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# Biologie# Biologie des systèmes

Le monde fascinant des animaux coloniaux

Un aperçu de la biologie et de l'unicité des organismes coloniaux comme Hydractinia.

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Les animaux coloniaux sont des groupes uniques d'organismes qui se développent d'une manière très différente des animaux solitaires. Au lieu de vivre seuls, ils sont composés de nombreux petits individus génétiquement identiques appelés zooïdes. Ces zooïdes sont connectés par des tissus vivants et partagent des systèmes pour le sang et les signaux nerveux. Un truc intéressant sur les animaux coloniaux, c'est qu'ils peuvent régénérer. Cette capacité vient de types spéciaux de cellules connues sous le nom de cellules souches pluripotentes, qui peuvent se transformer en différents types de cellules.

Les animaux coloniaux incluent divers groupes, comme les méduses, les tuniciers et les bryozoaires. Chaque colonie travaille ensemble comme un seul organisme, ce qui signifie qu'ils partagent des ressources et des fonctions. Au sein d'une colonie, les zooïdes peuvent prendre différents rôles. Par exemple, certains peuvent se concentrer sur l'alimentation, tandis que d'autres s'occupent de la reproduction ou de la défense.

L'Importance de l'Allorécognition

Pour maintenir leur uniformité génétique, les animaux coloniaux ont souvent un système appelé allorécognition. Ce système leur permet de savoir quels individus font partie de leur colonie et lesquels ne le sont pas. L'allorécognition a probablement évolué pour éviter des problèmes comme le parasitisme, où un organisme pourrait exploiter les ressources d'un autre. Ce système a été identifié dans divers groupes, mais les gènes responsables varient souvent d'une espèce à l'autre.

Un Regard Plus Près sur Hydractinia

Hydractinia est un genre spécifique d'animaux coloniaux qui pousse sur les coquilles des bernard-l'ermite. Une seule larve peut se poser sur une coquille et ensuite grandir en colonie, produisant de nouveaux individus appelés Polypes à travers un processus qui donne un réseau de zooïdes génétiquement identiques mais spécialisés. Chaque colonie peut être composée de différents types de polypes, spécialisés pour des tâches comme capturer des proies ou se reproduire.

Bien que toutes les cellules d'une colonie d'Hydractinia proviennent des mêmes cellules souches pluripotentes appelées i-cells, les scientifiques ne comprennent pas encore si les différents types d'animaux dans une colonie proviennent des mêmes cellules ou s'il existe des cellules distinctes pour chaque tâche spécialisée.

Comprendre les Types de Cellules avec l'Analyse de Cellules Uniques

Des avancées récentes en technologie, notamment la transcriptomique à cellule unique, permettent aux chercheurs d'analyser des cellules individuelles et de les catégoriser selon leur expression génétique. En étudiant les types de cellules à travers divers organismes, les chercheurs peuvent découvrir la composition cellulaire de différentes parties d'un organisme. Cependant, les études passées se concentraient principalement sur des bibliothèques de cellules mixtes, sans apporter d'insights sur le fonctionnement de parties spécifiques d'une colonie.

L'objectif ici est de créer une carte détaillée des différents types de cellules dans Hydractinia, y compris des échantillons provenant de différentes parties fonctionnelles de la colonie. Les chercheurs ont collecté un grand nombre de profils cellulaires à partir de différents échantillons, leur permettant d'identifier divers types de cellules et les gènes et facteurs associés exprimés dans ces cellules. Leur analyse a montré que de nombreux types de cellules se retrouvent dans différentes parties de la colonie, bien qu'en quantités variables, certains types étant spécifiques à certaines parties.

Résultats dans Hydractinia

La recherche a révélé des différences significatives dans la composition cellulaire des colonies d'Hydractinia. Par exemple, différents types de polypes, comme les polypes nourriciers et les polypes sexuels, abritent différents types de cellules. Les polypes nourriciers tendent à avoir plus de cellules impliquées dans la digestion, tandis que les polypes sexuels ont plus de cellules reproductrices.

Grâce à une analyse statistique, les chercheurs ont confirmé ces observations, montrant que certaines cellules sont plus courantes dans des types de polypes spécifiques. Par exemple, les polypes nourriciers ont beaucoup de cellules glandulaires et de nématocytes (cellules impliquées dans la piqûre), tandis que les polypes sexuels sont riches en cellules germinales.

En plus de ces types de cellules bien connus, les chercheurs ont également découvert des cellules plus spécialisées, y compris les cellules de type Shematrin, qui se trouvent principalement dans les stolons. Ces cellules sont impliquées dans la production de chitine et de minéraux, ce qui contribue à l'intégrité structurelle de la colonie, un peu comme la formation de coquilles chez les mollusques.

Analyse des Réseaux Génétiques et des Fonctions

Pour comprendre comment différents types de cellules se développent et fonctionnent, les chercheurs ont analysé des groupes de gènes qui s'expriment ensemble. En examinant ces réseaux de gènes, ils ont identifié divers modules liés à des types de cellules spécifiques, révélant des fonctions clés associées à chacun.

Plusieurs modules de gènes ont été trouvés actifs dans différents types de cellules, y compris les cellules épithéliales, qui sont impliquées dans la formation de barrières et la protection des tissus. D'autres modules étaient liés aux cellules musculaires et aux cellules digestives, indiquant les rôles importants joués par ces types de cellules dans la survie de la colonie.

