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オープンサイエンスの未来: 一体化アプローチ

オープンサイエンスは、協力、アクセスのしやすさ、そして研究の迅速な発見を促進するんだ。

Dana E. Cobb-Lewis, Devin Synder, Sonya Dumanis, Robert Thibault, Barbara Marebwa, Elisia Clark, Lara St. Clair, Leslie Kirsch, Michelle Durborow, Ekemini Riley

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目次

オープンサイエンスは、研究を見つけやすく、アクセスしやすく、使いやすくする方法だよ。科学者たちが自分の発見を他の人と共有することで、みんなが以前の成果を元にできるようになるからね。この共有が発見を早めて、研究者同士のコラボレーションを促すんだ。最近、多くの資金提供機関やジャーナルが研究者にオープンに作品を共有するよう求めてるけど、どうやってそれをするかは難しいこともあって、思わぬコストがかかることもあるんだ。

オープンサイエンスを促進する取り組みの一例が、パーキンソン病に関連するAligning Science Across Parkinson's(ASAP)プログラムなんだ。この取り組みは、チームワークを促したり、リソースを提供したり、データの共有を可能にすることで、パーキンソン病を研究する研究者を助けることを目指しているよ。ASAPには、オープンな情報の共有を促進するためにグランティーが守らなきゃいけない5つのルールがあるんだ。

ASAPオープンサイエンスポリシーの5つのルール

  1. 研究成果を共有: 研究者は、自分の仕事が公開されたらすぐに、データやコード、ソフトウェア、プロトコルなどすべての成果を共有しなきゃいけない。最初は、研究者は出版時までにラボの素材を預けなきゃいけなかったけど、これが難しすぎることが分かって、今はそのプロセスを始めるだけで大丈夫なんだ。

  2. 研究のインプットを特定: 研究者は、自分の研究に使用した材料や他の人が作ったコードなど、研究インプットについて明確に特定して情報を提供すべきだよ。

  3. オープンアクセスを確保: 研究は一般の人が自由にアクセスできるようにしなきゃいけない。これには、正式に公開される前に研究のプレプリント(初期ドラフト)を投稿することが含まれるんだ。

  4. ASAPを認める: グランティーは、自分の研究にASAPを言及して、クリエイターにクレジットを与えなきゃいけないんだ。

  5. ASAPネットワークと成果を共有: すべての研究成果は、ASAPネットワーク内で共有して、他の人がアクセスしやすく、学びやすくするべきだよ。

オープンサイエンスの課題

オープンサイエンスの目標は素晴らしいけど、研究者がこれらのルールに従うのは難しいことがあるんだ。一部の研究者は、データがリクエストに応じて利用可能だと言うだけで十分だと思ったり、追加の材料を添付するだけで済むと考えているけど、研究によると、研究者がこのようにデータを共有すると約束しても、やっぱり実行しないことが多いんだ。

大きな障害の一つは、多くの研究者がデータを効果的に共有する方法について適切なトレーニングを受けていないことだよ。また、データの管理についても、共有されるファイルがきちんと整理され、適切にラベル付けされて、他の人が使いやすいことを確保するのが難しい場合もあるんだ。整理されてないデータにアクセスするのは、詰まったクローゼットを探るようなもので、大変なんだよ。

多くの研究者は、自分の研究を共有するためのベストプラクティスに気づいていない。たとえば、プロトコルや方法を共有するのは重要だけど、実際には研究者の約3分の1しかこれらの詳細を文章化して共有していないんだ。これは、重要な材料が抜けたレシピで料理しようとするようなもので、ケーキを焼くのは大変だよ!

オープンサイエンスのコスト

オープンサイエンスポリシーを実施するのは無料じゃないんだ。資金提供者は、これらの実践を管理する際のさまざまなコストを考慮しなきゃいけないよ。例えば、データを適切に保存し、効果的に整理し、一般に公開するために必要なコストがあるんだ。

  1. データ共有コスト: 資金提供者は、データを効果的に整理したり、リポジトリに保存したり、共有のためのインフラを維持するためのコストを負担する必要があるんだ。一部のリポジトリは無料だけど、大きなデータセットは、特に人間を対象にしたデータを扱う研究者にとってコストにつながることがあるよ。

  2. コードとソフトウェアのコスト: 資金提供団体は、スクリプトやソフトウェアを共有するためのコストを負担しない場合があるけど、ソフトウェアの維持や更新は高くつくことがあるんだ。もしツールが人気になったら、更新やバグ修正、技術サポートのためにもっとリソースが必要になるかもしれない。

  3. プロトコル共有のコスト: 研究機関は研究者に詳細な実験プロトコルを共有してほしいと思うかもしれないけど、これを作成して整理するには時間と労力がかかることがあるんだ。資金提供者は、研究者の自信を高めるためにトレーニングを支援しなきゃいけないこともあるよ。

  4. ラボの素材のコスト: 研究者がラボの素材を預けるのに時間がかかることもあるし、知的財産権のような法的問題が複雑にすることもあるんだ。資金提供者は、このプロセスを通じて研究者をサポートし、負担を軽減する必要があるよ。

データ共有の推進

これらの課題にもかかわらず、多くの資金提供機関がデータ共有の実践を向上させるように奮闘しているんだ。研究者の中には、データを共有しないことで科学の進展を妨げていることに気づいていない人もいるかもしれない。ブロックでタワーを作ろうとしているのに、少ししか持ってないような感じだよ—コラボレーションがないと、タワーは高くならない!

