Il Ruolo dei Microrganismi nella Resilienza delle Piante
Uno studio rivela come i microbi delle foglie supportano le piante sotto stress causato dai cambiamenti climatici.
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Indice
- Importanza dei Microbi sulle Foglie
- Come l'Ambiente Influenza l'Immunità delle Piante
- Ricerca sul Microbioma delle Piante e Resilienza
- Caratteristiche della Pianta Mutante
- Studio del Microbioma del Mutante CLLF
- Valutazione dell'Equilibrio Microbico nel CLLF
- Sistema Immunitario Potenziato del CLLF
- Risposta di Difesa del CLLF durante lo Stress Termico
- Ruolo della Composizione del Microbioma nella Salute delle Piante
- Conclusione
- Fonte originale
- Link di riferimento
Le condizioni meteorologiche estreme dovute ai cambiamenti climatici, come temperature elevate, siccità e aumento della salinità, rappresentano sfide serie per l'agricoltura e la produzione di colture. Questi cambiamenti possono influenzare come le piante crescono e si sviluppano, il che impatta le loro relazioni con i microbi nel terreno e sulle loro foglie. Questa relazione è fondamentale, dato che un equilibrio sano di microbi può aiutare a prevenire Malattie nelle piante. Se questo equilibrio si perde, possono sorgere problemi come malattie delle piante e raccolti ridotti. Quindi, capire come le piante mantengono questo equilibrio nelle loro Comunità microbiche, soprattutto in condizioni ambientali stressanti, è fondamentale.
Importanza dei Microbi sulle Foglie
I batteri associati alle foglie svolgono un ruolo cruciale nella Salute delle piante. Proteggono le piante da malattie e devono essere regolati per prevenire infezioni dannose. Le piante hanno sviluppato vari metodi per attrarre batteri benefici e mantenere una comunità microbica equilibrata. L'area sulle foglie dove questi microbi vivono, chiamata fitlosfera, può raccogliere batteri sia dal suolo che dall'aria. Questo processo può avvenire in due modi: sistematicamente o casualmente.
Le difese delle piante non solo aiutano a combattere le malattie, ma giocano anche un ruolo importante nel mantenere l'equilibrio dei batteri sulle loro foglie. Ad esempio, l'interazione tra batteri amici e potenzialmente dannosi con i componenti del Sistema Immunitario aiuta a evitare squilibri che potrebbero portare a malattie. Inoltre, alcuni composti vegetali possono influenzare quali batteri vengono attratti alla pianta offrendo risorse o creando tossicità. Tuttavia, come l'immunità della pianta si collega a come i batteri vengono raccolti nelle piante sane necessita di ulteriore esplorazione.
Come l'Ambiente Influenza l'Immunità delle Piante
Il sistema immunitario delle piante è influenzato dall'ambiente circostante. Anche se come fattori di stress come la temperatura influenzino l'immunità delle piante è ancora oggetto di studio, la temperatura ha mostrato effetti significativi. Ad esempio, a temperature moderatamente alte, la produzione di un ormone di difesa chiave per le piante, l'acido salicilico, si riduce. Questa riduzione può portare a un rischio maggiore di malattie poiché la pianta diventa più vulnerabile ai patogeni. Alcuni microbi possono aiutare le piante a resistere allo stress termico, il che indica che il microbioma delle foglie potrebbe attutire alcuni impatti negativi dell'aumento delle temperature.
Ricerca sul Microbioma delle Piante e Resilienza
Credevamo che l'equilibrio raggiunto dai sistemi immunitari delle piante durante la raccolta naturale dei microbi delle foglie fosse importante per aiutare le piante a far fronte allo stress termico. Per testare questa idea, abbiamo prima esaminato come i processi biologici delle piante influenzano l'equilibrio dei loro microbiomi fogliari. Abbiamo creato una pianta mutante casuale che era sana ma sviluppava un diverso equilibrio di microbi fogliari. Abbiamo indagato come i segnali immunitari di questo mutante reagissero a patogeni e stress termico. Alla fine, abbiamo valutato come il microbioma bilanciato aiutasse a compensare i cambiamenti nelle risposte immunitarie dovute alle variazioni di temperatura.
