Bacillus subtilis et son processus de sporulation stratégique
Comment Bacillus subtilis gère le comportement cellulaire à travers la sporulation et la production de glycérol.
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Les cellules d'une population peuvent se comporter de manière assez similaire, surtout quand elles se développent bien dans de bonnes conditions. Mais quand il y a moins de cellules et que certains gènes sont moins actifs, de petits changements dans leur environnement ou des différences dans les protéines à l'intérieur des cellules peuvent mener à des comportements variés. Ça s'appelle l'« Hétérogénéité phénotypique ». Ça aide à expliquer plusieurs situations, comme pourquoi certaines bactéries sont résistantes aux antibiotiques, pourquoi les tumeurs peuvent croître à des rythmes différents, et comment les organismes unicellulaires se répartissent les tâches.
L’hétérogénéité phénotypique peut se produire à cause de changements temporaires dans l'ADN des cellules qui entraînent des activations de gènes différentes dans différentes cellules. Il y a souvent un élément de hasard dans la façon dont cette diversité apparaît. Par exemple, quand la quantité d'une protéine régulatrice clé est très basse dans une cellule, de petites différences dans la quantité de cette protéine produite peuvent mener à des caractéristiques différentes dans les cellules. De plus, si des protéines régulatrices importantes sont distribuées de manière inégale entre les cellules filles, elles peuvent aussi se comporter différemment.
Un exemple remarquable de ça se voit dans la formation d'endospores par Bacillus subtilis. Quand cette bactérie fait face à la famine, elle commence un processus appelé Sporulation, où elle change de sa forme habituelle en une spore dormante. La décision de commencer la sporulation est guidée par une protéine régulatrice appelée Spo0A. Quand la concentration de Spo0A active dans la cellule atteint un certain niveau, cela déclenche l'expression de plusieurs gènes spécifiques à la sporulation.
Un des premiers pas dans ce processus est quand la cellule se divise asymétriquement pour produire deux cellules filles différentes : une plus grande cellule mère et une plus petite forespore. La cellule mère engloutit ensuite la forespore, qui finit par mûrir en spore. Tout ce processus peut prendre environ six heures et est irréversible même si les conditions s'améliorent. Si le déclencheur initial de la sporulation est temporaire, les cellules qui se sont engagées dans ce processus peuvent ne pas être capables de profiter de nouveaux nutriments, ce qui en fait une décision risquée.
Cependant, la sporulation ne se produit pas en même temps pour toutes les cellules. Cette asynchronicité permet à certaines cellules de rester non sporulantes et prêtes à croître quand de nouveaux nutriments deviennent disponibles. Les différences initiales dans la façon dont Spo0A est activé créent cette variation parmi les cellules, ce qui peut aider la population à survivre à des changements environnementaux soudains.
Un facteur appelé ShfP joue un rôle significatif dans ce processus. Quand ShfP est supprimé, cela peut résoudre des problèmes de sporulation causés par une autre suppression (shfA). ShfA est produit dans la cellule mère et a un domaine spécial qui peut l'aider à se connecter à la forespore. Sans ShfA, l'efficacité de la sporulation diminue significativement. Les chercheurs ont découvert que quand ils suppriment ShfP avec ShfA, l'efficacité de la sporulation revient à des niveaux normaux. Cela suggère que ShfP inhibe la sporulation, tandis que ShfA protège contre les effets négatifs de ShfP.
ShfP est une protéine composée de 1 289 acides aminés et a plusieurs caractéristiques uniques. Elle inclut une séquence qui guide son transport à l'extérieur de la cellule et plusieurs domaines qui peuvent l'aider à se lier à d'autres molécules. La structure de ShfP montre qu'elle est probablement connectée à la surface externe de la forespore.
Les structures partagées de ShfP peuvent être trouvées dans de nombreux types de bactéries. Cela suggère que, bien que ShfP ait un rôle spécial dans les bactéries sporulantes, des protéines similaires peuvent avoir des fonctions différentes dans d'autres bactéries. Le domaine calcinurine-like de ShfP lui permet d'agir sur diverses substances, qui peuvent inclure des éléments importants pour la croissance et la survie des bactéries.
ShfP est produit spécifiquement dans la forespore durant la sporulation, et les chercheurs ont montré qu'il est nécessaire pour sa fonction. Ils ont trouvé que disruptant certaines parties de la structure de ShfP affectait sa capacité à compléter les problèmes de sporulation. Cela indique que la capacité de ShfP à agir comme une phosphoestérase est critique.
