Sfruttare la genetica nello sviluppo di farmaci
I ricercatori usano informazioni genetiche per migliorare lo sviluppo di farmaci per malattie complesse.
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Sviluppare nuovi farmaci di solito richiede molto tempo e soldi. Si stima che creare un singolo nuovo farmaco possa costare circa 2,6 miliardi di dollari e ci vogliano circa 12-15 anni prima che sia disponibile per i pazienti. Inoltre, molti di questi farmaci non hanno successo durante i test. Questo processo lento e costoso mette in evidenza la necessità di modi migliori per prevedere quali farmaci funzioneranno.
Recentemente, i ricercatori hanno iniziato a guardare alla genetica per aiutare a prevedere il successo dei farmaci. Studiando il genoma umano, gli scienziati hanno trovato specifici Marcatori genetici legati a varie malattie, che possono anche indicare potenziali obiettivi farmacologici. Ad esempio, certi cambiamenti genetici associati alla malattia di Crohn possono essere colpiti da un farmaco chiamato ustekinumab, originariamente progettato per trattare la psoriasi. Questo dimostra come comprendere la genetica possa aiutare sia a trovare nuovi farmaci che a perfezionare i trattamenti esistenti.
Gli studi hanno mostrato che i farmaci supportati da evidenze genetiche tendono a avere più successo nei Trial clinici. Uno studio ha analizzato trial clinici passati e ha scoperto che i farmaci supportati da dati genetici umani hanno il doppio delle probabilità di avere successo. Questi risultati rivelano quanto possa essere significativa la genetica nello sviluppo dei farmaci.
Tuttavia, è spesso difficile individuare le esatte cause genetiche delle malattie comuni. In molti casi, i marcatori genetici trovati negli studi sono in parti del genoma che non codificano direttamente per le proteine. D'altro canto, le Malattie Mendeliane rare, causate da una singola mutazione genica, di solito hanno obiettivi più definiti e utilizzabili per i farmaci.
In questo contesto, c'è un crescente interesse a sfruttare le informazioni apprese dalle malattie mendeliane per migliorare le opzioni di trattamento per le Malattie Complesse, che sono spesso più difficili da trattare.
Il Ruolo delle Malattie Mendeliane
Le malattie mendeliane derivano da specifiche mutazioni in singoli geni. Queste malattie forniscono un chiaro legame tra genetica e caratteristiche della malattia, rendendole preziose per comprendere la biologia dietro condizioni più complesse. Se riusciamo a identificare come i geni coinvolti nelle malattie mendeliane contribuiscono a malattie comuni, potremmo trovare nuovi modi per trattare quelle condizioni.
La ricerca ha dimostrato che le persone con certe malattie mendeliane hanno spesso una maggiore probabilità di sviluppare malattie complesse. Questo suggerisce che i geni responsabili delle condizioni mendeliane potrebbero influenzare lo sviluppo di altre malattie. Ad esempio, uno studio ha trovato che gli individui con la sindrome di Rubinstein-Taybi hanno un rischio aumentato di linfoma. Questo fa capire che le mutazioni collegate alla malattia mendeliana giocano anche un ruolo nello sviluppo della malattia complessa.
Nonostante queste intuizioni, il legame tra le malattie mendeliane e le malattie complesse non è ancora stato completamente utilizzato nella scoperta di farmaci. C'è bisogno di approcci che possano tradurre questa conoscenza in applicazioni pratiche per sviluppare nuovi trattamenti.
Metodo Proposto
L'obiettivo è trovare farmaci che possano essere utilizzati per malattie complesse guardando ai geni coinvolti in malattie mendeliane correlate. Analizzando le connessioni tra queste condizioni, i ricercatori puntano a raccomandare farmaci che prendono di mira geni associati a malattie mendeliane come trattamenti potenziali per le malattie complesse in comorbidità.
Per fare questo, i ricercatori prima raccolgono dati sui legami noti tra malattie mendeliane e malattie complesse. Identificando i geni che causano malattie mendeliane, possono compilare un elenco di farmaci che prendono di mira questi specifici geni. Il passo successivo consiste nel mettere in relazione questi farmaci con malattie complesse basandosi su informazioni genetiche condivise.