Caratteristiche della Pianta Mutante
Abbiamo creato una libreria di piante mutanti da un tipo specifico di Arabidopsis thaliana, chiamato ecotipo NG2, che era stato raccolto a Jena, in Germania. Utilizzando la mutagenesi chimica, abbiamo generato una varietà di mutanti. Nella seconda generazione, abbiamo selezionato questi mutanti per cariche batteriche più alte rispetto al tipo di pianta normale. Circa il 5% delle piante mutanti mostrava cariche batteriche aumentate, indicando un cambiamento in come raccoglievano questi microbi. Un particolare mutante, chiamato "CLLF," aveva la carica batterica più alta e presentava caratteristiche distinte, come foglie arricciate e fioritura ritardata.
Studio del Microbioma del Mutante CLLF
Abbiamo esaminato il microbioma completo sia della pianta standard NG2 che del mutante CLLF, che era principalmente geneticamente consistente, e li abbiamo coltivati in un ambiente controllato. Abbiamo mantenuto il suolo separato dalle piante per garantire che le differenze nella colonizzazione microbica non fossero dovute a contatti col suolo. Dopo tre settimane, abbiamo scoperto che le foglie del CLLF avevano circa 100 volte più batteri rispetto al tipo standard. Abbiamo confermato questo risultato attraverso un metodo di test sensibile.
Inoltre, le foglie del mutante CLLF attirarono una varietà più ampia di tipi batterici rispetto alla pianta standard, suggerendo una comunità microbica più ricca. Ulteriori analisi hanno mostrato differenze chiare tra le comunità microbiche delle due piante.
Valutazione dell'Equilibrio Microbico nel CLLF
Per capire se la carica batterica più alta nella pianta CLLF fosse sana o problematica, abbiamo esaminato attentamente i tipi di batteri che raccoglieva. In generale, la pianta CLLF includeva famiglie batteriche simili a quelle della pianta standard ma aveva significativamente più di alcuni tipi. Questo aumento non era dovuto a una crescita eccessiva di batteri dannosi, che spesso porta a condizioni microbiche malsane, note come disbiosi.
Abbiamo anche controllato se le piante CLLF mostrassero sintomi di malattia in condizioni di laboratorio e abbiamo scoperto che rimanevano sane. Abbiamo ulteriormente testato la loro sopravvivenza in un giardino all'aperto, dove si comportavano in modo simile alle piante standard. Queste evidenze suggeriscono che il mutante CLLF crea con successo una comunità microbica equilibrata nonostante la sua carica batterica più alta.
Sistema Immunitario Potenziato del CLLF
Abbiamo esaminato se il sistema immunitario del mutante CLLF funzionasse bene. Abbiamo misurato i livelli di ormoni di difesa nella pianta CLLF e abbiamo trovato che erano più alti rispetto al tipo standard, indicando una risposta immunitaria più attiva. Quando coltivate in condizioni sterili, le piante CLLF mostrano comunque livelli aumentati di questi ormoni, confermando che non era solo dovuto alla presenza di microbi.
Risposta di Difesa del CLLF durante lo Stress Termico
Quando sottoposte a temperature elevate, è comune che le piante mostrino espressioni ridotte di geni legati alla difesa, rendendole più suscettibili a infezioni. Nel nostro studio, durante un picco di temperatura, le piante CLLF rimasero tolleranti e mostrarono una risposta immunitaria stabile. Il loro profilo di espressione genica non cambiò significativamente a causa del calore, a differenza di quanto ci si aspetterebbe normalmente. Questa stabilità potrebbe contribuire alla loro resilienza contro i patogeni anche a temperature elevate.
Ruolo della Composizione del Microbioma nella Salute delle Piante
Per capire meglio la relazione tra il sistema immunitario della pianta CLLF e il suo microbioma, abbiamo eseguito un esperimento semi-gnobiotico. Questo ha coinvolto l'inoculazione delle piante con diversi set di batteri, sia il microbioma completo del CLLF che versioni semplificate senza alcuni gruppi. È stata osservata una crescita sana delle piante quando tutti i microbi associati erano presenti. Tuttavia, quando è stato usato il microbioma ridotto, le piante standard hanno mostrato risposte immunitarie aumentate a causa della perdita di diversità microbica.
