Aperçus génétiques sur le risque de cancer du poumon selon les origines
Une étude révèle de nouveaux marqueurs génétiques pour le cancer du poumon dans des populations diverses.
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Le cancer du poumon est un gros problème de santé et c'est la première cause de décès par cancer. Ça touche beaucoup de gens, surtout les hommes, et c'est le deuxième cancer le plus fréquent chez les femmes après le cancer du sein. Même si le tabagisme a diminué au fil des ans, le tabac reste un facteur majeur dans les cas de cancer du poumon, étant lié à plus de 80% des diagnostics. Même parmi les non-fumeurs, la génétique peut jouer un rôle dans le risque de développer un cancer du poumon.
Facteurs génétiques dans le cancer du poumon
Des recherches ont montré que certaines mutations génétiques peuvent augmenter la probabilité d'avoir un cancer du poumon. Les études d'association à l'échelle du génome (GWAS) aident à identifier ces facteurs de risque en examinant le génome entier de nombreuses personnes pour trouver des variations spécifiques courantes chez les gens atteints de cancer du poumon.
Des études ont mis en avant le rôle de gènes liés au système immunitaire, au cycle cellulaire et aux processus de réparation de l'ADN. Certains gènes, comme ceux liés aux récepteurs de la nicotine, peuvent aussi influencer des comportements qui conduisent au tabagisme, augmentant ainsi le risque de cancer du poumon. Bien que la recherche ait progressé dans l'identification des facteurs génétiques, déterminer quelles mutations sont directement responsables du cancer du poumon et celles influencées par des facteurs environnementaux reste compliqué.
Différences entre les groupes
Le cancer du poumon montre différents motifs génétiques parmi divers groupes ancestraux. Par exemple, les marqueurs génétiques liés au cancer du poumon dans les populations européennes et est-asiatiques ne se chevauchent pas beaucoup. Les études indiquent que la façon dont le cancer du poumon se développe peut varier en fonction de l'ascendance, avec des caractéristiques tumorales différentes observées dans ces groupes. Bien que certains gènes identifiés dans les populations européennes et est-asiatiques aient été confirmés dans de plus petites études de personnes d'ascendance africaine, aucun marqueur génétique spécifique pour l'ascendance africaine n'a encore été trouvé.
L'étude
Dans cette recherche, les variations génétiques liées au cancer du poumon ont été examinées à la fois dans l'ascendance européenne et dans la plus grande cohorte d'ascendance africaine à ce jour. L'étude a utilisé un grand groupe de vétérans, majoritairement des hommes, issus du Million Veteran Program. Étant donné que les hommes ont une incidence plus élevée de cancer du poumon et que de nombreux participants sont des fumeurs, cet ensemble de données est particulièrement précieux pour comprendre les risques génétiques impliqués.
Les chercheurs ont réalisé des GWAS pour tous les cas de cancer du poumon, ainsi que pour deux types courants : l'adénocarcinome et le carcinome à cellules squameuses. Ils ont trouvé de nombreux marqueurs génétiques associés au risque de cancer du poumon, confirmant plusieurs facteurs de risque déjà connus et découvrant de nouveaux.
Résultats dans l'ascendance européenne
L'analyse du groupe d'ascendance européenne a révélé des marqueurs génétiques significatifs. Un total de 26 marqueurs indépendants liés au risque de cancer du poumon ont été identifiés. Parmi eux, quatre étaient de nouvelles découvertes liées à des gènes spécifiques impliqués dans la croissance tumorale et les fonctions de réparation.
En examinant les deux types de cancer, adénocarcinome et carcinome à cellules squameuses, des variantes génétiques supplémentaires ont été trouvées qui n'avaient pas été rapportées auparavant. Il semble que certains gènes influencent spécifiquement le risque de différents types de cancer du poumon, indiquant un paysage génétique complexe.
Découvertes dans l'ascendance africaine
Dans la cohorte d'ascendance africaine, deux marqueurs génétiques significatifs ont été identifiés. Un marqueur bien connu, CHRNA5, a été confirmé dans les populations africaines. Les chercheurs ont également découvert un marqueur génétique potentiellement nouveau lié à un long ARN non codant, qui pourrait jouer un rôle dans le risque de cancer du poumon. Cependant, aucune association significative n'a été trouvée pour les types spécifiques de cancer du poumon dans cette cohorte.
Les résultats soulignent le besoin de plus d'études dans les populations africaines. Des recherches plus approfondies pourraient aider à clarifier les facteurs génétiques contribuant au risque de cancer du poumon dans ces groupes.
Analyse combinée
En combinant les résultats des deux groupes d'ascendance, les chercheurs ont identifié de nouveaux marqueurs génétiques associés au cancer du poumon. Cette analyse multi-ascendante a aidé à confirmer plusieurs marqueurs déjà connus et à en révéler de nouveaux, soulignant l'importance des ensembles de données grands et divers dans la recherche génétique.
