PULSAR: Un Passo Verso la Documentazione Medica Automatica
PULSAR trasforma le conversazioni tra dottori e pazienti in registri medici efficienti.
― 5 leggere min
Indice
L'uso di modelli linguistici avanzati sta diventando sempre più popolare in vari settori, compreso quello della salute. Questi modelli possono aiutare a cambiare il modo in cui i professionisti sanitari gestiscono le informazioni sui pazienti. In questo contesto, parliamo di un sistema chiamato Pulsar, progettato per convertire i dialoghi tra medici e pazienti in cartelle cliniche. Questo è particolarmente utile perché può automatizzare alcune delle attività amministrative negli ospedali, che spesso richiedono molto tempo.
Importanza del Compito
I professionisti della salute passano un sacco di tempo a documentare le interazioni con i pazienti. Questo processo può richiedere almeno 35 minuti ogni due giorni. Automatizzare questo compito potrebbe significare che dottori e infermieri avrebbero più tempo da dedicare alla cura dei pazienti invece che alla carta. Riassumere le conversazioni in documentazione clinica è uno dei compiti che PULSAR intende affrontare. Questo comporta trasformare gli scambi verbali in registrazioni scritte, come i sintomi o la storia medica di un paziente.
Il Framework
PULSAR è costruito su un modello linguistico che è stato appositamente preparato per il campo della salute. Il modello impara dai dati di Dialogo, che combina con dati sintetici generati per migliorare le sue prestazioni. Anche se il team dietro PULSAR si è concentrato sullo sviluppo di un modello addestrato con questo approccio, si sono accorti che semplicemente aumentare la dimensione del modello spesso portava a risultati migliori, a prescindere dall'addestramento specializzato.
Compiti nella Sfida
La sfida consiste in diversi compiti volti a valutare quanto bene i modelli linguistici possano riassumere i dialoghi in cartelle cliniche.
Compito A: Classificazione dell'Argomento
Nel primo compito, ci si concentra sulla determinazione dell'argomento di una conversazione. Il modello deve classificare le conversazioni in sezioni specifiche di una cartella clinica, come "Soggettivo", dove i pazienti descrivono i propri sintomi.
Compito B: Riepilogo del Dialogo
Nel secondo compito, il modello deve convertire una conversazione su un dato argomento nella sezione appropriata della cartella clinica. Questo richiede di generare un testo che corrisponda allo stile e al formato delle note cliniche basato su una conversazione dettagliata.
Compito C: Riepilogo Completo dell'Incontro
L'ultimo compito va oltre, richiedendo al modello di prendere intere conversazioni e produrre cartelle cliniche complete. Questo copre più sezioni come "Soggettivo", "Esame Obiettivo", "Risultati Oggettivi" e "Valutazione e Piano".
Metodologia
PULSAR è stato sviluppato utilizzando un obiettivo di pre-addestramento che si concentra sulla ricostruzione di riassunti dalle conversazioni. Una parte cruciale per migliorare le prestazioni è stata l'augmentazione dei dati, dove sono stati generati esempi di addestramento aggiuntivi per integrare i dati esistenti.
Fonti Dati
Per l'addestramento e la valutazione, il team ha utilizzato un grande set di dati noto come MIMIC-III, che contiene vari record clinici. L'obiettivo era affinare il modello affinché potesse funzionare bene nonostante i dati limitati disponibili per alcuni compiti.
Generazione dei Dati di Allenamento
Poiché la quantità di dati di addestramento per alcuni compiti era bassa, sono stati creati dati sintetici per completare il processo di addestramento. Prendendo appunti medici esistenti e generando dialoghi ipotetici basati su di essi, il modello poteva imparare meglio le conversioni da conversazioni a note. Sono stati impiegati LLM come ChatGPT a questo scopo.
Strategia di Prompting
Per generare dati significativi, è stato implementato un sistema di prompting a due fasi. La prima fase prevedeva l'uso di un esempio per spingere un modello linguistico a creare una conversazione fittizia. Nella seconda fase, sono stati inclusi elementi aggiuntivi, come riempitivi conversazionali (ad es., "um" o "hmm"), per rendere il dialogo generato più naturale.
