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Adaptations locales des plantes de Brassica à la salinité

Des recherches montrent comment le Brassica fruticulosa côtier s'adapte à des niveaux élevés de sel.

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Les plantes s'adaptent à leur environnement de plein de façons, surtout face à des défis comme les niveaux élevés de sel dans le sol. On a souvent l'idée que les plantes de la même espèce vont développer des manières similaires de gérer ces défis. Pourtant, cette idée n'a pas été vraiment testée à cause des limites dans l'étude des différentes Populations de plantes. Pour mieux comprendre comment les plantes s'adaptent aux environnements salins, cette étude se concentre sur une zone spécifique en Catalogne, dans le nord de l'Espagne, où certaines plantes font face à des niveaux de salinité élevés le long de la côte.

Avant ça, des recherches sur une espèce de plante appelée Arabidopsis thaliana dans cette région ont montré que les plantes locales ont développé des traits différents pour survivre à divers niveaux de sel, même sur de courtes distances. Le terrain près de la côte a des niveaux de sel beaucoup plus élevés par rapport aux zones plus à l'intérieur des terres. Ces niveaux de sel influencent quelles plantes peuvent pousser dans certaines zones et favorisent l'évolution des traits de tolérance au sel dans les populations locales. Des études ont montré que même des plantes autogames comme l'Arabidopsis peuvent montrer des adaptations différentes dans ces conditions.

Cependant, l'Arabidopsis a certaines limites pour étudier les adaptations. Elle se reproduit principalement seule, ce qui entraîne moins de Diversité génétique comparé à d'autres plantes apparentées qui pollinisent croisement. Une faible diversité génétique peut causer des problèmes comme la dérive génétique et la propagation de traits génétiques nuisibles. De plus, l'Arabidopsis est assez différente de beaucoup de cultures importantes, ce qui rend difficile l'application des résultats à l'amélioration des cultures.

D'un autre côté, les plantes sauvages qui pollinisent croisement ont une plus grande diversité génétique, ce qui les rend plus adaptées pour étudier les adaptations. En tenant compte de cela, les chercheurs ont cherché des espèces de plantes sauvages dans la famille des Brassicaceae, qui comprend beaucoup de cultures et de légumes, pour examiner comment elles s'adaptent à des niveaux de salinité élevés dans la zone côtière.

Contexte sur les Plantes Brassica

Le genre Brassica comprend près de 100 espèces de plantes différentes. Beaucoup d'entre elles sont utilisées comme nourriture, comme le chou, le brocoli et le chou frisé. Cette famille de plantes peut aussi bien s'adapter à de nouveaux environnements grâce à leur capacité à hybrider et à changer génétiquement. Ces traits en font des cibles intéressantes pour la recherche sur comment rendre les plantes plus résistantes aux changements environnementaux.

Cette étude a d'abord cherché des Brassicas sauvages dans le nord-est de l'Espagne, se concentrant finalement sur six espèces qui semblaient montrer différentes adaptations aux niveaux de salinité élevés. Parmi celles-ci, Brassica fruticulosa a été identifiée comme un candidat prometteur pour étudier les adaptations locales au stress salin. Cette espèce n'avait pas été reconnue auparavant pour son adaptation unique à une forte salinité.

Zones d'étude et Méthodes

En Catalogne, le paysage varie beaucoup. Il y a une différence claire de salinité du sol entre les zones intérieures et la côte, ce qui pousse l'évolution de la tolérance au sel chez les plantes. La recherche a cherché des populations de Brassicaceae sauvages avec différents traits de tolérance au sel. Un total de 13 espèces sauvages de Brassica ont été identifiées dans la région, avec six espèces trouvées dans diverses localisations côtières et intérieures.

Des graines de ces espèces ont été collectées, et leur capacité à tolérer le sel a été testée. Certaines espèces ont montré une forte tolérance à la salinité peu importe leur emplacement, tandis que d'autres avaient des niveaux de sensibilité variés au sel. L'accent a été mis sur Brassica fruticulosa, qui a montré des différences notables dans sa tolérance au sel aussi bien sur la côte qu'à l'intérieur des terres.

Pour mieux comprendre ces adaptations, les chercheurs ont cultivé des plantes dans des environnements contrôlés avec des niveaux de sel spécifiques. Ils ont mesuré comment les plantes poussaient et produisaient des graines. Pour Brassica fruticulosa, des différences significatives de performance ont été observées entre les populations côtières et intérieures.

