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# Biologie# Biologie des systèmes

Synchronisation dans le développement embryonnaire

Une étude montre comment les cellules se synchronisent pendant le développement, ce qui influence la formation des tissus.

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La Synchronisation est un concept clé qui apparaît dans plein de domaines scientifiques, y compris la biologie. Un des exemples les plus fascinants de synchronisation se produit pendant le développement des embryons de vertébrés. Dans ce processus, des groupes de cellules dans le mésoderme, qui est l'une des couches formées pendant le développement embryonnaire, commencent à coordonner leurs activités. Ces cellules agissent de manière rythmique, ce qui influence leur croissance et leur organisation en structures comme la colonne vertébrale.

L’Horloge de segmentation

Un aspect spécifique de cette synchronisation est l'horloge de segmentation, qui est un système qui aide à former des Somites. Les somites sont les éléments de base pour des structures comme les vertèbres, les muscles et la peau. L'horloge de segmentation fonctionne grâce à un mécanisme moléculaire où les cellules activent et désactivent certains gènes de manière rythmique. Au fil des ans, des recherches ont montré que plusieurs voies de signalisation et protéines sont cruciales pour ce processus.

Une des voies clés impliquées s'appelle la Voie de signalisation Notch. On a découvert que cette voie fonctionne dans plusieurs espèces différentes, y compris les poules, les souris, les poissons-zèbres et les serpents. L'activité de la voie Notch aide les cellules à communiquer entre elles, leur permettant de rester synchronisées. Cela se fait par un mécanisme de rétroaction impliquant des protéines connues sous le nom de famille Hes. Ces protéines régulent quand les gènes sont activés ou désactivés, maintenant le comportement rythmique des cellules.

Questions sur la Synchronisation

Bien que les scientifiques aient fait des progrès significatifs pour comprendre les détails de comment ces Oscillateurs moléculaires fonctionnent, il reste encore des questions de base sans réponse. Par exemple, comment les cellules savent-elles ce que font leurs voisines ? Est-ce qu'elles accélèrent ou ralentissent en fonction de l'activité des cellules voisines ? De plus, la communication entre les cellules est-elle égale, ou est-ce qu'elle varie selon la situation ?

Pour explorer ces questions, des chercheurs ont cherché à découvrir les règles de synchronisation entre deux oscillateurs qui ont des comportements similaires mais légèrement différents. Ils ont utilisé un modèle théorique appelé le modèle de Kuramoto, qui est populaire pour étudier la synchronisation. Selon ce modèle, deux oscillateurs ajustent leurs phases à travers un type de connexion qui peut soit les aider à s’aligner, soit créer une différence entre eux.

Approche Expérimentale

Pour tester leurs idées, les chercheurs ont conçu une expérience en utilisant une méthode appelée le Randomization Assay For Low input (RAFL). Dans cette configuration, ils ont pris des cellules de deux embryons différents et les ont mélangées tout en gardant une trace de leurs phases d'origine. Cela a permis de voir comment les cellules mélangées se comportaient au fil du temps et comment leurs rythmes changeaient.

Les chercheurs ont surveillé les oscillations en temps réel et comparé les comportements du groupe de cellules mélangées à ceux des groupes non mélangés. Cela leur a permis d'explorer les effets de la synchronisation de manière contrôlée.

Résultats sur la Dynamique de la Synchronisation

À travers leurs expériences, les chercheurs ont trouvé des motifs intéressants. Dans de nombreux cas, quand ils mélangeaient des cellules de différents embryons, un groupe de cellules dominait et entraînait l'autre groupe à se synchroniser avec son rythme. Ce résultat était surprenant car il suggérait qu'il y a un déséquilibre dans la façon dont la synchronisation se produit. Le groupe de cellules "gagnant" maintenait son rythme, tandis que le groupe "perdant" adaptez son activité pour correspondre au gagnant.

Cette synchronisation dite "le gagnant prend tout" n'était pas attendue selon le modèle de Kuramoto, qui prédisait un résultat différent où les deux oscillateurs moyennant leurs phases. Dans les cas où les oscillateurs étaient presque en phases opposées, le groupe perdant décalait dramatiquement sa phase pour s'aligner avec le groupe gagnant.

Modélisation Théorique des Règles de Couplage

Pour mieux comprendre cette forme inhabituelle de synchronisation, les chercheurs se sont tournés vers la modélisation mathématique. Ils ont créé un modèle simplifié qui capturait le comportement des oscillateurs dans le groupe mélangé. Ce nouveau modèle, appelé le modèle de Kuramoto rectifié (ReKu), a été conçu pour tenir compte de l'asymétrie observée dans les expériences.

