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# Biologie# Microbiologie

Comment le mode de vie influence les microbiomes buccaux

Des recherches montrent que les facteurs de style de vie influencent les microbiomes buccaux de différentes populations.

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Au cours des 300 000 dernières années, les humains ont évolué de plein de manières. Ces changements incluent les outils qu'on utilise, comment on organise le travail, et comment on construit nos villes. Ces évolutions ont eu un gros impact sur nos sociétés et même sur notre biologie. Un des changements les plus significatifs de notre histoire récente a été le passage de la chasse et de la cueillette à l'agriculture, et plus tard à la vie industrielle. Ces transformations ont aussi entraîné une variété de modes de vie, influençant notre alimentation, où l'on vit, les maladies auxquelles on fait face, et comment on interagit avec notre environnement.

Un domaine de recherche important c'est le microbiome humain. Ce terme fait référence à tous les microbes, comme les bactéries et les champignons, qui vivent dans notre corps. Les changements dans notre mode de vie et notre alimentation peuvent influencer ce microbiome, surtout dans nos intestins. Des études ont montré que les populations vivant un Style de vie industrialisé ont tendance à avoir un microbiome intestinal moins diversifié que celles qui suivent des modes de vie plus traditionnels. Plus précisément, les gens dans des sociétés industrialisées ont souvent moins de certains microbes bénéfiques qui sont plus courants chez les groupes non industrialisés.

Bien qu'il y ait eu pas mal de recherches sur les Microbiomes intestinaux, les différences de microbiomes buccaux entre différents modes de vie ne sont pas aussi bien étudiées. Le microbiome buccal joue un rôle crucial dans notre santé globale, affectant à la fois la santé buccale et la santé du corps en général. En plus, le microbiome buccal est important dans les études sur l'ADN ancien, car il peut donner des indices sur notre histoire.

Pour combler ce manque de compréhension, il est essentiel d'étudier le microbiome buccal dans des populations diverses qui pratiquent différents modes de vie à travers le monde.

Microbiomes Anciens et Leur Importance

Beaucoup d'infos sur les microbiomes buccaux viennent d'études sur le tartre dentaire ancien. La plaque dentaire peut se durcir et conserver les microorganismes présents dans la bouche pendant des milliers d'années. Les chercheurs ont analysé l'ADN ancien de ces restes fossilés pour suivre les changements dans les microbiomes buccaux, surtout pendant des changements de mode de vie significatifs comme le passage à l'agriculture.

La transition vers l'agriculture a été associée à des changements dans l'alimentation, ce qui a augmenté les niveaux de certains microbes pathogènes dans le microbiome buccal. Cependant, étudier l'ADN ancien a ses défis. Les échantillons sont rares et les tailles d'échantillons sont souvent petites, rendant difficile de tirer des conclusions générales. De plus, les différences géographiques et temporelles compliquent les comparaisons entre les groupes avec des modes de vie variés.

Les microbiomes buccaux des humains modernes offrent une autre manière d'étudier ces différences. Bien que beaucoup de recherches se soient concentrées sur les populations des pays industrialisés, un nombre limité d'études a examiné les groupes non industrialisés. Ces études ont montré que la Diversité microbienne buccale a tendance à diminuer avec l'industrialisation et que la composition du microbiome varie selon le mode de vie.

Le Rôle du Mode de Vie dans la Formation des Microbiomes Buccaux

Au Népal, différents groupes ethniques représentent une variété de modes de vie, des chasseurs-cueilleurs traditionnels aux agriculteurs et aux expatriés vivant dans des pays industrialisés. En examinant ces populations népalaises, les chercheurs peuvent étudier comment le mode de vie influence le microbiome buccal. Par exemple, un groupe de chasseurs-cueilleurs, les Chepang, a une alimentation et un mode de vie différents par rapport aux agriculteurs comme les Tharu ou Newar.

Pour mener cette recherche, les scientifiques ont collecté des échantillons de salive auprès d'individus dans ces populations diverses. Des enquêtes ont également été réalisées pour rassembler des infos sur l'alimentation, l'éducation, et les pratiques de santé des participants. Cette étude visait à voir comment les facteurs de mode de vie étaient associés à des changements dans le microbiome buccal.