Scores de risque polygénétiques
Pour mieux comprendre le risque de cancer du poumon, les chercheurs ont créé des scores de risque polygénétiques (PRS) basés sur leurs découvertes. Ces scores indiquent le risque génétique d'un individu de développer un cancer du poumon. Les scores étaient liés non seulement au risque de cancer du poumon mais aussi aux comportements de tabagisme, suggérant que certains facteurs génétiques peuvent influencer les habitudes de fumer.
Le score a montré que les individus avec des scores de risque plus élevés étaient significativement plus susceptibles de développer un cancer du poumon, peu importe leur statut de fumeur. Cela indique que les facteurs génétiques peuvent jouer un rôle crucial même chez les non-fumeurs.
Le rôle du tabagisme
Bien que le tabagisme soit la principale cause de cancer du poumon, ses effets peuvent obscurcir la compréhension génétique de la maladie. L'étude a analysé comment le comportement de fumer influence les facteurs génétiques associés au cancer du poumon. En ajustant pour le statut de fumeur, les chercheurs ont cherché à réduire tout biais qui pourrait affecter les résultats.
Cette approche a révélé que lorsque le tabagisme est pris en compte, la contribution apparente de certains facteurs génétiques peut changer considérablement. Notamment, certaines associations génétiques sont devenues plus claires quand le tabagisme était pris en compte, suggérant que ces facteurs pourraient être importants pour comprendre le risque de cancer du poumon.
Associations avec d'autres problèmes de santé
La recherche a également examiné comment le risque de cancer du poumon est lié à d'autres problèmes de santé. En utilisant le PRS, les chercheurs ont trouvé des associations avec divers traits et maladies. Ils ont noté des liens significatifs avec le cancer de la peau et certains traits métaboliques, indiquant que la génétique du risque de cancer du poumon pourrait avoir des implications plus larges pour d'autres problèmes de santé.
Fait intéressant, certaines conditions métaboliques, comme le diabète de type 2 et l'obésité, ont montré une corrélation protectrice lorsque les effets du tabagisme ont été éliminés. Cela suggère que le tabagisme peut fausser la relation entre le cancer du poumon et ces traits métaboliques.
Conclusion
Cette étude souligne l'importance de la recherche génétique pour comprendre le risque de cancer du poumon. Elle identifie de nouveaux marqueurs génétiques associés à la maladie à travers différents groupes ancestraux, renforçant la complexité de la génétique du cancer du poumon. Les résultats suggèrent que, bien que le tabagisme soit un facteur de risque significatif, de nombreuses influences génétiques sont en jeu, qui peuvent varier parmi différentes populations.
En démêlant les facteurs génétiques et environnementaux contribuant au cancer du poumon, les chercheurs peuvent améliorer les modèles d'évaluation des risques et potentiellement améliorer les processus de dépistage pour les fumeurs et les non-fumeurs. L'approche adoptée dans cette étude illustre le besoin de données plus larges et plus diversifiées pour découvrir les subtilités génétiques de maladies comme le cancer du poumon.
Les efforts de recherche en cours seront cruciaux pour identifier des marqueurs génétiques plus spécifiques et comprendre leurs rôles dans le développement du cancer du poumon. En fin de compte, cette connaissance pourrait mener à de meilleures stratégies de prévention et de traitement, potentiellement sauver des vies à l'avenir.
Titre: Multi-ancestry meta-analyses of lung cancer in the Million Veteran Program reveal novel risk loci and elucidate smoking-independent genetic risk
Résumé: Lung cancer remains the leading cause of cancer mortality, despite declines in smoking rates. Previous lung cancer genome-wide association studies (GWAS) have identified numerous loci, but separating the genetic risks of lung cancer and smoking behavioral susceptibility remains challenging. We performed multi-ancestry GWAS meta-analyses of lung cancer using the Million Veteran Program (MVP) cohort and a previous study of European-ancestry individuals, comprising 42,102 cases and 181,270 controls, followed by replication in an independent cohort of 19,404 cases and 17,378 controls. We further performed conditional meta-analyses on cigarettes per day and identified two novel, replicated loci, including the 19p13.11 pleiotropic cancer locus in LUSC. Overall, we report twelve novel risk loci for overall lung cancer, lung adenocarcinoma (LUAD), and squamous cell lung carcinoma (LUSC), nine of which were externally replicated. Finally, we performed phenome-wide association studies (PheWAS) on polygenic risk scores (PRS) for lung cancer, with and without conditioning on smoking. The unconditioned lung cancer PRS was associated with smoking status in controls, illustrating reduced predictive utility in non-smokers. Additionally, our PRS demonstrates smoking-independent pleiotropy of lung cancer risk across neoplasms and metabolic traits.
Auteurs: Saiju Pyarajan, B. R. Gorman, S.-G. Ji, M. Francis, A. K. Sendamarai, Y. Shi, P. Devineni, U. Saxena, E. Partan, A. K. DeVito, J. Byun, Y. Han, X. Xiao, D. D. Sin, W. Timens, J. Moser, S. Muralidhar, R. Ramoni, R. J. Hung, J. D. Mckay, Y. Bosse, R. Sun, C. Amos, VA Million Veteran Program
Dernière mise à jour: 2024-04-26 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.04.25.24306313
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.04.25.24306313.full.pdf
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