連していることを明らかにした。だから、特定のバクテリアの集団が年齢とともに減少すると、これらの有益な脂肪酸の生成が減少する可能性があるんだ。これは特に懸念されることで、SCFAは炎症を調整したり免疫機能をサポートしたりする役割があるからなんだ。

血漿代謝物の変化

SCFAに加えて、研究者たちはラットの血中の他の代謝物、特にトリプトファンや胆汁酸に関連するものも調べた。トリプトファンは、腸内バクテリアの働きによっていくつかの重要な化合物に変化することができるアミノ酸なんだ。

彼らは、特定のトリプトファン代謝物のレベルが年齢とともに変化することに気づいた。例えば、キヌレニンのレベルは年を取ったメスのラットで減少する傾向があったんだ。これは重要なことで、トリプトファンの代謝は気分や認知機能、他の健康結果に影響を与える可能性があるからなんだ。

同様に、研究者たちは血漿中の胆汁酸代謝物も分析した。彼らは、特定の一次胆汁酸のレベルが年齢とともに増加することを発見した、特にオスのラットで。この胆汁酸は肝臓で生成されて、腸内バクテリアの行動に影響を与えることがある。観察された胆汁酸の変化は、老化、腸内マイクロバイームの構成、代謝の関係を示唆しているかもしれないんだ。

結論

この研究は、腸内マイクロバイーム、老化、性、遺伝子の間にある複雑な相互作用を強調している。発見は、老化に伴う腸内の変化を研究する際に、遺伝的に多様なモデルを使用する重要性を示しているんだ。

老化に応じて腸内バクテリアがどう変化し、その変化が性や遺伝的因子によってどう異なるかを調べることで、研究者たちは健康や病気のプロセスについてより広い洞察を得られるんだ。この研究は、私たちが老いるにつれて健康を改善するための新しいアプローチを開くんだ、特に腸内マイクロバイームを支援する方法について理解することからね。

要するに、バランスの取れた腸内マイクロバイームを維持することが、健康的な老化の重要な要因かもしれない。科学者たちがこれらの関係を探り続けることで、腸内の健康を向上させる新しい戦略が見つかるかもしれない、結果的に老化した人々の健康状態が改善される可能性もあるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Age, Sex, and mitochondrial-haplotype influence gut microbiome composition and metabolites in a genetically diverse rat model.

概要: We evaluated the impact of sex and mitochondrial-haplotype on the age-related changes in the fecal gut microbiome of the genetically heterogeneous rodent model, the OKC-HETB/W rat. Alpha-diversity, measuring richness and evenness of gut microbiome composition, did not change with age or mitochondrial-haplotype. However, beta-diversity, a measure of microbial differences among samples, was significantly modulated by age in male and female rats in both mitochondrial-haplotypes. The age-related changes in the microbiome differed markedly between male and female rats. Five microbial species changed significantly with age in male rats compared to nine microbial species in female rats. Only three of these microbes changed with age in both male and female rats. The mitochondrial-haplotype of the rats also affected how aging altered the microbiome. Interestingly, most of the microbial species that changed significantly with age were mitochondrial-haplotype and sex specific, i.e., changing in one sex and not the other. We also discovered that sex and mitochondrial-haplotype significantly affected the age-related variations in content of fecal short-chain fatty acids and plasma metabolites that influence or are regulated by the microbiome, e.g., tryptophan derived metabolites and bile acids. This study demonstrates that the hosts sex plays a significant role in how the gut microbiome evolves with age, even within a genetically diverse background. Importantly, this is the first study to show that the mitochondrial-haplotype of a host impacts the age-related changes in the microbiome and supports previous studies suggesting a bidirectional interaction between the gut microbiome and host mitochondria. HighlightsMost age-related changes in microbial species occurred in one sex but not the other Mitochondrial-haplotype altered the microbiome and was generally sex dependent Microbiome associated metabolites differed by age, sex, and mitochondria-haplotype

著者: Archana Unnikrishnan, H. V. M. Nguyen, E. Cabello, D. Dyer, C. Fender, M. Garcia-Jaramillo, N. Hord, S. Austad, A. Richardson

最終更新: Oct 29, 2024

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.28.620746

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.28.620746.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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