Performance des Plantes Sous Stress Salin

L'étude a testé comment Brassica fruticulosa pouvait survivre dans des conditions salines comparé à d'autres espèces de Brassica. Dans des expériences contrôlées, les populations côtières ont beaucoup mieux performé sous stress salin que les populations intérieures. Cela suggère que les plantes côtières sont spécifiquement adaptées à gérer des niveaux de sel plus élevés.

Dans des expériences où des plantes côtières et intérieures étaient cultivées ensemble, les plantes côtières surpassaient systématiquement les plantes intérieures quand elles étaient cultivées en conditions côtières. À l'inverse, quand les deux types étaient cultivés à l'intérieur, les plantes intérieures montraient une meilleure forme. Cela indique que les deux groupes sont adaptés localement, prosperant mieux dans leur environnement natif.

Pour tester davantage leur tolérance au sel, les chercheurs ont réalisé des expériences hydroponiques où la salinité était précisément contrôlée. Les populations côtières ont germé et poussé mieux que les populations intérieures sous des conditions de haute salinité. Ces résultats montrent clairement la tolérance à la salinité des populations côtières de Brassica fruticulosa.

Analyse Génomique et Assemblage du Génome

Pour enquêter sur la base génétique de l'adaptation de Brassica fruticulosa à des conditions salines, les chercheurs ont séquencé le génome d'une plante provenant d'une zone côtière connue pour sa tolérance au sel. Ils ont utilisé des technologies de pointe pour assembler l'information génétique et évaluer la qualité générale du génome.

Après le séquençage, les chercheurs ont nettoyé les données de toute erreur potentielle et analysé la structure génétique des populations. Cette analyse a aidé à identifier comment différents groupes de Brassica fruticulosa sont liés les uns aux autres sur la base de leur information génétique.

En étudiant le génome de cette espèce, les chercheurs cherchaient à découvrir les gènes spécifiques qui pourraient contribuer à la tolérance au sel. Cette information est essentielle pour comprendre les adaptations de ces plantes et pourrait fournir des idées pour élever des variétés de cultures plus résistantes.

Structure des Populations et Diversité Génétique

L'étude a aussi examiné la structure de la population de Brassica fruticulosa en examinant de nombreux individus à travers différents lieux. En échantillonnant 18 populations, les chercheurs ont pu identifier des motifs liés à l'origine géographique et voir comment ces populations sont liées génétiquement.

L'analyse a révélé que les variations génétiques étaient plus étroitement liées à la zone d'origine des plantes plutôt qu'à leurs niveaux de tolérance au sel. Cela souligne l'importance de l'adaptation locale et comment différents environnements peuvent façonner le patrimoine génétique des populations de plantes.

Différentes Réponses à la Salinité

La recherche a révélé des différences intéressantes dans la façon dont les populations voisines de Brassica fruticulosa réagissent au stress salin au niveau génétique. En utilisant une analyse transcriptomique, les scientifiques ont examiné quels gènes étaient activés en réponse au stress salin dans différentes populations.

Sous stress salin, deux groupes de plantes (celles des zones nord et centrale) ont montré des motifs distincts dans l'expression génétique. Cela indiquait qu'ils utilisent différentes stratégies pour faire face à la forte salinité. Bien que les deux groupes maintenaient une croissance globale similaire, leurs méthodes pour gérer le sel étaient différentes.

Par exemple, les plantes du nord étaient meilleures pour exclure le sodium de leurs tissus, tandis que les plantes centrales avaient tendance à tolérer des niveaux de sodium plus élevés en les compartimentant dans leurs cellules. Ces résultats mettent en lumière que même les populations étroitement liées peuvent développer diverses adaptations au même stress environnemental.

Mécanismes de Tolérance au Sel

L'étude a également examiné comment les plantes de Brassica fruticulosa réussissent à survivre sous des conditions salines. Les populations côtières ont été trouvées à restreindre l'absorption de sodium, privilégiant plutôt le potassium, ce qui est crucial pour la santé des plantes. Cette stratégie aide à maintenir des niveaux de sodium bas dans leurs tissus.

D'un autre côté, les populations centrales semblaient tolérer des niveaux de sodium plus élevés et compenser sa toxicité potentielle en accumulant d'autres molécules protectrices comme la proline. Cette capacité à gérer le sodium à l'intérieur de leurs cellules réduit le stress oxydatif causé par le sel.

