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Nuovo metodo per ricostruire l'anatomia mancante nell'imaging 3D

Un nuovo approccio per colmare le lacune nell'imaging medico per una maggiore accuratezza anatomica.

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Indice

Nel campo della medicina, è fondamentale avere Immagini 3D accurate del corpo umano, specialmente quando si tratta di interventi chirurgici o infortuni. A volte, i dottori devono ricostruire parti del corpo che non sono completamente visibili per vari motivi, come traumi o operazioni. Questo processo è essenziale per applicazioni come la creazione di organi artificiali, lo studio di resti antichi e il miglioramento delle animazioni in contesti medici.

Questo articolo parla di un nuovo modo di riempire le parti mancanti delle immagini 3D del corpo. Questo metodo può funzionare con diversi tipi di anatomia, inclusi organi, muscoli e vasi sanguigni, che a volte mancano nei dati di imaging. Utilizzando tecnologie avanzate, possiamo creare ricostruzioni migliori che possano aiutare in varie applicazioni mediche.

Il Problema dell'Anatomia Mancante nell'Imaging 3D

Quando i medici usano tecniche di imaging come le TAC, possono vedere diverse parti del corpo in dettaglio. Tuttavia, a volte queste scansioni non catturano tutta l'anatomia. Questo può accadere a causa di interventi chirurgici o altri problemi medici. Per affrontare queste lacune, è necessario ricostruire le parti mancanti.

La maggior parte dei metodi esistenti si concentra su parti specifiche del corpo o forme semplici, il che limita il loro uso in scenari più complessi. Abbiamo bisogno di un sistema che possa gestire diversi tipi di anatomia mancante in un colpo solo. Questo può migliorare applicazioni come il trapianto di organi, dove i medici hanno bisogno di immagini complete e accurate per creare e posizionare organi artificiali.

Il Nostro Approccio

Per affrontare la sfida della Ricostruzione dell'anatomia mancante, abbiamo sviluppato un sistema che utilizza un denoising autoencoder 3D (DAE). Questo tipo di sistema funziona imparando a separare immagini complete e incomplete del corpo e poi ricostruendo le parti che mancano.

Abbiamo due metodi principali per questa ricostruzione:

  1. Mappatura Molti-a-Uno: Il DAE riceve immagini incomplete e impara a mappare su immagini complete. Questo significa che può gestire vari livelli di anatomia mancante all'interno di un'unica struttura.

  2. Mappatura Uno-a-Uno con Apprendimento Residuale: In questo approccio, ci concentriamo sull'imparare le differenze tra le immagini incomplete e quelle complete. Questo metodo è generalmente più semplice e porta a risultati migliori.

Per migliorare il processo di apprendimento, abbiamo introdotto un metodo di aggregazione che aiuta il DAE a imparare in modo più efficace, sia che stia lavorando su mappature molti-a-uno o uno-a-uno.

Test del Nostro Metodo

Abbiamo validato il nostro metodo utilizzando un dataset costituito da immagini TAC del corpo umano. Questo dataset includeva una varietà di anatomie e ha fornito una buona sfida per il nostro sistema di ricostruzione. Abbiamo creato diverse istanze di immagini incomplete rimuovendo alcune anatomie, permettendoci di testare quanto bene il nostro DAE potesse ricostruire queste parti mancanti.

I nostri test includevano tre diversi livelli di anatomia mancante: 10%, 20% e 40% del volume totale. Abbiamo anche creato un altro test dove è stata rimossa solo un'anatomia specifica. Utilizzando questi metodi, siamo stati in grado di misurare quanto efficacemente il nostro sistema potesse ricostruire le parti mancanti.

Risultati

I risultati dei nostri test hanno mostrato che il nostro metodo poteva effettivamente ricostruire anatomie mancanti a vari livelli di incompletezza. Il DAE ha prodotto rappresentazioni abbastanza accurate delle parti mancanti, rendendolo una soluzione promettente per applicazioni pratiche.

Abbiamo confrontato il nostro metodo con approcci esistenti per vedere come si comportava. I nostri esperimenti hanno indicato che incorporare l'apprendimento residuo e l'aggregazione delle perdite ha significativamente migliorato la qualità della ricostruzione. In generale, le versioni più avanzate del nostro modello hanno superato i modelli base più semplici.

Analisi Visiva dell'Anatomia Ricostruita

Abbiamo condotto valutazioni qualitative per visualizzare quanto bene il nostro sistema ha ricostruito le parti mancanti. In varie immagini 2D, abbiamo mostrato le istanze originali incomplete accanto ai risultati ricostruiti. Notevolmente, i modelli che utilizzavano l'apprendimento residuo tendevano a produrre risultati migliori, mostrando meno errori nelle ricostruzioni.

