Une nouvelle méthode améliore l'analyse d'imagerie cérébrale
MSIVA simplifie les données d'imagerie cérébrale, révélant des liens avec le comportement et les problèmes de santé.
Xinhui Li, P. Kochunov, T. Adali, R. F. Silva, V. Calhoun
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Table des matières
L'imagerie cérébrale, c'est un moyen de jeter un œil à la structure du cerveau et à son fonctionnement. Ça aide les scientifiques à voir comment le cerveau est lié au comportement. Des techniques comme l'IRM (imagerie par résonance magnétique) sont utilisées, mais gérer les données peut être compliqué. Les données IRM peuvent être super complexes, car elles incluent des milliers de petites unités appelées voxels. Cependant, les chercheurs ont découvert que, même si les données semblent compliquées, leur vraie complexité peut être beaucoup plus simple.
Des recherches récentes ont montré que, dans certains cas, des groupes de neurones forment des motifs qui influencent comment on bouge ou pense. Ces motifs aident pour des actions comme atteindre quelque chose ou prendre des décisions. Donc, c'est crucial de créer des modèles qui peuvent apprendre les motifs plus simples dans ces données complexes. Différents types de techniques d'imagerie fournissent diverses informations sur le cerveau. Par exemple, l'IRM structurale donne des images détaillées de l'anatomie cérébrale, mais ne montre pas les changements dans le temps. D'un autre côté, l'IRM fonctionnelle suit le flux sanguin dans le cerveau, montrant l'activité mais avec moins de détails.
Combiner les infos de l'IRM structurale et fonctionnelle donne une vue plus complète du cerveau. À mesure que les chercheurs ont accès à plus de données de diverses techniques d'imagerie, il devient important de développer des méthodes qui peuvent analyser cette info avec précision.
Méthodes pour Analyser les Données d'Imagerie Cérébrale
Les scientifiques ont trouvé plusieurs méthodes pour analyser des données issues de différentes techniques d'imagerie. Parmi les méthodes populaires, on trouve l'analyse des composants indépendants conjointe, l'analyse vectorielle indépendante, et l'analyse de corrélation canonique. Une méthode plus récente, appelée Analyse Indépendante de Sous-Espaces Multidataset (MISA), combine différents modèles pour découvrir des motifs cachés dans les données cérébrales.
MISA peut révéler des données importantes à la fois des IRM structurelles et fonctionnelles. Une amélioration récente sur MISA, appelée Analyse de Vecteurs Indépendants Multimodaux (MMIVA), vise à trouver des connexions entre différents motifs cérébraux à travers divers types de données. Cependant, MMIVA a quelques problèmes. Elle suppose que les motifs cérébraux sont simples et indépendants, ce qui n'est pas toujours vrai.
Pour remédier à ces limitations, une nouvelle méthode appelée Analyse de Vecteurs Indépendants de Sous-Espaces Multimodaux (MSIVA) a été introduite. MSIVA s'appuie sur MMIVA en permettant des relations plus complexes entre les motifs cérébraux et en identifiant des sources d'informations uniques à partir de différents types de données. MSIVA peut capturer les connexions entre les motifs à travers différentes techniques d'imagerie et cherche aussi des motifs distincts propres à chaque technique.
Évaluation de MSIVA
Pour voir comment MSIVA fonctionne, des comparaisons ont été faites avec d'autres approches en utilisant des Données synthétiques qui simulent de vraies données cérébrales. L'objectif était de vérifier si MSIVA pouvait identifier avec précision les motifs cachés dans ces données synthétiques. Ensuite, MSIVA a été testé sur deux grands ensembles de données d'imagerie cérébrale réelles. Le premier ensemble de données venait du UK Biobank, qui inclut des infos de santé et des scans cérébraux de nombreux participants. Le deuxième ensemble de données comprenait des patients atteints de schizophrénie.
Les résultats ont montré que MSIVA pouvait trouver des relations cachées mieux que les autres méthodes testées. Dans les données synthétiques comme réelles, MSIVA a fourni des aperçus plus clairs sur les fonctions du cerveau et comment elles sont liées au comportement.
Lien entre les Motifs Cérébraux et le Comportement
Après avoir utilisé MSIVA pour identifier les motifs cérébraux, l'étape suivante était de voir comment ces motifs étaient liés à différentes caractéristiques des individus, comme l'âge et le diagnostic de conditions de santé. Pour les données du UK Biobank, les résultats ont indiqué que certaines zones du cerveau étaient étroitement associées au vieillissement, et d'autres à des différences de genre.
