アスペルギルス菌の隠れた世界
アスペルギルス菌の役割と影響を世界中で探る。
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目次
アスペルギルスは、地球のほぼどこにでもいる大きな菌群だよ。糸状菌の一種で、長い糸のような構造を持ってる。大体450種類くらいの異なる種がいるよ。土壌や空気、水の中にもいるし、北極の寒いところが好きなやつや、植物や動物の中に住んでるやつもいるんだ。
これらの菌は、私たちの生活で大事な役割を果たしてる。中にはコレステロールを下げる薬に使われるアスペルギルスの種もあれば、醤油を作るのに使われるものもある。化粧品業界でも利用されてるんだ!でも、全部が良い菌ってわけじゃなくて、食べ物を腐らせたり、植物に病気を引き起こしたり、人間や動物にも健康問題を引き起こすやつもいる。
多様な菌のグループ
アスペルギルスのグループは、ライフスタイルの多様性で知られてる。一部のアスペルギルス種は死んだ有機物を食べるけど、他のは健康な植物の中に住むこともある。中には植物や動物、人間に病気を引き起こすものもいるよ。たとえば、アスペルギルス・ニガーやアスペルギルス・フラバスはしばしば腐った農産物、ナッツや果物に見られる。これらの菌の中には、マイコトキシンという有害な物質を生産するものもいて、健康に悪影響を及ぼすことがある。
アスペルギルス種は人間に病気を引き起こすことがあって、これをアスペルギルス症って呼ぶんだ。この感染症は、肺や皮膚など体のいろんな部分に現れることがある。毎年、全世界で100万人以上に影響を与えてる。その中でも特に危険な形態が侵襲性アスペルギルス症で、主にアスペルギルス・フミガトゥスや他のいくつかによって引き起こされるんだ。
分布と生息地
アスペルギルス種は、いろんな環境に存在していて、すごく適応力がある。研究によると、気候に関連したパターンが分布に影響を与えてるみたい。たとえば、温度や降雨量がこれらの菌がどこで繁栄するかに関与してることを調べた研究もあった。ただ、アスペルギルス種の全球的な分布パターンはまだ完全には理解されていない。
いくつかのデータベースが作られて、アスペルギルスを含むいろんな菌の情報を集めてる。これらのデータベースは、科学者が菌の分布と環境要因との関係を研究するのに役立ってる。予測アルゴリズムを使うことで、研究者は気候データに基づいてアスペルギルス種がどこにいるかを推定できるんだ。
研究の目的
最近の研究の目標は、医療やバイオテクノロジーに重要なアスペルギルス種の地理的分布と多様性を分析することだった。176種の30,542件の記録を調べることで、これらの種がどのようにさまざまな環境に広がっているかをよりよく理解しようとしたんだ。
さらに、このデータを将来の気候モデルと組み合わせて、気候変動がアスペルギルス種の分布にどう影響するかを見ようとしてた。研究結果は、アスペルギルス種がどこに住むかを決定する要因と、気候変動にどう反応するかを明らかにすることを目指してる。
種の豊かさのホットスポット
アスペルギルス種が最も豊富に存在する場所を調べたとき、研究者たちは、リッチな地域はたいてい温暖湿潤で温帯の森林であることを発見した。いろんな場所から集めたデータをマッピングしたら、高い豊かさのホットスポットが南東ヨーロッパや南東アジアといった場所に見つかったんだ。
面白いことに、たくさんの種がいるエリアは、通常、生物多様性が高く、安定した気温が特徴の地域に見られた。他の地域、たとえばアメリカの一部やオーストラリアでは、中程度の種の豊かさが見られたけど、これは気候の季節的な変化が大きいせいかもしれない。
サンプリングバイアスをチェックするために、研究者たちは、それぞれのエリアから集められたサンプル数と予測される種の豊かさを比較した。予測で高い豊かさになるエリアでも、比較的少ないサンプルしか取られていないところがあった。これは、研究者が見落としていた種の豊かなエリアがあるかもしれないことを示唆しているんだ。
バイオームと気候クラス
アスペルギルス種は15種類の異なるバイオームに広がっていて、地中海林が種の豊かさで最もリッチなんだ。このバイオームにはカリフォルニアや南アフリカのような地域が含まれていて、暑く乾燥した夏と涼しく湿った冬が特徴だよ。
研究では、異なる気候クラスでの平均的な種の豊かさも調べられた。驚いたことに、種の豊かさは温帯地域で高いことがわかった。この発見は、通常多くの植物や動物が熱帯地域で繁栄するというパターンに反してるんだ。
種の豊かさに対する環境の影響
アスペルギルスの豊かさに影響を与える要因をよりよく理解するために、研究者たちはいくつかの生態的要因を調べた。分析の結果、特定の環境ゾーン、土壌の種類、植生が種の豊かさを高める重要な要因であることが示された。
彼らはまた、人間の活動がこれらの菌に影響を与えることにも言及してる。人間の影響が強いエリアは、アスペルギルスが繁栄する新しい機会を提供するかもしれないし、ポジティブな面でもネガティブな面でもそうだ。この研究は、自然と人為的な変化の両方が、これらの菌がどこに住むかを形成することを示唆してる。
種の範囲の変動
研究者たちは、異なるアスペルギルス種の範囲にかなりの変動があることを発見した。平均して、各種は全球の地域の約2%を占めていて、範囲が広いものもあれば、特定の環境にしか住まないものもいる。
たとえば、アスペルギルス・シグロスやアスペルギルス・フロクリコスは最も広い範囲が予測されてるけど、アスペルギルス・ラックノーエンシスのような種は、より小さく、ローカライズされたエリアに留まってる。
この変動は、トレーニングデータに記録された出現数と種の範囲サイズの関連についての疑問を生じさせる。分析は弱い負の相関を示していて、つまり、記録が少ない種はより広い範囲を持つ可能性があるけど、この効果は生態的要因に比べて小さいんだ。
種間の範囲の重複
多くのアスペルギルス種が生息地を共有しているため、研究者は彼らの範囲がどれだけ重なっているのかを調べた。ジャッカール指数を使って、類似性の測定を行い、どの種が同じエリアに住んでいるかを見たんだ。
ほとんどの種は限られた重複を示していて、著しく共有される範囲を持つペアは少なかった。この低い重複は資源競争のためかもしれなくて、同じ場所に存在する種が少なくなってる可能性がある。
環境の影響因子
研究はまた、アスペルギルスの分布を駆動する環境因子も調査した。気候分類、エコフロリスティックゾーン、人間の影響といった重要な変数が分布に大きな役割を果たしていることが示唆された。これらの発見は、気候、植生、土壌の変動がアスペルギルス種がどこに住めるかを決める上で重要な役割を果たすことを示してる。
気候変動への反応
気候変動が私たちの上に迫る中、研究者たちはアスペルギルス種がどのように反応するかを予測するために取り組んだ。モデルを改良して、変わりゆく温度や条件がこれらの菌の分布にどう影響するかを見ようとしたんだ。
驚くべきことに、多くの種が様々な気候シナリオの中で範囲が減少することが予測されていて、一部は拡大する可能性もあるけど、それは微小なものかもしれない。この変動は、各種が気候変動に対して異なる反応を示し、あるものは他のものより適応が良いことを示してる。
主な病原体と小さな病原体
