Modellare la diffusione delle malattie: sfide e spunti
Capire come le caratteristiche individuali influenzano gli esiti delle malattie attraverso la modellazione.
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Indice
Quando le malattie infettive si diffondono, i ricercatori usano modelli per prevedere cosa potrebbe succedere dopo. Questi modelli hanno bisogno di informazioni accurate su come la malattia colpisce persone diverse. Ad esempio, devono sapere le probabilità che qualcuno si ammali, debba andare in ospedale o addirittura muoia a causa della malattia. Guardano anche a quanto bene i vaccini o le infezioni pregresse possano proteggere le persone da malattie o conseguenze serie.
Durante la pandemia di COVID-19, abbiamo imparato che queste probabilità possono variare molto. Dipendono da tanti fattori, come la variante specifica del virus a cui qualcuno è esposto, e dai dettagli personali degli individui, come l'età, il sesso, le condizioni di salute e se hanno avuto infezioni o vaccinazioni precedenti. Quindi, è fondamentale chiarire quali informazioni degli studi di ricerca possono essere usate per informare questi modelli di previsione delle malattie.
Modelli basati sugli individui
Un approccio che usano i ricercatori si chiama modello basato sugli individui (IBM). Questo tipo di modello prende un gruppo di persone con caratteristiche specifiche, come età e stato di salute, e simula come la malattia si diffonde tra di loro. Il modello tiene traccia di quante persone si infettano, quante necessitano di cure mediche e quante sopravvivono. I risultati possono aiutare a prevedere come interventi diversi, come la Vaccinazione, influenzano la diffusione della malattia.
In un IBM, ogni persona inizia con un insieme di dettagli che rimangono gli stessi o cambiano nel tempo. Questi dettagli possono includere le loro condizioni di salute di base, che possono renderli più vulnerabili alla malattia. Il modello include anche se una persona è stata vaccinata, poiché questo può cambiare il loro rischio di ammalarsi. I ricercatori aggiustano il modello mentre introducono infezioni, partendo da alcune persone che hanno già la malattia per vedere come si diffonde.
Per far funzionare il modello, i ricercatori devono stimare quanto sia probabile che una persona con caratteristiche specifiche affronti diversi risultati, come ospedalizzazione o morte, dopo essere stata esposta al virus. Questo implica comprendere gli effetti combinati della vaccinazione e dell'esposizione al virus per individui con particolari riferimenti di salute.
Monitoraggio della Progressione della Malattia
I ricercatori sono particolarmente interessati agli eventi principali che possono accadere dopo che qualcuno è stato esposto al COVID-19. Questi eventi possono includere l'infezione, la comparsa dei sintomi, la diagnosi, l'ospedalizzazione, la necessità di cure intensive o la morte. Fondamentalmente, ci sono molti possibili risultati per ogni persona, ma solo alcuni di essi si verificheranno in base a come rispondono all'infezione e al loro contesto di salute.
La situazione ideale sarebbe avere abbastanza informazioni per stimare la probabilità di ogni risultato per ogni possibile combinazione di caratteristiche individuali e scenari di esposizione. Tuttavia, raccogliere dati su tutti questi fattori è complicato. Ad esempio, spesso non vediamo i casi lievi perché non vengono testati o diagnosticati, il che rende difficile avere un quadro completo.
Sfide nella Stima dei Parametri
Quando raccolgono dati per un IBM, i ricercatori affrontano diverse sfide. Un problema è che di solito è impossibile vedere ogni risultato per ogni persona in uno studio. Coloro che si ammalano gravemente hanno più probabilità di essere diagnosticati, mentre i casi lievi possono passare inosservati. Questo distorce i dati che raccolgono.
Un altro problema è la complessità delle caratteristiche individuali. I ricercatori trovano difficile stimare le probabilità con precisione perché ci sono troppi fattori da considerare. Ad esempio, potrebbero assumere che gli effetti di diverse condizioni di salute si moltiplichino tra loro quando valutano il rischio di qualcuno, semplificando il problema ma senza riflettere la realtà.
Il bias può anche interferire con la loro capacità di stimare queste probabilità correttamente. Il bias si verifica quando alcuni gruppi hanno più probabilità di essere inclusi in uno studio, il che potrebbe non riflettere la popolazione generale. Questo può portare a conclusioni errate.
Progettazioni di Studio Ideali
Per ottenere le stime più accurate per i loro modelli, i ricercatori idealmente vogliono condurre studi che randomizzino la vaccinazione e l'esposizione tra gli individui. Tuttavia, questo approccio potrebbe non essere sempre etico o fattibile. Se gli scienziati potessero condurre studi di questo tipo, selezionerebbero persone a caso e le assegnerebbero a ricevere un vaccino o a essere esposte al virus in un contesto controllato. Monitorerebbero quindi gli esiti di questi partecipanti per raccogliere dati non biasati.
