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Améliorer les diagnostics automatisés avec l'IA et les graphes de connaissances

Combiner des graphes de connaissances médicales avec l'IA améliore la précision des diagnostics.

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Dans le domaine de la santé, les dossiers des patients sont super importants pour suivre les conditions de santé, les diagnostics et les traitements. Les Dossiers de santé électroniques (DSE) donnent un aperçu détaillé de l'historique médical d'un patient. Mais, la complexité et la longueur de ces dossiers peuvent submerger les professionnels de santé, ce qui peut entraîner des erreurs dans les diagnostics. Les Grands Modèles de Langage (GML) ont montré qu'ils peuvent analyser du texte et accomplir diverses tâches. Cependant, leur utilisation dans le domaine de la santé doit être prudente à cause des risques d'erreurs et de préjudices pour les patients.

Cet article parle d'une nouvelle méthode qui combine un graphe de Connaissances médicales avec des GML pour améliorer la génération automatique de diagnostics. Cette méthode utilise un modèle de graphe spécifique inspiré de la façon dont les médecins réfléchissent en posant des diagnostics. En utilisant une base de données de connaissances médicales, l'approche peut aider à interpréter et à résumer des informations médicales complexes. Des tests sur des données réelles d'hôpital montrent que cette méthode pourrait améliorer la précision de la génération de diagnostics automatiques et fournir des explications claires sur le processus de diagnostic.

Le Rôle des Dossiers de Santé Électroniques

Les DSE sont cruciaux pour maintenir des soins continus aux patients. Ils rassemblent des infos sur les patients, y compris leurs symptômes, leurs antécédents médicaux et leurs traitements en cours. Bien que les DSE puissent offrir des aperçus précieux, ils contiennent souvent trop de détails et de redondance. Ça peut rendre la tâche des professionnels de santé difficile, conduisant à des diagnostics manqués ou incorrects.

Avec la quantité d'infos dans les DSE, les médecins passent parfois à côté de sections critiques ou se fient à des raccourcis de prise de décision rapide qui pourraient contribuer à des erreurs de diagnostic. Les tentatives existantes pour automatiser le diagnostic à partir des notes de progrès ont commencé à explorer l'utilisation de modèles linguistiques. Cependant, ces modèles nécessitent toujours une grande précision, car des erreurs dans le diagnostic peuvent gravement impacter la sécurité des patients et les résultats des traitements.

La Nécessité d'Outils Diagnostiques Améliorés

Le Système Unifié de Langage Médical (UMLS) est une ressource complète qui contient une multitude de connaissances médicales. Il aide à organiser et à récupérer des informations biomédicales. Un grand nombre de concepts et de relations médicales existent au sein de l'UMLS, ce qui rend la détermination des diagnostics ardue. Lors de l'extraction de connaissances pertinentes pour un diagnostic, deux problèmes principaux se présentent : la nature unique et spécifique des plaintes et des antécédents des patients, et le nombre énorme de concepts et de relations dans le graphe de connaissances.

Utiliser des Graphes de connaissances peut améliorer les capacités des GML pour générer des diagnostics. Cette étude cherche à fusionner les GML et les graphes de connaissances pour fournir de meilleures perspectives sur les soins de santé. Le processus de diagnostic implique d'analyser les données des patients, de récupérer des connaissances pertinentes et de former une hypothèse, un processus qui reflète la façon dont les professionnels de santé pensent.

Présentation de Dr.Knows

Dr.Knows est un nouveau modèle basé sur un graphe conçu pour identifier des connaissances médicales pertinentes pour le diagnostic. Son but est d'établir des connexions entre des cas spécifiques et des connaissances médicales plus larges, aidant ainsi les GML à générer des diagnostics plus précis. Plutôt que de nécessiter un pré-entraînement étendu, Dr.Knows utilise le graphe de connaissances comme une ressource supplémentaire pour aider à interpréter des textes médicaux complexes.

Dr.Knows fonctionne en traitant les données des dossiers patients et en extrayant des concepts et des relations pertinents. Il explore ces connexions pour identifier des diagnostics probables en se basant sur les récits médicaux fournis. En gros, Dr.Knows aide les GML en offrant un chemin plus clair à travers le vaste réseau des connaissances médicales, menant finalement à de meilleures prédictions diagnostiques.

Utilisation des Graphes de Connaissances dans le Diagnostic

Les graphes de connaissances servent de représentation structurée des connaissances médicales, où les concepts représentent des termes médicaux ou des conditions des patients et les relations illustrent comment ces concepts sont connectés. Par exemple, si un patient se présente avec de la fièvre et une toux, le graphe de connaissances peut aider à identifier des diagnostics probables en examinant des conditions médicales et des symptômes associés.

