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# Ciencias de la Salud# Medicina Genética y Genómica

Se encontraron variantes diversas de CFTR entre diferentes grupos étnicos

Un estudio revela la diversidad en las variantes de CFTR que afectan el diagnóstico y tratamiento de la fibrosis quística.

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La Fibrosis quística (FQ) es una condición genética seria que afecta muchas partes del cuerpo, especialmente los pulmones. Es causada por cambios en un gen llamado regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística (CFTR). Estos cambios pueden llevar a que se forme un moco espeso y pegajoso en los pulmones y el sistema digestivo, causando una serie de problemas de salud. Aunque hay tratamientos disponibles que abordan los problemas causados por los cambios en el gen CFTR, solo están aprobados para algunas formas de la mutación genética. Incluso entre aquellos que son elegibles, las respuestas al tratamiento pueden variar mucho.

Entendimiento Actual de las Variantes de CFTR

Recientes avances en la tecnología genética han identificado muchos cambios en el gen que causan FQ en personas de ascendencia europea. Sin embargo, sabemos mucho menos sobre cómo se distribuyen estos cambios entre personas de otros orígenes. Entender los diferentes tipos de variantes de CFTR en diversas poblaciones podría mejorar cómo diagnosticamos la FQ y permitir que más personas accedan a terapias personalizadas.

La investigación se ha centrado principalmente en personas con FQ de ascendencia europea, ya que la condición es mucho más común en este grupo. Las posibilidades de nacer con FQ son aproximadamente 1 en 3,000 para aquellos de ascendencia europea, pero mucho más bajas en otros grupos étnicos, como 1 en 15,000 para los africanos y 1 en 35,000 para los asiáticos.

A nivel global, se piensa que alrededor de 100,000 personas tienen FQ, siendo la mutación más común la F508del. Sin embargo, estudios emergentes sugieren que las variantes del gen CFTR pueden diferir significativamente entre orígenes étnicos. Algunas variantes, como 3120+1G>A en africanos o p.G970D en individuos chinos, son menos conocidas pero potencialmente importantes para entender la FQ en estos grupos.

Desafíos en el Diagnóstico de la FQ

Diagnosticar la FQ generalmente implica una prueba de sudor, que mide los niveles de sal en el sudor, y pruebas genéticas para variantes de CFTR. Las pruebas genéticas pueden identificar tanto a personas sintomáticas como a aquellas que pueden desarrollar síntomas más tarde. Sin embargo, depender solo de los síntomas puede retrasar el diagnóstico, lo que puede empeorar los resultados de salud. Un diagnóstico temprano permite una intervención oportuna, lo cual es crucial para manejar la FQ de manera efectiva.

Un problema significativo surge cuando las personas tienen variantes raras de CFTR que no están incluidas en los paneles de pruebas estándar. Esto puede llevar a un diagnóstico tardío para esas personas y afectar negativamente su salud general.

La Importancia de Caracterizar las Variantes de CFTR

Determinar con precisión qué variantes de CFTR son críticas para la salud puede ser complicado. Las variantes pueden afectar a las personas de manera diferente, incluso entre aquellos con el mismo cambio genético. Los esfuerzos para catalogar las variantes de CFTR han identificado más de 2,100 cambios diferentes. Sin embargo, incluso con este progreso, no todas las variantes potencialmente dañinas están bien entendidas. Análisis recientes y exhaustivos utilizando secuenciación del genoma completo han revelado un número mucho mayor de variantes, subrayando la importancia de examinar todas las variaciones potenciales.

Objetivos del Estudio

En este estudio, los investigadores se propusieron analizar la variación de las variantes de CFTR en diferentes orígenes étnicos utilizando datos de una gran base de datos de salud poblacional del Reino Unido. Examinaron variantes de CFTR en seis grupos principales: africanos, americanos, asiáticos del centro y sur, asiáticos orientales, europeos y del medio oriente, junto con un grupo mixto.

El estudio también buscó:

  • Identificar variantes de CFTR únicas en diferentes ascendencias.
  • Estimar la edad de las variantes que causan la FQ.
  • Analizar los resultados de salud para individuos que portan múltiples variantes de CFTR.

Población del Estudio y Métodos

La investigación se basó en datos de más de 454,000 individuos en el Biobanco del Reino Unido, una base de datos pública que contiene información de salud y genética. El estudio se centró en entender la diversidad de las variantes de CFTR entre las diferentes ascendencias y cómo estas variaciones afectan la salud.

La ascendencia de los participantes fue clasificada en función de dos grandes conjuntos de datos de referencia. Los investigadores documentaron detalles demográficos, incluyendo género y edad, así como otras mediciones de salud.

Resultados: Variantes de CFTR Diversas entre las Ascendencias

El estudio identificó más de 4,000 variantes de CFTR en los diferentes grupos ancestrales, con más de la mitad representando cambios en las regiones no codificantes del gen. La mayoría de las variantes se encontraron en europeos, mientras que otros grupos como la población hispano/mezclada americana tuvieron significativamente menos variantes.

