Entendiendo la Genómica: Impacto en la Salud y Enfermedades
La genómica juega un papel clave en el diagnóstico y tratamiento de condiciones de salud.
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Tabla de contenidos
- La Importancia de los Genes en la Salud
- ¿Qué Son las Variantes Genéticas?
- El Papel de las Guías en las Pruebas Genéticas
- Evaluación de las Variantes Genéticas
- Métodos Tradicionales para Identificar Genes de Enfermedades
- El Cambio en la Investigación Genética
- La Necesidad de Grandes Bases de Datos Poblacionales
- Esfuerzos Colaborativos en la Investigación de Genes
- ¿Qué es la Curación de Genes?
- El Papel de la Coalición de Curación de Genes
- Estandarización de Términos en Genética
- Importancia de los Patrones de Herencia
- Distinguir Entre Herencia y Requerimiento Alélico
- El Papel de las Consecuencias de las Variantes en la Enfermedad
- La Importancia de los Datos Estructurados
- El Estudio Piloto
- Aplicación en Entornos Clínicos
- Agilizando el Proceso de Pruebas Genéticas
- Desafíos en la Interpretación Genética
- La Necesidad de Guías Claras
- Conclusión
- Direcciones Futuras
- Fuente original
- Enlaces de referencia
La genómica es el estudio de los genes y sus funciones. Juega un papel importante en entender cómo nuestros genes influyen en la salud y las enfermedades. En los últimos años, el uso de datos Genómicos ha cambiado mucho la forma en que diagnosticamos y tratamos diversas condiciones médicas.
La Importancia de los Genes en la Salud
Cada persona tiene un conjunto único de genes que puede afectar su salud. Algunos genes pueden hacer que las personas sean más propensas a ciertas enfermedades, mientras que otros ayudan a protegerse contra ellas. Por eso es esencial evaluar la relación entre diferentes genes y cómo pueden relacionarse con las enfermedades.
¿Qué Son las Variantes Genéticas?
Las variantes genéticas son cambios en los genes que pueden afectar cómo se ve o cómo funciona el cuerpo de una persona. Algunas variantes son inofensivas, mientras que otras pueden llevar a enfermedades. Cuando los profesionales de salud buscan causas de enfermedades genéticas, necesitan clasificar estas variantes correctamente.
El Papel de las Guías en las Pruebas Genéticas
Se han desarrollado guías para ayudar a los médicos a interpretar las pruebas genéticas correctamente. Por ejemplo, el Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG) ha sugerido reglas para evaluar variantes genéticas. Estas guías ayudan a asegurarse de que los médicos puedan tomar decisiones informadas al diagnosticar y tratar pacientes.
Evaluación de las Variantes Genéticas
El primer paso para entender una variante genética es evaluar si está vinculada a una enfermedad. Este proceso implica evaluar datos y estudios existentes. Si una variante está vinculada a una enfermedad, su clasificación puede ayudar a tomar decisiones médicas importantes.
Métodos Tradicionales para Identificar Genes de Enfermedades
En el pasado, los científicos a menudo miraban a familias grandes para identificar genes que causaban enfermedades. Estudiaron marcadores genéticos, que son partes del gen que pueden ayudar a encontrar el gen de la enfermedad. Con el tiempo, los investigadores comenzaron a enfocarse en genes específicos que creían que estaban causando la enfermedad basándose en lo que ya sabían.
El Cambio en la Investigación Genética
Solo recientemente se ha reconocido que muchas variantes genéticas raras son más comunes de lo que se pensaba antes. Estudios antiguos a menudo usaban tamaños de muestra pequeños, lo que llevaba a imprecisiones en la comprensión de las relaciones entre genes y enfermedades. Como resultado, muchas afirmaciones sobre los vínculos entre genes y enfermedades no se sostuvieron con el tiempo.
La Necesidad de Grandes Bases de Datos Poblacionales
Para mejorar la precisión de la investigación genética, los científicos ahora están usando bases de datos públicas más grandes. Estas bases de datos permiten a los investigadores comparar variantes genéticas a través de diferentes poblaciones. Usar estos recursos ayuda a asegurarse de que los hallazgos sean confiables y válidos.
Esfuerzos Colaborativos en la Investigación de Genes
Muchas organizaciones e investigadores trabajan juntos para estudiar la relación entre genes y enfermedades. Esta colaboración asegura que los datos sobre genes y su potencial asociación con enfermedades sean completos y precisos.
¿Qué es la Curación de Genes?
La curación de genes es el proceso de revisar y organizar información sobre genes y sus asociaciones con enfermedades. Esto ayuda a asegurar que los datos sean precisos y que se puedan usar de manera confiable por investigadores y clínicos.
El Papel de la Coalición de Curación de Genes
La Coalición de Curación de Genes (GenCC) reúne a varios grupos involucrados en la investigación genética. Su objetivo es crear guías y estándares consistentes para cómo se recopilan y comparten los datos genéticos. Esto ayuda a asegurar que los datos de diferentes fuentes puedan ser fácilmente comparados y entendidos.
Estandarización de Términos en Genética
Uno de los desafíos en la investigación genética es el uso de diferentes términos para describir los mismos conceptos. Por ejemplo, los términos sobre cómo se hereda una enfermedad o cuántas copias de un gen deben verse afectadas para que una enfermedad ocurra pueden diferir entre estudios. GenCC busca estandarizar estos términos, haciendo más fácil la comunicación entre investigadores y médicos.
Importancia de los Patrones de Herencia
Los patrones de herencia describen cómo se pasan los rasgos genéticos de una generación a otra. Entender estos patrones es crucial para evaluar los riesgos de enfermedades dentro de las familias. Los médicos suelen usar esta información para guiar el escrutinio familiar y ofrecer consejos.