Risultati
Le prestazioni del modello sono state valutate utilizzando una serie di metriche per capire quanto bene ha funzionato nei compiti.
Efficacia dell'Approccio
In generale, PULSAR ha mostrato risultati promettenti, soprattutto nei compiti di riepilogo. La capacità del modello di convertire dialoghi in cartelle cliniche è stata riconosciuta, rendendolo competitivo tra le proposte per la sfida. Tuttavia, è stato osservato che semplicemente aumentare la dimensione del modello ha portato ai miglioramenti più significativi nelle prestazioni complessive.
Pre-Addestramento e Aumento Dati
I risultati hanno anche rivelato esiti misti riguardo all'efficacia del pre-addestramento specializzato. In alcuni casi, non ha fornito i benefici attesi. L'augmentazione dei dati, d'altra parte, si è dimostrata particolarmente utile quando i dati originali di addestramento erano scarsi.
Sfide Affrontate
Anche se i risultati erano incoraggianti, ci sono state alcune sfide da affrontare nel lavoro futuro. Un problema chiave era la discrepanza tra i dati utilizzati per l'addestramento e quelli delle conversazioni reali. I modelli di addestramento spesso faticavano con il linguaggio informale presente nei dialoghi effettivi.
Direzioni Future
Andando avanti, ci sono diverse strade per migliorare PULSAR e sistemi simili. Sperimentare con diversi obiettivi di pre-addestramento potrebbe portare a migliori prestazioni. Serve anche un'ulteriore esplorazione su come gli iperparametri influenzano i risultati. Inoltre, adottare metodi di filtraggio avanzati durante l'augmentazione dati potrebbe migliorare il processo di addestramento.
Conclusione
PULSAR rappresenta un significativo passo avanti nell'uso dei modelli linguistici per la salute. Il potenziale di automatizzare il processo di documentazione potrebbe portare a una consegna dei servizi sanitari più efficiente. Tuttavia, c'è ancora molto lavoro da fare per affinare questi modelli e garantire che funzionino efficacemente in scenari reali. I risultati di questo progetto aprono la porta a ulteriori ricerche in quest'area, sottolineando l'importanza del miglioramento continuo nei modelli linguistici applicati alla salute.
Titolo: PULSAR at MEDIQA-Sum 2023: Large Language Models Augmented by Synthetic Dialogue Convert Patient Dialogues to Medical Records
Estratto: This paper describes PULSAR, our system submission at the ImageClef 2023 MediQA-Sum task on summarising patient-doctor dialogues into clinical records. The proposed framework relies on domain-specific pre-training, to produce a specialised language model which is trained on task-specific natural data augmented by synthetic data generated by a black-box LLM. We find limited evidence towards the efficacy of domain-specific pre-training and data augmentation, while scaling up the language model yields the best performance gains. Our approach was ranked second and third among 13 submissions on task B of the challenge. Our code is available at https://github.com/yuping-wu/PULSAR.
Autori: Viktor Schlegel, Hao Li, Yuping Wu, Anand Subramanian, Thanh-Tung Nguyen, Abhinav Ramesh Kashyap, Daniel Beck, Xiaojun Zeng, Riza Theresa Batista-Navarro, Stefan Winkler, Goran Nenadic
Ultimo aggiornamento: 2023-07-04 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://arxiv.org/abs/2307.02006
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2307.02006
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia arxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.
Link di riferimento
- https://pygments.org/
- https://pypi.python.org/pypi/Pygments
- https://github.com/yuping-wu/PULSAR
- https://chat.openai.com
- https://mtsamples.com/
- https://www.kaggle.com/datasets/tboyle10/medicaltranscriptions
- https://github.com/huggingface/accelerate
- https://huggingface.co/xyla/Clinical-T5-Large
- https://www.incompleteideas.net/IncIdeas/BitterLesson.html