Sfortunatamente, le condizioni del mondo reale rendono spesso impraticabile questo tipo di studio. Le persone che si offrono volontarie per tali prove possono essere molto diverse da quelle che non lo fanno. Questo significa che sarebbe difficile generalizzare i risultati alla popolazione più ampia.
Metodi di Studio Alternativi
Quando la randomizzazione non è possibile, i ricercatori possono usare dati da studi sui vaccini che confrontano individui vaccinati con quelli che hanno ricevuto un placebo. In questi studi, l'esposizione al virus non viene sempre misurata direttamente, ma i ricercatori possono comunque stimare l'efficacia del vaccino guardando i tassi di diversi risultati di salute tra questi gruppi.
Un altro approccio è esaminare gli studi di tracciamento dei contatti. In questi studi, i ricercatori seguono i contatti dei casi confermati per vedere quanti si ammalano e quanto grave diventa la loro malattia. Questi studi possono produrre informazioni preziose, specialmente subito dopo l'emergere di varianti del virus. Tuttavia, possono anche essere piccoli e richiedere molto lavoro.
I ricercatori possono utilizzare piramidi di gravità della malattia, confrontando la probabilità di esiti gravi come ospedalizzazione o morte tra coloro che sono infettati. Comprendendo la connessione tra le diverse fasi della malattia, possono costruire modelli migliori.
Bias nelle Probabilità di Progressione
Stimare quanto sia probabile che qualcuno passi da una fase di malattia a un'altra non è semplice. I ricercatori si trovano spesso di fronte a vari bias che possono distorcere i loro risultati. Ad esempio, se si concentrano solo su individui che mostrano sintomi, potrebbero perdere fattori critici che influenzano la probabilità di esiti gravi.
Per mitigare i bias nelle loro stime, i ricercatori devono raccogliere quante più informazioni pertinenti possibile e tenere conto di vari fattori, come età e condizioni di salute. Tuttavia, misurare accuratamente questi fattori può essere difficile, soprattutto quando alcune persone potrebbero non avere documentate le loro condizioni di salute.
Se non possono garantire di considerare tutti i fattori influenti, le stime potrebbero avere un certo bias ma possono comunque fornire informazioni utili, specialmente se non è possibile ottenere dati migliori.
Analisi di sensibilità
Importanza delleI ricercatori possono condurre analisi di sensibilità per capire come le variabili non misurate potrebbero influenzare i loro risultati. Questo li aiuta a valutare il potenziale bias nelle loro stime e ad aggiustare le loro conclusioni di conseguenza.
Conclusione
Modellare le epidemie di malattie infettive può essere complesso, specialmente quando si considerano le varie caratteristiche degli individui e come queste influenzano gli esiti di salute. Anche se i ricercatori affrontano numerose sfide e bias nella raccolta dei dati, una progettazione studiata può fornire intuizioni preziose. Comprendendo queste complessità, i ricercatori possono migliorare i loro modelli e prevedere meglio come si diffondono le malattie e come interventi come la vaccinazione impattano sulla salute pubblica.
Titolo: Some principles for using epidemiologic study results to parameterize transmission models
Estratto: BackgroundInfectious disease models, including individual based models (IBMs), can be used to inform public health response. For these models to be effective, accurate estimates of key parameters describing the natural history of infection and disease are needed. However, obtaining these parameter estimates from epidemiological studies is not always straightforward. We aim to 1) outline challenges to parameter estimation that arise due to common biases found in epidemiologic studies and 2) describe the conditions under which careful consideration in the design and analysis of the study could allow us to obtain a causal estimate of the parameter of interest. In this discussion we do not focus on issues of generalizability and transportability. MethodsUsing examples from the COVID-19 pandemic, we first identify different ways of parameterizing IBMs and describe ideal study designs to estimate these parameters. Given real-world limitations, we describe challenges in parameter estimation due to confounding and conditioning on a post-exposure observation. We then describe ideal study designs that can lead to unbiased parameter estimates. We finally discuss additional challenges in estimating progression probabilities and the consequences of these challenges. ResultsCausal estimation can only occur if we are able to accurately measure and control for all confounding variables that create non-causal associations between the exposure and outcome of interest, which is sometimes challenging given the nature of the variables we need to measure. In the absence of perfect control, non-causal parameter estimates should still be used, as sometimes they are the best available information we have. ConclusionsIdentifying which estimates from epidemiologic studies correspond to the quantities needed to parameterize disease models, and determining whether these parameters have causal interpretations, can inform future study designs and improve inferences from infectious disease models. Understanding the way in which biases can arise in parameter estimation can inform sensitivity analyses or help with interpretation of results if the magnitude and direction of the bias is understood.
Autori: Keya Joshi, R. Kahn, C. Boyer, M. Lipsitch
Ultimo aggiornamento: 2023-10-03 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.03.23296455
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.10.03.23296455.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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