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# Biologie# Biologie des systèmes

Étudier le rôle de la sérotonine chez les planaires

Une étude révèle comment la sérotonine affecte le fonctionnement du cerveau et d'autres cellules chez les planaires.

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Les systèmes vivants sont complexes. Changer juste un gène peut avoir plein d'effets sur un organisme. Au début, les effets peuvent se voir dans les cellules ou tissus spécifiques où le gène est actif. Ça peut changer le fonctionnement de ces cellules. Avec le temps, ces changements peuvent se propager à d'autres parties du corps, entraînant des effets variés. C'est super important pour les cellules du cerveau, car elles contrôlent plein de fonctions dans le corps.

Par exemple, des problèmes dans les cellules cérébrales qui produisent de la Sérotonine peuvent provoquer divers soucis chez différents animaux. Le système de la sérotonine est crucial pour de nombreuses fonctions, comme l'humeur, l'appétit, le sommeil et le mouvement. La plupart des études sur la sérotonine se concentrent sur les vertébrés, mais récemment, des chercheurs se sont aussi intéressés aux invertébrés.

Les planaires sont de super modèles pour étudier les cellules cérébrales et leurs fonctions parce qu'ils ont des cellules souches spéciales qui peuvent se transformer en plusieurs types de cellules, y compris des Neurones. Ils peuvent aussi régénérer rapidement leur tête entière, y compris le cerveau. En utilisant des techniques spécifiques, les chercheurs peuvent modifier ces processus chez les planaires adultes pour voir comment ça affecte le comportement de l'organisme.

Les planaires ont un système nerveux qui comprend un cerveau, des cordons nerveux et divers types de neurones. Les chercheurs ont identifié plusieurs sortes de neurones chez les planaires, y compris ceux qui produisent de la dopamine, de la sérotonine, et d'autres produits chimiques importants. De nouvelles techniques aident les chercheurs à mieux comprendre les différents types de neurones chez les planaires.

Le processus de formation et de développement des neurones chez les planaires repose sur des protéines spécifiques appelées facteurs de transcription. Chez les planaires, deux facteurs de transcription clés, pitx et lhx1/5-1, se trouvent dans un petit groupe de neurones producteurs de sérotonine, mais les bloquer peut causer de gros soucis dans tout l’organisme. Les problèmes peuvent inclure des difficultés à bouger et des changements dans la forme du corps et le comportement. Les raisons exactes de ces problèmes ne sont pas totalement comprises et sont difficiles à étudier avec des méthodes traditionnelles. Des méthodes plus récentes à l'échelle du transcriptome peuvent aider, mais elles rencontrent des difficultés pour distinguer les effets directs et indirects à travers différents types de cellules.

L'analyse des cellules uniques est devenue un outil important pour étudier les systèmes vivants complexes. Elle permet aux chercheurs de différencier les différents types de cellules et leurs réponses aux changements. Avec de nouvelles méthodes, les scientifiques peuvent analyser plusieurs échantillons lors d'une seule expérience, réduisant ainsi les erreurs et les coûts.

Dans cette étude, les chercheurs ont utilisé des méthodes avancées pour examiner comment le blocage de la fonction de la sérotonine affecte les planaires. Ils ont découvert que la réduction des gènes pitx et lhx1/5-1 causait des changements dans les neurones producteurs de sérotonine et affectait aussi d'autres types de cellules, qui ne devraient pas être directement influencées. Comprendre ces effets aide à reconstituer le rôle plus large de la sérotonine chez les planaires et éclaire les nouveaux types de cellules identifiés impliqués dans la fonction de la sérotonine.

L'Importance des Neurones

Les neurones sont essentiels pour communiquer des signaux dans tout le corps. Ils ne fonctionnent pas seuls ; ils interagissent avec d'autres neurones et divers types de cellules, influençant les fonctions à l'échelle de l'organisme. Comprendre comment fonctionnent les neurones donne un aperçu des processus biologiques plus larges.

Les recherches ont montré que modifier les neurones producteurs de sérotonine peut avoir de grandes conséquences non seulement sur les neurones eux-mêmes, mais aussi sur d'autres types de tissus qu'ils influencent. Cela souligne l'interconnexion des systèmes biologiques.

Les planaires, étant des organismes relativement simples, servent de modèle pour comprendre les complexités des interactions neuronales et leurs effets systémiques. Ils offrent une opportunité unique d'étudier comment les neurones affectent le fonctionnement global du corps.

Le Modèle Planaires

Les planaires sont des vers plats connus pour leurs capacités de régénération remarquables. Ils peuvent faire repousser des parties de leur corps perdues, y compris leur cerveau. Cette capacité est en partie due à un riche approvisionnement en cellules souches, ou néoblastes, qui peuvent se transformer en n'importe quel type de cellule nécessaire.

Le système nerveux des planaires est bien organisé, avec un cerveau et deux cordons nerveux principaux, ainsi que divers types de neurones. Les chercheurs ont pu identifier différents types de neurones chez les planaires, comme ceux qui produisent de la sérotonine, en utilisant des techniques avancées. La capacité de régénérer et de modifier leur structure cellulaire fait des planaires des candidats idéaux pour étudier les effets de la réduction des gènes sur les neurones.

Les facteurs de transcription spécifiques, pitx et lhx1/5-1, ont montré qu'ils jouent des rôles clés dans la fonction des neurones producteurs de sérotonine. Quand ces gènes sont réduits, ça provoque des effets notables sur le mouvement et la forme du corps. Comprendre les effets en cascade de ces changements aide à éclairer le rôle de la sérotonine dans la biologie des planaires.