研究者は、特にテクノロジーの時代において、自分の研究をオープンに共有することの重要性を学ばなきゃいけない。コミュニティが認識したリポジトリや適切なドキュメントなどのツールがあれば、データ共有の負担が軽減されるんだ。研究者が自分の資料や方法をもっと共有すればするほど、他の人がそれを利用しやすくなって、より大きな知識の集積が得られるよ。

支援的インフラの構築

オープンサイエンスを促進するためには、研究者が共有しやすい支援システムを作ることが重要なんだ。これは、より良い共有プラットフォームを導入したり、データをホストしたり、トレーニングを提供することを含むよ。例えば、ASAPは、パーキンソン病に関する遺伝子データや臨床データのためのデータリポジトリを作成するために、いくつかの組織と提携しているんだ。

資金提供者は、研究者が自分の研究を共有する重要性を理解できるようにトレーニングプログラムに投資することができるよ。また、共有されたリソースを維持する手助けをして、研究者の負担を軽減することもできるんだ。結局のところ、共有は思いやりだし、研究者が互いの研究を大切にすれば、みんなに利益があるんだ。

研究者の奨励

研究者がオープンサイエンスの実践を採用するように奨励するのは、認識とインセンティブに関わっているんだ。資金提供者は、オープンアクセス出版費を支援したり、オープンサイエンスポリシーに成功裏に従った研究者に賞を提供することで、研究者をモチベートすることができるよ。

オープンさとコラボレーションの利点を明確に理解すれば、研究者はこれらの実践を受け入れることに前向きになれるかもしれない。また、助成金の機会には過去の遵守を基準に含めることで、研究者がオープンサイエンスのルールに従うよう促すことができるよ。

プロジェクトマネージャーの役割

オープンサイエンスの世界では、プロジェクトマネージャーがいると良い結果をもたらすことがあるんだ。彼らは研究者がコミュニケーションを取りやすくして、情報を効果的に共有する手伝いをしてくれるよ。データ共有やオープンサイエンスポリシーの遵守のプロセスをガイドして、研究者と資金提供者の橋渡しをしてくれるんだ。

プロジェクトマネージャーが先導することで、研究チームはオープンサイエンスポリシーに従うための準備が整うんだ。彼らは情報共有を導いて、オープンサイエンスの実践を受け入れるために協力を調整してくれるよ。まるで洞窟の中でガイドがいるようなもので、道を知っている誰かがいれば早く出口を見つけられるってわけ。

オープンサイエンスの影響

研究の世界が進化し続ける中で、オープンサイエンスは科学的発見の風景を変革する可能性を秘めているんだ。データや研究成果を共有することで、科学者たちは急務の問題に迅速に対処して、効果的に協力できるようになるよ。

パーキンソン病を研究している研究者が、お互いのデータにアクセスして、互いの発見をもとにできたら、突破口が開けるかもしれないよね!

オープンサイエンスは透明性を促進し、信頼を築き、チームワークを奨励するんだ。研究者がオープンに発表することで、共有の文化が生まれて、将来の科学者たちを鼓舞することができるんだ。このアプローチは、研究の質を高めるだけでなく、科学を一般の人々に近づけて、日常生活にもっと関連性を持たせるんだよ。

結論

オープンサイエンスは、もっとアクセスしやすく、協力的で透明な研究環境を作ることを目指した前向きなアプローチなんだ。このようなポリシーを実施する際の課題にもかかわらず、ASAPのような資金提供団体はこれらの価値を積極的に推進しているよ。データや研究成果、洞察を共有することで、科学者たちは発見の速度を速め、科学研究全体の質を向上させることができるんだ。

研究者への継続的な努力、教育、支援があれば、オープンサイエンスの未来は明るいと思う。だから、自分たちの発見やアイデア、リソースをどんどん共有していこう!結局、科学はチームスポーツだから、みんながプレイするチャンスを持つべきなんだ!

オリジナルソース

タイトル: Investing in Open Science: Key Considerations for Funders

概要: The open science movement aims to transform the research landscape by promoting research transparency in order to enable reproducibility and replicability, lower the barriers for collaboration, and reduce unnecessary duplication. Recently, in recognition of the value of open science, funding agencies have begun to mandate open science policies as a condition in grantee awards. However, operationalization and implementation of an open science policy can have unanticipated costs and logistical barriers, which can impact both the funder, as well as the grantee. These factors should be considered when implementing an open science policy. The Aligning Science Across Parkinsons (ASAP) initiative utilizes a comprehensive open science policy, which, in addition to requiring immediate free online access to all publications, also requires all newly-generated datasets, protocols, code, and key lab materials be shared by the time of publication. Moreover, preprints must be posted to a preprint repository by the time of manuscript submission to a journal for review. Here, we outline the potential costs associated with implementing and enforcing this open science policy. We recommend that funders take these considerations into account when investing in open science policies within the biomedical research ecosystem.

著者: Dana E. Cobb-Lewis, Devin Synder, Sonya Dumanis, Robert Thibault, Barbara Marebwa, Elisia Clark, Lara St. Clair, Leslie Kirsch, Michelle Durborow, Ekemini Riley

最終更新: 2024-12-10 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.09.627554

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.09.627554.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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