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Amélioration de la segmentation du placenta en échographie 3D

La segmentation interactive améliore la précision de l'imagerie placentaire pour de meilleurs résultats de grossesse.

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Mesurer la taille du placenta avec des images d'échographie 3D est super important pour comprendre les résultats de la grossesse. En général, on obtient ces mesures en regardant manuellement les images et en marquant le placenta, mais ça prend beaucoup de temps et ça nécessite des experts. Il existe des méthodes automatiques qui essaient de segmenter le placenta à partir des images, mais ça ne fonctionne pas toujours bien. C'est problématique quand les images sont bruyantes ou floues. Récemment, de nouveaux modèles inspirés des techniques de segmentation précédentes ont été créés pour aider à l'imagerie médicale. Ces modèles permettent aux utilisateurs de donner des indices visuels pour aider à définir les zones sur lesquelles ils veulent se concentrer. Cependant, aucun de ces modèles n'a été conçu à l'origine pour les images d'échographie 3D ou pour les défis uniques qu'elles posent.

Le Problème

La technique d'imagerie par échographie 3D peut montrer le placenta, mais les images sont souvent bruyantes, ce qui rend difficile de voir les détails clairement. C'est particulièrement vrai au début de la grossesse, quand le placenta et les tissus environnants se ressemblent. Les contractions utérines peuvent aussi changer l'apparence des images. À cause de ces soucis, obtenir des segmentations claires et précises du placenta reste un vrai défi.

Méthodes Actuelles

De nombreux outils ont été développés au fil des années pour comprendre et analyser les images d'échographie 3D. Certains d'entre eux utilisent plusieurs images étiquetées existantes pour aider à créer de nouvelles segmentations. Récemment, les méthodes d'apprentissage profond ont montré beaucoup de promesse, mais elles peuvent encore avoir du mal avec des images de mauvaise qualité. Les programmes informatiques ne parviennent pas toujours à trouver les bords du placenta avec Précision dans des conditions difficiles.

C'est là que les techniques de Segmentation interactive peuvent être utiles. Ces méthodes peuvent s'adapter à la nature unique de chaque image. Elles aident aussi les utilisateurs à créer des ensembles de données plus grands, nécessaires pour entraîner des systèmes automatisés. Un système créé par GE-Healthcare combine l'entrée de l'utilisateur avec une série d'algorithmes pour mieux segmenter les images.

Segmentation Interactive

Une méthode de segmentation interactive permet aux utilisateurs de donner des indications sous plusieurs formes, comme des points ou des gribouillis, pour montrer où se trouve le placenta. Le système utilise ensuite ces informations avec ses données entraînées pour améliorer les résultats de segmentation. Beaucoup de ces méthodes visent à être à la fois efficaces et efficientes. Un bon système donnera des résultats utiles avec le moins d'entrées utilisateur possible. Cependant, certaines méthodes existantes n'ont pas réussi à maintenir des segmentations cohérentes ou robustes.

L'Approche PRISM

On a utilisé un modèle particulier appelé PRISM pour cette tâche. Ce modèle permet aux utilisateurs d'entrer des prompts visuels et s'appuie sur un mélange de plusieurs techniques pour améliorer sa précision. Il a été conçu pour recevoir des retours des utilisateurs, permettant au modèle d'apprendre et de s'adapter à chaque interaction. Pour nos tests, on a utilisé un nombre spécifique d'itérations et de prompts pour voir à quel point PRISM pouvait segmenter le placenta dans les images d'échographie 3D.

Matériaux et Méthodes

Les données pour notre étude venaient d'images d'échographie 3D collectées chez des femmes au début de leur grossesse. Les images ont été traitées pour standardiser leur taille et leur qualité. On a créé un ensemble d'entraînement, un ensemble de validation et un ensemble de test à partir de ces images. Les méthodes qu'on a employées comprenaient l'ajustement des intensités d'image et l'ajout de variations pour un meilleur entraînement.

Génération de Prompts Visuels

Le modèle PRISM accepte une variété d'entrées visuelles, y compris des points, des boîtes et des gribouillis. On a créé ces prompts en échantillonnant les régions identifiées comme faux négatifs (zones mal identifiées) et faux positifs (zones mal comptées). L'entrée initiale consistait principalement en prompts positifs pour indiquer la zone d'intérêt.

Résultats

Après avoir effectué nos tests, on a comparé l'efficacité de PRISM avec d'autres modèles existants. On s'est concentré sur divers métriques pour évaluer la Performance, y compris le score Dice, qui indique à quel point nos résultats correspondaient aux véritables frontières du placenta. Le score Dice idéal est de 0,95. Nos résultats ont montré que PRISM a atteint cette norme avec seulement quelques itérations.