Méthodes d'Étude

Dans cette recherche, les scientifiques ont utilisé deux techniques à la pointe de la technologie : ACME et SPLiT-seq.

Technique ACME

ACME est une méthode qui combine la dissociation cellulaire et la fixation. Cela permet d'étudier les cellules sans provoquer le stress qui survient généralement avec les méthodes de dissociation traditionnelles. Le but d'ACME est de préserver les cellules dans leur état naturel, permettant des analyses plus précises de leurs fonctions.

Technique SPLiT-seq

SPLiT-seq est une approche de code-barres combinatoire utilisée dans le séquençage ARN des cellules uniques. Elle permet de combiner plusieurs échantillons et répliques dans une seule expérience, minimisant ainsi les effets de lots et les coûts. En utilisant cette technique, les chercheurs peuvent analyser comment différentes cellules réagissent aux changements, fournissant une vue détaillée des interactions et fonctions cellulaires.

En combinant ces méthodes, les chercheurs peuvent obtenir des informations sur les effets directs de la réduction des gènes sur les neurones ainsi que les impacts plus larges sur d'autres types de tissus.

Résultats et Découvertes

Après avoir mené des expériences utilisant ACME et SPLiT-seq, les chercheurs ont observé des changements substantiels chez les planaires avec les gènes pitx et lhx1/5-1 réduits.

Effets sur les Neurones Sérotoninergiques

La réduction de ces gènes a directement affecté les neurones producteurs de sérotonine. Cela a entraîné des changements dans le mouvement et la structure du corps qui concordent avec les résultats antérieurs concernant le rôle de la sérotonine chez les planaires.

Effets Indirects sur D'autres Types de Cellules

Fait intéressant, les effets de la réduction de ces gènes se sont étendus au-delà des neurones producteurs de sérotonine. Les chercheurs ont également trouvé des changements dans des types de cellules qui n'expriment pas les facteurs de transcription, comme celles de l'épiderme et des tissus musculaires. Ces découvertes indiquent que l'impact de la sérotonine n'est pas limité aux neurones, mais affecte aussi d'autres types de cellules cruciales pour la fonction globale de l'organisme.

Rôle des Cellules Parenchymateuses

Les cellules parenchymateuses, un type de cellule moins compris chez les planaires, ont montré des réponses significatives aux changements dans le signalement de la sérotonine. Ces cellules semblent aider au métabolisme des neurotransmetteurs, un peu comme les fonctions des cellules gliales dans d'autres systèmes.

Les chercheurs ont découvert qu'après l'inhibition de la sérotonine, ces cellules parenchymateuses ont montré des altérations dans leur expression génétique, suggérant qu'elles pourraient jouer des rôles de soutien similaires à ceux des cellules gliales pour maintenir l'équilibre des neurotransmetteurs.

Conclusion

Cette recherche contribue à une compréhension croissante de la façon dont la sérotonine influence divers processus biologiques chez les planaires. L'utilisation combinée d'ACME et de SPLiT-seq offre une approche puissante pour explorer les interactions complexes au sein des systèmes vivants.

En étudiant non seulement les neurones mais aussi les effets en aval sur d'autres types de cellules, les résultats éclairent les rôles interconnectés que différents types de cellules jouent dans les fonctions globales d'un organisme. Une exploration plus poussée de ces dynamiques approfondira notre compréhension des interactions cellulaires et des implications plus larges du signalement des neurotransmetteurs dans les systèmes vivants.

Les planaires se distinguent comme un organisme modèle grâce à leurs qualités uniques, et la recherche continue de révéler les complexités de leur biologie, fournissant des connaissances qui pourraient s'étendre à des organismes plus complexes, y compris les humains.

Source originale

Titre: Multiplex single-cell analysis of serotonergic neuron function in planarians reveals widespread effects in diverse cell types

Résumé: Neurons function by interacting with each other and with other cell types, often exerting organism-wide regulation. Serotonergic neurons play a systemic role in processes such as appetite, sleep and motor control. Functional studies in the planarian Schmidtea mediterranea have shown that impairment of serotonergic neurons results in systemic effects. Studying neurons and the tissues they interact with is challenging using either bulk or single-cell analysis techniques. While bulk methods merge the information from all cell types, single-cell methods show promise in overcoming this limitation. However, current single-cell approaches encounter other challenges including stress of cell dissociation, high cost, multiplexing capacity, batch effects, replication and statistical analysis. Here we used ACME and SPLiT-seq to generate a multiplex single-cell analysis of serotonergic neuron function in planarians by inhibiting pitx and lhx1/5-1, two transcription factors expressed in them. We recovered single-cell transcriptomic profiles of 47,292 cells from knockdown and control animals, including biological and technical replicates. Our results show that epidermal, muscular and the recently described parenchymal cell types are affected the most by serotonergic neuron impairment. By computationally dissecting each cell type, we elucidated gene expression changes in each, including changes in epidermis cilia genes and myofiber genes in muscle. Interestingly, parenchymal cells downregulate genes involved in neurotransmitter recycling, suggesting a glial-like function of these recently described enigmatic cell types. Our results will allow disentangling the complexity of serotonergic neuron inhibition by studying the downstream effectors and the affected tissues, and offer new data on the function of parenchymal cells in planarians. Ultimately, our results pave the way for dissecting complex phenotypes through multiplex single-cell transcriptomics.

Auteurs: Jordi Solana, E. Emili, D. Rodriguez-Fernandez, A. Perez-Posada, H. Garcia-Castro

Dernière mise à jour: 2024-03-02 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.581916

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.28.581916.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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