Défis dans l'Étude des Microbiomes Buccaux

Un défi clé dans la recherche sur les microbiomes est de s'assurer que les comparaisons scientifiques sont significatives. Les différences géographiques et des facteurs techniques peuvent fausser les résultats. Par exemple, les méthodes utilisées pour collecter et analyser les échantillons peuvent entraîner des variations. Pour résoudre ces problèmes, les chercheurs comparent souvent des échantillons collectés dans des conditions similaires et s'assurent que les méthodes d'extraction sont cohérentes.

Dans le cas du Népal, les chercheurs ont extrait l'ADN des échantillons de salive en utilisant différents kits et ont trouvé que la composition globale du microbiome était cohérente à travers ces méthodes. Cette approche a permis une analyse plus fiable du microbiome buccal sans les effets perturbateurs de différentes techniques d'extraction.

Résultats sur la Diversité du Microbiome Buccal

Les chercheurs ont évalué si la diversité globale du microbiome buccal différait parmi les groupes de modes de vie. Ils ont constaté que, à la différence des résultats précédents liés aux microbiomes intestinaux, la diversité du microbiome buccal ne montrait pas de différences significatives entre les populations examinées au Népal. Ce résultat était notable car il suggérait que la diversité dans le microbiome buccal pourrait ne pas être aussi fortement influencée par le mode de vie qu'on le pensait auparavant.

Cependant, même si la diversité ne différait pas de manière significative, la composition du microbiome buccal variait avec le mode de vie. Les chercheurs ont trouvé que les microbiomes buccaux se regroupaient en fonction du mode de vie, indiquant que bien que la diversité globale soit restée constante, les types de microbes présents étaient différents.

Changements Microbiens Spécifiques avec le Mode de Vie

Ensuite, l'étude a examiné quels types spécifiques de microbes étaient associés à différents modes de vie. Les analyses ont révélé que certains genres, ou groupes de bactéries, montraient des différences significatives basées sur les pratiques de mode de vie. Par exemple, certaines bactéries étaient plus courantes dans des populations traditionnelles, tandis que d'autres étaient plus présentes chez ceux vivant des modes de vie industrialisés.

Parmi ces découvertes, certains taxa diminuaient en abondance relative à mesure que les modes de vie passaient de traditionnels à plus industrialisés. Les chercheurs ont observé que le microbiome buccal reflétait ces changements de mode de vie, renforçant l'idée que ce que l'on mange et comment on vit jouent des rôles essentiels dans la formation de nos communautés microbiennes.

Facteurs de Mode de Vie et Leur Influence

L'étude a aussi visé à identifier des facteurs spécifiques de mode de vie qui pourraient expliquer ces différences dans le microbiome buccal. Les chercheurs ont réalisé des analyses statistiques pour évaluer les associations entre divers facteurs et les changements dans la composition microbienne. Des facteurs comme les habitudes alimentaires, le tabagisme, et même la localisation géographique ont montré des liens forts avec les profils microbiens.

Une découverte intéressante était une association entre le type de céréales consommées et des microbes spécifiques dans le microbiome buccal. Les personnes qui consommaient principalement de l'orge et du maïs avaient des communautés microbiennes différentes par rapport à celles qui consommaient du riz et du blé. Cela suggère que des Régimes divers peuvent avoir un impact considérable sur la composition microbienne.

Un autre facteur de mode de vie qui s'est démarqué était la consommation de sisnu, une plante fibreuse connue pour ses propriétés médicinales. Les chasseurs-cueilleurs Chepang consomment souvent du sisnu, et leurs microbiomes buccaux reflètent cette pratique alimentaire. D'autres recherches sont nécessaires pour comprendre comment cette plante influence la santé microbienne.

Pratiques d'Hygiène Bucco-Dentaire et Leur Impact

Notamment, les chercheurs n'ont pas trouvé d'associations significatives entre les pratiques d'hygiène bucco-dentaire, comme le brossage des dents et la soie dentaire, et le microbiome. Cela a été surprenant car on pense que l'hygiène bucco-dentaire joue un rôle crucial dans la formation des communautés microbiennes buccales. Cela suggère qu'il faut encore travailler pour examiner comment différentes méthodes de nettoyage et fréquences impactent le microbiome.

