Aligner des Transformers avec des Graphes pour une Performance Améliorée
Une approche novatrice pour intégrer des transformateurs avec des structures de graphes pour de meilleurs résultats.
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Table des matières
- Contexte
- Réseaux de Neurones Graphiques (GNN)
- Algorithme de Weisfeiler-Leman
- Transformation des Graphes avec des Transformateurs
- Alignement des Transformateurs avec la Hiérarchie de Weisfeiler-Leman
- Améliorer l'Expressivité
- Considérations Pratiques
- Méthodologie
- Développer un Cadre Théorique
- Tokenisation des Données de Graphe
- Mise en œuvre des Modèles Proposés
- Architecture des Transformateurs
- Encodages Positionnels au Niveau des Nœuds
- Transfert de Poids Efficace
- Évaluation Expérimentale
- Sélection des Données
- Pré-entraînement et Ajustement
- Références et Comparaisons
- Résultats
- Performance sur des Ensembles de Données Moléculaires
- Scalabilité et Efficacité
- Conclusion
- Travaux Futurs
- Source originale
- Liens de référence
Ces dernières années, le domaine de l'apprentissage automatique a connu une croissance rapide, surtout avec l'utilisation des modèles de Transformateurs. Ces modèles sont devenus populaires grâce à leur capacité à bien fonctionner avec différents types de données, y compris les images, les textes et les graphes. Les graphes sont des structures qui se composent de nœuds (ou sommets) et de connexions entre eux (arêtes). Ils sont utilisés pour représenter de nombreux problèmes du monde réel, comme les réseaux sociaux ou les structures moléculaires.
Cependant, utiliser des transformateurs avec des graphes n'est pas si simple. Les modèles de graphes traditionnels, connus sous le nom de Réseaux de neurones graphiques (GNN), ont souvent du mal à capturer des relations complexes dans les données. Ils comptent généralement sur des informations locales, ce qui limite leur efficacité à reconnaître différentes structures de graphes.
Cet article vise à combler le fossé entre les transformateurs et les graphes en explorant des moyens d'aligner les architectures de transformateurs avec une méthode particulière connue sous le nom de hiérarchie de Weisfeiler-Leman (WL). Cette hiérarchie aide à distinguer les différentes structures de graphes, améliorant ainsi l'expressivité des modèles qui l'appliquent.
Contexte
Réseaux de Neurones Graphiques (GNN)
Les réseaux de neurones graphiques sont conçus pour traiter des données qui peuvent être représentées sous forme de graphes. Ils fonctionnent en agrégeant des informations des nœuds voisins à chaque nœud, leur permettant d'apprendre des représentations utiles de ces nœuds. Cependant, la nature locale de cette approche peut poser des défis pour distinguer des graphes qui ne sont pas structurellement identiques, connus sous le nom de graphes non-isomorphes.
Algorithme de Weisfeiler-Leman
L'algorithme de Weisfeiler-Leman est une méthode utilisée pour tester si deux graphes sont isomorphes, ce qui signifie qu'ils peuvent être transformés l'un dans l'autre par un re-étiquetage de leurs nœuds. Cet algorithme colore de manière itérative les nœuds des graphes et affine ces couleurs en fonction de leurs voisins. La version k-dimensionnelle de cet algorithme étend cette idée aux tuples de nœuds, améliorant la capacité à différencier des structures de graphes plus complexes.
Transformation des Graphes avec des Transformateurs
Les transformateurs ont montré un grand succès dans diverses tâches d'apprentissage automatique grâce à leur capacité à apprendre de la structure globale des données. Ils utilisent un mécanisme d'attention pour se concentrer sur différentes parties de l'entrée, leur permettant de capturer des dépendances à long terme. Cependant, appliquer les transformateurs directement aux données de graphes a présenté des défis, principalement en raison de la nécessité d'encodages spécifiques aux graphes et des exigences de calcul associées aux mécanismes d'auto-attention.
Alignement des Transformateurs avec la Hiérarchie de Weisfeiler-Leman
Un point clé de cette discussion est l'alignement des transformateurs avec la hiérarchie de Weisfeiler-Leman. Cet alignement vise à améliorer l'expressivité des transformateurs lorsqu'ils sont appliqués aux données de graphes en tirant parti des fondements théoriques de l'algorithme WL.
Améliorer l'Expressivité
On propose des méthodes pour améliorer l'expressivité des modèles de transformateurs qui adhèrent de près à la hiérarchie de Weisfeiler-Leman. Ce faisant, on peut obtenir de meilleures performances sur des tâches liées aux graphes. Cette amélioration peut être cruciale pour des applications telles que la prédiction de propriétés moléculaires, où des représentations précises des structures chimiques sont essentielles.
Considérations Pratiques
Malgré les avantages théoriques d'aligner les transformateurs avec la hiérarchie WL, des problèmes pratiques tels que l'utilisation de la mémoire et la complexité du temps d'exécution persistent. Les exigences de calcul lourdes des transformateurs standard peuvent limiter leur évolutivité lorsqu'il s'agit de données de graphes à grande échelle. Par conséquent, il est nécessaire de trouver des implémentations pratiques qui peuvent utiliser ces modèles de manière efficace.
Méthodologie
Développer un Cadre Théorique
Pour aligner les transformateurs avec la hiérarchie de Weisfeiler-Leman, on établit un cadre théorique qui permet d'évaluer les encodages positionnels et leur impact sur la performance du modèle. On explore des méthodes d'encodage établies qui peuvent améliorer les capacités d'apprentissage des architectures basées sur des transformateurs lorsque celles-ci sont appliquées à la structure des graphes.
