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# Biología # Bioingeniería

Poliquetidos: los pequeños guerreros de la naturaleza en la medicina

Explorando los poliketidos y su papel en la creación de nuevos medicamentos.

Wenzheng Jin, Jiaming Tu, Bei Zhang, Xuri Wu, Yijun Chen

― 7 minilectura


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Los poliketidos son un grupo de compuestos naturales que producen organismos chiquitos como bacterias y hongos. Son famosos por su variedad de estructuras y usos, sobre todo en medicina. Algunos poliketidos tienen propiedades que pueden combatir el cáncer o bacterias. Piensa en ellos como los guerreros de la naturaleza, luchando contra enfermedades mientras están en el mundo microscópico.

¿Qué hace especiales a los poliketidos?

Una razón por la que los poliketidos son tan interesantes es que vienen en muchas formas y tamaños. Esta diversidad es como tener una caja de bombones surtidos: cada uno es único, pero todos vienen de una receta similar. El proceso de hacer poliketidos involucra enzimas especiales conocidas como sintasas de poliketidos (PKS). Estas enzimas funcionan como líneas de ensamblaje en una fábrica, produciendo varios poliketidos según instrucciones específicas.

La maquinaria detrás de PKS

Las PKS se pueden dividir en diferentes tipos según cómo operan. Las PKS tipo I, por ejemplo, trabajan de manera modular. Imagina un set de Legos donde cada pieza representa una función específica en la síntesis de poliketidos. Estas unidades se juntan en un orden específico para hacer el producto final. Desde que los investigadores comenzaron a estudiar estas líneas de ensamblaje, ha surgido un concepto que compara este proceso con construir con bloques de Lego.

Ahora los investigadores están descubriendo cómo reorganizar estos bloques de construcción para crear nuevos poliketidos, al igual que construir una nueva estructura con Legos que no están en el set original. Esto ha llevado a la capacidad de diseñar poliketidos con propiedades específicas, aumentando su utilidad en medicina.

Desafíos en la ingeniería de PKS

Aunque suena como un sueño crear nuevos poliketidos a través de la ingeniería, no todo es color de rosa. Las formas complejas y las partes móviles de las PKS pueden hacer que sean complicadas de trabajar. Incluso después de hacer un cambio, la línea de ensamblaje puede volverse frágil y dejar de funcionar bien, como una estructura de LEGO que se desarma si quitas una pieza crucial.

Aprendiendo de la evolución

Para abordar estos desafíos, los científicos han empezado a mirar cómo estas enzimas han evolucionado con el tiempo. Al estudiar los cambios que han ocurrido naturalmente en las PKS a lo largo de generaciones, pueden inventar nuevos trucos para mejorar estas enzimas en el laboratorio. Por ejemplo, cuando los genes se intercambian o modifican naturalmente entre módulos similares en las PKS, se abren nuevas posibilidades para crear variaciones de poliketidos.

En un estudio, los investigadores descubrieron que ciertas secciones de los genes de PKS mostraban secuencias casi idénticas en diferentes módulos. Llamaron a estas secciones "regiones de ATconversion" porque eran específicas de la parte de aciltransferasa (AT) de la sintasa, que juega un papel clave en determinar el tipo de bloques de construcción utilizados en la síntesis de poliketidos. Este descubrimiento inspiró la idea de usar estas regiones ATconversion reconocibles para diseñar poliketidos nuevos.

Encontrando nuevos candidatos

Aprovechando la idea de los intercambios de genes, los investigadores han podido identificar grupos de genes biosintéticos similares en diferentes bacterias. Es como revisar la caja de juguetes de un amigo y encontrar piezas similares a tu propio set de LEGO. En un caso, se encontró un nuevo grupo de genes biosintéticos en una bacteria conocida como S. mangrovisoli. Este grupo era similar a uno que producía un poliketido llamado cinamomicina, que ha demostrado tener propiedades anticancerígenas.

Creando nuevos poliketidos

Con el descubrimiento emocionante de nuevos grupos de genes, los investigadores se embarcaron en una misión para combinar genes de diferentes fuentes. Al intercambiar secciones del grupo cmm (el que produce cinamomicina) con secciones del nuevo grupo mgm, crearon con éxito variantes de poliketidos, también conocidas como mangromicinas. ¡Es como mezclar dos sets de LEGO diferentes para crear algo completamente nuevo!

El proceso de ingeniería

El proceso de ingeniería involucró reemplazar cuidadosamente las regiones de ATconversion de los genes. Algunos de estos cambios llevaron a la producción de nuevos compuestos que tenían propiedades similares a las de la cinamomicina pero con características únicas. Es como añadir un ingrediente especial a una receta que hace que el plato final sea aún más sabroso.

Éxito y sorpresas

Después de realizar numerosos experimentos, los investigadores encontraron que las variaciones de las mangromicinas producidas no solo eran nuevas, sino también eficientes. Algunos de estos nuevos compuestos se produjeron incluso en mayores cantidades que las cinamomicinas originales. ¡Era como si hubieran descubierto una receta secreta que hacía que los dulces fueran aún más dulces!