Liens entre Microbiomes Buccaux et Intestinaux

L'étude a aussi exploré les connexions entre les microbiomes buccaux et intestinaux. Les chercheurs ont évalué à quel point les communautés microbiennes dans la bouche et dans l'intestin étaient similaires chez des individus de différents modes de vie. Ils ont trouvé une tendance suggérant que les individus vivant des modes de vie agraires avaient des microbiomes buccaux et intestinaux plus similaires par rapport à ceux vivant des modes de vie plus traditionnels. Cependant, cette tendance n'était pas statistiquement significative, ce qui indique la nécessité de futures études pour confirmer ces observations.

Implications Plus Larges de la Recherche

Cette recherche souligne l'importance de comprendre comment le mode de vie influence le microbiome buccal. Avec beaucoup d'attention historiquement portée sur les populations industrialisées, des études comme celle-ci aident à combler des lacunes de connaissance sur la manière dont des modes de vie divers affectent la santé humaine à travers le monde.

En intégrant une gamme de facteurs de mode de vie, les chercheurs peuvent développer une meilleure compréhension de la façon dont nos communautés microbiennes changent. Ces informations peuvent finalement guider des interventions visant à améliorer les résultats de santé et à gérer les maladies associées aux déséquilibres microbiens.

Conclusion

L'étude des microbiomes buccaux dans diverses populations humaines offre des insights précieux sur la façon dont les facteurs de mode de vie façonnent notre santé microbienne. En comparant des groupes divers au Népal, les chercheurs peuvent examiner les façons subtiles mais impactantes dont nos régimes et habitudes influencent les organismes qui vivent en nous.

À mesure que nous continuons à explorer les complexités de nos microbiomes, il est clair que notre environnement et nos choix jouent des rôles cruciaux. Cette recherche enrichit non seulement notre compréhension de la biologie humaine, mais souligne aussi l'importance de préserver des cultures et des modes de vie divers.

Pour l'avenir, des études plus complètes sont nécessaires pour suivre comment les changements de mode de vie, que ce soit en raison de la modernisation ou de changements alimentaires, affectent l'équilibre de nos communautés microbiennes. Ces insights seront essentiels pour les stratégies de santé futures visant à promouvoir une meilleure santé à travers une compréhension plus approfondie de nos écosystèmes microbiens uniques.

Source originale

Titre: Nepali oral microbiomes reflect a gradient of lifestyles from traditional to industrialized

Résumé: BackgroundLifestyle plays an important role in shaping the gut microbiome. However, its contributions to the oral microbiome remains less clear, due to the confounding effects of geography and methodology in investigations of populations studied to date. Furthermore, while the oral microbiome seems to differ between foraging and industrialized populations, we lack insight into whether transitions to and away from agrarian lifestyles shape the oral microbiota. Given the growing interest in so-called vanishing microbiomes potentially being a risk factor for increased disease prevalence in industrialized populations, it is important that we distinguish lifestyle from geography in the study of microbiomes across populations. ResultsHere, we investigate salivary microbiomes of 63 Nepali individuals representing a spectrum of lifestyles: foraging, subsistence farming (individuals that transitioned from foraging to farming within the last 50 years), agriculturalists (individuals that have transitioned to farming for at least 300 years), and industrialists (expatriates that immigrated to the United States within the last 20 years). We characterize the role of lifestyle in microbial diversity, identify microbes that differ between lifestyles, and pinpoint specific lifestyle factors that may be contributing to differences in the microbiomes across populations. Contrary to prevailing views, when geography is controlled for, oral microbiome alpha diversity does not differ significantly across lifestyles. Microbiome composition, however, follows the gradient of lifestyles from foraging through agrarianism to industrialism, supporting the notion that lifestyle indeed plays a role in the oral microbiome. Relative abundances of several individual taxa, including Streptobacillus and an unclassified Porphyromonadaceae genus, also mirror lifestyle. Finally, we identify specific lifestyle factors associated with microbiome composition across the gradient of lifestyles, including smoking and grain source. ConclusionOur findings demonstrate that by controlling for geography, we can isolate an important role for lifestyle in determining oral microbiome composition. In doing so, we highlight the potential contributions of several lifestyle factors, underlining the importance of carefully examining the oral microbiome across lifestyles to improve our understanding of global microbiomes.

Auteurs: Emily R Davenport, E. P. Ryu, Y. Gautam, D. M. Proctor, D. Bhandari, S. Tandukar, M. Gupta, G. P. Gautam, D. A. Relman, A. A. Shibl, J. B. Sherchand, A. R. Jha

Dernière mise à jour: 2024-07-03 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.01.601557

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.01.601557.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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