L'analisi si concentrerà su varie categorie di malattie e sui farmaci attualmente in uso o in fase di ricerca. Esaminando i tassi di successo di questi farmaci nei trial clinici, i ricercatori valuteranno se i farmaci candidati suggeriti in base alle associazioni con le malattie mendeliane hanno maggiori probabilità di successo nel trattare malattie complesse.
Indagare i Dati Clinici
Per portare avanti questa ricerca, il primo passo consiste nel raccogliere informazioni sulle comorbidità, ovvero condizioni che si verificano comunemente insieme. Un dataset significativo contiene oltre 2.900 coppie di malattie mendeliane e malattie complesse. Questi dati consentono ai ricercatori di capire le relazioni tra le diverse malattie.
Successivamente, i ricercatori compilano un elenco di farmaci che prendono di mira i geni legati a malattie mendeliane. Incrociando questo elenco con dati su farmaci attualmente in fase di test o approvati per malattie complesse, possono identificare potenziali candidati per il ripristino.
In totale, analizzano migliaia di trial clinici per vedere quali farmaci sono in fase di indagine per varie malattie complesse. L'analisi include anche farmaci approvati per queste condizioni. Confrontando i farmaci candidati con i trattamenti esistenti, i ricercatori sperano di trovare quelli con una maggiore probabilità di successo.
Valutare i Candidati Farmaci
Una volta raccolti i dati, il passo successivo è determinare se i farmaci candidati suggeriti in base alle associazioni con le malattie mendeliane sono effettivamente legati a risultati positivi. Per convalidare queste connessioni, i ricercatori utilizzano metodi statistici per analizzare la probabilità che i loro farmaci candidati siano efficaci.
L'analisi rivela una significativa abbondanza di farmaci candidati tra quelli attualmente in fase di test o indicati per malattie complesse. Questa analisi mostra che i farmaci che prendono di mira i geni causali delle malattie mendeliane hanno maggiori probabilità di risultare efficaci nel trattare malattie complesse.
In generale, i risultati indicano che le connessioni derivate dalle comorbidità delle malattie mendeliane forniscono intuizioni preziose per il ripristino dei farmaci. Questo stabilisce un nuovo approccio alla scoperta di farmaci che potrebbe portare a percorsi più rapidi ed efficienti per lo sviluppo di trattamenti.
Focalizzarsi su Malattie Mendeliane Druggabili
Non tutte le malattie mendeliane sono uguali quando si tratta di trattamenti disponibili. Alcune malattie sono collegate a geni per cui esistono già molti farmaci mirati. Questo può mettere in evidenza opportunità potenziali per il ripristino dei farmaci.
Tra le malattie mendeliane analizzate, i ricercatori trovano che quelle associate a un numero maggiore di geni utilizzabili per i farmaci sono più promettenti per scoprire nuove opzioni terapeutiche per le malattie complesse. Concentrandosi su queste malattie mendeliane "high-drug", i ricercatori possono identificare meglio quali target genetici potrebbero portare a trattamenti di successo.
L'analisi aiuta a individuare un certo numero di malattie mendeliane specifiche che potrebbero offrire il maggiore potenziale per la scoperta di farmaci. Emerse delle tendenze chiare dove più farmaci sono già stati sviluppati per determinate condizioni mendeliane, rendendole candidati probabili per offrire nuove intuizioni nel trattamento delle malattie complesse.
Combinare Evidenze per Previsioni Migliori
Sebbene la comorbidità fornisca un'importante strada per la scoperta di farmaci, la similarità genetica è un altro fattore importante da considerare. La similarità genetica si riferisce ai geni condivisi tra le malattie, indicando una base biologica comune. Quando sia la comorbidità che la similarità genetica sono presenti, la probabilità di trovare trattamenti efficaci aumenta.
In particolare, guardando ai tumori, i ricercatori valutano se i farmaci candidati supportati sia dalla comorbidità che dalla similarità genetica abbiano maggiori possibilità di successo. L'analisi mostra che quando entrambi i fattori vengono presi in considerazione, la probabilità di efficacia dei farmaci aumenta significativamente.
Sfruttando queste due forme di evidenza, i ricercatori possono dare priorità ai farmaci candidati che mirano alla biologia condivisa tra malattie mendeliane e malattie complesse. Questo approccio combinato migliora il successo complessivo delle previsioni sui farmaci.