Pressions de Sélection dans les Zones Côtières

Les chercheurs ont cherché à comprendre quels facteurs conduisent ces différences d'adaptations. Bien que la salinité soit une influence majeure, d'autres facteurs environnementaux comme le vent et les conditions du sol peuvent aussi jouer un rôle. L'étude a examiné les taux d'évaporation dans la zone, car cela peut augmenter les niveaux de stress auxquels les plantes font face.

Des taux d'évaporation élevés peuvent intensifier les effets du stress salin sur les plantes, conduisant à des réponses adaptatives différentes. Dans des régions avec une évaporation plus élevée, les plantes peuvent évoluer des mécanismes pour exclure le sodium, tandis que dans des zones avec moins de stress, elles pourraient développer des tolérances qui leur permettent de gérer efficacement les niveaux de sodium.

Conclusion

Cette recherche établit Brassica fruticulosa comme un modèle précieux pour étudier les adaptations locales à la forte salinité. Les résultats montrent que même au sein de la même espèce, les plantes peuvent développer des stratégies variées pour faire face à des défis environnementaux similaires. En se concentrant sur les parents sauvages des cultures, les scientifiques peuvent explorer de nouveaux traits génétiques qui pourraient améliorer la résilience dans des contextes agricoles.

Les différences claires observées entre les populations côtières nord et centrale indiquent que les conditions environnementales locales façonnent la façon dont les plantes s'adaptent à la salinité. Comprendre ces mécanismes aidera non seulement à conserver les populations de plantes sauvages, mais aussi à améliorer les variétés de cultures qui peuvent prospérer dans des environnements changeants.

Le travail suggère que les études futures devraient continuer à explorer les interactions complexes entre les plantes et leurs environnements, surtout dans les zones côtières où les stress varient. En faisant cela, les chercheurs peuvent en apprendre davantage sur la façon dont les plantes s'adaptent et comment ces adaptations peuvent être appliquées aux efforts d'agriculture et de conservation.

Source originale

Titre: Local cryptic diversity in salinity adaptation mechanisms in a wild outcrossing Brassica

Résumé: It is generally assumed that populations of the same species should evolve shared mechanisms of adaptation to common stressors due to evolutionary constraint. Here, we describe a novel system of within-species local adaptation to coastal habitats, Brassica fruticulosa, and detail surprising mechanistic variability in adaptive responses to extreme salinity. These radically different adaptive responses in neighbouring populations are evidenced by transcriptomes, diverse physiological outputs, and completely distinct genomic selective landscapes. In response to high salinity Northern Catalonian populations restrict root-to-shoot Na+ transport, favouring K+ uptake. Contrastingly, Central Catalonian populations accumulate Na+ in leaves and compensate for the osmotic imbalance with compatible solutes such as proline and elevated Ca2+. Despite contrasting responses, both metapopulations were salinity tolerant relative to all inland accessions. To characterise the genomic basis of these two divergent adaptive strategies in an otherwise non-saline-tolerant endemic, we generate a long-read-based genome and population sequencing of 18 populations (9 inland, 9 coastal) across the B. fruticulosa species range. Results of genomic and transcriptomic approaches confirm the physiological observations of completely distinct underlying mechanisms of adaptation to extreme salinity and reveal potential genetic targets of these two recently evolved salinity adaptations. We therefore provide a new model of within-species salinity adaptation and reveal cryptic variation in neighbouring plant populations in the mechanisms of adaptation to an important natural stressor highly relevant to agriculture. SignificanceIts usually expected that closely related populations of a given species should adapt to the same environmental stressor in the same way due to genetic or physiological constraints. However, this is not commonly tested due to practical constraints. Here we show that, even at the level of neighbouring populations, contrasting adaptive mechanisms control adaptive responses to extreme coastal salinity in a new plant model, Brassica fruticulosa, a close wild relative of many crops of worldwide importance. This indicates multiple options for engineering an agriculturally crucial adaptation: soil salinization. These results will be of great interest to not only those studying fundamental mechanisms of adaptation, but also resilience improvement in Brassica species.

Auteurs: Levi Yant, S. Busoms, A. da Silva, G. Escola, R. Abdilzadeh, E. Curran, A. Bollmann-Giolai, S. Bray, M. Wilson, C. Poschenrieder

Dernière mise à jour: 2024-04-22 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.590122

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.590122.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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