Interessante, le piante CLLF con il microbioma ridotto hanno mantenuto una crescita sana anche sotto stress, suggerendo che il loro robusto sistema immunitario ha compensato la mancanza di diversità. D'altra parte, le piante standard mostravano segni di stress, indicando che dipendevano di più dal loro microbioma per stabilità durante lo stress.
Conclusione
Le nostre scoperte sottolineano che una comunità microbica diversificata può migliorare significativamente la resilienza di una pianta agli stress ambientali. Il mutante CLLF è un esempio di come una risposta immunitaria attiva possa coesistere con una carica batterica alta, creando un equilibrio che evita la disbiosi. Questa ricerca apre la strada a ulteriori studi su come migliorare intenzionalmente i microbiomi delle piante per mitigare gli effetti dei cambiamenti climatici sull'agricoltura. Capire i ruoli degli ormoni vegetali nel reclutamento di microbi benefici mentre si mantiene un sistema immunitario robusto è essenziale per sviluppare colture che resistano a condizioni estreme.
In sintesi, mentre i cambiamenti climatici pongono rischi severi per l'agricoltura, le intricate relazioni tra le piante e le loro comunità microbiche offrono opportunità per migliorare la resilienza delle colture. Le strategie future potrebbero coinvolgere la coltivazione di piante che possono bilanciare efficacemente le loro risposte immunitarie e cariche microbiche per garantire salute e produttività in condizioni ambientali mutevoli.
Titolo: Immunity and bacterial recruitment in plant leaves are parallel processes whose link shapes sensitivity to temperature stress
Estratto: Rising global temperatures necessitate developing climate-resilient crops with better adaptability to changing climates. Under elevated temperatures, plant immunity is downregulated, putting them at risk of foliar pathogen attack. Manipulating plant defense hormones is one way to mitigate this detrimental effect. However, it is unclear how plant immunity interacts with plant microbiome assembly and how temperature will thus affect overall plant health and stability. We used chemical mutagenesis to identify a phenotypically healthy genotype of A. thaliana, "CLLF", that compared to the wild type naturally recruits an altered leaf bacteriome, including unusually high bacteria loads. Simultaneously, CLLF hyperaccumulates salicylic acid (SA) and jasmonates, has constitutively upregulated systemic and innate defenses, and has increased resistance to necrotrophic fungal and hemi-biotrophic bacterial pathogens, indicating that pathogen immunity and non-pathogen recruitment function in parallel. Growth of specific non-pathogenic leaf bacteria on SA as a carbon source suggests the same hormones may even link the two processes. CLLF also showed high tolerance to heat stress in comparison to the wild type, but SA-associated defense processes are not downregulated under heat. Synthetic community (SynCom) experiments showed that when the taxonomic diversity of bacteria available to CLLF is artificially reduced, resilience to heat stress is compromised, leading to dysbiosis, but this does not occur with the full SynCom or in the wild type with any SynCom. Thus, the downregulation of defenses in response to heat may contribute to avoidance of dysbiosis caused by some leaf bacteria, but full bacteriome taxonomic diversity can restore balance. Significance StatementPlants are living ecosystems colonized by diverse microorganisms who strongly shape host health. Understanding how balance arises in host-associated microbiomes is a key step to understanding how to preserve, manage and possibly optimize these complex ecosystems, especially in a changing climate. Using a random mutagenesis approach in a natural A. thaliana ecotype, we find that constitutively upregulated defenses are associated with both tolerance to (a)biotic threats and healthy recruitment of leaf bacteria, very likely in a direct manner. Thus, immunity and bacterial recruitment in leaves operate in parallel. Synthetic community experiments show further that this link plays important roles in shaping plant resilience to heat stress, an important consideration in developing plants more stable to climate change.
Autori: Matthew T. Agler, J. Jose, E. Teutloff, S. Naseem, E. T. Barth, R. Halitschke, M. Marz
Ultimo aggiornamento: 2024-06-10 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.10.598336
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.10.598336.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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