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L'impact des ancêtres africains sur les résultats du COVID-19

Des recherches examinent comment l'ascendance africaine influence la gravité du COVID-19 et la réponse immunitaire.

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La pandémie de COVID-19 a profondément touché les gens dans le monde entier. Alors que beaucoup ressentent des symptômes légers ou ne montrent aucun signe de maladie, d'autres peuvent développer des conditions sévères comme la pneumonie hypoxique, qui peut être mortelle.

Le Rôle de l'Ascendance Africaine dans les Résultats du COVID-19

Des recherches suggèrent que l’ascendance africaine pourrait avoir un impact sur les résultats du COVID-19. Cependant, on ne sait pas vraiment comment ça fonctionne. Le contexte social et économique d'une personne peut compliquer l'analyse des hospitalisations et des décès chez les Africains. Quand on prend ces facteurs en compte, il semblerait que les Africains pourraient faire face à des risques de maladies graves similaires, voire plus faibles, par rapport aux autres. Fait intéressant, les taux de vaccination et de mortalité en Afrique figurent parmi les plus bas au monde.

Variantes Génétiques dans les Populations Africaines

Certaines études ont montré que des facteurs génétiques spécifiques aux populations africaines sont liés à des cas sévères de COVID-19. Par exemple, une variante génétique appelée OAS1 rs10774671 G, qui pourrait protéger contre des maladies graves, apparaît plus fréquemment chez les Africains que chez les Européens. En plus, on a remarqué que certains gènes liés aux cas graves de COVID-19 se comportent différemment dans les cellules immunitaires entre Africains et Européens. En général, une plus grande ascendance européenne semble correspondre à une réponse immunitaire plus forte contre le virus, ce qui a des implications importantes pour les stratégies de traitement. Tout ça amène à penser que les personnes d'ascendance africaine pourraient avoir des avantages génétiques contre des cas sévères de COVID-19.

Évolution et Virus Pathogènes

Les virus qui causent des maladies exercent une pression considérable sur l'évolution humaine. Certaines études ont trouvé que certains gènes liés à la susceptibilité au SARS-CoV-2, le virus responsable du COVID-19, sont soumis à une Sélection naturelle dans les populations africaines. Cependant, on ne sait toujours pas comment la sélection naturelle affecte les différences dans les variations génétiques ou l'expression de ces gènes liés aux maladies critiques. Cette étude examine la sélection naturelle récente de risques génétiques spécifiques associés à des cas graves de COVID-19 en Afrique subsaharienne, visant à clarifier pourquoi ce groupe pourrait avoir un niveau de risque différent.

Méthodes Utilisées dans l'Étude

SNPS et COVID-19

Cette étude a utilisé des données génétiques d'une collaboration importante axée sur le COVID-19. Des marqueurs génétiques spécifiques appelés SNPs, liés à des cas graves de COVID-19, ont été analysés dans un grand échantillon. Au total, 8 305 SNPs ont montré un lien fort avec des maladies graves causées par le COVID-19.

Analyse de Population

Pour analyser les signaux de sélection naturelle, des données génétiques de divers groupes ont été examinées, y compris des Européens et des individus d'Afrique subsaharienne. Une méthode de scoring spécifique a été utilisée pour évaluer dans quelle mesure une variante génétique particulière est favorisée ou défavorisée au sein de ces populations. Un nombre considérable de SNPs a été identifié comme montrant des signes forts de sélection naturelle.

Génomes Humains Anciens

Des informations génétiques provenant à la fois de populations humaines contemporaines et anciennes ont été analysées pour comprendre comment les fréquences des SNP ont évolué au fil du temps. En observant comment les caractéristiques génétiques ont évolué, les chercheurs peuvent obtenir des idées sur la façon dont les populations peuvent s'adapter aux maladies.

Analyse d'Association

Des données d'une grande étude de santé au Royaume-Uni, qui incluait de nombreux individus d'ascendance africaine, ont également été analysées. Cela incluait des informations sur combien de personnes avaient des cas graves de COVID-19 en fonction de leurs variantes génétiques.

Analyse de la Relation Causale

Pour établir si certains traits génétiques influençaient la gravité du COVID-19, des analyses supplémentaires ont été menées pour voir si des facteurs génétiques spécifiques avaient un rôle causal dans la gravité de la maladie. Cela impliquait une technique appelée randomisation mendélienne, qui aide à établir des relations entre des facteurs génétiques et des résultats de santé.