Identification des Facteurs de transcription Clés

Les facteurs de transcription (TFs) régulent l'expression des gènes. Ils jouent des rôles critiques dans la détermination de la manière dont les cellules se différencient en leurs types spécifiques. Les chercheurs ont identifié plus de 800 TFs dans Hydractinia et se sont concentrés sur 69 qui montrent des motifs d'expression spécifiques dans certains types de cellules. En analysant la connectivité de ces facteurs de transcription, ils ont pu identifier des acteurs clés dans le développement des types de cellules.

Les chercheurs ont trouvé plusieurs TFs importants liés au développement de types de cellules spécifiques. Par exemple, certains TFs étaient associés aux nématocytes et aux cellules épithéliales, suggérant leur implication dans les caractéristiques uniques de ces cellules.

Le Rôle Unique des Cellules de Type Shematrin

Parmi les différents types de cellules, les cellules de type Shematrin sont particulièrement intéressantes. Ces cellules expriment des gènes similaires à ceux des mollusques, connus pour leur rôle dans la formation de coquilles. La recherche suggère que ces cellules de type Shematrin pourraient contribuer au processus de minéralisation dans les colonies d'Hydractinia, leur permettant potentiellement de mieux s'ancrer sur les coquilles des bernard-l'ermite.

Les cellules de type Shematrin ont présenté un groupe de gènes organisés à un endroit génomique spécifique, indiquant une possible relation évolutive avec des gènes similaires chez d'autres organismes. L'analyse a montré que ces gènes sont étroitement liés à la production de chitine.

Comparaison avec d'autres Cnidaires

Les chercheurs ont également examiné si des gènes similaires de type Shematrin existent chez d'autres cnidaires, comme les coraux et les méduses. Ils ont découvert que certains de ces gènes sont présents chez plusieurs espèces apparentées, bien qu'ils puissent avoir des fonctions différentes. En recherchant ces gènes, ils ont confirmé que des voies de biomérialisation similaires ne sont pas uniques à Hydractinia, mais peuvent également être trouvées chez d'autres cnidaires.

Perspectives Évolutionnaires

Cette recherche offre des perspectives sur la manière dont différents types de cellules pourraient avoir évolué. Les résultats suggèrent que, bien que de nombreux types de cellules soient partagés à travers différentes parties de la colonie, la spécialisation des cellules pourrait avoir été un facteur critique dans la manière dont ces animaux se sont adaptés à leur environnement.

La similarité de certains gènes et fonctions entre Hydractinia et d'autres organismes implique une origine ancestrale commune. Cependant, le rôle distinct des cellules de type Shematrin indique qu'il pourrait y avoir des innovations uniques qui ont émergé au sein de la lignée d'Hydractinia.

Conclusion

La recherche sur Hydractinia révèle beaucoup sur la complexité et la diversité des animaux coloniaux. En plongeant dans les types de cellules individuelles et leurs fonctions, les scientifiques peuvent mieux comprendre comment ces créatures opèrent en tant qu'unités interconnectées. Ce travail contribue non seulement à la connaissance des organismes coloniaux, mais établit également les bases pour de futures études visant à explorer divers aspects de leur biologie et de leur évolution.

À mesure que les techniques s'améliorent, les chercheurs découvriront probablement encore plus sur ces créatures fascinantes, menant à une appréciation plus profonde de la biodiversité trouvée dans nos océans. Cette étude montre que l'interconnexion de la vie s'accompagne à la fois de traits partagés et d'adaptations uniques, soulignant la nature dynamique de l'évolution dans le royaume animal.

En examinant ces petites créatures complexes, nous ouvrons la voie à des insights plus larges sur la manière dont la vie sur Terre a évolué et continue de s'adapter face aux changements d'environnement. L'aventure dans les royaumes microscopiques de la biologie ne fait que commencer.

Source originale

Titre: The Hydractinia cell atlas reveals cellular and molecular principles of cnidarian coloniality

Résumé: Coloniality is a widespread growth form in cnidarians, tunicates, and bryozoans, among others. Despite being modular, composed of multiple zooids and supporting tissues, colonies function as a single physiological unit. A major question in the biology of colonies is the cellular mechanism of generating structurally and functionally distinct colony parts. The cnidarian Hydractinia establishes colonies with different types of zooids (polyps), interconnected by a gastrovascular system that is attached to the substrate and known as stolons. We obtained single cell transcriptomic profiles of [~]200K Hydractinia cells, including isolated stolons and two polyp types. We characterised the major Hydractinia cell types and quantified their abundance across colony parts. Overall, we find that distinct colony parts are characterised primarily by distinct combinations of shared cell types and to a lesser extent by part-specific cell types. Therefore, we propose that both cell type combinations, as well as rarer cell type innovations, have been the main mechanism in the evolution of coloniality in cnidarians. We identified cell type-specific transcription factors (TFs) and gene networks expressed within these cell types. Notably, we discovered a previously unidentified, stolon-specific cell type, which expresses enzymes related to biomineralization and chitin synthesis, reminiscent of molluscan shell matrix proteins that may represent a crucial adaptation to the animals habitat. In summary, the Hydractinia cell atlas elucidates the fundamental cellular and molecular mechanisms underlying coloniality.

Auteurs: Jordi Solana, D. A. Salamanca-Diaz, H. R. Horkan, H. Garcia-Castro, E. Emili, M. Salinas-Saavedra, M. E. Rossi, M. Alvarez-Presas, R. M. Gabhann, F. Febrimarsa, A. Perez-Posada, N. J. Kenny, J. Paps, U. Frank

Dernière mise à jour: 2024-06-20 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599157

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599157.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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