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Améliorer l'imagerie des vaisseaux sanguins dans le cerveau

Une nouvelle méthode améliore les images des vaisseaux sanguins à partir des données MRA pour de meilleurs diagnostics.

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Les vaisseaux sanguins dans le cerveau sont super importants pour garder un bon flux sanguin. Quand il y a des soucis avec ces vaisseaux, comme des blocages ou des points faibles, ça peut causer des gros problèmes de santé comme des AVC. Pour bien diagnostiquer et traiter ces problèmes, les médecins ont besoin d'images claires des vaisseaux sanguins. Une des techniques d'imagerie avancées qu'on utilise pour ça, c'est l'Angiographie par résonance magnétique, souvent appelée ARNM.

Mais transformer les données brutes de l'ARNM en images claires des vaisseaux sanguins, c'est pas facile. Les images peuvent être bruyantes ou floues, ce qui complique la visibilité des détails. Pour aider avec ça, des chercheurs bosse sur des méthodes pour identifier et mettre en avant les vaisseaux sanguins automatiquement. Ça s'appelle la Segmentation.

Le défi de la segmentation

La segmentation, c'est le processus qui consiste à séparer les vaisseaux sanguins du reste de l'image. C'est une tâche complexe parce que la qualité des images peut varier énormément. Quand les images sont pas très claires, c'est encore plus dur de repérer les vaisseaux. L'apprentissage profond, un type d'intelligence artificielle, peut aider dans cette tâche car il peut apprendre à partir de grandes quantités de données et identifier des motifs qui pourraient être difficiles à voir manuellement.

Cependant, l'apprentissage profond a besoin de beaucoup de données étiquetées pour s'entraîner. Étiqueter des images, c'est une tâche lente et compliquée qui nécessite de l'expertise, car ça peut prendre jusqu'à une heure ou plus pour juste une image. À cause de ça, il y a une pression pour trouver des moyens de créer automatiquement ces images étiquetées, qui pourront ensuite être utilisées pour entraîner des modèles d'apprentissage profond afin d'améliorer la segmentation.

Méthodes actuelles et leurs limites

Bien que certains chercheurs aient utilisé l'apprentissage profond pour la segmentation des vaisseaux sanguins, beaucoup de ces approches n'ont pas été rendues publiques. Ça rend difficile pour les autres dans le domaine de les utiliser ou même d'apprendre de ces méthodes. De plus, les ensembles de données existants pour entraîner des modèles d'apprentissage automatique sont souvent limités ou pas bien alignés avec les besoins des tâches de segmentation.

Certaines méthodes plus anciennes reposent sur des techniques traditionnelles pour améliorer les images avant de les segmenter. Ces techniques mettent souvent en avant les parties des images qui ressemblent à des vaisseaux sanguins en filtrant selon leur forme et leur luminosité. Cependant, beaucoup de ces méthodes ne sont pas facilement accessibles pour les autres, ce qui signifie que les chercheurs commencent souvent de zéro.

Une nouvelle approche

Pour régler ces problèmes, une nouvelle méthode a été développée qui combine plusieurs techniques pour produire des images plus claires des vaisseaux sanguins à partir des données d'ARNM. Cette méthode se concentre d'abord sur l'amélioration des images, puis applique des étapes spécifiques pour assurer la meilleure segmentation possible des vaisseaux.

Prétraitement des images

Avant de commencer la segmentation, les images passent par une étape de prétraitement. Ça implique de retirer les parties de l'image qui ne sont pas des vaisseaux sanguins, comme le crâne et d'autres structures. Après avoir enlevé les zones indésirables, une technique appelée correction du champ de biais est appliquée, ce qui aide à améliorer la qualité globale des images.

Améliorer les vaisseaux

Une des parties clés de la nouvelle méthode est l'utilisation d'un filtre spécial qui améliore l'apparence des vaisseaux sanguins. Ce filtre se concentre sur la forme et la luminosité des vaisseaux et est appliqué de manière à pouvoir identifier à la fois les petits et les grands vaisseaux. En ajustant le filtre selon les détails spécifiques des images, la méthode peut offrir des contrastes clairs entre les vaisseaux et les tissus environnants.