Distinguir Entre Herencia y Requerimiento Alélico
La herencia describe cómo se transmite un rasgo, mientras que el requerimiento alélico se refiere a cuántas copias de un gen necesitan verse afectadas para causar la enfermedad. Por ejemplo, en algunas enfermedades, tener solo un gen defectuoso puede ser suficiente para causar la enfermedad (herencia dominante), mientras que en otras, ambas copias necesitan estar afectadas (herencia recesiva).
El Papel de las Consecuencias de las Variantes en la Enfermedad
Al estudiar variantes genéticas, también es importante considerar qué impacto tienen estas variantes en la función de las proteínas. Ciertas variantes pueden llevar a una disminución en la cantidad de proteína producida, mientras que otras pueden cambiar la función de la proteína. Conocer las consecuencias de estas variantes puede ayudar a entender los mecanismos detrás de las enfermedades.
La Importancia de los Datos Estructurados
Tener datos organizados que describan cómo se relacionan los genes, variantes y enfermedades puede ayudar a agilizar los esfuerzos de investigación. Usar una terminología consistente permite una mejor comunicación entre investigadores y proveedores de salud, mejorando la calidad del cuidado para los pacientes.
El Estudio Piloto
Se llevó a cabo un estudio piloto para probar un nuevo sistema de categorización de genes y su relación con enfermedades usando terminología estandarizada. Este estudio involucró examinar un conjunto de genes asociados con diversas condiciones de salud. La retroalimentación del estudio ayudó a refinar el sistema de clasificación.
Aplicación en Entornos Clínicos
El uso de genómica en la práctica clínica está en aumento. Con el avance de las tecnologías de secuenciación de ADN, los médicos tienen más acceso a información genética que nunca. Esto puede llevar a diagnósticos más precisos y planes de tratamiento personalizados.
Agilizando el Proceso de Pruebas Genéticas
Con más variantes genéticas siendo identificadas a través de pruebas, es esencial tener sistemas que filtren efectivamente las variantes que no son clínicamente relevantes. Hacer esto puede ayudar a enfocarse en los hallazgos más significativos, haciendo el proceso de prueba más eficiente.
Desafíos en la Interpretación Genética
Interpretar datos genéticos puede ser complicado. Diferentes laboratorios pueden tener diferentes enfoques para informar sobre variantes, llevando a confusiones. Por ejemplo, algunos pueden informar todas las variantes encontradas en una prueba, mientras que otros solo reportan aquellas consideradas patogénicas o probablemente patogénicas.
La Necesidad de Guías Claras
A medida que las pruebas genéticas se vuelven rutinarias, tener guías claras para reportar e interpretar variantes genéticas es crucial. Esto asegura que los proveedores de salud puedan evaluar adecuadamente la relevancia de la información genética, guiando sus decisiones para el cuidado del paciente.
Conclusión
La genómica está remodelando el panorama de la medicina al mejorar nuestra comprensión de las enfermedades y sus fundamentos genéticos. A medida que los investigadores trabajan juntos para crear términos y marcos estandarizados, el campo continuará avanzando. Este progreso llevará, en última instancia, a un mejor cuidado del paciente, opciones de tratamiento mejoradas y diagnósticos más precisos.
Direcciones Futuras
Mirando hacia adelante, serán necesarios esfuerzos continuos para refinar la clasificación e interpretación genética. La colaboración continua entre diferentes organizaciones e investigadores será clave para asegurar la precisión y confiabilidad de la información genética. Este enfoque colaborativo ayudará a allanar el camino para un uso más efectivo de los datos genómicos en la atención médica, beneficiando a pacientes y familias por igual.
Título: Towards robust clinical genome interpretation: developing a consistent terminology to characterize disease-gene relationships - allelic requirement, inheritance modes and disease mechanisms
Resumen: PURPOSEThe terminology used for gene-disease curation and variant annotation to describe inheritance, allelic requirement, and both sequence and functional consequences of a variant is currently not standardized. There is considerable discrepancy in the literature and across clinical variant reporting in the derivation and application of terms. Here we standardize the terminology for the characterization of disease-gene relationships to facilitate harmonized global curation, and to support variant classification within the ACMG/AMP framework. METHODSTerminology for inheritance, allelic requirement, and both structural and functional consequences of a variant used by Gene Curation Coalition (GenCC) members and partner organizations was collated and reviewed. Harmonized terminology with definitions and use examples was created, reviewed, and validated. RESULTSWe present a standardized terminology to describe gene-disease relationships, and to support variant annotation. We demonstrate application of the terminology for classification of variation in the ACMG SF 2.0 genes recommended for reporting of secondary findings. Consensus terms were agreed and formalized in both sequence ontology (SO) and human phenotype ontology (HPO) ontologies. GenCC member groups intend to use or map to these terms in their respective resources. CONCLUSIONThe terminology standardization presented here will improve harmonization, facilitate the pooling of curation datasets across international curation efforts and, in turn, improve consistency in variant classification and genetic test interpretation.
Autores: Angharad M Roberts, M. T. DiStefano, E. R. Riggs, K. S. Josephs, F. S. Alkuraya, J. Amberger, M. Amin, J. S. berg, F. Cunningham, K. Eilbeck, H. V. Firth, J. Foreman, A. Hamosh, E. Hay, S. Leigh, C. L. Martin, E. M. McDonagh, D. Perrett, E. M. Ramos, P. N. Robinson, A. Rath, D. V. Sant, Z. Stark, N. Whiffin, H. L. Rehm, J. S. Ware
Última actualización: 2023-04-03 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.03.30.23287948
Fuente PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.03.30.23287948.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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