L'utilisation d'un graphe de connaissances permet un raisonnement multi-sauts, ce qui signifie que le modèle peut créer des connexions à travers diverses relations pour atteindre un diagnostic final. C'est particulièrement utile lorsque les relations directes entre les symptômes et les diagnostics ne sont pas évidentes. En examinant ces couches de relations, Dr.Knows peut améliorer la précision et la fiabilité des prédictions diagnostiques.

Le Jeu de Données

Dans cette étude, deux jeux de données ont été utilisés pour l'évaluation : l'un provenant d'une source publique et l'autre rassemblé à partir des dossiers internes d'un hôpital. Le jeu de données public, connu sous le nom de MIMIC-III, contient des données de patients admis dans des unités de soins intensifs. Le jeu de données interne inclut diverses notes de progrès de différents départements de l'hôpital.

Les deux jeux de données suivent un format standard pour l'enregistrement des notes de soins quotidiennes. Les notes de progrès sont divisées en sections comprenant des rapports subjectifs des patients, des résultats objectifs, des évaluations et des plans. L'objectif était de prédire la liste des problèmes et des diagnostics qui font partie de la section plan.

Le jeu de données MIMIC-III comprend des diagnostics annotés, qui servent de base pour entraîner le modèle. Le jeu de données interne, bien que non annoté, permet d'extraire des concepts médicaux basés sur un vocabulaire reconnu.

L'Architecture du Modèle Dr.Knows

Dr.Knows prend des concepts médicaux identifiés à partir des dossiers patients et récupère des connaissances connexes de l'UMLS. Le modèle encode ces informations dans un format structuré pouvant être traité pour générer des représentations de parcours significatives. Ces parcours sont cruciaux pour que le modèle évalue les relations entre les concepts et leur pertinence par rapport au texte d'entrée.

L'architecture du modèle est conçue pour évaluer la force des connexions entre les concepts en analysant les relations sémantiques. Si un diagnostic direct ne peut pas être identifié, le modèle peut avancer à travers les couches de connaissances connexes pour tirer une conclusion solide.

Entraîner le Modèle

Pour entraîner Dr.Knows, une variété de méthodes ont été utilisées, y compris la création de parcours de représentation et l'évaluation de la précision du modèle pour prédire des diagnostics. Le processus d'entraînement a impliqué un ajustement fin en utilisant deux modèles de base différents : T5 et ChatGPT. En s'entraînant sur les jeux de données collectés, la performance du modèle a été évaluée en fonction de sa capacité à prédire des diagnostics basés sur les récits des patients.

En plus des méthodes d'entraînement standard, le modèle incorpore des mécanismes d'attention avancés pour garantir la pertinence et la clarté dans le diagnostic. Cela permet au modèle de se concentrer sur des aspects critiques des informations du patient, conduisant à des prédictions plus précises.

Évaluation de la Performance du Modèle

L'évaluation de Dr.Knows montre son efficacité à prédire des diagnostics à partir de dossiers médicaux. La performance du modèle est évaluée à l'aide de plusieurs métriques, y compris la précision et le rappel, qui mesurent l'exactitude des prédictions du modèle par rapport aux conditions diagnostiquées réelles.

Les résultats indiquent que Dr.Knows a surpassé de manière significative les méthodes traditionnelles d'extraction de concepts. En intégrant des graphes de connaissances, le modèle a montré un taux plus élevé de prédictions de diagnostics précises. Les résultats soulignent également l'importance de fournir des raisons pour le diagnostic, car la clarté dans le processus de raisonnement peut renforcer la confiance dans l'IA dans des milieux cliniques.

Incitation Par les Parcours avec des Modèles de Base

Un aspect essentiel de cette étude était d'évaluer la contribution des parcours de connaissances à la performance des modèles de base comme T5 et ChatGPT. En s'appuyant sur les parcours prédits par Dr.Knows, les chercheurs ont exploré comment cette connaissance supplémentaire influençait la performance des modèles linguistiques pour résumer les diagnostics.

À travers une série d'étapes méthodiques, les résultats ont suggéré qu'inclure des parcours comme incitations pouvait considérablement améliorer les capacités des modèles, permettant une plus grande précision dans la génération de diagnostics et d'explications.

Résultats de l'Analyse

L'analyse a révélé que les modèles bénéficiant de l'incitation par les parcours ont atteint de meilleurs résultats que ceux qui ne l'avaient pas fait. En particulier, lorsque des parcours générés par Dr.Knows étaient utilisés comme entrée, cela améliorait la capacité des modèles à capturer des détails pertinents des notes des patients, les traduisant en diagnostics plus clairs.