Dans l'ensemble de données des patients, des analyses similaires ont trouvé des connexions entre les motifs cérébraux et la présence de schizophrénie. Cela montre comment MSIVA peut révéler des liens importants entre la fonction cérébrale et des traits de santé clés.
Exploration des Différences d'Âge Cérébral
Une des analyses intéressantes réalisées a été de regarder le "écart d'âge cérébral". Ce concept fait référence à la comparaison entre l'âge du cerveau d'une personne, comme indiqué par les données d'imagerie, et son âge chronologique réel. Comprendre cet écart aide les chercheurs à identifier des facteurs qui peuvent influencer la santé cérébrale.
Dans l'analyse, on a trouvé que des choix de style de vie comme le temps passé devant la télé ou l'activité physique pouvaient affecter l'écart d'âge cérébral. Les personnes qui faisaient plus d'exercice avaient tendance à avoir un cerveau qui semblait plus jeune, tandis qu'un temps plus élevé devant la télé était associé à un cerveau paraissant plus vieux.
Conclusion
En résumé, la nouvelle méthode MSIVA fournit un outil puissant pour les chercheurs étudiant le cerveau. En révélant des motifs complexes dans les données d'imagerie cérébrale, MSIVA aide à lier ces motifs à divers traits et conditions de santé. Cette connaissance peut mener à de meilleures compréhensions de la santé cérébrale, du vieillissement et des conditions psychologiques. À mesure que davantage de données d'imagerie cérébrale deviennent disponibles, des méthodes comme MSIVA seront essentielles pour aider les chercheurs à comprendre le fonctionnement complexe du cerveau humain.
Titre: Multimodal subspace independent vector analysis effectively captures the latent relationships between brain structure and function
Résumé: A key challenge in neuroscience is to understand the structural and functional relationships of the brain from high-dimensional, multimodal neuroimaging data. While conventional multivariate approaches often simplify statistical assumptions and estimate one-dimensional independent sources shared across modalities, the relationships between true latent sources are likely more complex - statistical dependence may exist within and between modalities, and span one or more dimensions. Here we present Multimodal Subspace Independent Vector Analysis (MSIVA), a methodology to capture both joint and unique vector sources from multiple data modalities by defining both cross-modal and unimodal subspaces with variable dimensions. In particular, MSIVA enables flexible estimation of varying-size independent subspaces within modalities and their one-to-one linkage to corresponding sub-spaces across modalities. As we demonstrate, a main benefit of MSIVA is the ability to capture subject-level variability at the voxel level within independent subspaces, contrasting with the rigidity of traditional methods that share the same independent components across subjects. We compared MSIVA to a unimodal initialization baseline and a multimodal initialization baseline, and evaluated all three approaches with five candidate subspace structures on both synthetic and neuroimaging datasets. We show that MSIVA successfully identified the ground-truth subspace structures in multiple synthetic datasets, while the multimodal baseline failed to detect high-dimensional subspaces. We then demonstrate that MSIVA better detected the latent subspace structure in two large multimodal neuroimaging datasets including structural MRI (sMRI) and functional MRI (fMRI), compared with the unimodal baseline. From subsequent subspace-specific canonical correlation analysis, brain-phenotype prediction, and voxelwise brain-age delta analysis, our findings suggest that the estimated sources from MSIVA with optimal subspace structure are strongly associated with various phenotype variables, including age, sex, schizophrenia, lifestyle factors, and cognitive functions. Further, we identified modality- and group-specific brain regions related to multiple phenotype measures such as age (e.g., cerebellum, precentral gyrus, and cingulate gyrus in sMRI; occipital lobe and superior frontal gyrus in fMRI), sex (e.g., cerebellum in sMRI, frontal lobe in fMRI, and precuneus in both sMRI and fMRI), schizophrenia (e.g., cerebellum, temporal pole, and frontal operculum cortex in sMRI; occipital pole, lingual gyrus, and precuneus in fMRI), shedding light on phenotypic and neuropsychiatric biomarkers of linked brain structure and function.
Auteurs: Xinhui Li, P. Kochunov, T. Adali, R. F. Silva, V. Calhoun
Dernière mise à jour: 2024-10-22 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.17.558092
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.17.558092.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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