Tokenisation des Données de Graphe
Un aspect critique de notre approche implique la tokenisation des données de graphes d'une manière qui respecte la hiérarchie WL. Cette tokenisation non seulement capture l'information structurelle du graphe, mais facilite aussi la capacité du transformateur à traiter les données efficacement. Une attention particulière est accordée à s'assurer que les embeddings résultants sont distinguables en fonction de leurs connexions ou relations au sein du graphe.
Mise en œuvre des Modèles Proposés
Architecture des Transformateurs
Notre architecture de transformateur proposée se compose de plusieurs couches qui intègrent des informations positionnelles avec la structure du graphe. Chaque couche est conçue pour mettre à jour les embeddings des nœuds en fonction des relations définies par les arêtes, tirant parti du mécanisme d'auto-attention pour capturer le contexte nécessaire.
Encodages Positionnels au Niveau des Nœuds
On se concentre sur deux types d'encodages positionnels : les encodages positionnels laplaciens (LPE) et les encodages positionnels structurels (SPE). Ces encodages améliorent la capacité du modèle à reconnaître l'importance des nœuds individuels et leurs rôles dans la structure globale.
Transfert de Poids Efficace
Pour rendre le modèle plus pratique, on incorpore une méthode connue sous le nom de transfert d'ordre. Cela permet aux modèles pré-entraînés d'être ajustés pour des tâches de graphes d'ordre supérieur. En réutilisant des poids de modèles d'ordre inférieur, l'efficacité de l'entraînement est améliorée, réduisant le temps et les ressources nécessaires pour atteindre une performance compétitive.
Évaluation Expérimentale
Sélection des Données
Pour nos expériences, on utilise des ensembles de données établis qui représentent diverses tâches d'apprentissage graphique. Notamment, on se concentre sur des ensembles de données moléculaires, où les propriétés des molécules peuvent être prédites en fonction de leurs représentations structurelles.
Pré-entraînement et Ajustement
On adopte une approche en deux étapes : pré-entraînement du modèle sur un grand ensemble de données pour capturer des caractéristiques générales des graphes, puis ajustement sur des tâches spécifiques pour affiner sa performance. Cette méthode permet d'utiliser efficacement les poids pré-entraînés, améliorant la capacité du modèle à se généraliser à travers différentes structures de graphes.
Références et Comparaisons
Pour évaluer l'efficacité de nos modèles proposés, on compare leur performance avec des bases solides, y compris des GNN traditionnels et des transformateurs de graphes qui utilisent des mécanismes d'attention modifiés. Grâce à un benchmarking systématique, on démontre que nos modèles obtiennent des résultats compétitifs tout en répondant également aux préoccupations pratiques concernant le temps d'exécution et l'utilisation de la mémoire.
Résultats
Performance sur des Ensembles de Données Moléculaires
Nos modèles montrent des résultats prometteurs sur divers ensembles de données moléculaires. On observe des améliorations significatives de la performance prédictive, surtout lors de l'ajustement sur des tâches de données plus petites. Cela valide l'efficacité de notre alignement avec la hiérarchie de Weisfeiler-Leman et des méthodes d'encodage mises en œuvre.
Scalabilité et Efficacité
On examine aussi la scalabilité de nos modèles de transformateurs lorsqu'ils sont appliqués à des ensembles de données plus importants. L'efficacité de notre approche est évidente, car on parvient à maintenir une performance compétitive sans des exigences de ressources prohibitivement élevées.
Conclusion
Dans cet article, on a présenté une approche pour aligner les modèles de transformateurs avec la hiérarchie de Weisfeiler-Leman, améliorant ainsi leur expressivité et leur applicabilité aux données de graphes. En développant un cadre théorique, en raffinant les méthodes de tokenisation et en mettant en œuvre des encodages positionnels efficaces, on a jeté les bases pour de futures recherches dans ce domaine.
L'application réussie de ces techniques à la prédiction de propriétés moléculaires montre le potentiel des transformateurs dans les tâches d'apprentissage graphique. À mesure que l'on continue d'explorer et de peaufiner ces modèles, on anticipe d'autres avancées dans leurs performances et leur efficacité, ouvrant la voie à leur utilisation dans une variété d'applications du monde réel.
Travaux Futurs
En regardant vers l'avenir, il y a plusieurs avenues pour de futures recherches. On peut explorer des encodages spécifiques aux graphes supplémentaires et leur impact sur la performance des transformateurs. De plus, étudier comment ces modèles peuvent s'adapter à différentes structures et propriétés de graphes sera crucial. En avançant notre compréhension et notre mise en œuvre des transformateurs de graphes, on peut débloquer leur plein potentiel dans le domaine de l'apprentissage automatique.
Titre: Aligning Transformers with Weisfeiler-Leman
Résumé: Graph neural network architectures aligned with the $k$-dimensional Weisfeiler--Leman ($k$-WL) hierarchy offer theoretically well-understood expressive power. However, these architectures often fail to deliver state-of-the-art predictive performance on real-world graphs, limiting their practical utility. While recent works aligning graph transformer architectures with the $k$-WL hierarchy have shown promising empirical results, employing transformers for higher orders of $k$ remains challenging due to a prohibitive runtime and memory complexity of self-attention as well as impractical architectural assumptions, such as an infeasible number of attention heads. Here, we advance the alignment of transformers with the $k$-WL hierarchy, showing stronger expressivity results for each $k$, making them more feasible in practice. In addition, we develop a theoretical framework that allows the study of established positional encodings such as Laplacian PEs and SPE. We evaluate our transformers on the large-scale PCQM4Mv2 dataset, showing competitive predictive performance with the state-of-the-art and demonstrating strong downstream performance when fine-tuning them on small-scale molecular datasets. Our code is available at https://github.com/luis-mueller/wl-transformers.
Auteurs: Luis Müller, Christopher Morris
Dernière mise à jour: 2024-06-05 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2406.03148
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2406.03148
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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