Améliorer la segmentation d'instance avec des prioris de forme
Une nouvelle méthode pour la segmentation d'instances utilisant des prioris de forme montre du potentiel dans des scénarios avec peu de données.
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Table des matières
La Segmentation d'Instances, c'est un truc en vision par ordinateur où le but est de repérer et séparer chaque instance d'un objet dans une image. Ce procédé est super important pour plein d'applis, comme le suivi des cellules en imagerie biomédicale. D'habitude, beaucoup de méthodes de segmentation d'instances dépendent de l'apprentissage supervisé, donc elles ont besoin de pas mal de données annotées, genre des images où les objets sont bien délimités.
Mais obtenir ces jeux de données annotés, c'est pas toujours simple et ça prend du temps. Du coup, on explore une nouvelle approche qui utilise un "shape prior". Un shape prior, c'est un modèle appris qui aide à reconnaître les formes des objets, ce qui permet à la méthode de bien marcher même quand y'a que quelques exemples étiquetés, voire aucun.
Le Modèle Shape Prior
Le processus commence par la création d'un modèle shape prior grâce à un type d'apprentissage machine appelé autoencodeur variationnel. Ce modèle n'a pas besoin d'une grosse quantité de données d'entraînement. En fait, juste un petit nombre de formes du jeu de données cible, combiné avec quelques formes synthétiques, peut donner des résultats similaires à ceux obtenus avec des méthodes entièrement supervisées.
Avec cette approche, on peut obtenir des résultats impressionnants sur divers jeux de données d'imagerie biomédicale. L'idée, c'est que les formes fournissent des indices visuels puissants pour aider à identifier les objets, même dans des images complexes. Cette méthode a montré qu'elle fonctionnait bien là où les méthodes traditionnelles, qui dépendent beaucoup de gros jeux de données annotés, peuvent galérer.
Composants Clés du Cadre
Notre approche se compose de trois parties principales :
Réseau de Localisation : Ce petit bout prédit où se trouvent les objets dans l'image et donne un score pour indiquer leur présence.
Transformateur Spatial : Ce composant découpe des sections plus petites de l'image selon les prédictions faites par le réseau de localisation.
Réseau de Segmentation de Patchs : Après le découpage, cette partie analyse les petites sections pour segmenter les objets qu'elles contiennent.
En coordonnant ces composants, le cadre est entraîné pour minimiser les erreurs dans ses prédictions, ce qui donne de meilleurs résultats de segmentation.
Entraînement du Localisateur
Le réseau de localisation est conçu avec des couches qui traitent l'image et font des prédictions sur où se trouvent les objets. Lors de l'entraînement de ce modèle, l'image est divisée en une grille, et chaque cellule de la grille prédit si un objet est présent, avec des mesures pour définir la taille et la forme de l'objet.
Le réseau de localisation utilise des couches convolutionnelles standard, qui sont courantes dans les tâches de traitement d'images. Il traite l'ensemble de l'image et identifie les zones potentielles pouvant contenir des objets. Les paramètres définis pour le réseau aident à affiner les prédictions.
Découpage et Assemblage de Patchs
Une fois que le réseau de localisation a fait ses prédictions, le transformateur spatial prend le relais pour découper ces zones identifiées. Ce processus de découpage est fluide, permettant à l'ensemble du modèle d'être entraîné ensemble sans avoir besoin de séparer les tâches. Il ajuste et transforme les points de la grille pour produire les patchs d'image découpés.
Les patchs découpés sont normalisés et traités, permettant au modèle de se concentrer sur les sections pertinentes pour la segmentation. Après avoir segmenté ces patchs, les résultats sont combinés pour former une sortie complète, assemblant les zones segmentées en une représentation cohérente des objets identifiés.
Shape Prior et Segmentation
Le modèle shape prior est essentiel pour ce cadre. En l'entraînant avec un nombre limité d'exemples de formes, le modèle apprend à reconnaître des formes d'objets plausibles. Cette capacité est particulièrement utile pour les instances d'objets ayant des formes constantes d'une image à l'autre.
Le shape prior est fixe pendant l'entraînement du réseau de segmentation, ce qui garantit que le modèle s'appuie sur les formes apprises tout en étant adaptable aux variations des données réelles. Cette combinaison d'un shape prior fixe et d'un réseau de segmentation dynamique aide à minimiser les erreurs et à améliorer la performance globale.
Gestion des Données
En pratique, on évalue notre méthode sur trois jeux de données notables. Chaque jeu contient des images d'objets à segmenter. Les modèles sont comparés à une méthode supervisée bien connue appelée Mask R-CNN pour évaluer la performance.
Lors de l'évaluation, on examine comment notre méthode s'en sort avec des quantités variées de données d'entraînement, en regardant spécifiquement les cas avec peu ou pas d'annotations. Cette comparaison met généralement en avant les points forts de notre approche, surtout dans des situations où les données disponibles sont limitées.
Résultats et Constats
Au fil des expériences, il devient clair que notre méthode peut rivaliser efficacement avec d'autres modèles qui reposent sur de grandes quantités de données annotées. Sur certains jeux de données, notre approche surpasse même Mask R-CNN, démontrant son efficacité à reconnaître et segmenter des objets avec peu d'input.
Par exemple, quand on a testé notre méthode sur le jeu de données BBBC, elle a montré une forte performance. Cependant, sur d'autres jeux, les résultats variaient, surtout quand les contours des objets n'étaient pas bien définis, ce qui a parfois conduit à des problèmes de sous-segmentation.
Ces observations soulignent les forces et les faiblesses de notre cadre. La dépendance aux indices de contour signifie que les images avec des limites claires produisent de meilleurs résultats, tandis que celles avec moins de clarté posent des défis pour une segmentation précise.
Conclusion
En résumé, le cadre de segmentation d'instances proposé utilise un modèle shape prior pour faciliter la segmentation des objets dans les images, minimisant le besoin de gros jeux de données annotés. Cette méthode montre un grand potentiel pour traiter les cas où les données d'entraînement sont rares, surtout dans le contexte biomédical.
Les améliorations futures viseront à renforcer la capacité du modèle à gérer des images sans contours clairs, élargissant ainsi son applicabilité. Globalement, cette approche ouvre de nouvelles voies dans le domaine de la segmentation d'instances, la rendant plus accessible pour diverses applications pratiques.
Titre: Semi-supervised Instance Segmentation with a Learned Shape Prior
Résumé: To date, most instance segmentation approaches are based on supervised learning that requires a considerable amount of annotated object contours as training ground truth. Here, we propose a framework that searches for the target object based on a shape prior. The shape prior model is learned with a variational autoencoder that requires only a very limited amount of training data: In our experiments, a few dozens of object shape patches from the target dataset, as well as purely synthetic shapes, were sufficient to achieve results en par with supervised methods with full access to training data on two out of three cell segmentation datasets. Our method with a synthetic shape prior was superior to pre-trained supervised models with access to limited domain-specific training data on all three datasets. Since the learning of prior models requires shape patches, whether real or synthetic data, we call this framework semi-supervised learning.
Auteurs: Long Chen, Weiwen Zhang, Yuli Wu, Martin Strauch, Dorit Merhof
Dernière mise à jour: 2023-09-09 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2309.04888
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2309.04888
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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