Quand ils ont étudié ShfP plus en détail, les chercheurs ont observé qu'il libère du Glycérol dans l'environnement. Ce glycérol sert à deux choses : il agit comme un nutriment pour d'autres cellules, leur permettant de croître et de rester actives, et il envoie aussi des signaux pour retarder la sporulation dans les cellules qui n'ont pas encore commencé le processus. Donc, Bacillus subtilis crée une population plus diversifiée avec des cellules à différents stades de sporulation, améliorant leurs chances de survie quand les conditions changent.
En utilisant diverses méthodes de laboratoire, les chercheurs ont pu identifier les caractéristiques et les fonctions du glycérol produit par ShfP. Ils ont découvert qu'il est produit en quantités significatives et joue un rôle crucial dans le soutien de la croissance des cellules qui n'ont peut-être pas encore commencé la sporulation.
Quand ils ont regardé les effets du glycérol sur la sporulation, ils ont trouvé que la présence de quantités plus élevées de glycérol dans le milieu pouvait ralentir significativement l'entrée dans la sporulation pour les cellules qui ne s'étaient pas engagées dans ce chemin. Les cellules produisant du glycérol protégeaient donc d'autres cellules d'entrer dans la sporulation trop tôt.
Pour mieux comprendre le mécanisme en jeu, les chercheurs ont exploré comment le glycérol interagit avec d'autres voies cellulaires. Ils ont découvert que le glycérol pouvait influencer les activités de capteurs spécifiques dans les cellules, les aidant à déterminer quand entrer en sporulation. Ils ont aussi découvert que son impact n'était pas seulement dû à sa disponibilité en tant que nutriment, mais aussi à travers une voie de signalisation qui aide à coordonner le comportement cellulaire.
Cette recherche met en avant que la production de glycérol par des cellules sporulantes précoces est un mouvement stratégique pour assurer la survie. Cela renforce l'idée que c'est une réponse planifiée plutôt qu'un événement aléatoire.
En termes simples, Bacillus subtilis a développé un moyen de créer de la variété parmi sa population cellulaire durant la sporulation. Les cellules qui commencent ce processus tôt produisent du glycérol, qui non seulement soutient leur propre croissance mais aide aussi à garder d'autres cellules de commencer la sporulation trop tôt. Cela permet à certaines cellules de la population de rester prêtes à profiter de nouvelles ressources dans l'environnement.
Les résultats suggèrent que les mécanismes observés chez Bacillus subtilis pourraient être courants chez d'autres bactéries, indiquant que cette stratégie de gestion du comportement cellulaire à travers la libération de nutriments est une adaptation importante.
Comprendre comment Bacillus subtilis régule son processus de sporulation peut aussi fournir des informations sur la façon dont d'autres organismes peuvent survivre dans des conditions difficiles. Cette recherche contribue à une meilleure connaissance de la croissance bactérienne, des stratégies de survie et de la dynamique des populations. Elle illustre comment même des organismes unicellulaires montrent des comportements complexes pour assurer leur survie dans des environnements changeants.
En résumé, l'interaction entre ShfP, la production de glycérol et la décision de sporuler représente un exemple fascinant de la façon dont les bactéries peuvent gérer leur développement de manière stratégique. En régulant ce processus, Bacillus subtilis améliore non seulement ses propres chances de survie, mais montre aussi comment un comportement collectif dans une population peut émerger des actions individuelles des cellules. C'est un domaine d'étude intéressant qui pourrait avoir des implications pour comprendre le comportement bactérien de manière plus large.
Titre: Altruistic feeding and cell-cell signaling during bacterial differentiation actively enhance phenotypic heterogeneity
Résumé: Starvation triggers bacterial spore formation, a committed differentiation program that transforms a vegetative cell into a dormant spore. Cells in a population enter sporulation non-uniformly to secure against the possibility that favorable growth conditions, which puts sporulation-committed cells at a disadvantage, may resume. This heterogeneous behavior is initiated by a passive mechanism: stochastic activation of a master transcriptional regulator. Here, we identify a cell-cell communication pathway that actively promotes phenotypic heterogeneity, wherein Bacillus subtilis cells that start sporulating early utilize a calcineurin-like phosphoesterase to release glycerol, which simultaneously acts as a signaling molecule and a nutrient to delay non-sporulating cells from entering sporulation. This produced a more diverse population that was better poised to exploit a sudden influx of nutrients compared to those generating heterogeneity via stochastic gene expression alone. Although conflict systems are prevalent among microbes, genetically encoded cooperative behavior in unicellular organisms can evidently also boost inclusive fitness.
Auteurs: Kumaran S Ramamurthi, T. B. Updegrove, T. Delerue, V. Anantharaman, H. Cho, C. Chan, T. Nipper, H. Choo-Wosoba, L. Jenkins, L. Zhang, Y. Su, H. Shroff, J. Chen, C. Bewley, L. Aravind
Dernière mise à jour: 2024-03-27 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.27.587046
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.27.587046.full.pdf
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