Les évaluations régulières ont montré que les modèles pouvaient atteindre des scores ROUGE plus élevés, indiquant que les résumés produits étaient plus alignés avec les notes originales. La capacité à produire des diagnostics clairs, concis et précis est cruciale dans les milieux cliniques, rendant cette approche plutôt bénéfique.

Défis dans la Mise en Œuvre

Bien que la technique montre un grand potentiel, il reste encore des défis à considérer lors de sa mise en œuvre dans de vrais milieux de santé. La qualité des données DSE et du graphe de connaissances joue un rôle important dans la précision des prédictions. Des problèmes comme des données manquantes ou incomplètes peuvent conduire à des diagnostics incorrects, soulignant la nécessité de dossiers de haute qualité et complets.

De plus, l'approche repose beaucoup sur la disponibilité de données annotées pour l'entraînement. Sans suffisamment d'exemples annotés, il devient difficile d'assurer la fiabilité du modèle à travers divers scénarios. Les travaux futurs devraient se concentrer sur l'amélioration de l'adaptabilité du modèle à différents environnements cliniques et la réduction des biais qui pourraient surgir des données d'entraînement.

Considérations Éthiques

Alors que le secteur de la santé adopte de plus en plus des outils d'IA pour le diagnostic et la prise de décision, les considérations éthiques doivent être au premier plan. Assurer la confidentialité des patients et la sécurité des données est primordial, surtout lorsqu'on manipule des informations sensibles dans les DSE. Il est crucial de respecter les règlements et de mettre en œuvre des mesures de protection strictes pour préserver les données des patients.

La transparence des modèles d'IA est également une préoccupation. Bien que des efforts aient été faits pour rendre Dr.Knows explicable, la complexité de la prise de décision par l'IA peut toujours poser des défis. Une communication claire sur la façon dont les décisions sont prises et le raisonnement derrière les résultats diagnostiques est vitale pour instaurer la confiance entre les professionnels de la santé et les patients.

Une dépendance excessive vis-à-vis de l'IA pour le diagnostic est un autre risque. L'IA devrait être considérée comme un outil pour soutenir, plutôt que remplacer, la prise de décision humaine dans le secteur de la santé. Il est essentiel que les professionnels de la santé maintiennent leurs compétences de pensée critique et que les outils d'IA soient utilisés de manière responsable.

Conclusion

En résumé, l'intégration d'un graphe de connaissances médicales avec des modèles linguistiques offre une voie prometteuse pour améliorer la précision de la génération de diagnostics automatisés dans le secteur de la santé. Le modèle Dr.Knows démontre un potentiel pour améliorer les soins aux patients en offrant des parcours diagnostiques plus clairs et plus explicables. En s'appuyant sur des connaissances médicales structurées, le modèle peut guider les professionnels à travers le paysage médical souvent complexe, menant finalement à de meilleurs résultats pour les patients.

Au fur et à mesure que la recherche progresse, il sera primordial d'explorer davantage le perfectionnement du modèle, de traiter les problèmes éthiques et d'assurer une qualité des données robuste. En continuant à avancer dans ces domaines, les outils d'IA peuvent contribuer de manière significative à l'avenir des soins de santé, rendant le diagnostic plus efficace et fiable pour les patients et les professionnels.

Source originale

Titre: Leveraging A Medical Knowledge Graph into Large Language Models for Diagnosis Prediction

Résumé: Electronic Health Records (EHRs) and routine documentation practices play a vital role in patients' daily care, providing a holistic record of health, diagnoses, and treatment. However, complex and verbose EHR narratives overload healthcare providers, risking diagnostic inaccuracies. While Large Language Models (LLMs) have showcased their potential in diverse language tasks, their application in the healthcare arena needs to ensure the minimization of diagnostic errors and the prevention of patient harm. In this paper, we outline an innovative approach for augmenting the proficiency of LLMs in the realm of automated diagnosis generation, achieved through the incorporation of a medical knowledge graph (KG) and a novel graph model: Dr.Knows, inspired by the clinical diagnostic reasoning process. We derive the KG from the National Library of Medicine's Unified Medical Language System (UMLS), a robust repository of biomedical knowledge. Our method negates the need for pre-training and instead leverages the KG as an auxiliary instrument aiding in the interpretation and summarization of complex medical concepts. Using real-world hospital datasets, our experimental results demonstrate that the proposed approach of combining LLMs with KG has the potential to improve the accuracy of automated diagnosis generation. More importantly, our approach offers an explainable diagnostic pathway, edging us closer to the realization of AI-augmented diagnostic decision support systems.

Auteurs: Yanjun Gao, Ruizhe Li, John Caskey, Dmitriy Dligach, Timothy Miller, Matthew M. Churpek, Majid Afshar

Dernière mise à jour: 2023-08-28 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2308.14321

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2308.14321

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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