También se identificaron variantes específicas de ascendencia, lo que indica que ciertos cambios genéticos son únicos para poblaciones específicas. Se encontró el mayor número de variantes únicas en europeos, mientras que el menor en el grupo hispano/mezclado americano. Notablemente, alrededor del 28% de las variantes encontradas en el grupo de ascendencia mixta eran únicas para esa población.

Relevancia Clínica de las Variantes Identificadas

El estudio exploró la distribución de las variantes que causan la FQ, que varían entre poblaciones. Se identificó un porcentaje significativo de variantes que causan FQ en el grupo europeo en comparación con otros. La variante que causa la FQ más prevalente, F508del, se encontró en todas las poblaciones, pero era particularmente común en europeos. Otras variantes también se vincularon a ciertos grupos étnicos, demostrando la variabilidad en la prevalencia de cambios genéticos relacionados con la FQ.

Participantes con Múltiples Variantes de CFTR

La investigación destacó a individuos con dos variantes que causan FQ o aquellos con una variante que causa FQ y otra de significado incierto. Un pequeño número de participantes tenía dos variantes que causan FQ, con varias combinaciones vinculadas a diferentes resultados. Algunos de estos individuos presentaron síntomas clásicos de FQ, mientras que otros no, indicando variabilidad en cómo se manifiesta la FQ.

Resultados de Salud y Análisis de Fenotipo

El estudio examinó los registros de salud de los participantes para identificar cualquier asociación entre sus variantes de CFTR y condiciones de salud. Algunos participantes con dos variantes que causan FQ mostraron problemas de salud relacionados con la FQ. Un rango de códigos ICD relacionados con síntomas de FQ, como infecciones pulmonares, estaba significativamente enriquecido en aquellos con más de una variante que causa FQ.

Aquellos con variantes de significado incierto también mostraron algunas condiciones de salud relacionadas, aunque los hallazgos fueron menos claros en este grupo.

Estimación de Edad de las Variantes que Causan FQ

Los investigadores estimaron las edades de ciertas variantes que causan FQ, algunas de las cuales se originaron hace miles de años. Este contexto histórico puede brindar información sobre los cambios genéticos que han persistido a lo largo del tiempo.

Implicaciones para el Diagnóstico y Tratamiento de la Fibrosis Quística

Una de las principales conclusiones del estudio es la necesidad de entender todo el espectro de variantes de CFTR en todas las ascendencias. Las pruebas genéticas actuales a menudo pasan por alto variantes que son más comunes en poblaciones no europeas, lo que podría llevar a subdiagnósticos o Diagnósticos erróneos de la FQ.

Al identificar y caracterizar más variantes, especialmente aquellas únicas de ciertos grupos étnicos, los proveedores de atención médica pueden mejorar los paneles de detección de FQ. Esto podría llevar a estrategias de tratamiento más personalizadas para pacientes de diversas procedencias.

Conclusión

En conclusión, el estudio subraya la diversidad de las variantes de CFTR presentes en diferentes grupos étnicos. Con más de 4,000 variantes identificadas, destaca que entender estas variantes es esencial para un diagnóstico preciso y un tratamiento efectivo de la FQ.

A medida que las bases de datos genéticas continúan expandiéndose, la investigación futura se beneficiará de un rango más amplio de datos, permitiendo mejorar los conocimientos sobre la importancia clínica de estos cambios genéticos y potencialmente mejores resultados para las personas afectadas por la FQ.

Mejorar el acceso a pruebas genéticas y terapias dirigidas para poblaciones diversas es crucial para avanzar en la atención de la FQ y asegurar que todas las personas reciban el mejor tratamiento disponible basado en su única composición genética.

Fuente original

Título: Diversity of CFTR variants across ancestries characterized using 454,727 UK biobank whole exome sequences

Resumen: Limited understanding of the diversity of CFTR variants across ancestries hampers efforts to advance molecular diagnosis of cystic fibrosis (CF). The consequences pose a risk of delayed diagnoses and subsequently worsened health outcomes for patients. Characterizing the distribution of CFTR variants across ancestries is, therefore, critical for revolutionizing molecular diagnoses of CF. By interrogating 454,727 UK biobank whole exome Sequences, we detected over 4,000 CFTR variants, including novel ancestry-specific variants, across six ancestries. F508del was the most prevalent CF-causing variant found across the ancestries, except in East Asia, where V520F was the most prevalent. Sixteen participants had two CF-causing variants, with two diagnosed as CF. We found 154 participants with a CF-causing and varying clinical consequences (VCC) variant. Overall, participants with multiple clinically relevant variants reported indications significantly associated with CF and its pulmonary phenotypes [Bonferroni adjusted p

Autores: Aparna Vasanthakumar, J. E. Ideozu, M. Liu, B. M. Riley-Gillis, S. R. Paladugu, F. Rahimov, P. Krishnan, R. Tripathi, P. Dorr, H. Levy, A. Singh, J. F. Waring

Última actualización: 2023-03-13 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.03.10.23287070

Fuente PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.03.10.23287070.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

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