Dans ce modèle, la réponse des oscillateurs l'un à l'autre n'était pas uniforme. Au lieu de cela, il favorisait un oscillateur par rapport à l'autre, en fonction de leurs phases iniciales. Le modèle permettait la possibilité qu'un oscillateur puisse rester inchangé tandis que l'autre s'adaptait à son rythme. Cette double asymétrie dans les règles de couplage aidait à expliquer la dominance observée dans les données expérimentales.

Enquête sur d'Autres Modèles

Bien que le modèle ReKu corresponde bien aux observations expérimentales, les chercheurs ont également examiné d'autres modèles de couplage pour voir s'ils pouvaient expliquer les résultats. Une alternative était le modèle Kuramoto-Sakaguchi (KS), qui introduit un décalage de phase dans le couplage. Cependant, ce modèle ne tenait pas compte du comportement observé dans les expériences, surtout pour les décalages de phase proches des phases opposées.

Une autre alternative était le modèle de couplage impulsionnel, où un oscillateur envoie de forts signaux uniquement à certaines phases. Bien que cela puisse conduire à la synchronisation, cela nécessitait un couplage très fort pour obtenir des résultats similaires à ceux des expériences. Ainsi, les chercheurs ont conclu que la double asymétrie dans le modèle ReKu était essentielle pour expliquer les dynamiques de synchronisation observées.

Lien des Résultats au Contexte Biologique

Ces résultats ont des implications plus larges pour comprendre comment la synchronisation fonctionne dans les systèmes vivants. Dans les embryons vivants, au fur et à mesure que les cellules se développent, leurs comportements rythmiques peuvent changer au fil du temps. Cela conduit à des motifs qui peuvent influencer comment des structures comme la colonne vertébrale et les muscles se forment.

Fait intéressant, bien que les expériences aient montré que les cellules pouvaient ajuster leurs rythmes pour se synchroniser, cela ne signifie pas nécessairement que la même chose se produit in vivo (dans un organisme vivant). Les processus dans de vrais embryons pourraient impliquer des interactions plus complexes, où l'organisation spatiale des cellules affecte la manière dont elles se synchronisent.

Dans l'ensemble, la recherche souligne l'importance d'étudier ces mécanismes de synchronisation dans les embryons. Elle fournit des aperçus sur la communication cellulaire et comment les comportements individuels peuvent conduire à des actions coordonnées dans des groupes de cellules, ce qui est essentiel pour un développement approprié. Comprendre ces mécanismes pourrait également ouvrir de nouvelles voies pour explorer comment des processus similaires se produisent dans d'autres systèmes biologiques en dehors du développement embryonnaire.

Source originale

Titre: Nonreciprocal synchronization in embryonic oscillator ensembles

Résumé: Synchronization of coupled oscillators is a universal phenomenon encountered across different scales and contexts e.g., chemical wave patterns, superconductors and the unison applause we witness in concert halls. The existence of common underlying coupling rules define universality classes, revealing a fundamental sameness between seemingly distinct systems. Identifying rules of synchronization in any particular setting is hence of paramount relevance. Here, we address the coupling rules within an embryonic oscillator ensemble linked to vertebrate embryo body axis segmentation. In vertebrates, the periodic segmentation of the body axis involves synchronized signaling oscillations in cells within the presomitic mesoderm (PSM), from which somites, the pre-vertebrae, form. At the molecular level, it is known that intact Notch-signaling and cell-to-cell contact is required for synchronization between PSM cells. However, an understanding of the coupling rules is still lacking. To identify these, we develop a novel experimental assay that enables direct quantification of synchronization dynamics within mixtures of oscillating cell ensembles, for which the initial input frequency and phase distribution are known. Our results reveal a "winner-takes-it-all" synchronization outcome i.e., the emerging collective rhythm matches one of the input rhythms. Using a combination of theory and experimental validation, we develop a new coupling model, the "Rectified Kuramoto" (ReKu) model, characterized by a phase-dependent, non-reciprocal interaction in the coupling of oscillatory cells. Such non-reciprocal synchronization rules reveal fundamental similarities between embryonic oscillators and a class of collective behaviours seen in neurons and fireflies, where higher level computations are performed and linked to non-reciprocal synchronization.

Auteurs: Alexander Aulehla, C. Ho, L. Jutras-Dube, M. Zhao, G. Mönke, I. Z. Kiss, P. Francois

Dernière mise à jour: 2024-01-31 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577856

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.29.577856.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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