Résultats sur CCR3

Parmi les gènes étudiés, CCR3, un gène impliqué dans les réponses immunitaires, a montré des signes de sélection naturelle récente chez les Africains. Une variante spécifique au sein de CCR3 s'est révélée significative. Ce gène joue un rôle dans le système immunitaire, et sa sélection naturelle indique qu'il pourrait impacter la façon dont les individus réagissent aux cas graves de COVID-19.

Comptes d'Eosinophiles et Sévérité du COVID-19

Les Éosinophiles sont un type de globule blanc qui joue un grand rôle dans la réponse immunitaire du corps. La recherche indique que les individus avec une variante génétique spécifique de CCR3 pourraient avoir moins de comptes d'éosinophiles. Cela pourrait signifier qu'ils sont plus à risque pour des cas sévères de COVID-19. L'étude suggère que le lien entre les éosinophiles et les maladies sévères pourrait être crucial pour comprendre pourquoi certaines personnes s'en sortent moins bien que d'autres.

La Complexité des Eosinophiles dans la Maladie

Le rôle des éosinophiles dans le COVID-19 est complexe. Bien qu'ils puissent aider à combattre les infections, leur présence peut aussi entraîner des réponses inflammatoires qui aggravent l'état d'un patient. Certaines études ont rapporté des résultats contradictoires sur les comptes d'éosinophiles et la sévérité de la maladie, indiquant que leur rôle pourrait changer selon le stade de la maladie ou la population spécifique étudiée.

Implications pour la Recherche Future

Cette étude souligne l'importance de comprendre comment des variantes génétiques spécifiques affectent les résultats de santé. En se concentrant sur des gènes spécifiques comme CCR3 et leur lien avec la réponse immunitaire, des recherches futures pourraient dévoiler de nouvelles possibilités de traitement pour les cas sévères de COVID-19.

Conclusion

Les résultats suggèrent que certains traits génétiques chez les individus africains pourraient offrir un certain niveau de protection contre des cas sévères de COVID-19. Comprendre comment ces traits fonctionnent dans le système immunitaire pourrait conduire à de nouvelles stratégies de traitement. La relation entre les comptes d'éosinophiles et le COVID-19 nécessite également davantage d'exploration, car le rôle de ces globules blancs semble être critique dans la progression de la maladie.

En enquêtant sur la sélection naturelle et les variations génétiques, cette recherche crée une base pour des cibles thérapeutiques potentielles dans le traitement des patients gravement malades du COVID-19. Au fur et à mesure que notre compréhension de ces facteurs génétiques s'améliore, cela pourrait mener à des approches de traitement plus personnalisées et efficaces.

Source originale

Titre: Critically-ill COVID-19 susceptibility gene CCR3 shows natural selection in sub-Saharan Africans

Résumé: The prevalence of COVID-19 critical illness varies across ethnicities, with recent studies suggesting that genetic factors may contribute to this variation. The aim of this study was to investigate natural selection signals of genes associated with critically-ill COVID-19 in sub-Saharan Africans. Severe COVID-19 SNPs were obtained from the HGI website. Selection signals were assessed in 661 sub-Sahara Africans from 1000 Genomes Project using integrated haplotype score (iHS), cross-population extended haplotype homozygosity (xpEHH), and fixation index (Fst). Allele frequency trajectory analysis of ancient DNA samples were used to validate the existing of selection in sub-Sahara Africans. We also used Mendelian randomization to decipher the correlation between natural selection and critically-ill COVID-19. We identified that CCR3 exhibited significant natural selection signals in sub-Sahara Africans. Within the CCR3 gene, rs17217831-A showed both high iHS (Standardized iHS = 2) and high XP-EHH (Standardized XP-EHH = 2.5) in sub-Sahara Africans. Allele frequency trajectory of CCR3 rs17217831-A revealed natural selection occurring in the recent 1,500 years. Natural selection resulted in increased CCR3 expression in sub-Sahara Africans. Mendelian Randomization provided evidence that increased blood CCR3 expression and eosinophil counts lowered the risk of critically ill COVID-19. Our findings suggest that sub-Saharan Africans are less vulnerable to critically ill COVID-19 due to natural selection and identify CCR3 as a potential novel therapeutic target.

Auteurs: Peng Chen, Z. Sun, L. Pan, A. Tian

Dernière mise à jour: 2024-01-13 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.01.12.24301202

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.01.12.24301202.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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