Ajustando la producción

A medida que los investigadores continuaron explorando el potencial de estos poliketidos, descubrieron que pequeños cambios en las enzimas involucradas podían llevar a diferentes resultados en los productos hechos. Esto es como un chef que sabe que añadir una pizca de sal o un toque de pimienta puede cambiar drásticamente el sabor de un plato. Tal ajuste en el laboratorio permite una producción específica de poliketidos diversos, haciéndolos adecuados para diferentes necesidades medicinales.

El papel de la corrección de pruebas

Un hallazgo interesante durante esta investigación fue el papel de ciertos dominios (partes) de las PKS que actuaban como correctores durante el proceso de producción de poliketidos. Estos elementos de corrección aseguran que los bloques de construcción correctos se incorporen en el producto final. Imagina tener un amigo que revisa tu ensamblaje de LEGO para asegurarse de que coloques las piezas correctas en los lugares correctos: esto es vital para producir poliketidos con precisión.

El tapón del sitio activo

Los investigadores también identificaron una región específica en la PKS, llamada "Tapón del Sitio Activo", que desempeña un papel importante en determinar el tipo de bloques de construcción utilizados. Al manipular esta área, podían influir en qué poliketido se producía. ¡Es como cambiar la boquilla de una bolsa de decoración para crear diferentes diseños en un pastel!

Pasos finales para la producción de poliketidos

Después de crear con éxito variantes de poliketidos, los investigadores pasaron a los pasos finales para crear un nuevo poliketido llamado mangromicina C. Este proceso implicó modificar un gen existente para prevenir cambios químicos no deseados durante la síntesis. El equipo orquestó varios cambios genéticos a través de múltiples rondas de fermentación para optimizar la producción de este nuevo compuesto.

La imagen más grande

El éxito de estos esfuerzos de ingeniería representa un avance significativo en el campo del descubrimiento de productos naturales. Con el conocimiento obtenido de los procesos evolutivos y la aplicación de técnicas de ingeniería, los investigadores ahora pueden acceder a compuestos naturales de maneras que antes no eran posibles. ¡Es como abrir un nuevo grifo que libera un flujo de compuestos emocionantes y beneficiosos!

Conclusión: Un futuro prometedor

La exploración de los poliketidos y los métodos desarrollados para ingenierizar su producción destacan lo innovadores y creativos que pueden ser los científicos. Al combinar la sabiduría de la naturaleza con los avances tecnológicos, estamos desbloqueando un tesoro de posibilidades para nuevos medicamentos y tratamientos. Así que, la próxima vez que tomes un medicamento que te ayude a sentirte mejor, piensa en los pequeños guerreros, los poliketidos, y la ciencia creativa detrás de su producción, porque un montón de construcción al estilo LEGO y algo de reordenamiento inteligente pueden haber llevado ese remedio a tu botiquín.

Fuente original

Título: Gene Conversion Directed Successive Engineering of Modular Polyketide Synthases

Resumen: Modular polyketide synthases (PKSs) can produce various secondary metabolites in a collinearity fashion. Although rational engineering of modular PKS can ultimately create a diverse array of novel compounds, de novo generation of defined structures usually results in the loss or remarkable decline of productivity due primarily to the incompatibility of different elements. Here, we present a modular PKS engineering strategy driven by an evolutionary event of gene conversion to accomplish successive engineering of the modular PKS in cinnamomycin biosynthetic gene cluster (cmm BGC). By simulating the gene conversion process, cmm BGC is consecutively reprogrammed to generate a novel macrolide with predicted structural features. Moreover, in contrast to previous notion, the intra-module KS domain is demonstrated to associate with the selectivity of extender units. Collectively, the coordination between evolutionary consequence and functional manipulation of assembly line may shed a new light on modular PKS engineering. Graphical Abstract O_FIG O_LINKSMALLFIG WIDTH=200 HEIGHT=104 SRC="FIGDIR/small/630704v1_ufig1.gif" ALT="Figure 1"> View larger version (17K): org.highwire.dtl.DTLVardef@269409org.highwire.dtl.DTLVardef@c10c30org.highwire.dtl.DTLVardef@725c0org.highwire.dtl.DTLVardef@13f6fa6_HPS_FORMAT_FIGEXP M_FIG Gene conversion process, typically occurred in KS (purple squares) and AT (blue squares), plays an integral role of structural diversity of polyketides. In this study, an unusual gene conversion was observed in cmm BGC. Subsequently, a homologous BGC was obtained through genome mining by a gene conversion-associated KS domain. Under the direction of gene conversion, the modular PKS in cmm BGC was successively reprogrammed, resulting in de novo biosynthesis of a new-to-nature polyketide. C_FIG

Autores: Wenzheng Jin, Jiaming Tu, Bei Zhang, Xuri Wu, Yijun Chen

Última actualización: Dec 30, 2024

Idioma: English

Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.29.630704

Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.29.630704.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

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