気候変動の影響を調査している中で、研究者たちはアスペルギルス・フミガトゥスやアスペルギルス・フラバスのような主要な病原体に焦点を当てたんだ。彼らの調査結果は、これらの主な病原体の範囲が時間とともにわずかに減少する可能性があることを示唆してる、特に深刻な気候変動条件下で。
逆に、いくつかの小さな病原体は、予測される範囲がより一貫して減少していることがわかった。この結果は、一部の種が分布をシフトする可能性がある一方で、占める全体のエリアは比較的安定していることを示してるんだ。
将来の研究への影響
アスペルギルスの分布に関する研究は、将来の研究にさまざまな重要な影響を与えるよ。気候条件が変わる中で、これらの菌がどのように進化し、環境に適応するかを理解することが重要になる。これらの洞察は、特に暖かい気候で繁栄する菌が増えることで、潜在的な健康リスクを予測するのに役立てられるかもしれない。
種が同じ生態的ニッチを占め続けるという仮定は、環境変化に応じて適応する場合は正しくないかもしれない。他の菌の観察から、彼らは高温での成長のために急速に突然変異を獲得することができることがわかっている。
結論
要するに、アスペルギルス種は非常に多様で適応力のある菌群で、世界中に広がっているよ。産業や生態系における役割は重要だけど、健康や農業にリスクももたらすんだ。彼らの分布に関する研究は、従来の期待とは異なる生物多様性のパターンを明らかにし、特に気候変動が私たちの世界に影響を与える中で、さらなる研究の必要性を示してる。
菌は自然の驚異を考えたときにまず思い浮かぶものではないかもしれないけど、もっと魅力的な動物や植物と同じくらい注目されるべき存在なんだ。だから、次にキノコに出会ったときは、それがただのきれいな帽子じゃなくて、アスペルギルスの魅力的な世界に属しているかもしれないってことを思い出してね!
タイトル: Global patterns of species diversity and distribution in the biomedically and biotechnologically important fungal genus Aspergillus
概要: Aspergillus fungi are key producers of pharmaceuticals, enzymes, and food products and exhibit diverse lifestyles, ranging from saprophytes to opportunistic pathogens. To improve understanding of Aspergillus species diversity, identify key environmental factors influencing their geographic distributions, and estimate the impact of future climate change, we trained a random forest machine learning classifier on 30,542 terrestrial occurrence records for 176 species ([~]40% of known species in the genus) and 96 environmental variables. We found that regions with high species diversity are concentrated in temperate forests, which suggests that areas with mild seasonal variation may serve as diversity hotspots. Species range estimates revealed extensive variability, both within and across taxonomic sections; while some species are cosmopolitan, others have more restricted ranges. Furthermore, range overlap between species is generally low. The top predictors of mean species richness were the index of cumulative human impact and five bioclimatic factors, such as temperature and temperate vs non-temperate ecoregions. Our future climate analyses revealed considerable variation in species range estimates in response to changing climates; some species ranges are predicted to expand (e.g., the food spoilage and mycotoxin-producing Aspergillus versicolor), and others are predicted to contract or remain stable. Notably, the predicted range of the major pathogen Aspergillus fumigatus was predicted to decrease in response to climate change, whereas the range of the major pathogen Aspergillus flavus was predicted to increase and gradually decrease. Our findings reveal how both natural and human factors influence Aspergillus species ranges and highlight their ecological diversity, including the diversity of their responses to changing climates, which is of relevance to pathogen and mycotoxin risk assessment.
著者: Olivia L. Riedling, Kyle T. David, Antonis Rokas
最終更新: 2024-12-03 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.29.626055
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.29.626055.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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