Applicazioni nel Mondo Reale
Le implicazioni pratiche di questa ricerca sono significative. Ad esempio, se un farmaco utilizzato per trattare una specifica malattia mendeliana può anche beneficiare i pazienti con una malattia complessa correlata, potrebbe aprire opportunità per migliorare le opzioni di trattamento.
In pratica, questo significa che i ricercatori possono raccomandare farmaci approvati specifici per condizioni come il diabete di tipo 1 basandosi sui loro legami con le malattie mendeliane. Ad esempio, il verapamil, un farmaco utilizzato per trattare l'angina, ha mostrato promesse nell'aiutare le cellule produttrici di insulina a sopravvivere. Allo stesso modo, il carbamazepina, utilizzato per il controllo delle crisi, potrebbe anche giocare un ruolo nel trattamento del diabete di tipo 1.
Queste raccomandazioni sono basate su una combinazione di intuizioni genetiche e prove cliniche, suggerendo che i farmaci esistenti potrebbero essere efficaci per utilizzi aggiuntivi oltre il loro scopo originale.
Limitazioni e Direzioni Future
Nonostante i risultati promettenti, ci sono alcune limitazioni nello studio. Per prima cosa, non tutte le malattie complesse avevano dati completi disponibili, il che potrebbe influenzare la qualità delle raccomandazioni. Inoltre, è importante notare che non ogni caso di comorbidità indica una causa biologica condivisa. A volte, l'assenza di una relazione potrebbe essere dovuta ad altri fattori.
La ricerca futura dovrebbe concentrarsi sull'espansione dei dataset utilizzati per l'analisi per includere più malattie complesse e comprendere meglio le relazioni gene-malattia. Inoltre, c'è potenziale per indagare se le associazioni tra malattie comuni possano anche portare all'identificazione di farmaci esistenti che potrebbero beneficiare i pazienti.
Utilizzando i risultati, i ricercatori potrebbero sviluppare strategie mirate per trial clinici volti al ripristino dei farmaci basati su dati genetici e di comorbidità. Questo approccio segna un cambiamento in come lo sviluppo dei farmaci può sfruttare la conoscenza esistente per migliorare i piani di trattamento per i pazienti con malattie complesse.
Conclusione
In sintesi, lo studio stabilisce un quadro per utilizzare le intuizioni dalle malattie mendeliane per guidare gli sforzi di scoperta di farmaci per malattie complesse. Concentrandosi sulle relazioni genetiche e sulle comorbidità tra queste condizioni, i ricercatori possono proporre nuove opzioni di trattamento e identificare candidati promettenti per ulteriori indagini. Questa combinazione di approcci ha il potenziale per portare a percorsi di sviluppo più rapidi ed efficienti per i farmaci, migliorando infine l'assistenza e i risultati per i pazienti a lungo termine.
Titolo: Mendelian disease comorbidity as a resource for novel therapeutic targets
Estratto: Drugs targeting disease causal genes are more likely to succeed for that disease. However, complex disease causal genes are not always clear. In contrast, Mendelian disease causal genes are well-known and druggable. Here, we seek an approach to exploit the well characterized biology of Mendelian diseases for complex disease drug discovery, by leveraging evidence of pathogenic processes shared between monogenic and complex disease. One way to find shared disease etiology is clinical association: some Mendelian diseases are known to predispose patients to specific complex diseases (comorbidity). Previous studies link this comorbidity to pleiotropic effects of the Mendelian disease causal genes on the complex disease. In previous work studying incidence of 90 Mendelian and 65 complex diseases, we found 2,908 pairs of clinically associated (comorbid) diseases. Using this clinical signal, we can match each complex disease to a set of Mendelian disease causal genes. We hypothesize that the drugs targeting these genes are potential candidate drugs for the complex disease. Our analysis shows that the candidate drugs are enriched among currently investigated or indicated drugs for the relevant complex diseases (odds ratio=1.84, p=5.98e-22). By combining comorbidity with genetic similarity, we recommend drugs further enriched for those investigated or indicated. Our findings suggest a novel way to take advantage of the rich knowledge about Mendelian disease biology to improve treatment of complex diseases.
Autori: Rachel D Melamed, P. N. Lalakgas
Ultimo aggiornamento: 2024-05-07 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.23.550190
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.23.550190.full.pdf
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