Techniques de seuillage

Après avoir amélioré les vaisseaux, des techniques de seuillage sont appliquées pour séparer les vaisseaux du reste de l'image. Ça implique de définir certains niveaux de luminosité : un seuil élevé pour repérer les parties les plus lumineuses des vaisseaux et un seuil plus bas pour inclure ceux qui sont un peu plus sombres mais toujours importants. Cette approche à deux niveaux garantit que les petits et les grands vaisseaux sont capturés efficacement.

Nettoyer le résultat

Une fois les vaisseaux segmentés, il peut encore y avoir du bruit ou de petits artefacts laissés dans les images. Pour y remédier, une technique de sélection de composantes connectées est utilisée, qui se concentre sur la conservation uniquement des structures plus grandes qui sont probablement des vaisseaux sanguins tout en supprimant les petits clusters non pertinents. Ça garantit que l'image finale est aussi propre et précise que possible.

Tests et résultats

Pour déterminer combien cette méthode fonctionne bien, une série de tests a été réalisée. Des experts médicaux ont été montrés les images segmentées et ont dû évaluer leur qualité. Les résultats ont montré que la méthode complète offrait les meilleurs scores de qualité, ce qui signifie qu'elle était la plus efficace pour identifier correctement les vaisseaux sanguins.

Les experts ont noté que l'omission de l'une des étapes de la méthode entraînait une baisse de qualité. Par exemple, sans l'étape de sélection de composantes connectées, il y avait une augmentation significative du bruit, ce qui réduisait la visibilité des véritables vaisseaux sanguins.

Directions futures

Il y a des projets pour tester la méthode avec plus d'images provenant de différentes sources. Ça aidera à peaufiner les paramètres et à améliorer encore plus les résultats de segmentation. Bien que la méthode ait atteint un score de qualité élevé, il y a encore de la place pour l'amélioration, surtout avec l'utilisation de la technologie d'apprentissage profond.

En fournissant un moyen fiable de créer des images étiquetées, cette nouvelle méthode pourrait devenir un outil précieux pour entraîner des modèles plus avancés capables d'identifier les vaisseaux sanguins encore plus précisément. À mesure que la technologie continue d'évoluer, l'espoir est que ces méthodes puissent mener à de meilleurs diagnostics et traitements pour les maladies cérébrovasculaires.

Conclusion

La capacité de segmenter automatiquement les vaisseaux sanguins à partir des images d'ARNM est un pas important vers l'amélioration des diagnostics de santé cérébrale. En combinant des méthodes de traitement d'images traditionnelles avec des techniques modernes, cette approche propose un moyen de créer des images claires et exploitables des vaisseaux sanguins. Avec un développement et des tests supplémentaires, elle promet d'aider les professionnels de la santé à mieux comprendre et traiter les conditions liées au flux sanguin dans le cerveau. Ça pourrait finalement améliorer les résultats pour les patients et offrir des interventions plus efficaces pour des conditions de santé graves.

Source originale

Titre: Segmentation method for cerebral blood vessels from MRA using hysteresis

Résumé: Segmentation of cerebral blood vessels from Magnetic Resonance Imaging (MRI) is an open problem that could be solved with deep learning (DL). However, annotated data for training is often scarce. Due to the absence of open-source tools, we aim to develop a classical segmentation method that generates vessel ground truth from Magnetic Resonance Angiography for DL training of segmentation across a variety of modalities. The method combines size-specific Hessian filters, hysteresis thresholding and connected component correction. The optimal choice of processing steps was evaluated with a blinded scoring by a clinician using 24 3D images. The results show that all method steps are necessary to produce the highest (14.2/15) vessel segmentation quality score. Omitting the connected component correction caused the largest quality loss. The method, which is available on GitHub, can be used to train DL models for vessel segmentation.

Auteurs: Georgia Kenyon, Stephan Lau, Michael A. Chappell, Mark Jenkinson

Dernière mise à jour: 2023-03-09 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2303.05113

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2303.05113

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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