Per le parti del corpo più complesse, come i polmoni e i fegati, il nostro approccio ha funzionato abbastanza bene. Tuttavia, strutture più piccole, come i reni e le milze, hanno presentato sfide in termini di sensibilità e precisione.

Completamento dell'Anatomia Multi-Class

Oltre a ricostruire singole anatomie mancanti, il nostro metodo può anche gestire più parti mancanti. Ci siamo concentrati su un insieme di 12 anatomie specifiche, inclusi cuore, polmoni e gabbia toracica, e abbiamo testato la capacità del nostro sistema di ricostruirle simultaneamente.

Durante questi test, abbiamo osservato che, mentre le strutture più grandi erano generalmente ricostruite in modo accurato, i dettagli più fini come le costole richiedevano spesso maggiore affinamento. I risultati indicavano che il nostro metodo poteva gestire il completamento multi-class, ma alcune limitazioni persistevano.

Discussione

Le nostre scoperte dimostrano che è possibile ricostruire più anatomie mancanti all'interno di un'unica struttura. Questo è importante per migliorare le applicazioni pratiche in medicina e può aiutare a facilitare migliori processi di imaging.

Inoltre, l'uso dell'apprendimento residuo e dell'aggregazione delle perdite offre un approccio più robusto per affrontare le sfide associate ai dati incompleti. Inoltre, sebbene i risultati siano promettenti, ci sono ancora aree che necessitano di miglioramento, in particolare nel gestire anatomie più piccole e nel perfezionare i risultati per una maggiore precisione.

Futuri Lavori

Sebbene il nostro metodo attuale mostri significative potenzialità, ci sono aree che richiedono ulteriori ricerche. Ad esempio, il dataset esistente non copre ogni tipo di anatomia. Gli sforzi futuri mireranno a includere una gamma più ampia di anatomie, come il cranio e altri tessuti molli, per aumentare la versatilità del modello.

Inoltre, puntiamo a affrontare la ricostruzione di parti molto piccole e ottimizzare il modello per ridurre artefatti nel risultato finale. Implementando tecniche come la super-risoluzione, possiamo migliorare la qualità delle ricostruzioni iniziali per applicazioni mediche.

Infine, vediamo potenziale nell'integrare il nostro modello in sistemi più ampi per la segmentazione del corpo intero, dove potrebbe migliorare l'accuratezza e l'efficienza dei processi di imaging medico. In generale, il nostro lavoro pone le basi per sviluppi futuri entusiasmanti nel campo dell'imaging medico e della ricostruzione anatomica.

Conclusione

In sintesi, il nostro nuovo metodo per ricostruire parti mancanti del corpo ha mostrato risultati efficaci in vari test. Utilizzando tecnologie avanzate, possiamo affrontare meglio le sfide nel campo dell'imaging medico. La combinazione di più tecniche, inclusi l'apprendimento residuo e l'aggregazione delle perdite, fornisce una solida base per futuri progressi. Il nostro lavoro continuo si concentrerà sul perfezionamento di questo metodo e sull'espansione delle sue capacità per coprire una gamma più ampia di strutture anatomiche. Questa ricerca ha il potenziale di impattare notevolmente le pratiche mediche e migliorare i risultati per i pazienti in futuro.

Fonte originale

Titolo: Anatomy Completor: A Multi-class Completion Framework for 3D Anatomy Reconstruction

Estratto: In this paper, we introduce a completion framework to reconstruct the geometric shapes of various anatomies, including organs, vessels and muscles. Our work targets a scenario where one or multiple anatomies are missing in the imaging data due to surgical, pathological or traumatic factors, or simply because these anatomies are not covered by image acquisition. Automatic reconstruction of the missing anatomies benefits many applications, such as organ 3D bio-printing, whole-body segmentation, animation realism, paleoradiology and forensic imaging. We propose two paradigms based on a 3D denoising auto-encoder (DAE) to solve the anatomy reconstruction problem: (i) the DAE learns a many-to-one mapping between incomplete and complete instances; (ii) the DAE learns directly a one-to-one residual mapping between the incomplete instances and the target anatomies. We apply a loss aggregation scheme that enables the DAE to learn the many-to-one mapping more effectively and further enhances the learning of the residual mapping. On top of this, we extend the DAE to a multiclass completor by assigning a unique label to each anatomy involved. We evaluate our method using a CT dataset with whole-body segmentations. Results show that our method produces reasonable anatomy reconstructions given instances with different levels of incompleteness (i.e., one or multiple random anatomies are missing). Codes and pretrained models are publicly available at https://github.com/Jianningli/medshapenet-feedback/ tree/main/anatomy-completor

Autori: Jianning Li, Antonio Pepe, Gijs Luijten, Christina Schwarz-Gsaxner, Jens Kleesiek, Jan Egger

Ultimo aggiornamento: 2023-09-10 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://arxiv.org/abs/2309.04956

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2309.04956

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia arxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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