Analyse de Performance

Le modèle PRISM a montré des résultats efficaces, en particulier en utilisant des gribouillis comme prompts. On a aussi remarqué que le modèle performait mieux quand les prompts étaient créés dans certaines orientations et avec différents types de gribouillis. Cela a montré que la façon dont les prompts sont fournis peut significativement affecter le résultat.

Efficacité avec Moins de Prompts

Quand on a testé le modèle avec moins de prompts, on a constaté qu'il pouvait quand même bien fonctionner. Le besoin de moins d'entrées utilisateur rend PRISM plus pratique pour des applications réelles. Les données indiquent qu même avec des prompts rares, le modèle pouvait rapidement atteindre les niveaux de performance cible. C'est prometteur pour une utilisation future dans des milieux médicaux où le temps et l'efficacité sont critiques.

Comparaison avec D'autres Modèles

Dans nos comparaisons avec d'autres méthodes, PRISM a montré des avantages clairs. Bien que certaines méthodes automatiques aient montré des résultats décents, elles ont souvent échoué dans des conditions difficiles, comme des images de mauvaise qualité avec beaucoup de bruit. PRISM, en revanche, s'est bien adapté à ces défis et a maintenu un niveau de précision plus élevé.

Discussion

Notre évaluation du modèle PRISM a mis en évidence son efficacité dans le domaine de la segmentation du placenta à partir d'images d'échographie 3D. La nature interactive du système permet des mises à jour et des améliorations rapides basées sur les prompts des utilisateurs, ce qui le rend adapté à une utilisation pratique.

Directions Futures

À l'avenir, on vise à améliorer encore la performance du modèle en mettant en œuvre des techniques d'entraînement encore plus avancées. Cela pourrait inclure l'utilisation de modèles pré-entraînés pour améliorer l'efficacité et explorer d'autres types de prompts visuels que les utilisateurs peuvent fournir. Notre objectif est de s'assurer que le système reste facile à utiliser tout en délivrant des résultats de haute qualité.

En se concentrant sur la création d'un modèle qui fonctionne bien avec des entrées limitées, l'approche PRISM pourrait ouvrir la voie à de nouveaux outils dans l'imagerie médicale, facilitant aux professionnels de santé l'évaluation précise et rapide des grossesses.

Conclusion

En résumé, la tâche de segmenter le placenta à partir d'images d'échographie 3D pose plusieurs défis. Cependant, notre travail avec le modèle PRISM montre que les techniques de segmentation interactive peuvent offrir des solutions efficaces et pratiques. En permettant l'entrée des utilisateurs et en s'adaptant aux besoins spécifiques de chaque image, PRISM s'est révélé être un outil précieux pour améliorer la précision de l'imagerie médicale. Alors qu'on continue à affiner cette technologie, on pense qu'elle peut significativement aider à de meilleures évaluations de grossesse et, en fin de compte, conduire à de meilleurs résultats pour les mamans et leurs bébés.

Source originale

Titre: Interactive Segmentation Model for Placenta Segmentation from 3D Ultrasound images

Résumé: Placenta volume measurement from 3D ultrasound images is critical for predicting pregnancy outcomes, and manual annotation is the gold standard. However, such manual annotation is expensive and time-consuming. Automated segmentation algorithms can often successfully segment the placenta, but these methods may not consistently produce robust segmentations suitable for practical use. Recently, inspired by the Segment Anything Model (SAM), deep learning-based interactive segmentation models have been widely applied in the medical imaging domain. These models produce a segmentation from visual prompts provided to indicate the target region, which may offer a feasible solution for practical use. However, none of these models are specifically designed for interactively segmenting 3D ultrasound images, which remain challenging due to the inherent noise of this modality. In this paper, we evaluate publicly available state-of-the-art 3D interactive segmentation models in contrast to a human-in-the-loop approach for the placenta segmentation task. The Dice score, normalized surface Dice, averaged symmetric surface distance, and 95-percent Hausdorff distance are used as evaluation metrics. We consider a Dice score of 0.95 a successful segmentation. Our results indicate that the human-in-the-loop segmentation model reaches this standard. Moreover, we assess the efficiency of the human-in-the-loop model as a function of the amount of prompts. Our results demonstrate that the human-in-the-loop model is both effective and efficient for interactive placenta segmentation. The code is available at \url{https://github.com/MedICL-VU/PRISM-placenta}.

Auteurs: Hao Li, Baris Oguz, Gabriel Arenas, Xing Yao, Jiacheng Wang, Alison Pouch, Brett Byram, Nadav Schwartz, Ipek Oguz

Dernière mise à jour: 2024-07-10 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2407.08020

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.08020

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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